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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g076680.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9R9U2_RICCO)

Sequence

ATGCTAAAAAGGTCGAAACTTTCGATTCACATACGTGAAGAGCTAGGATCTCTGAATAGG
AACCCTACATTTGCATTTTGTACTTGTGTGACTGATGACAAGTGTGATAATGCTAAAGCA
AGAGGCGATGGGTCGGAGTCTGAGAATGAATGGGAAAGATTGCTTAAGCCTTTTGACTTC
AAACAACTCCAAAGATCACTCAATAAAATTACCCCGTATCAGCTCAATAAATTATTGGCA
CTCCCTTTGGATGTACCAACATCGATGGAGCTATTCCAGTGGGCCGGTAGCCAAACAAGC
TATTGCCACTCATTTGATGTCTACTTTACTTTAATTGATAAACTTGGGGCCGCCAAGGAA
TTTAAGATTATAGATAGATTGTTATTACGGATGAAAGATGAAGGGACAGTTTTCAAAGAG
TCCCTCTTTATTATGATAATGAGGCATTATGGAAGAGCTGGTTTACCAGGGCAAGCAACT
AGAATACTTTTGGATATGTGGAATACTTTCTCTTGTGAACCCACTTTCAAGTCATACAAT
CAAGCGTTGGATATTCTGTTAGCCGGAAATTGTCCCAAAGTTGCTCCAAATGTATTTTAT
GAAATGTTGGGGAAAGGTATTTCTCCTTCTGTATTCACTTTTGCTCGGGTGATACAAGCA
TTATGTATAGTCAATGAGGTAGACTCTGCTTGTTCACTTCTCAGAGACATGACAAAACAT
GGGTGTGTACCAAATTCAGTGATTTACCAGATTCTTATTCATGCTCTTTCAAAGTCTAAT
CGAGTAAATGATGCGTTAAAACTTTTGGAGGAGATGTTTCTTATGGGTTGCATGCCCGAC
GTCAATACTTTCAATGACATTATCCATGGGCTTTGCCGAGCTGATAGGATTCATGAGGCT
GCAAAACTGGTTGATCGGATGCTTCTTCGAGGTTTCACCCCCGATGCTATAACTTATGGC
ATTCTGATGCATGCTTTATGTCGAACAGGGCGAGTTGATGAAGCAAAGGTTCTTCTCAAC
AAAGCACCTGAACAGAATAATGTCCTCTTCAATACGTTGATCAATGGTTATGTGACTAAT
GGCCGAGTTGATGAAGCAAAAACCATTCTGAATGAGAACATGTTGATTAAAGGTTATCAA
CCAGATGTTTATACATACAACATTCTAATTCGAGGTCTTTGCAAGAAAGGAATTTTGTCT
TCGGCTCATGAAGCTGTAAGCGAAATGTCATCCCAAGGTATCCAGCCCAATGCAATTACG
TACACAACCTTGATTGATGGCTTCTCAAAGGCTGGCCGCCTACAGGAAGCTTATGACCTT
GTTACTGAGATGTCAGCAAAAAGTCTCAGCCTAAATATAATGGGTTATAACTCTCTTATA
TCAGCTCTGAGTAAACAAGGAATGATCCAACAGGCATTAGAAATTTTTGGTGATATGTCA
AACAACGGATGTAAACCAGACATTTTTACATTCAATGCTTTGATTTTAGGCTTTTGCAAG
ATTGACAAGATGGATGAAGCTTTGGGGATATACCGGGATATGTTCCAGGAAGGAGTTATT
GTTAATACAGTCACCTACAACACATTGATTCATGCTTTCTTGAGGAAAGGTAAAACCCAA
GAGGCGCTTAAGCTTGTAAATGATATGTTATTCAGAGGATGTCCCCTTGATGAGATCACA
TACAATGGCCTCATAAAAGCACTTTGCAATGATGGAGCAGTTGAGAGAGCATTAGGGCTT
TTTGAAGAGATGATGAGAAAAGGATCAAAACCTAATCATGTAACGTGCAACATCTTGATC
AACGGCTTTTGCAGAATAGGTAAGGTTCAAAATGCCCTTGAGTTTCTGAGAGACCTGATA
CAACGTGGATTGACACCTGATATAGTCACATATAACAGTCTAATAAATGGCCTTTGTAAC
AATGGTCGAATTCGAGAAGCTCAGAACCTCTTTGAAAAATTAGAACTTGAAGGAGTTTGT
CCTGATACTATCACTTATAACACCTTGATTTCTTCCTATTGTAAAATGCGCATGCTTGAT
GATGCTTATACCCTGTTTACTAGAGGTATAGCTGTTGGTTTCATTCCCAATAGTGTCACA
TGGTACATATTAGTTAGAAATTTTGTTCGAAAGAGTTATGAGTCATGTTCTTTTGTTGTC
CGTTCGAAAGAACAGACAACATCTTGTGATCGAGTGTCTTTCTTTTTCCTTAATGCTTGT
GATTCCTGTCTTCGATGTGCAGTAATAGAAGAGTTCTTTGTGATTTTGTGCAAAGAATCA
TATGAAACTTTAACTTCTGTTATAAAGAAAATTACATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g076680.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9R9U2_RICCO)

Sequence

MLKRSKLSIHIREELGSLNRNPTFAFCTCVTDDKCDNAKARGDGSESENEWERLLKPFDF
KQLQRSLNKITPYQLNKLLALPLDVPTSMELFQWAGSQTSYCHSFDVYFTLIDKLGAAKE
FKIIDRLLLRMKDEGTVFKESLFIMIMRHYGRAGLPGQATRILLDMWNTFSCEPTFKSYN
QALDILLAGNCPKVAPNVFYEMLGKGISPSVFTFARVIQALCIVNEVDSACSLLRDMTKH
GCVPNSVIYQILIHALSKSNRVNDALKLLEEMFLMGCMPDVNTFNDIIHGLCRADRIHEA
AKLVDRMLLRGFTPDAITYGILMHALCRTGRVDEAKVLLNKAPEQNNVLFNTLINGYVTN
GRVDEAKTILNENMLIKGYQPDVYTYNILIRGLCKKGILSSAHEAVSEMSSQGIQPNAIT
YTTLIDGFSKAGRLQEAYDLVTEMSAKSLSLNIMGYNSLISALSKQGMIQQALEIFGDMS
NNGCKPDIFTFNALILGFCKIDKMDEALGIYRDMFQEGVIVNTVTYNTLIHAFLRKGKTQ
EALKLVNDMLFRGCPLDEITYNGLIKALCNDGAVERALGLFEEMMRKGSKPNHVTCNILI
NGFCRIGKVQNALEFLRDLIQRGLTPDIVTYNSLINGLCNNGRIREAQNLFEKLELEGVC
PDTITYNTLISSYCKMRMLDDAYTLFTRGIAVGFIPNSVTWYILVRNFVRKSYESCSFVV
RSKEQTTSCDRVSFFFLNACDSCLRCAVIEEFFVILCKESYETLTSVIKKIT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g076680.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9R9U2_RICCO)

Sequence

ATGCTAAAAAGGTCGAAACTTTCGATTCACATACGTGAAGAGCTAGGATCTCTGAATAGG
AACCCTACATTTGCATTTTGTACTTGTGTGACTGATGACAAGTGTGATAATGCTAAAGCA
AGAGGCGATGGGTCGGAGTCTGAGAATGAATGGGAAAGATTGCTTAAGCCTTTTGACTTC
AAACAACTCCAAAGATCACTCAATAAAATTACCCCGTATCAGCTCAATAAATTATTGGCA
CTCCCTTTGGATGTACCAACATCGATGGAGCTATTCCAGTGGGCCGGTAGCCAAACAAGC
TATTGCCACTCATTTGATGTCTACTTTACTTTAATTGATAAACTTGGGGCCGCCAAGGAA
TTTAAGATTATAGATAGATTGTTATTACGGATGAAAGATGAAGGGACAGTTTTCAAAGAG
TCCCTCTTTATTATGATAATGAGGCATTATGGAAGAGCTGGTTTACCAGGGCAAGCAACT
AGAATACTTTTGGATATGTGGAATACTTTCTCTTGTGAACCCACTTTCAAGTCATACAAT
CAAGCGTTGGATATTCTGTTAGCCGGAAATTGTCCCAAAGTTGCTCCAAATGTATTTTAT
GAAATGTTGGGGAAAGGTATTTCTCCTTCTGTATTCACTTTTGCTCGGGTGATACAAGCA
TTATGTATAGTCAATGAGGTAGACTCTGCTTGTTCACTTCTCAGAGACATGACAAAACAT
GGGTGTGTACCAAATTCAGTGATTTACCAGATTCTTATTCATGCTCTTTCAAAGTCTAAT
CGAGTAAATGATGCGTTAAAACTTTTGGAGGAGATGTTTCTTATGGGTTGCATGCCCGAC
GTCAATACTTTCAATGACATTATCCATGGGCTTTGCCGAGCTGATAGGATTCATGAGGCT
GCAAAACTGGTTGATCGGATGCTTCTTCGAGGTTTCACCCCCGATGCTATAACTTATGGC
ATTCTGATGCATGCTTTATGTCGAACAGGGCGAGTTGATGAAGCAAAGGTTCTTCTCAAC
AAAGCACCTGAACAGAATAATGTCCTCTTCAATACGTTGATCAATGGTTATGTGACTAAT
GGCCGAGTTGATGAAGCAAAAACCATTCTGAATGAGAACATGTTGATTAAAGGTTATCAA
CCAGATGTTTATACATACAACATTCTAATTCGAGGTCTTTGCAAGAAAGGAATTTTGTCT
TCGGCTCATGAAGCTGTAAGCGAAATGTCATCCCAAGGTATCCAGCCCAATGCAATTACG
TACACAACCTTGATTGATGGCTTCTCAAAGGCTGGCCGCCTACAGGAAGCTTATGACCTT
GTTACTGAGATGTCAGCAAAAAGTCTCAGCCTAAATATAATGGGTTATAACTCTCTTATA
TCAGCTCTGAGTAAACAAGGAATGATCCAACAGGCATTAGAAATTTTTGGTGATATGTCA
AACAACGGATGTAAACCAGACATTTTTACATTCAATGCTTTGATTTTAGGCTTTTGCAAG
ATTGACAAGATGGATGAAGCTTTGGGGATATACCGGGATATGTTCCAGGAAGGAGTTATT
GTTAATACAGTCACCTACAACACATTGATTCATGCTTTCTTGAGGAAAGGTAAAACCCAA
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TACAATGGCCTCATAAAAGCACTTTGCAATGATGGAGCAGTTGAGAGAGCATTAGGGCTT
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AACGGCTTTTGCAGAATAGGTAAGGTTCAAAATGCCCTTGAGTTTCTGAGAGACCTGATA
CAACGTGGATTGACACCTGATATAGTCACATATAACAGTCTAATAAATGGCCTTTGTAAC
AATGGTCGAATTCGAGAAGCTCAGAACCTCTTTGAAAAATTAGAACTTGAAGGAGTTTGT
CCTGATACTATCACTTATAACACCTTGATTTCTTCCTATTGTAAAATGCGCATGCTTGAT
GATGCTTATACCCTGTTTACTAGAGGTATAGCTGTTGGTTTCATTCCCAATAGTGTCACA
TGGTACATATTAGTTAGAAATTTTGTTCGAAAGAGTTATGAGTCATGTTCTTTTGTTGTC
CGTTCGAAAGAACAGACAACATCTTGTGATCGAGTGTCTTTCTTTTTCCTTAATGCTTGT
GATTCCTGTCTTCGATGTGCAGTAATAGAAGAGTTCTTTGTGATTTTGTGCAAAGAATCA
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