Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g079040.1.1
CDS Infomation	Exostosin family protein (AHRD V3.3 *** AT4G22580.1)
Sequence	ATGGAAACCAATTTCATCTTTTTTGTGTTTTTGCTGTTTATTTTGTCTGCAACTTGTCAA GATTCCGATCTTGAAACTGATTGCACAAACAAATGGATCCATATCAGGCATCTACCACCT CAATTCAATCTTGACCTTTTATCAAATTGCTCTGCATATCCTCTGTTTGATAATTTCTGT CCTTATTTAGCAAACCATGGCCTTGGTCAAAAGACTCACAACAAATCACACAGCTGGTAT CGCACTGATCCTTTTATGCTTGAGCTTGTTTTTCATCGTAGAATGCTTGAATACCCTTGT CTTACATCTGATCCTACTCATGCCAATGCAATTTATGTGCCTTATTATGGTGGTCTTGAT AGTCTTAAGTACTTGTATGGTCCTGAAATTAATTCAAGTTTTCAGCATGGTTTAGATTTG TATGATTTTCTTGTCCATGTTGATTCACCTAATATTTGGAGTAGAAATTATGGTCATGAT CATTTTATGGTTATGGCAAGGCCTGCTTGGGACTTTAATCAACCTTTGAATAGTGATCCT TTGTATTTTGGTACTTCATTTCTTGAATTGCCTGAGTTTTACAATGTGACTGCATTGACT CATGAGAGTAGAGCTTATCCTTGGCAAGAACAAGCTATTCCATATCCCACTTCATTTCAT CCTCCGAATTTAGCCTTTTTCGAATCTTGGGTGAATAGGTTAAGGAGGTCTAGGAGGACT ACATTGATGTTGTTTGCTGGTGGTGGTGGAATTTCAGCTAATCCTAATGTTAGGAGAAGT ATTAGACTTGAGTGTGAGAATGCTACTAGTATGAGTGCTAATGGAACAGGGTACGAGAAA TTGTGCGAATTTGTTGATTGTTCTAATGGGATTTGTCAACATGATCCTATAAGGTTTATG AAGCCAATGTTGCAAGCTACCTTTTGTTTACAACCTCCAGGGGACACACCGACTAGACGT TCCACGTTTGATGGGATTCTTGCAGGGTGTATTCCTGTGTTCTTTGAAGATTTGTCCGCG AAAAAACAGTATGGATGGCATTTACCAGAGGAGAAGTATGAAGAATTTTCAGTGTCGATA CCTAAAGAAGACGTTGTGTTTAAGGGGTTGAGCATTGTTGATGTTTTATCGAGTATACCT AGAGCTCAAGTTAGAAGGATGAGAGAAAAGGTTTTGGAAATGTTGCCTAGAGTTATGTAT AGAAAGCAGGGAAGTTCTTTGGGTTTAAGGAGTAAAAAAGATGCATTTGATATTGCAATT GAAGGCACTTTGGAAAGAATCAAGTCTAGGCTTCAAGAAATAGCAGCTCAATAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g079040.1.1
PEP Infomation	Exostosin family protein (AHRD V3.3 *** AT4G22580.1)
Sequence	METNFIFFVFLLFILSATCQDSDLETDCTNKWIHIRHLPPQFNLDLLSNCSAYPLFDNFC PYLANHGLGQKTHNKSHSWYRTDPFMLELVFHRRMLEYPCLTSDPTHANAIYVPYYGGLD SLKYLYGPEINSSFQHGLDLYDFLVHVDSPNIWSRNYGHDHFMVMARPAWDFNQPLNSDP LYFGTSFLELPEFYNVTALTHESRAYPWQEQAIPYPTSFHPPNLAFFESWVNRLRRSRRT TLMLFAGGGGISANPNVRRSIRLECENATSMSANGTGYEKLCEFVDCSNGICQHDPIRFM KPMLQATFCLQPPGDTPTRRSTFDGILAGCIPVFFEDLSAKKQYGWHLPEEKYEEFSVSI PKEDVVFKGLSIVDVLSSIPRAQVRRMREKVLEMLPRVMYRKQGSSLGLRSKKDAFDIAI EGTLERIKSRLQEIAAQ*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g079040.1.1
Transcript Infomation	Exostosin family protein (AHRD V3.3 *** AT4G22580.1)
Sequence	ATGGAAACCAATTTCATCTTTTTTGTGTTTTTGCTGTTTATTTTGTCTGCAACTTGTCAA GATTCCGATCTTGAAACTGATTGCACAAACAAATGGATCCATATCAGGCATCTACCACCT CAATTCAATCTTGACCTTTTATCAAATTGCTCTGCATATCCTCTGTTTGATAATTTCTGT CCTTATTTAGCAAACCATGGCCTTGGTCAAAAGACTCACAACAAATCACACAGCTGGTAT CGCACTGATCCTTTTATGCTTGAGCTTGTTTTTCATCGTAGAATGCTTGAATACCCTTGT CTTACATCTGATCCTACTCATGCCAATGCAATTTATGTGCCTTATTATGGTGGTCTTGAT AGTCTTAAGTACTTGTATGGTCCTGAAATTAATTCAAGTTTTCAGCATGGTTTAGATTTG TATGATTTTCTTGTCCATGTTGATTCACCTAATATTTGGAGTAGAAATTATGGTCATGAT CATTTTATGGTTATGGCAAGGCCTGCTTGGGACTTTAATCAACCTTTGAATAGTGATCCT TTGTATTTTGGTACTTCATTTCTTGAATTGCCTGAGTTTTACAATGTGACTGCATTGACT CATGAGAGTAGAGCTTATCCTTGGCAAGAACAAGCTATTCCATATCCCACTTCATTTCAT CCTCCGAATTTAGCCTTTTTCGAATCTTGGGTGAATAGGTTAAGGAGGTCTAGGAGGACT ACATTGATGTTGTTTGCTGGTGGTGGTGGAATTTCAGCTAATCCTAATGTTAGGAGAAGT ATTAGACTTGAGTGTGAGAATGCTACTAGTATGAGTGCTAATGGAACAGGGTACGAGAAA TTGTGCGAATTTGTTGATTGTTCTAATGGGATTTGTCAACATGATCCTATAAGGTTTATG AAGCCAATGTTGCAAGCTACCTTTTGTTTACAACCTCCAGGGGACACACCGACTAGACGT TCCACGTTTGATGGGATTCTTGCAGGGTGTATTCCTGTGTTCTTTGAAGATTTGTCCGCG AAAAAACAGTATGGATGGCATTTACCAGAGGAGAAGTATGAAGAATTTTCAGTGTCGATA CCTAAAGAAGACGTTGTGTTTAAGGGGTTGAGCATTGTTGATGTTTTATCGAGTATACCT AGAGCTCAAGTTAGAAGGATGAGAGAAAAGGTTTTGGAAATGTTGCCTAGAGTTATGTAT AGAAAGCAGGGAAGTTCTTTGGGTTTAAGGAGTAAAAAAGATGCATTTGATATTGCAATT GAAGGCACTTTGGAAAGAATCAAGTCTAGGCTTCAAGAAATAGCAGCTCAATAA