Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g075830.3.1
CDS Infomation	Peroxidase (AHRD V3.3 *** K4CMV0_SOLLC)
Sequence	ATGGCAACATTAACATTTCTTTCATTTCTCATTCTTCAACTCTTTTTGATTACTAATAAT TGTGAAGGTGTAGAAGTAGGATTCTACAAGAAAACATGTCCAAATGTGGAAGCAATTGTC AAAGAAACAACAAAACACTACATTTCTATTGCTCCTACTTTGGCTGCCCCTTTGTTAAGA ATGCACTTCCATGATTGTTTTGTTAGGGGATGTGATGGTTCGGTGCTACTAAATTCAACA AAAGGAAATAAAGCAGAGAAAGATGCAATTCCAAATCAAAGCCTAAGAGGATTTCAAGTG ATAGATGCTGCTAAATCTGCTTTGGAAAAAGAGTGTCCTGGCATTGTATCTTGCTCTGAT ATTCTAGCCTTAGCTGCTCGTGACGCTGTTTCACTGATAAATGGACCAACATGGTCAGTC CCCTTAGGTAGAAGAGATGGAAGAGTCTCAATTCTTTCAGAGGCCTCAAAAAACCTACCA ACTCCTTTTGATAACTTCACTACTCTCAAAACTACATTTGGTGCATTGGGACTAAATGTT AAAGACCTTGTTGTTCTATCAGGAGGACACACAATTGGGATGTCACATTGTTTTTCCTTT TCGAGTCGTTTGTATAATTTCACTGGCAAAGGTGATATGGATCCAAACATGGATCAAAAC TACATTAATCATTTGAAGATCAAATGTAAACCTGGAGATGTGACAACAATTGTTGAAATG GATCCTGGAAGTTTCAAGAGTTTCGACGCTGATTATTACACTATGATTGCCAAAAGAAGA GGATTGTTCGCGTCTGATGCAGCTCTTCTTAGCAATACTCAAACAAAAGAATATGTTTTA TCACAATTAAATCGTCATGGATCAACTTTCTTTGAGGATTTTGGTGAATCAATGGTGAAA ATGGGACAAATTGGAGTCCTTACTGGGAATGCAGGGGAAATTCGAAAACATTGTGCCTTC AGAAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g075830.3.1
PEP Infomation	Peroxidase (AHRD V3.3 *** K4CMV0_SOLLC)
Sequence	MATLTFLSFLILQLFLITNNCEGVEVGFYKKTCPNVEAIVKETTKHYISIAPTLAAPLLR MHFHDCFVRGCDGSVLLNSTKGNKAEKDAIPNQSLRGFQVIDAAKSALEKECPGIVSCSD ILALAARDAVSLINGPTWSVPLGRRDGRVSILSEASKNLPTPFDNFTTLKTTFGALGLNV KDLVVLSGGHTIGMSHCFSFSSRLYNFTGKGDMDPNMDQNYINHLKIKCKPGDVTTIVEM DPGSFKSFDADYYTMIAKRRGLFASDAALLSNTQTKEYVLSQLNRHGSTFFEDFGESMVK MGQIGVLTGNAGEIRKHCAFRN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g075830.3.1
Transcript Infomation	Peroxidase (AHRD V3.3 *** K4CMV0_SOLLC)
Sequence	CTATCATTTTAATAAATCAAAGGATTGATATCATAATTTGTTTCCTATTTAAACAGCATG CATTTGTGTGTTTCAATCATCAATCACTTCAAGATTTTAAATTTTCTCCACAAAAATTAA TATAATGGCAACATTAACATTTCTTTCATTTCTCATTCTTCAACTCTTTTTGATTACTAA TAATTGTGAAGGTGTAGAAGTAGGATTCTACAAGAAAACATGTCCAAATGTGGAAGCAAT TGTCAAAGAAACAACAAAACACTACATTTCTATTGCTCCTACTTTGGCTGCCCCTTTGTT AAGAATGCACTTCCATGATTGTTTTGTTAGGGGATGTGATGGTTCGGTGCTACTAAATTC AACAAAAGGAAATAAAGCAGAGAAAGATGCAATTCCAAATCAAAGCCTAAGAGGATTTCA AGTGATAGATGCTGCTAAATCTGCTTTGGAAAAAGAGTGTCCTGGCATTGTATCTTGCTC TGATATTCTAGCCTTAGCTGCTCGTGACGCTGTTTCACTGATAAATGGACCAACATGGTC AGTCCCCTTAGGTAGAAGAGATGGAAGAGTCTCAATTCTTTCAGAGGCCTCAAAAAACCT ACCAACTCCTTTTGATAACTTCACTACTCTCAAAACTACATTTGGTGCATTGGGACTAAA TGTTAAAGACCTTGTTGTTCTATCAGGAGGACACACAATTGGGATGTCACATTGTTTTTC CTTTTCGAGTCGTTTGTATAATTTCACTGGCAAAGGTGATATGGATCCAAACATGGATCA AAACTACATTAATCATTTGAAGATCAAATGTAAACCTGGAGATGTGACAACAATTGTTGA AATGGATCCTGGAAGTTTCAAGAGTTTCGACGCTGATTATTACACTATGATTGCCAAAAG AAGAGGATTGTTCGCGTCTGATGCAGCTCTTCTTAGCAATACTCAAACAAAAGAATATGT TTTATCACAATTAAATCGTCATGGATCAACTTTCTTTGAGGATTTTGGTGAATCAATGGT GAAAATGGGACAAATTGGAGTCCTTACTGGGAATGCAGGGGAAATTCGAAAACATTGTGC CTTCAGAAATTAAGAGAAACTTTGATTTTTTTAGTCATTTTTATTATTGTTTATGTTTCA ATTGAATAATCTTTTTCCCATGTCCTGATTGTATAGTGTAACTTGTAAGTTTTTATTTGA TTCTTAAGCATGTAACAAAATAAAAAAAACAAATATTGTGTTGGTTTTACTAGCTCGCAC TCTCATTTTGTTTTTGTTATTTTTAGTACATCAGACTGTCTTTTTGTTTTTAATTTCATA AAAAGTTAAAAAGAGTGTGTAACTAGCATGAGTAAATTCATAAGTAATCACTTTTTAGCC GTCTTTGTGATCGTTCTATTGTTAGCTAGATATATAGCTCAATTTCGTCTGCTTAAATGA AGTACAAAATGACAATTTTAACATTGCATGTTAGTAGAATTGAAGCTATACCA