Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc09g005480.3.1

CDS Infomation

F-box family protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061GHK4_THECC)

Sequence

ATGGAGAAGAAGAAGAAGCTATCAAAAAATTCAATCTTTCCAGATGCCAAAATCAAATTT
GCAAAGGTCCCAACAATTCATTTCCAAGACGAAATAATGATGGACATCCTCCGCAGGTTA
CCTATGCGCTCTATTCTTCGGTTCAAATGTGTTTCAAAATTTTGGAAATCATTAATTGAC
GATACTTACTTTAAGAGGACACATTATATTCATAACAGGGATAACCAAAATTCCAAAAAA
ATTCTTATTGCCGAAAGGTTAGTTAACAAGGATGAAACCTTTAGCTTCTATACTTCCTCT
TTATCGATGGTTGAGGATAAACAAAAGCTTGATTGGCCTACAAGCTGCAATCCAGTGGAT
GCCAGAATATTTTGTTCTTGTGATGGATTGGTTCTTACTCGTGTTTGTTCCAAAATGTTC
GATGAAGAACTTTTGTTGTGGAACCCGTCTACAAGAGAATCAATACTACTTCCCCATCCA
GAATATCGAATAATGACTTATGTATTTGGATTGGAATATGATGCAACTAGTGAAGGCTAT
AAGATCCTTGCAGTTAAACTCAATGGAAAAAAAAGTATCAATATTTCGATTGAATTTCTC
TCTATAAAAAGGAACAGTTCCTGGAGAAGAATTGATTATCCTACTGACATTCAGCGGGTT
CGTGGTTTTAGGGATTGTGGTACGGATAATTTGGCTTTTCTACATGGAGCATTTCATTGG
CTAGGTAAGTCAACTTCTGGATATTATACTACGGTTTCATTAAATATTTCAAATGAGGTG
TATGGAGAGGTACCGTTATTGAAGCAAATGTATGATCTATGTCCCCTGTACTTCTTCTTC
GATCACGGTGTTTCAGTATTGAGAGGAATGCTTTGCTTTTATTCTACATATAACAAGATA
TCGAGGAGCACTAATGGCATTTTTAATTTGTGGGTAATGAAGGACTATGGTGTCAGGGAA
TCTTGGACTAACTTTATTAAAATACGAGATACCGATCTTTTTCTTTCAGCCCGACCAGTA
TATATGTTTGCGGATTGTCAAGTGTTACTGCACTTCCAACGTTTTGGATATTTTAGTTCT
AATTTCACGACAAGTGGAAGACCATTTGATTTATGCCCTGAATGTGATACTACTAAGCGA
GGAATTGTTTATGCAGAGAGCTTCATTTCACCTACTTCACTGCTTACTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc09g005480.3.1

PEP Infomation

F-box family protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061GHK4_THECC)

Sequence

MEKKKKLSKNSIFPDAKIKFAKVPTIHFQDEIMMDILRRLPMRSILRFKCVSKFWKSLID
DTYFKRTHYIHNRDNQNSKKILIAERLVNKDETFSFYTSSLSMVEDKQKLDWPTSCNPVD
ARIFCSCDGLVLTRVCSKMFDEELLLWNPSTRESILLPHPEYRIMTYVFGLEYDATSEGY
KILAVKLNGKKSINISIEFLSIKRNSSWRRIDYPTDIQRVRGFRDCGTDNLAFLHGAFHW
LGKSTSGYYTTVSLNISNEVYGEVPLLKQMYDLCPLYFFFDHGVSVLRGMLCFYSTYNKI
SRSTNGIFNLWVMKDYGVRESWTNFIKIRDTDLFLSARPVYMFADCQVLLHFQRFGYFSS
NFTTSGRPFDLCPECDTTKRGIVYAESFISPTSLLT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc09g005480.3.1

Transcript Infomation

F-box family protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061GHK4_THECC)

Sequence

GAGACGATGGCAATAAAGATGCCCAAGTGTACGTGCTCCCATCGTCGCCATGCCCATCTA
AATTTAGCTCGTAGAAAAGCCAACAAGTCCATTCTTAAGAGAATAAAAGCTAATCTTCTT
AAGTTTAGCAATGGAGAAGAAGAAGAAGCTATCAAAAAATTCAATCTTTCCAGATGCCAA
AATCAAATTTGCAAAGGTCCCAACAATTCATTTCCAAGACGAAATAATGATGGACATCCT
CCGCAGGTTACCTATGCGCTCTATTCTTCGGTTCAAATGTGTTTCAAAATTTTGGAAATC
ATTAATTGACGATACTTACTTTAAGAGGACACATTATATTCATAACAGGGATAACCAAAA
TTCCAAAAAAATTCTTATTGCCGAAAGGTTAGTTAACAAGGATGAAACCTTTAGCTTCTA
TACTTCCTCTTTATCGATGGTTGAGGATAAACAAAAGCTTGATTGGCCTACAAGCTGCAA
TCCAGTGGATGCCAGAATATTTTGTTCTTGTGATGGATTGGTTCTTACTCGTGTTTGTTC
CAAAATGTTCGATGAAGAACTTTTGTTGTGGAACCCGTCTACAAGAGAATCAATACTACT
TCCCCATCCAGAATATCGAATAATGACTTATGTATTTGGATTGGAATATGATGCAACTAG
TGAAGGCTATAAGATCCTTGCAGTTAAACTCAATGGAAAAAAAAGTATCAATATTTCGAT
TGAATTTCTCTCTATAAAAAGGAACAGTTCCTGGAGAAGAATTGATTATCCTACTGACAT
TCAGCGGGTTCGTGGTTTTAGGGATTGTGGTACGGATAATTTGGCTTTTCTACATGGAGC
ATTTCATTGGCTAGGTAAGTCAACTTCTGGATATTATACTACGGTTTCATTAAATATTTC
AAATGAGGTGTATGGAGAGGTACCGTTATTGAAGCAAATGTATGATCTATGTCCCCTGTA
CTTCTTCTTCGATCACGGTGTTTCAGTATTGAGAGGAATGCTTTGCTTTTATTCTACATA
TAACAAGATATCGAGGAGCACTAATGGCATTTTTAATTTGTGGGTAATGAAGGACTATGG
TGTCAGGGAATCTTGGACTAACTTTATTAAAATACGAGATACCGATCTTTTTCTTTCAGC
CCGACCAGTATATATGTTTGCGGATTGTCAAGTGTTACTGCACTTCCAACGTTTTGGATA
TTTTAGTTCTAATTTCACGACAAGTGGAAGACCATTTGATTTATGCCCTGAATGTGATAC
TACTAAGCGAGGAATTGTTTATGCAGAGAGCTTCATTTCACCTACTTCACTGCTTACTTA
GTATTTGCATATGTTTTCTTCCGTTGAATTTATTTATTTGGGTTTCTTAATGTGTTTGCA
TTTTCTCCAAAGGATGCACTTTTTTGTTATTTTATGATTTGGCTATGCGTGTCACAGACT
CACCAAACCACTTATTTGGCAAATGTATTTGCATTGGTGCAAATTCACTAATACTTGTGT
TAAAAATTTCCCAGAAAGCAGGAGGGGAAGTTTATTATAAGGTGCAATTGTATTCATCTT
TAGAATACAAATTGGTTAGACGAGACATAGTAATATAGAGAGAGGCTGACGATCCTATCT
GCTCAGTGAATTAATTGGACAAATCACTTATCGATAATATCGTTACGATACAATACATTG
TTGAAGTAACACGAACAACCATATGAACGTTCACATATGGAGATTTCATCATAACAAAAA
CACTTGATCGTTATAACATCACAGGGCAGTTTGCCCAAAAATAGCAAACATTGTTGGAAA
AGAACATATATATAGACGGGGCTTGTCGCTTAGCGATCCATCTGCTATTACAACAAAGAA
TACAAAAAAAAAAAAGCGGAAAAAAACAACTTCAAGTGTAATAAACAATGAAAATAAGTT
TCGAGCTATACAAACTAATTTTTCTTGATAAGTATCCTTGTTTAGTTCCCTTTGCCTTCA
TCTTCATTCAAGATACGATTGCGGAAATCATTGACCATGAGAGGAAGCCCCTCTTGCAAC
GATATTTTTGGTTCCCAGTTTAGTAGTTCCTTTGCTTTGCTAATATCAGGTTTCCTCTTG
TGAGGATCATCAGCAGTGTTGGCTTTCAACTCAATAGTGGCACTGGGATCAATCACTTCT
TTCACCACCTGTTTTGTTTCATAACATATCTTAGCACACAAAACTAGATAGATATATCTA
TATGTTGATTAGATGTTTAAGACATTTCCTGGCTCTAAGATAACCACATGAAGTACAACA
TATGAACAAATATCGAGTAAAGCAACCAAAGCTTCTGTACGAACATATTTGTAGACATGT
ACATATGCGTAAATAATCATAACTTACCCCAGCAAGCTCCAACATGGTAAATTCTCTTGG
AAGTTGAAAGGGCCAATGTGCTCACCCTCCATGAGGGCCACTAATCCATCAACCTTTAAT
CAAAATGAAGCTAATTATCTTCAATATGGGTCTTCCAAGCTACTTCTTTAGATCTCACAT
TGATCAGATACACACATACAACTCTCCAATCAGAACAAATAAGAGACCAAAAAAAAAAAG
CTTTTGATGAACATTCGAGTTAATGTAAAGAGTAAGAATGGCTTTAATCTC