Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc09g005110.3.1
CDS Infomation	Pyruvate decarboxylase (AHRD V3.3 *** Q8H9C6_SOLTU)
Sequence	ATGGACTTCAAAATCGACACTTGCAAGCCAATAAATGGCGACATAGCAAACGTACCAACC AATAAAGCTGTTACAATCCAAAACTCCACCATTCCATTCAATTCCCCTGACTCAACACTC GGCCGTCACCTTGCCCGCCGGTTAGTTCAGATCGGAGTAACCGACGTTTTCTCCGTTCCC GGTGATTTCAACTTGACACTTCTCGATCATCTCATTGCTGAACCTGAACTTAACCTTATA GGTTGTTGTAATGAGCTAAATGCAGGCTATGCAGCTGATGGATATGCTAGGGCACGGGGA ATTGGGGCTTGTGTTGTTACGTTTACCGTCGGTGGATTAAGTATCGTTAATGCAATTGCT GGTGCTTATAGTGAAAATTTACCTTTGATTTGTATGGTTGGTGGACCTAATTCTAATGAT TATGGAACTAATACAATACTTCATCATACTATTGGTTTACATGATTTTAGTCAAGAGCTT CGTTGTTTTCAAACTGTGACTTGCTACCAGGCTGTGTTGAATAATTTAGAAGATGCTCAT GAACTGATTGATACTGCAATTTCCACATCTTTGAAAGAGAGTAAGCCGGTTTATATTAGT GTAGGATGTAACTTGCCGGGGATTCCGCATCCTACGTTCAGTCGTGAACCAGTTCCGTTT TCCCTCTCTCCCAGATTAAGTAATATGATGGGGTTGGAAGCAGCAGTAGAAGCAGCGGCT GAGTTCTTGAACAAATCAGTAAAGCCAGTGCTTGTTGGAGGGCAAAATATGCGCGTTGCA AAGGCATGTGATGCTTTTGTTGAGCTGGCTGACAGCTGTGGTTACGCGGTGGCAGTGATG CCAGCCGCAAAAGGTTTGGTTCCGGAACACCATCCACATTTCTTAGGAACTTACTGGGGT GCAGTGAGCACGACCTTCTGTGCTGAAATTGTTGAATCTGCTGATGCCTACTTGTTTGCT GGACCAATTTTTAACGACTATAGCTCTGTTGGTTATTCTCTTCTTCTCAAGAAAGACAAA GTGATCATTGTCCAGCCTGATCGTGTGACAATTGGGAACGGACCTGCATTTGGTTGTGTT CTAATGAGGGATTTCCTTTCCGCATTAGCAAAGAGAGTAAAGCATAATCCAACTTCTTAT GAGAATTATCATAGGATTTATGTTCCTGATGGACTTCCTCTCAAATGTAAGCCTAAGGAG GCATTAAGGGTGAACGTTCTATTTCAACACATTCAAAATATGCTGACTGGTGAGAGTGCT GTGATTGCTGAGACGGGGGACTCGTGGTTCAACTGTCAGAAGCTGAAATTGCCACAAGGA TGCGGATATGAGTTCCAAATGCAGTATGGATCTATCGGTTGGTCTGTTGGTGCAACTCTT GGTTATGCACAAGCTGCACCAGAAAAACGGGTGATTGCCTGCATCGGTGATGGTAGCTTT CAGATGACTGCTCAAGATATTTCAACAATGCTAAGGTGTGGGCAGAGGACCATTATCTTC TTGATAAACAATGGTGGTTATACAATTGAAGTTGAGATCCATGATGGACCTTACAATGTG ATCAAGAATTGGAACTACACAGGATTAGTCGATGCAATCCATAACGGAGAAGGAAAATGT TGGACAACCAAGGTTTATTGTGAAGAAGAGTTGGTGGAAGCAATTGAAACAGCAAATGGA GCAAAGAAAGACTGTTTGTGTTTCATTGAAGTGATTGTCCACAAACATGACACTAGCAAA GAGCTACTTGAATGGGGTTCTAGGGTCTCAGCAGCTAATAGTCGTCCACCAAATCCACAG TAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc09g005110.3.1
PEP Infomation	Pyruvate decarboxylase (AHRD V3.3 *** Q8H9C6_SOLTU)
Sequence	MDFKIDTCKPINGDIANVPTNKAVTIQNSTIPFNSPDSTLGRHLARRLVQIGVTDVFSVP GDFNLTLLDHLIAEPELNLIGCCNELNAGYAADGYARARGIGACVVTFTVGGLSIVNAIA GAYSENLPLICMVGGPNSNDYGTNTILHHTIGLHDFSQELRCFQTVTCYQAVLNNLEDAH ELIDTAISTSLKESKPVYISVGCNLPGIPHPTFSREPVPFSLSPRLSNMMGLEAAVEAAA EFLNKSVKPVLVGGQNMRVAKACDAFVELADSCGYAVAVMPAAKGLVPEHHPHFLGTYWG AVSTTFCAEIVESADAYLFAGPIFNDYSSVGYSLLLKKDKVIIVQPDRVTIGNGPAFGCV LMRDFLSALAKRVKHNPTSYENYHRIYVPDGLPLKCKPKEALRVNVLFQHIQNMLTGESA VIAETGDSWFNCQKLKLPQGCGYEFQMQYGSIGWSVGATLGYAQAAPEKRVIACIGDGSF QMTAQDISTMLRCGQRTIIFLINNGGYTIEVEIHDGPYNVIKNWNYTGLVDAIHNGEGKC WTTKVYCEEELVEAIETANGAKKDCLCFIEVIVHKHDTSKELLEWGSRVSAANSRPPNPQ *

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc09g005110.3.1
Transcript Infomation	Pyruvate decarboxylase (AHRD V3.3 *** Q8H9C6_SOLTU)
Sequence	CTTGAATCGTTCACCCATACTTTCAACAAATTTTCAATAAAAAATAATAACGATTAAAGT TTAATTAAATTCATAAATATAAATGTATGTTTTTTCTATGCATATTTCTCACTTCATCTG TACTTCTGCCCCATGCTAATAAATACTACTAAAATCTATAAGTTGTTAAGTAAACCTCTA ATTATATAACTCCCTGAATCCGCCCCCTGTTTCTTCATAATCCAACACACTATATAACTC CCTCCATTTCTCACTCACAAAACAAATCAAATTCTTCATAAATAATGGACTTCAAAATCG ACACTTGCAAGCCAATAAATGGCGACATAGCAAACGTACCAACCAATAAAGCTGTTACAA TCCAAAACTCCACCATTCCATTCAATTCCCCTGACTCAACACTCGGCCGTCACCTTGCCC GCCGGTTAGTTCAGATCGGAGTAACCGACGTTTTCTCCGTTCCCGGTGATTTCAACTTGA CACTTCTCGATCATCTCATTGCTGAACCTGAACTTAACCTTATAGGTTGTTGTAATGAGC TAAATGCAGGCTATGCAGCTGATGGATATGCTAGGGCACGGGGAATTGGGGCTTGTGTTG TTACGTTTACCGTCGGTGGATTAAGTATCGTTAATGCAATTGCTGGTGCTTATAGTGAAA ATTTACCTTTGATTTGTATGGTTGGTGGACCTAATTCTAATGATTATGGAACTAATACAA TACTTCATCATACTATTGGTTTACATGATTTTAGTCAAGAGCTTCGTTGTTTTCAAACTG TGACTTGCTACCAGGCTGTGTTGAATAATTTAGAAGATGCTCATGAACTGATTGATACTG CAATTTCCACATCTTTGAAAGAGAGTAAGCCGGTTTATATTAGTGTAGGATGTAACTTGC CGGGGATTCCGCATCCTACGTTCAGTCGTGAACCAGTTCCGTTTTCCCTCTCTCCCAGAT TAAGTAATATGATGGGGTTGGAAGCAGCAGTAGAAGCAGCGGCTGAGTTCTTGAACAAAT CAGTAAAGCCAGTGCTTGTTGGAGGGCAAAATATGCGCGTTGCAAAGGCATGTGATGCTT TTGTTGAGCTGGCTGACAGCTGTGGTTACGCGGTGGCAGTGATGCCAGCCGCAAAAGGTT TGGTTCCGGAACACCATCCACATTTCTTAGGAACTTACTGGGGTGCAGTGAGCACGACCT TCTGTGCTGAAATTGTTGAATCTGCTGATGCCTACTTGTTTGCTGGACCAATTTTTAACG ACTATAGCTCTGTTGGTTATTCTCTTCTTCTCAAGAAAGACAAAGTGATCATTGTCCAGC CTGATCGTGTGACAATTGGGAACGGACCTGCATTTGGTTGTGTTCTAATGAGGGATTTCC TTTCCGCATTAGCAAAGAGAGTAAAGCATAATCCAACTTCTTATGAGAATTATCATAGGA TTTATGTTCCTGATGGACTTCCTCTCAAATGTAAGCCTAAGGAGGCATTAAGGGTGAACG TTCTATTTCAACACATTCAAAATATGCTGACTGGTGAGAGTGCTGTGATTGCTGAGACGG GGGACTCGTGGTTCAACTGTCAGAAGCTGAAATTGCCACAAGGATGCGGATATGAGTTCC AAATGCAGTATGGATCTATCGGTTGGTCTGTTGGTGCAACTCTTGGTTATGCACAAGCTG CACCAGAAAAACGGGTGATTGCCTGCATCGGTGATGGTAGCTTTCAGATGACTGCTCAAG ATATTTCAACAATGCTAAGGTGTGGGCAGAGGACCATTATCTTCTTGATAAACAATGGTG GTTATACAATTGAAGTTGAGATCCATGATGGACCTTACAATGTGATCAAGAATTGGAACT ACACAGGATTAGTCGATGCAATCCATAACGGAGAAGGAAAATGTTGGACAACCAAGGTTT ATTGTGAAGAAGAGTTGGTGGAAGCAATTGAAACAGCAAATGGAGCAAAGAAAGACTGTT TGTGTTTCATTGAAGTGATTGTCCACAAACATGACACTAGCAAAGAGCTACTTGAATGGG GTTCTAGGGTCTCAGCAGCTAATAGTCGTCCACCAAATCCACAGTAAAATGTTCAAAGAA TATTGAATTTGCTGCAAAGAATTCTTGCAATTTGAGAGTTGCCACTATATGTTGTAATGT TTTCTTGTGATTTTCGCAGGAAGGGTTTGTATTCCACTAAGTATTGCTTTTGTTAACTTG TTCATCCATTAATGCCTTTTCCTTTGAAACTCTTCCTTCTTTTTTTTTCCTACGTATTCG TATTGATTTTGGTTCACCGTCACACTCATGCAAATATTTGTTATATTCGAAATCTAAAAT GTTCTACCTGAGAACCAACGACCTTATTGGTCACGTCTAGCACCCGTTTAGGCTCAGGCC AGCAGTCCCGAATCCAATCATCGATTGATCTTGAAGTCTATGGCTTTCTGAGAAAACTAA GCGACCATTTTGCAGCAAAGAAGCAGGAAAGGGTGCTCCTTCTTAACATCTTCAAGACTG TCAAGACCTTCAACACGTGCCAACACTAAGAGGTGTTTCTGAGCCTGCACGAGAAAATAA ACCATATATGTATTTTTCAAATTCACAAGGGAGAAGGGCCAAAAAGCAGTGTGAGGGAGA GAAAGATAACCTTTGGATAAAGATCATTCAGTACTACAACATCATCTGACATCTCTATTA TATTCTTATGCCTCTCAGGATGCATTGCAGTGTCATAAAGAGCCTGAACCCATGAGCCCC ATGCCTTTCTTGACTGTCCACCAGTTTTTCCATCAACAGAACTTCCAACATTGGGGCCGA GTTCTTTCACAAAGCTTTTAAACTTCTTGTTCATGTCTGTTTCACAGACAGCTTCACGCT TGGCTTTCTGATCACCACTTCTAGAACCTTGCTCTAGTTGAACTTCTCCTTTAAATTCTT TGTCGAACTTATCCTTACATGACTCTTCTTGAGTCCTAACTATAGATGCAAAACCATCAA AGAGGGATGAGTAAGCTTCTCGGAGTATTTTACAGCCCTTGATGTAGTCATTGTCGAGAC AGTTTGGTCTTTGGGGATTCATATTTGGTCCAAGTACATGTATGACATGAGTAACTCCTT CCCCACTAAACAAGGGAGAGGAGGAAGGAAGAGGGACAACAATAGCTTTTCCAGAACTAA GAGATCCAGCTTTAGCTTTGGTTGCAGTTTCAAGAATGGGACCAGCAGCACTAAATATAG CAGCATTTACGCCTCCACCTCCTGGTTTTAGTCGCCTGAACAAAGTTGGCTCTTAGATGA GACGTAAAAAATTAACAACACATAATATCTGTGCAAGATAATACTTAAGGTGAAAACACG GGAAAGAGTGTGTAGACAGAATATTGTATTAAAACGAGTTGGTGAGATTACAATTAATTT GTATCAAGGACCTGCGGGACATTGTAAGGAAATTGATCTATCCGCAAGATTTTCTAGCAC CCTGCTATTTTAATGGATTGCATGCACACAACTCATCATCAATACCACGCGTGTGTACCA AATTGACTCATGAATCATGAAAGTAGATTTCTGCTGGATATATAAATCCTCCATATTGCA CCTCTGGCAAAAGAAGGTTATTTCAGGCACAAGGCTACACACTGTTCCATTTGTTTAACA TGCCATCAACCAGGCTTAAAACTGTTTGTCATTTGAAAAATAGCACTTCATCTCTCGGAA TACTTTCTTTTGCATCCAAACTTAAAGGTACAATTTGGAGGCTCCGAAAAGATGGCGTAC AATTGAATTTAATGTATTACCACTTGATCTACCTCACGACTTTCTTGTCACTAAACAAAA TCTCCACAAGAGAACATTCAAGCAGAAAGAAAAATGGAAGTTTCTGGTAAGCCTTTTGCA TAATTACATCAAGTTTCTCATTTTCACTAGCACAGTATCATGGTACAGAGAATTACCAGT TAGTGGCATTAGCAATCACGTTGCAGTGCAAACCTCCTTCTGAGTACAGTTTAGTTATAT TCCCGACAAACGTAAAGAACTTTTTGGAGTCGATGTTCTTCTCTGCAGCTTTATCCCTGA CAAGGGACAATATTTTTGAATGCTGAGATAAATCCACCAAGACAAGCCTAGCATTCCCAA GTTTATTTACATATTCCTCGACCTTTTCCACTATTATATCTGATGCTTTTTCAAGATTGA AATGGAAATCTGCTGTAGAAATAGATGGAAATGCAAGTGTTGGGGCATTTTCTAAAGAAA TGCTACTGCCAACAGATGCCATTTTCGGTTCTTCACAGCTTTCTAGTACTTGGTTGGAGT CCTTCTCCTTGGTGGCATGAGAAAGAGTATTGTCCCGAGAGACATTCATCACAGCATCAG AACATCCAGGAGGATCCTTTTTTTTGAGAAACTTCATTATACCAAGTTGGACTTTGGCAT CTGAGGTTTTCTGGCCGAAAAAGCCTGGTGGAAGTTTATCTGATGGACCAAGTGAAGTGT ACGTATTGATAGCACCTTGAACATCTTTTTCATCTTGGCAAACTGTAATTCTATCATACC CTTCATTCAGCTTAGGCAACTCTTTCTTTTGCAGCATCCTATTCACAACTGCAGCAGCTT TCCCACCTTGCAAATTTCCCTCATGCTCTGTCCTCTTAACCGACCGAGAAATACAAAGCT TAGCTGGAAGATCAAGTGCCACAGCGTGTTTCTCAACTTGTGGACCGACAAGCTTC