Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g005710.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061ES09_THECC)
Sequence	ATGCCTAAACGAGATGTAGCATCGGCAACATCTTTGATTAGCCATTTTGCTAAACTGAAT CAACACAAGAAAGCAATGAATATCTTCTCAAGAATGTTTGAGCTGAATATTAGACCGAAT GAGTTCACATTTGGTGTTGTAATTCACTCATCTGTTGTTCTTGATGATCCAAATTTAGGA AAGCAATTTCATGGTGTTTCAATGAAACTTGGTCTTAACTCGAATGTTTACGTGGGTAGT GCACTTTTGGATCTTTATGCAAAGCTATGCAGCATTGAAGAAGGTCTGTTTGTTTTTGAG GATACACATGAACCAAATGTGGTTTCGTATACAACTTTATTATGTGGATATCTTAAAGAA CAGAGGTTTGATGAAGCAATGGAGATTTTTCGGATAATTCCAGAGAGAAATGTTGTTACT TGGAATGCTATGATTAGTGGTTATAGCAAGAAAGGATGTAACGAAGAGGCTGTTAATCTT TTTATTGAGATGTTGAGACGAGGTTTCATACCTGATCAATCTACGTTCCCTTCTTTGTTA AGTGCAGCTGCAAATATGGCAGCATTGGGTAAGGGAAAAAGTTTGCATGCTTGTGCTGTG AAGTATTTGGGTCAGGTTGGTGTGTTTGTTGGCAATTCACTTGTTAGCTTTTATGCAAAA TGTGGGAGTTTAGAGGATTGTCTTCGCGTTTTTGATAGACTTACTGAAAGAAATGTTGTG ACTTGGAATGCTTTAATATGTGCTCATGCTCAAAATGGGAGAGGGGATGTAGCGATTGAA TTGTTTAAGAGAATGGAGTATATGGGAATTAAGTCAAATAGTGTTACGCTTCTTGGTTTG TTACTGGCGTGTAGTCATGTTGGTCTTGTTGATGAGGCTTATTCATATTTTGAGCAGGCA AGAACTCGGGATGCTAATCTACTGAAATCTGAGCACTATGCATGTATGGTTGACCTGCTA TCGCGTTCAGGGAGGTTTAAACAAGCTGAGAAATTCATTCATGATTTGCCTTTTGATCCA GGTATAGGATTTTGGAAGGCATTGTTAGGAGGCTGCCAGGTTCATTCAAACACGAAGCTA GGGGAATACGCTGCTGAAAAGGTATTGGCTTTAGAGCCTGGAGATGTTTCATCATATGTG ATGCTTTCGAATGCACATTCTGCTGCTGGAAGATGGCAGAGTGTGTCCATCGTAAGGAAT GAAATGAGGGAAAAAGGGTTGAAGACGGTCCCTGGATGTAGTTGGGTTGAAATCAAATGC AAAATTCATGTATTTGTTACTGGAGACAAGAGACATACCAACAAGCCTGAGATTTATGAA CTTCTTGGGTACTTCCTCCAGCACACAATGAAGAGCCAAGAAACTGATTTTCTTCAAGAA TTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g005710.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061ES09_THECC)
Sequence	MPKRDVASATSLISHFAKLNQHKKAMNIFSRMFELNIRPNEFTFGVVIHSSVVLDDPNLG KQFHGVSMKLGLNSNVYVGSALLDLYAKLCSIEEGLFVFEDTHEPNVVSYTTLLCGYLKE QRFDEAMEIFRIIPERNVVTWNAMISGYSKKGCNEEAVNLFIEMLRRGFIPDQSTFPSLL SAAANMAALGKGKSLHACAVKYLGQVGVFVGNSLVSFYAKCGSLEDCLRVFDRLTERNVV TWNALICAHAQNGRGDVAIELFKRMEYMGIKSNSVTLLGLLLACSHVGLVDEAYSYFEQA RTRDANLLKSEHYACMVDLLSRSGRFKQAEKFIHDLPFDPGIGFWKALLGGCQVHSNTKL GEYAAEKVLALEPGDVSSYVMLSNAHSAAGRWQSVSIVRNEMREKGLKTVPGCSWVEIKC KIHVFVTGDKRHTNKPEIYELLGYFLQHTMKSQETDFLQEF*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g005710.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061ES09_THECC)
Sequence	ATGCCTAAACGAGATGTAGCATCGGCAACATCTTTGATTAGCCATTTTGCTAAACTGAAT CAACACAAGAAAGCAATGAATATCTTCTCAAGAATGTTTGAGCTGAATATTAGACCGAAT GAGTTCACATTTGGTGTTGTAATTCACTCATCTGTTGTTCTTGATGATCCAAATTTAGGA AAGCAATTTCATGGTGTTTCAATGAAACTTGGTCTTAACTCGAATGTTTACGTGGGTAGT GCACTTTTGGATCTTTATGCAAAGCTATGCAGCATTGAAGAAGGTCTGTTTGTTTTTGAG GATACACATGAACCAAATGTGGTTTCGTATACAACTTTATTATGTGGATATCTTAAAGAA CAGAGGTTTGATGAAGCAATGGAGATTTTTCGGATAATTCCAGAGAGAAATGTTGTTACT TGGAATGCTATGATTAGTGGTTATAGCAAGAAAGGATGTAACGAAGAGGCTGTTAATCTT TTTATTGAGATGTTGAGACGAGGTTTCATACCTGATCAATCTACGTTCCCTTCTTTGTTA AGTGCAGCTGCAAATATGGCAGCATTGGGTAAGGGAAAAAGTTTGCATGCTTGTGCTGTG AAGTATTTGGGTCAGGTTGGTGTGTTTGTTGGCAATTCACTTGTTAGCTTTTATGCAAAA TGTGGGAGTTTAGAGGATTGTCTTCGCGTTTTTGATAGACTTACTGAAAGAAATGTTGTG ACTTGGAATGCTTTAATATGTGCTCATGCTCAAAATGGGAGAGGGGATGTAGCGATTGAA TTGTTTAAGAGAATGGAGTATATGGGAATTAAGTCAAATAGTGTTACGCTTCTTGGTTTG TTACTGGCGTGTAGTCATGTTGGTCTTGTTGATGAGGCTTATTCATATTTTGAGCAGGCA AGAACTCGGGATGCTAATCTACTGAAATCTGAGCACTATGCATGTATGGTTGACCTGCTA TCGCGTTCAGGGAGGTTTAAACAAGCTGAGAAATTCATTCATGATTTGCCTTTTGATCCA GGTATAGGATTTTGGAAGGCATTGTTAGGAGGCTGCCAGGTTCATTCAAACACGAAGCTA GGGGAATACGCTGCTGAAAAGGTATTGGCTTTAGAGCCTGGAGATGTTTCATCATATGTG ATGCTTTCGAATGCACATTCTGCTGCTGGAAGATGGCAGAGTGTGTCCATCGTAAGGAAT GAAATGAGGGAAAAAGGGTTGAAGACGGTCCCTGGATGTAGTTGGGTTGAAATCAAATGC AAAATTCATGTATTTGTTACTGGAGACAAGAGACATACCAACAAGCCTGAGATTTATGAA CTTCTTGGGTACTTCCTCCAGCACACAATGAAGAGCCAAGAAACTGATTTTCTTCAAGAA TTTTGA