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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g007040.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7LUH3_ARALL)

Sequence

ATGATAAAAAGGTTAGGATCATTCCGGTGCTATGTCAATCATAGGATACCGTCTTGTTTC
AGGAATGAACAGTCAAGTAATGATCATATAATCTTGTTGTGTAAGCAAAAATTGTTTAAA
CAAGCTTTAGAGTCATTTGAGTTGTTAGAAAGGAACACGACTTATAATTTGTATCCAAGC
ACGTATGCTCAGTTAGTTTCTGCGTGCTCATCTCTTAGATCCCTACCGTATGCAAGAAGA
GTTCATACTCATATTTTAGCATCAAATTATCAGCCAGACATGATTTTTCAAAATCATTTG
TTGAATATGTATGGGAAGTGTGGGTCGTTGAAGGAGGCTCGTAAGGTGTTTGATGAAATG
CTTGAACGAAATTTGGTTTCTTGGACTTCGATAATTGCTGGGTACTCACAGAATGGTCAG
GAGAATGAAGCATTAGATCTTTACTTTCAAATGCGACAGTTTGGTCTTATACCTGACCAG
TTCACATATGGAAGTGTAATCAAAACTTGCTCAAATATGAAACAGGTAGAGTTAGGGAAG
CAGTTGCATGGCCATGTCATTAAATCGGAACATGGTTCCCACCTTATTGCTCAGAATGCA
TTGATTGCGATGTACACAAAGTTTAATCAAATTGATGAGGCATTGTCAGTGTTCTCCCGT
ATTAATTCAAAGGATTTGATTTCGTGGAGCTCAATGATTGCTGGATTTTCACAGCTTGGT
TATGAATCAGAAGCTCTGTCCTGCTTCAGGGAGATGCTTAGTCAGGGCATTTACAAACTG
AACGAATTCATTTTTGGAAGCATTTTTAATGTCTGTAGAAGTCTTGCACAAGCAGAATAT
GGAAGACAAGTACATGGTTTAAGTATAAAATTTGGGCTTAGTTTTGACGCTTTTGCTGGT
TGCGCTGTTACTGACATGTATGCTAGATGTGGATGGTTGCATTCTGCAAGAACTGCATTC
TACCAGATAGGAAATCCTGATCTTGCGTCCTGGAATGCTCTGATTGCGGGTTTTGCATAC
GGAGGTGACCGTGATGAAGCTGTATCTCTCTTTTCTCAGATGAGAACTTTGAGGTTGACC
CCAGATGATGTCACAATTCGTTCTTTACTTTGTGCCTTTGTAAGTCCATGTGCTCTTTTT
CTAGGAAAGCAAGTGCACTGCTATGTTATTAAGAGTGGCTTTGATTTAGAGATTTCCATC
TCTAATACATTACTTTCAATGTATGCCAACTGTTCAGATCTTCCGGATGCACATAAAATT
TTCAATGAGATAAAAAACAAAGCAGATTTAGTCTCGTGGAATGCCATTCTTACAGCTTTT
CTACAACAGCGAGATTCTGGAGAGGTCTTCTCGTTATTTAAGATGATGCTTCTTTCTTCT
AATAAGCCTGATCATATTACATTAGTTAATATGCTTGGGGCATCTGGAAAAGTAGCCTCT
TTGGAAATCGGAGACCAGGTTTGTTGCTATGCCATGAAAAATGGGCTAAGTGAAGATATT
TATGTCATCAATGCTTTAATTGACATGTATGTGAAATGTGGACATATGACAAGCGCTAAG
AAGCTCTTTGATAGTATGAACAACCCTGATGCGGTTTCATGGAGTAGTTTAATAGTGGGG
TATGCTCAGTTTGGATACGGAGAAGAGGCTCTAGACCTATTCCAGAAGATGAGATATTTA
GCTGTCAAGCCAAACCAAGTTACCTTTGTCGGGGTTTTGACTGCTTGTAGTCATGTTGGA
CGAGTAAAAGAAGGGTGGCAGTTGTTCAGAGCCATGGAAACGGAGTTTGGTATTATACCA
ACTAGAGAGCATTGTTGCTGTGTGGTTGACATGCTTGCCCGAGCTGGCTGCATAGAAGAA
GCAGAAGCTTTTATCAATCAAATGGAAATAGATCCTGATATTGTGGTGTGGAAGACTTTG
TTAGCTGCTTGTAAGACACGTAACAATCTTGATGTTGGCAAACGAGCCGCAGAGAAAATT
TTGGAGATTGATCCCTCAAATTCTGCTGCACATGTGTTACTCTGTAACATTTTTGCTTCT
ACAGGCAGTTGGAAAGATGTTGCATCACTGAGGGGTCAGATGAGACAAAAAGGCGTCAAA
AAGGTTCCAGGTCAAAGTTGGATCGAAGTCAAGGACCGGATCCATGTCTTCTTGGCTGAG
GACTGTATGCATGCAGAAAGGGACAGCATATACTCCATGCTAGATGAACTATGGCTGCAG
ATGCTGGATGATGATTATTTGCCCCTCCAGAGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g007040.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7LUH3_ARALL)

Sequence

MIKRLGSFRCYVNHRIPSCFRNEQSSNDHIILLCKQKLFKQALESFELLERNTTYNLYPS
TYAQLVSACSSLRSLPYARRVHTHILASNYQPDMIFQNHLLNMYGKCGSLKEARKVFDEM
LERNLVSWTSIIAGYSQNGQENEALDLYFQMRQFGLIPDQFTYGSVIKTCSNMKQVELGK
QLHGHVIKSEHGSHLIAQNALIAMYTKFNQIDEALSVFSRINSKDLISWSSMIAGFSQLG
YESEALSCFREMLSQGIYKLNEFIFGSIFNVCRSLAQAEYGRQVHGLSIKFGLSFDAFAG
CAVTDMYARCGWLHSARTAFYQIGNPDLASWNALIAGFAYGGDRDEAVSLFSQMRTLRLT
PDDVTIRSLLCAFVSPCALFLGKQVHCYVIKSGFDLEISISNTLLSMYANCSDLPDAHKI
FNEIKNKADLVSWNAILTAFLQQRDSGEVFSLFKMMLLSSNKPDHITLVNMLGASGKVAS
LEIGDQVCCYAMKNGLSEDIYVINALIDMYVKCGHMTSAKKLFDSMNNPDAVSWSSLIVG
YAQFGYGEEALDLFQKMRYLAVKPNQVTFVGVLTACSHVGRVKEGWQLFRAMETEFGIIP
TREHCCCVVDMLARAGCIEEAEAFINQMEIDPDIVVWKTLLAACKTRNNLDVGKRAAEKI
LEIDPSNSAAHVLLCNIFASTGSWKDVASLRGQMRQKGVKKVPGQSWIEVKDRIHVFLAE
DCMHAERDSIYSMLDELWLQMLDDDYLPLQS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g007040.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** D7LUH3_ARALL)

Sequence

ATGATAAAAAGGTTAGGATCATTCCGGTGCTATGTCAATCATAGGATACCGTCTTGTTTC
AGGAATGAACAGTCAAGTAATGATCATATAATCTTGTTGTGTAAGCAAAAATTGTTTAAA
CAAGCTTTAGAGTCATTTGAGTTGTTAGAAAGGAACACGACTTATAATTTGTATCCAAGC
ACGTATGCTCAGTTAGTTTCTGCGTGCTCATCTCTTAGATCCCTACCGTATGCAAGAAGA
GTTCATACTCATATTTTAGCATCAAATTATCAGCCAGACATGATTTTTCAAAATCATTTG
TTGAATATGTATGGGAAGTGTGGGTCGTTGAAGGAGGCTCGTAAGGTGTTTGATGAAATG
CTTGAACGAAATTTGGTTTCTTGGACTTCGATAATTGCTGGGTACTCACAGAATGGTCAG
GAGAATGAAGCATTAGATCTTTACTTTCAAATGCGACAGTTTGGTCTTATACCTGACCAG
TTCACATATGGAAGTGTAATCAAAACTTGCTCAAATATGAAACAGGTAGAGTTAGGGAAG
CAGTTGCATGGCCATGTCATTAAATCGGAACATGGTTCCCACCTTATTGCTCAGAATGCA
TTGATTGCGATGTACACAAAGTTTAATCAAATTGATGAGGCATTGTCAGTGTTCTCCCGT
ATTAATTCAAAGGATTTGATTTCGTGGAGCTCAATGATTGCTGGATTTTCACAGCTTGGT
TATGAATCAGAAGCTCTGTCCTGCTTCAGGGAGATGCTTAGTCAGGGCATTTACAAACTG
AACGAATTCATTTTTGGAAGCATTTTTAATGTCTGTAGAAGTCTTGCACAAGCAGAATAT
GGAAGACAAGTACATGGTTTAAGTATAAAATTTGGGCTTAGTTTTGACGCTTTTGCTGGT
TGCGCTGTTACTGACATGTATGCTAGATGTGGATGGTTGCATTCTGCAAGAACTGCATTC
TACCAGATAGGAAATCCTGATCTTGCGTCCTGGAATGCTCTGATTGCGGGTTTTGCATAC
GGAGGTGACCGTGATGAAGCTGTATCTCTCTTTTCTCAGATGAGAACTTTGAGGTTGACC
CCAGATGATGTCACAATTCGTTCTTTACTTTGTGCCTTTGTAAGTCCATGTGCTCTTTTT
CTAGGAAAGCAAGTGCACTGCTATGTTATTAAGAGTGGCTTTGATTTAGAGATTTCCATC
TCTAATACATTACTTTCAATGTATGCCAACTGTTCAGATCTTCCGGATGCACATAAAATT
TTCAATGAGATAAAAAACAAAGCAGATTTAGTCTCGTGGAATGCCATTCTTACAGCTTTT
CTACAACAGCGAGATTCTGGAGAGGTCTTCTCGTTATTTAAGATGATGCTTCTTTCTTCT
AATAAGCCTGATCATATTACATTAGTTAATATGCTTGGGGCATCTGGAAAAGTAGCCTCT
TTGGAAATCGGAGACCAGGTTTGTTGCTATGCCATGAAAAATGGGCTAAGTGAAGATATT
TATGTCATCAATGCTTTAATTGACATGTATGTGAAATGTGGACATATGACAAGCGCTAAG
AAGCTCTTTGATAGTATGAACAACCCTGATGCGGTTTCATGGAGTAGTTTAATAGTGGGG
TATGCTCAGTTTGGATACGGAGAAGAGGCTCTAGACCTATTCCAGAAGATGAGATATTTA
GCTGTCAAGCCAAACCAAGTTACCTTTGTCGGGGTTTTGACTGCTTGTAGTCATGTTGGA
CGAGTAAAAGAAGGGTGGCAGTTGTTCAGAGCCATGGAAACGGAGTTTGGTATTATACCA
ACTAGAGAGCATTGTTGCTGTGTGGTTGACATGCTTGCCCGAGCTGGCTGCATAGAAGAA
GCAGAAGCTTTTATCAATCAAATGGAAATAGATCCTGATATTGTGGTGTGGAAGACTTTG
TTAGCTGCTTGTAAGACACGTAACAATCTTGATGTTGGCAAACGAGCCGCAGAGAAAATT
TTGGAGATTGATCCCTCAAATTCTGCTGCACATGTGTTACTCTGTAACATTTTTGCTTCT
ACAGGCAGTTGGAAAGATGTTGCATCACTGAGGGGTCAGATGAGACAAAAAGGCGTCAAA
AAGGTTCCAGGTCAAAGTTGGATCGAAGTCAAGGACCGGATCCATGTCTTCTTGGCTGAG
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ATGCTGGATGATGATTATTTGCCCCTCCAGAGTTAA