Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g075530.3.1
CDS Infomation	Alpha glucosidase-like protein (AHRD V3.3 *** Q93Y12_ARATH)
Sequence	ATGGACAAGCTACCATTTCCAAATAGCATTATTATATCACCAAAATGTCACTTCACTACT CTTTGCTTTGTAAATGTTAGGGTTTCAAATGGGTCTTTGAAAAAGAAGAAGCCAAAGCTC TTGAATTGCGCTAATCTGCTCAGTTCTACAAGTGTATCTTCGATTCATCGTTTAATCAGA GGGAGGAGTGTTAATAAGGGGTTTATTGGTGCAAGTTTTGTTATGTTGAAGATGGGTGGA ATAGAAGGTACAACTGCAATGTCTGATGCGAGAACGGGGAACATGATTTTCGAATCTATT TTGGAGGAAGGAGTCTTTCGTTTTGATTGCTCTGCAGATGATAGAAATGCAGCATTTCCG AGTATTTCCTTTGTTGATCCAAAAGTTAGGGAGACACCGTTAATGTCTATACATAAAGTT CCATCATATATTCCTACTTTTGAATGTGTCAGGGGACAACAAATTGTAAATATTGAGCTT CCATCAGGTACCTCATTCTATGGAACTGGGGAGGTAAGTGGTCAGCTTGAAAGAACTGGG AAAAGGATTTTGACATGGAATACTGATGCATGGGGTTATGGTCCGGGAACTACGTCCTTG TATCAATCACACCCGTGGGTGCTTGCTGTTCTTCCCAGTGGCGAGACACTTGGAGTTCTG GCAGATACAACACATCGATGTGAGGTTGACTTGCGACAAGAATCCAATATAAGATTTATC AGTCGACAGTCCTTCCCTGTTATTACATTTGGCCCATTTCCTTCACCAATTGATGTTCTT GTATCCCTCTCTCATGCTATCGGAACTGTGTTTATGCCTCCAAAGTGGTCCTTGGGTTAT CACCAATGCCGATGGAGCTATGTTCCGGATACTCGTGTTCGTGAGATTGCAAGGACCTTT CGGGAGAAGAAGATTCCCTGTGATGTCATATGGATGGACATTGACTACATGAACGGTTTT CGATGTTTTACATTTGATAAGGAGCGTTTTCCTGATCCAGAGTCCCTTGTGGAAGAACTT CATAAATCAGGTTTCAAAGCAATCTGGATGCTTGATCCAGGGATTAAGAATGAAAAGGGA TATTTTGCTTATGATAGTGGTTCTGAAGCAGATGTATGGGTTCAAACAGCGGATGGGAGG CCTTATGTTGGTGACGTGTGGCCTGGGCCTTGTGTGTTTCCGGATTTCACTCAATTGAAA GCCAGATCATGGTGGGCTAACCTAGTTAAAGATTTCATTTCCAATGGTGTGGACGGTATA TGGAATGACATGAACGAACCAGCTGTTTTTAAGACAGTAACAAAGACAATGCCGGAGAAT AATATTCACAGGGGAGATCCTGAATTTGGAGGTTGCCAGAATCATTCATACTATCACAAT GTTTATGGGATGCTCATGGCACGATCAACCTATGAAGGAATGAAGCTAGCTAATGGAAAT AAACGTCCTTTTGTTCTCACACGGGCTGGATTTGTGGGTAGCCAGAGGTATGCTGCTACA TGGACAGGGGATAACCTTTCTACATGGGAGCACTTGCAGATGAGTATCCCCATGGTTCTT CAACTGGGGCTCAGTGGTCAGCCACTTACAGGACCAGATATAGGTGGCTTTGCTGGAAAT GCAACTCCCCGGATGTTTGGGAGGTGGATGGGTGTTGGTTCCCTGTTTCCCTTCTGCCGT GCCCATTCTGAGGCTGACACAAATGATCACGAACCTTGGTCATTTGGGGAGGAGTGCGAG GAAGTTTGCCGCTTGGCATTGGAGCGGCGCTACCGTCTTCTACCACACATTTACACACTC TTTTACTTAGCACACACGAGGGGTACTCCGGTCTCTGCTCCTATCTTTTTTGCTGATCCA AAAGACCCCGAGCTGAGGAAACTTGAGAACTCATTTTTGCTGGGACCAATTCTTATATAT GCAAGCACTCAGCGTGATGAGGAATTGGATACAGCTCATCACAAATTACCAAGGGGCATT TGGTTGAGTTTTGATTTTGACGATTCACATCCGGATTTACCTGCACTATATTTGCTTGGT GGATCAATCATCCCTGTCGGTCCACTTTATCAGCATGTGGGTCAAGCTGATCCTAGTGAT GATTTAACATTACTCATCGCCCTGGATGAAAATGGTAAAGCTGAAGGTCTTCTTTTCGAA GATGATGGTGATGGATATGAATATAGCCAAGGTGGATATCTTTTGACGACATATGTTGCT GAGCTTCAGTCTTCTGTTGTTACTGTGCAAGTCGCCAAAACAGAAGGAAATTGGAGAAGG CCAAAGCGCCGATTGCATGTTAGAATATTGCTGGGTAAAGGTGCTATGCTTGATGCTTGG GGTTCTGATGGAGAGATTATACAATTAGCAATGCCATCAGAAACTGATGTATCAAATTTG GTTTCTGAAAGTGAAGAGAAGTACAGAAATCGTCTGGAAGGTGCTAAACGTATACCAGAC GTGGAAACTATCTCTGGACATAAAGGAGTAGAACTTTCAAGGACTCCAGTTGTTCTGAAG AGTGGTGATTGGGAGCTGAAAGCGGTCCCTTGGATAGGTGGTAGAATCCTTTCTATGGAC CATGTTCCTTCAGGAACTCAATGGCTTCACAGCCGGGTGGAAATAAATGGGTATGAAGAA TATAGTAACCGTGAATACAGATCAGCTGGATGTACCGAGGAGTATTCAGTTATTGAACGA GATCTGGAACAGGAAGGAGAATCAGAGTCTCTTAGGCTGGAAGGTGATATAGGTGGTGGA TTATTTATGGAACGATATATATCTTTGCCAAAAGACAACTCCAAGGTTTTCCGCATTGAT TCTGGAATTGTAGCTCGTGGAGTTGGTGCTGGTTCTGGAGGATTTTCTAGGCTTGTGTGC TTGCGTGTGCATCCAATGTTCACGTTGTTGCACCCAACTGAATCATACGTGTCCTTTACT TCCCTCAATGGGTCCAAGCATGAACTTTGGCCAGAATCTGGAGAACAAGTGTTTGAAGGA GATCTTCGCCCAAAGGGTGAATGGATGCTTGTTGATAGATGTCTTGGTCTGGGATTAGTC AATCGATTCAACATCGATCAAGTACACAAATGTATGGTGCATTGGGGTACCGGAACAGTG AATCTAGAGCTCTGGTCTGAAGAAAGGCCTGTCTCAAAGGACTCACCTCTTAAAATATCT CACGAGTACGAAGTGCAAAAGATAGCCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g075530.3.1
PEP Infomation	Alpha glucosidase-like protein (AHRD V3.3 *** Q93Y12_ARATH)
Sequence	MDKLPFPNSIIISPKCHFTTLCFVNVRVSNGSLKKKKPKLLNCANLLSSTSVSSIHRLIR GRSVNKGFIGASFVMLKMGGIEGTTAMSDARTGNMIFESILEEGVFRFDCSADDRNAAFP SISFVDPKVRETPLMSIHKVPSYIPTFECVRGQQIVNIELPSGTSFYGTGEVSGQLERTG KRILTWNTDAWGYGPGTTSLYQSHPWVLAVLPSGETLGVLADTTHRCEVDLRQESNIRFI SRQSFPVITFGPFPSPIDVLVSLSHAIGTVFMPPKWSLGYHQCRWSYVPDTRVREIARTF REKKIPCDVIWMDIDYMNGFRCFTFDKERFPDPESLVEELHKSGFKAIWMLDPGIKNEKG YFAYDSGSEADVWVQTADGRPYVGDVWPGPCVFPDFTQLKARSWWANLVKDFISNGVDGI WNDMNEPAVFKTVTKTMPENNIHRGDPEFGGCQNHSYYHNVYGMLMARSTYEGMKLANGN KRPFVLTRAGFVGSQRYAATWTGDNLSTWEHLQMSIPMVLQLGLSGQPLTGPDIGGFAGN ATPRMFGRWMGVGSLFPFCRAHSEADTNDHEPWSFGEECEEVCRLALERRYRLLPHIYTL FYLAHTRGTPVSAPIFFADPKDPELRKLENSFLLGPILIYASTQRDEELDTAHHKLPRGI WLSFDFDDSHPDLPALYLLGGSIIPVGPLYQHVGQADPSDDLTLLIALDENGKAEGLLFE DDGDGYEYSQGGYLLTTYVAELQSSVVTVQVAKTEGNWRRPKRRLHVRILLGKGAMLDAW GSDGEIIQLAMPSETDVSNLVSESEEKYRNRLEGAKRIPDVETISGHKGVELSRTPVVLK SGDWELKAVPWIGGRILSMDHVPSGTQWLHSRVEINGYEEYSNREYRSAGCTEEYSVIER DLEQEGESESLRLEGDIGGGLFMERYISLPKDNSKVFRIDSGIVARGVGAGSGGFSRLVC LRVHPMFTLLHPTESYVSFTSLNGSKHELWPESGEQVFEGDLRPKGEWMLVDRCLGLGLV NRFNIDQVHKCMVHWGTGTVNLELWSEERPVSKDSPLKISHEYEVQKIA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g075530.3.1
Transcript Infomation	Alpha glucosidase-like protein (AHRD V3.3 *** Q93Y12_ARATH)
Sequence	ACATATCACTTTTTTTGATGGATGTTCGTTCAATATTTATATTATTTGATTCGTATTGAT TTAATATAAATTTTGATGAATTTTTTAATATGAATGCGTATGTTAGACTTACAACAAAAT TAAATTTTATCAAGGTTTCGGTTGAGGAAGCCATATATGGACAAGCTACCATTTCCAAAT AGCATTATTATATCACCAAAATGTCACTTCACTACTCTTTGCTTTGTAAATGTTAGGGTT TCAAATGGGTCTTTGAAAAAGAAGAAGCCAAAGCTCTTGAATTGCGCTAATCTGCTCAGT TCTACAAGTGTATCTTCGATTCATCGTTTAATCAGAGGGAGGAGTGTTAATAAGGGGTTT ATTGGTGCAAGTTTTGTTATGTTGAAGATGGGTGGAATAGAAGGTACAACTGCAATGTCT GATGCGAGAACGGGGAACATGATTTTCGAATCTATTTTGGAGGAAGGAGTCTTTCGTTTT GATTGCTCTGCAGATGATAGAAATGCAGCATTTCCGAGTATTTCCTTTGTTGATCCAAAA GTTAGGGAGACACCGTTAATGTCTATACATAAAGTTCCATCATATATTCCTACTTTTGAA TGTGTCAGGGGACAACAAATTGTAAATATTGAGCTTCCATCAGGTACCTCATTCTATGGA ACTGGGGAGGTAAGTGGTCAGCTTGAAAGAACTGGGAAAAGGATTTTGACATGGAATACT GATGCATGGGGTTATGGTCCGGGAACTACGTCCTTGTATCAATCACACCCGTGGGTGCTT GCTGTTCTTCCCAGTGGCGAGACACTTGGAGTTCTGGCAGATACAACACATCGATGTGAG GTTGACTTGCGACAAGAATCCAATATAAGATTTATCAGTCGACAGTCCTTCCCTGTTATT ACATTTGGCCCATTTCCTTCACCAATTGATGTTCTTGTATCCCTCTCTCATGCTATCGGA ACTGTGTTTATGCCTCCAAAGTGGTCCTTGGGTTATCACCAATGCCGATGGAGCTATGTT CCGGATACTCGTGTTCGTGAGATTGCAAGGACCTTTCGGGAGAAGAAGATTCCCTGTGAT GTCATATGGATGGACATTGACTACATGAACGGTTTTCGATGTTTTACATTTGATAAGGAG CGTTTTCCTGATCCAGAGTCCCTTGTGGAAGAACTTCATAAATCAGGTTTCAAAGCAATC TGGATGCTTGATCCAGGGATTAAGAATGAAAAGGGATATTTTGCTTATGATAGTGGTTCT GAAGCAGATGTATGGGTTCAAACAGCGGATGGGAGGCCTTATGTTGGTGACGTGTGGCCT GGGCCTTGTGTGTTTCCGGATTTCACTCAATTGAAAGCCAGATCATGGTGGGCTAACCTA GTTAAAGATTTCATTTCCAATGGTGTGGACGGTATATGGAATGACATGAACGAACCAGCT GTTTTTAAGACAGTAACAAAGACAATGCCGGAGAATAATATTCACAGGGGAGATCCTGAA TTTGGAGGTTGCCAGAATCATTCATACTATCACAATGTTTATGGGATGCTCATGGCACGA TCAACCTATGAAGGAATGAAGCTAGCTAATGGAAATAAACGTCCTTTTGTTCTCACACGG GCTGGATTTGTGGGTAGCCAGAGGTATGCTGCTACATGGACAGGGGATAACCTTTCTACA TGGGAGCACTTGCAGATGAGTATCCCCATGGTTCTTCAACTGGGGCTCAGTGGTCAGCCA CTTACAGGACCAGATATAGGTGGCTTTGCTGGAAATGCAACTCCCCGGATGTTTGGGAGG TGGATGGGTGTTGGTTCCCTGTTTCCCTTCTGCCGTGCCCATTCTGAGGCTGACACAAAT GATCACGAACCTTGGTCATTTGGGGAGGAGTGCGAGGAAGTTTGCCGCTTGGCATTGGAG CGGCGCTACCGTCTTCTACCACACATTTACACACTCTTTTACTTAGCACACACGAGGGGT ACTCCGGTCTCTGCTCCTATCTTTTTTGCTGATCCAAAAGACCCCGAGCTGAGGAAACTT GAGAACTCATTTTTGCTGGGACCAATTCTTATATATGCAAGCACTCAGCGTGATGAGGAA TTGGATACAGCTCATCACAAATTACCAAGGGGCATTTGGTTGAGTTTTGATTTTGACGAT TCACATCCGGATTTACCTGCACTATATTTGCTTGGTGGATCAATCATCCCTGTCGGTCCA CTTTATCAGCATGTGGGTCAAGCTGATCCTAGTGATGATTTAACATTACTCATCGCCCTG GATGAAAATGGTAAAGCTGAAGGTCTTCTTTTCGAAGATGATGGTGATGGATATGAATAT AGCCAAGGTGGATATCTTTTGACGACATATGTTGCTGAGCTTCAGTCTTCTGTTGTTACT GTGCAAGTCGCCAAAACAGAAGGAAATTGGAGAAGGCCAAAGCGCCGATTGCATGTTAGA ATATTGCTGGGTAAAGGTGCTATGCTTGATGCTTGGGGTTCTGATGGAGAGATTATACAA TTAGCAATGCCATCAGAAACTGATGTATCAAATTTGGTTTCTGAAAGTGAAGAGAAGTAC AGAAATCGTCTGGAAGGTGCTAAACGTATACCAGACGTGGAAACTATCTCTGGACATAAA GGAGTAGAACTTTCAAGGACTCCAGTTGTTCTGAAGAGTGGTGATTGGGAGCTGAAAGCG GTCCCTTGGATAGGTGGTAGAATCCTTTCTATGGACCATGTTCCTTCAGGAACTCAATGG CTTCACAGCCGGGTGGAAATAAATGGGTATGAAGAATATAGTAACCGTGAATACAGATCA GCTGGATGTACCGAGGAGTATTCAGTTATTGAACGAGATCTGGAACAGGAAGGAGAATCA GAGTCTCTTAGGCTGGAAGGTGATATAGGTGGTGGATTATTTATGGAACGATATATATCT TTGCCAAAAGACAACTCCAAGGTTTTCCGCATTGATTCTGGAATTGTAGCTCGTGGAGTT GGTGCTGGTTCTGGAGGATTTTCTAGGCTTGTGTGCTTGCGTGTGCATCCAATGTTCACG TTGTTGCACCCAACTGAATCATACGTGTCCTTTACTTCCCTCAATGGGTCCAAGCATGAA CTTTGGCCAGAATCTGGAGAACAAGTGTTTGAAGGAGATCTTCGCCCAAAGGGTGAATGG ATGCTTGTTGATAGATGTCTTGGTCTGGGATTAGTCAATCGATTCAACATCGATCAAGTA CACAAATGTATGGTGCATTGGGGTACCGGAACAGTGAATCTAGAGCTCTGGTCTGAAGAA AGGCCTGTCTCAAAGGACTCACCTCTTAAAATATCTCACGAGTACGAAGTGCAAAAGATA GCCTAAAACTCTCACCCAGCATTGACCACTTGTTCAATGAGCATTTTCTGGGATTGAAGA ACAGTATACATTTCCACAAGCTATGGCCTTATGTAGATGGTGTTAAGTCAATAAGAATGA CTCAGAAGTCATACTCACCTTCCTCCAGCTTATCATTGACAGTCCGTTCAGGGTTTCAAA CTCAATGATGCAACTAAACACGAGTTTTCCGAGAAAACCTTGGTGTGGTAGTCAGGGAAG AGCTTGTAGGGATAAGAGACAGAAGATTGTTAAACAGGACACTGTATATGATCCTGGAAA TGTCATTAGTTTTGGACTTTTGGTATGTAGACCAAACAATAAAATCAATGCAAGCCTATG CTATGATTTGACAATTCAAATAGCCTATGTAGAAAGGGGGACCTTGGGAAAAAGTAGTAA CT