Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g007170.3.1
CDS Infomation	Protein kinase-like protein (AHRD V3.3 *** C6ZRY1_SOYBN)
Sequence	ATGGCGGCCATGATCCGCCTTGTTGAACCCAAGGCTAAATCTGTTCAATGGGTCTTTTTG GGTTGTCCTGGTGTCGGAAAAGGTACATATGCTAGCCGTCTCTCAACCCTTTTAGGCGTT CCTCATATTGCTACTGGAGATCTTGTTCGTGATGAGTTGAAATCTTCAGGTCCTTTATCG AAACAACTTGCAGAGATTGTCAACCAAGGAAAATTGGTTTCAGATGAGATTATACTGAAT CTACTATCCAAAAGGCTTGAGAGTGGGGAAGCTAAGGGTGAAGCTGGATTCATACTTGAT GGTTTCCCTAGAACTGTGAGACAAGCAAATTGTGACAAGACTTCTGATTTTAGTCTTGTC AGCAGAGGTATAGGAACTGGGAAAGAAAGTGAAGATCCTTTGCAACAGTTCGCTACCTTT TTGTCTATGAAAAGGTACCCCCCACCTTATGTGGCTAGCGGGGAAATATTGACCGAGGTG ACAGACATAGATTTGGTGGTTAATCTCAAGCTTCCAGAGCGGGTATTGGTTGAGAAATGC CTTGGCCGAAGAATCTGCAGTGAATGTGGAAAGAATTTCAACGTGGCATCTATAGATGTC GCTGGTGAAAATGGGGCTCCTAGAATCAGCATGGCTCCCCTTAATCCTCCCTCTCAGTGT ATATCAAAGTTAATCACTCGAGCAGATGATACAGAAGCCATTGTGAAGGAAAGGCTCAGT ATATACTGGGATAAGAGTCAGCCTGTTGAGGACTTCTACCGTAGCCAAGGTAAGTTACTG GAATTTGATTTACCGGGAGGCATCCCCGAATCATGGCCTAAGTTGCTGGAAGTTCTCAAC CTTGATGAACAAGAACATAAACTAGCTTCAAGTTTTAATGATTCTGTTAAATGGGCTTGT TGTGTTTTTGTCAAATTTCTTAGTCTTTGGATGATTTTTGGAGCTTCAGTTCTACATTAT TGCTTTAGTTTTACATTATTTAGAGAAATTTTGGAGGAGCTAGTTTTGTGGCTTAAGCTG GCGGATATTGCTCTTAAATATGGAAGTGATAAGTTGAAGGCAAAGACTCTGTTAGGTTCA AAGGAGTATGTTAAGGATGGCGAGTCTGGTCAAATTGGAGCCAAGATTTTTAAATTTCGT GAATTAGCAGTTGCAACAAGAAACTTTCGAGGTGATTGTCTTCTTGGAGAGGGAGGATTC GGAAGAGTATATAAAGGGCGGCTCGATTCCAATCAGATTGTTGCCATCAAGCAACTCGAT CGTAATGGATTGCAAGGGAACAGGGAATTTCTTGTTGAAGTGCTGATGCTAAGTCTGTTA CACCATCCTAACCTGGTAAATTTAACTGGTTATTGCGCTGATGGAGATCAAAGACTTCTG GTTTATGAATATATGCCACTAGGATCACTGGATGACCATCTTCATGATCTTACGCCCGGT AAGAAAGTGCTTGATTGGAATACGAGAATGAAAATTGCAGCTGGAGCAGCAAAGGGCTTG GAATATTTACATGACAGAGCAAGTCCACCTGTAATATACCGCGATTTGAAATGCTCCAAC ATTTTGCTTGGTGAGGGGTATCACCCAAAGCTATCTGACTTTGGATTGGCTAAGTTAGGG CCTGTAGGAGATAACACTCATGTCTCTACTAGAGTTATGGGTACTTATGGGTACTGTGCA CCAGAGTACGCCATGACTGGTCAGTTAACGTTAAAGTCAGATGTTTACAGCTTTGGAGTC GTCCTCTTGGAGATCATCACTGGAAGGAAAGCAATTGAATTTTCAAAAACTGGAGGAGAA CACAATCTGGTTGCATGGGCAAAACCGTTGTTCAGAGACCGGAGAAAATTCTCACAGATG GCTGATCCAATGCTTCAAGGACAATATCCAGAAAGAGGCTTATACCAAGCTCTAGCAGTT GCAGCAATGTGTGTTCAGGAACAACCTAACATGCGTCCAGTCATAGCAGACGTTGTCACA GCCTTATCTTACCTTGCTGCACAGAAATTTGACAGTGATACTGAGGGAGTTCAAAACCCA CGCTGGACACCTGCTACTCCACCTAGGACGAGACGTGATGCTGATAAGAGACAAAAGGGT GGCAACCATGAACCTAGATGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g007170.3.1
PEP Infomation	Protein kinase-like protein (AHRD V3.3 *** C6ZRY1_SOYBN)
Sequence	MAAMIRLVEPKAKSVQWVFLGCPGVGKGTYASRLSTLLGVPHIATGDLVRDELKSSGPLS KQLAEIVNQGKLVSDEIILNLLSKRLESGEAKGEAGFILDGFPRTVRQANCDKTSDFSLV SRGIGTGKESEDPLQQFATFLSMKRYPPPYVASGEILTEVTDIDLVVNLKLPERVLVEKC LGRRICSECGKNFNVASIDVAGENGAPRISMAPLNPPSQCISKLITRADDTEAIVKERLS IYWDKSQPVEDFYRSQGKLLEFDLPGGIPESWPKLLEVLNLDEQEHKLASSFNDSVKWAC CVFVKFLSLWMIFGASVLHYCFSFTLFREILEELVLWLKLADIALKYGSDKLKAKTLLGS KEYVKDGESGQIGAKIFKFRELAVATRNFRGDCLLGEGGFGRVYKGRLDSNQIVAIKQLD RNGLQGNREFLVEVLMLSLLHHPNLVNLTGYCADGDQRLLVYEYMPLGSLDDHLHDLTPG KKVLDWNTRMKIAAGAAKGLEYLHDRASPPVIYRDLKCSNILLGEGYHPKLSDFGLAKLG PVGDNTHVSTRVMGTYGYCAPEYAMTGQLTLKSDVYSFGVVLLEIITGRKAIEFSKTGGE HNLVAWAKPLFRDRRKFSQMADPMLQGQYPERGLYQALAVAAMCVQEQPNMRPVIADVVT ALSYLAAQKFDSDTEGVQNPRWTPATPPRTRRDADKRQKGGNHEPRW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g007170.3.1
Transcript Infomation	Protein kinase-like protein (AHRD V3.3 *** C6ZRY1_SOYBN)
Sequence	ATGGCGGCCATGATCCGCCTTGTTGAACCCAAGGCTAAATCTGTTCAATGGGTCTTTTTG GGTTGTCCTGGTGTCGGAAAAGGTACATATGCTAGCCGTCTCTCAACCCTTTTAGGCGTT CCTCATATTGCTACTGGAGATCTTGTTCGTGATGAGTTGAAATCTTCAGGTCCTTTATCG AAACAACTTGCAGAGATTGTCAACCAAGGAAAATTGGTTTCAGATGAGATTATACTGAAT CTACTATCCAAAAGGCTTGAGAGTGGGGAAGCTAAGGGTGAAGCTGGATTCATACTTGAT GGTTTCCCTAGAACTGTGAGACAAGCAAATTGTGACAAGACTTCTGATTTTAGTCTTGTC AGCAGAGGTATAGGAACTGGGAAAGAAAGTGAAGATCCTTTGCAACAGTTCGCTACCTTT TTGTCTATGAAAAGGTACCCCCCACCTTATGTGGCTAGCGGGGAAATATTGACCGAGGTG ACAGACATAGATTTGGTGGTTAATCTCAAGCTTCCAGAGCGGGTATTGGTTGAGAAATGC CTTGGCCGAAGAATCTGCAGTGAATGTGGAAAGAATTTCAACGTGGCATCTATAGATGTC GCTGGTGAAAATGGGGCTCCTAGAATCAGCATGGCTCCCCTTAATCCTCCCTCTCAGTGT ATATCAAAGTTAATCACTCGAGCAGATGATACAGAAGCCATTGTGAAGGAAAGGCTCAGT ATATACTGGGATAAGAGTCAGCCTGTTGAGGACTTCTACCGTAGCCAAGGTAAGTTACTG GAATTTGATTTACCGGGAGGCATCCCCGAATCATGGCCTAAGTTGCTGGAAGTTCTCAAC CTTGATGAACAAGAACATAAACTAGCTTCAAGTTTTAATGATTCTGTTAAATGGGCTTGT TGTGTTTTTGTCAAATTTCTTAGTCTTTGGATGATTTTTGGAGCTTCAGTTCTACATTAT TGCTTTAGTTTTACATTATTTAGAGAAATTTTGGAGGAGCTAGTTTTGTGGCTTAAGCTG GCGGATATTGCTCTTAAATATGGAAGTGATAAGTTGAAGGCAAAGACTCTGTTAGGTTCA AAGGAGTATGTTAAGGATGGCGAGTCTGGTCAAATTGGAGCCAAGATTTTTAAATTTCGT GAATTAGCAGTTGCAACAAGAAACTTTCGAGGTGATTGTCTTCTTGGAGAGGGAGGATTC GGAAGAGTATATAAAGGGCGGCTCGATTCCAATCAGATTGTTGCCATCAAGCAACTCGAT CGTAATGGATTGCAAGGGAACAGGGAATTTCTTGTTGAAGTGCTGATGCTAAGTCTGTTA CACCATCCTAACCTGGTAAATTTAACTGGTTATTGCGCTGATGGAGATCAAAGACTTCTG GTTTATGAATATATGCCACTAGGATCACTGGATGACCATCTTCATGATCTTACGCCCGGT AAGAAAGTGCTTGATTGGAATACGAGAATGAAAATTGCAGCTGGAGCAGCAAAGGGCTTG GAATATTTACATGACAGAGCAAGTCCACCTGTAATATACCGCGATTTGAAATGCTCCAAC ATTTTGCTTGGTGAGGGGTATCACCCAAAGCTATCTGACTTTGGATTGGCTAAGTTAGGG CCTGTAGGAGATAACACTCATGTCTCTACTAGAGTTATGGGTACTTATGGGTACTGTGCA CCAGAGTACGCCATGACTGGTCAGTTAACGTTAAAGTCAGATGTTTACAGCTTTGGAGTC GTCCTCTTGGAGATCATCACTGGAAGGAAAGCAATTGAATTTTCAAAAACTGGAGGAGAA CACAATCTGGTTGCATGGGCAAAACCGTTGTTCAGAGACCGGAGAAAATTCTCACAGATG GCTGATCCAATGCTTCAAGGACAATATCCAGAAAGAGGCTTATACCAAGCTCTAGCAGTT GCAGCAATGTGTGTTCAGGAACAACCTAACATGCGTCCAGTCATAGCAGACGTTGTCACA GCCTTATCTTACCTTGCTGCACAGAAATTTGACAGTGATACTGAGGGAGTTCAAAACCCA CGCTGGACACCTGCTACTCCACCTAGGACGAGACGTGATGCTGATAAGAGACAAAAGGGT GGCAACCATGAACCTAGATGGTGATAGGAAGACTAACAAGTTGCTCTATGAACAAGTACA TAACATCCAGACGAGTGACCTCTTGGATTACAGCTAGTTGAAGCTATAGATCACAGTACA AACGACAATCAAAATGCACCTCAAGTACAAGTTCAGCCAAACAGAACTTATATAGTGAAT GACCGCCAAAATTTTGTACTCGGAAGTCAGACCAGTTATGCTTATCTTTCCTAATATCGA GTATGTGAGTGCGTAGTTATTTCGTGTTAGTGCAGTTTATGGTTTTGCTCACTTCCTGGT AGCCATGCACAGCTTGGAAATGTATTTTTTGTTGTACAAAGTGGGCTTGCCTAACCATTT CCGTGTGCAGAGTATTGTATTGTGAAAAGGCAAATTATGATGTATAATGGACAGACTCAA TGATTGTATTTAATTAAATACATTTTTAGCCATATCTTTGTGATTAAAAAGCATTTACTT TA