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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g075350.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JUV7_CYNCS)

Sequence

ATGCAGAGGGTTTATTTCACATTCAATAATCATTTTGTGGACACTTTACTAAAACTAACT
CTCGGGTTGAACATAAAGAATAAAGAATGCTTACCATTCGAGCAACTCTCTCTTGTCCTC
GTGTATATACCTAACATATGTAGACTTCTAGTTTTGAGCAAATTTTACCATTTTCACTTT
CAAAAATATGGATCTAAAGCTCTCTTTTTTTGCCCATCACTGTCCAACAAAATCTCTCAA
CATGTACCACCTTTGCACCTCTCCTCTCATACCCTTTTCCCCAAAGATAACTTCTTTATT
ACATATGGGAAAGCTCAAGTCAATGCTTACACTTCCCCTGCCACCCACCAATTGTTTGAT
AAAGTGTCACAAAGAAGAATTCAAGATTTCAAGAATGGCAAAGGGGATGAAATATTTGAA
CTTGTTAACATGGTTAAAGAAAATCCTGATATCTTAAATGCTTCACAAGTACATGGCTTA
GTGCTTAAAGTAGGCATGCTTGCTCATTTGCCCACTGTTACTACATTCCTCATTATCTAC
TCAAGAGCCAAGAATTTAAGCTCTTCATTGACCCTTTTTGCTGAAATTATCAACAAAGAT
GTGGTTACCTGGAATGCTATCATGACAGCATGTATAGAGAACAATTCTTTTGCATTTGCA
GTGAATATCTTTGCTGAAATGGTGAATGGAGGAAAGCAGTTTGATTCTGCCACGCTTGTT
ATTGTCATTTCTGCATTATCTAACATGAGAGATTTCAGAAAGGGATTGGTTGTTCATTGT
TTAGGTATGAAAATGGGAATGCTTTGGGATTCAATCTTGGGAAATGCTCTGATTGACTTT
TATGCAAAGTGTAGTTATTTGAGCTCAGCGGAGTGTGTATTTATCGATATAGAATGTAAA
GATGTTGTTTCCTGGAATTCAGTAATTAGTGGTTGTCTTTATAATGGTAATCCTGAGAAG
TCTTTATTGTACTTTAGGCAGATGGCTAATTTGGAAAAGGGTGCTGATAGCGTGAGTCTC
TCTTGTGCTATCACTGCTTCTGCATGTTTAGATGAGTTTTATTGTGGTCATACTATTCAT
GGATGGGGTATAAAGCTAGGATATGAGGAGAGATGCCACCTTTCAGTGGCAAATTCCCTC
ATTTCATTGTATTTCCGATCTGGGGATACTGATGCTGCTGAATATATCTTTAATAAAATG
GAGTGTACGGATATAATAACATGGAATTCAATGATAAGTGGATTCGCTTTGAATGGAAAA
ATTACTGATGCATTTGATGCTCTTCATGAAATGCAGTTCATAAGGACCATAGAACTGGAT
GCTGTGACATTAATTTCCATTATCCCGCTAGTTGCAGAATTCATGCTATTGAGAGAAGGA
AAAGCTACTCATGCCTTTGCCATCCGTAGAGAGATGGGAGAAGAACTCTCCATGATGAAT
GCTCTCATGGATATGTATTTTAACTGCGGAAGGGTCAAGGACGCTGAGCAGCTTTTCTTA
AATATGCCAAAGAAAGATATAGTTTCATGGAATACCATAATCTCTGGGTATTCCCAGAAT
GGCTGGTGTAGAGAAGCTCAGTCATTGCTTAAGAAGTTTCACAGTGGGAGCTCAGAATGC
AGCCTGTCGACTCTCTTGGCTATTCTTCCTGCTTGTGATTCCCCCAACTTGATTCAATTT
GGTAAGTTGATCCATTCGTGGGAGGTGAAGTTGGGATTTGTAAATAATACCATCTTAGTA
AATTCGTTGATGTACATGTATACTTGTTCCGGTGATCTAGTAGCTTCTTTCAAATTGCTG
GAGGAGATAGCTTATACTGCTGATGTGGATAGCTGGAATACTGTGATTTCAGGATGCACA
CAGAATGGCCACTACTGGGAAGCTTTAAATGCTTTCAAGTTAATGAGACTCAAATCAAAT
ATCATCCATGATACTATTACTCTAGTCAATATCATACCAGCCTTTGGAGATCTTGAATTG
ACATGTGAAGGAAAGTCAATTCATGCCTTAGCTTTAAAGACCTCAGCTGGTCAAGACATT
CGTGTGCAGAATGCTCTTGTTACTATGTATGGAAAATTGAGTAACGTGAAAAGTGCAACA
AAAGTGTTTGAACTTTGCTTTTATCATAACTTGTGCTCTTGGAACTGCATGATATCTGCT
TTAGCTCAGAATAAAAATTCTAAAGAAGCAATAGAATTGTTCCGTTTGCTTGAGTTTAAA
CCAGACGAGATCACCATCGCTACCGTTCTTTCAGCTTGTCGGCAACTTGGAATTATTAGA
CATGGGAAACAGATCCATTCACACCTCATCAGATCTGGTTTTTACAAAAATGCTTTTGTA
TCAGCTGCTCTTGTGGATATGTATAGTAGCTGTGGCAGGTTAGACATTGCTCTTCAGGTA
TTCCAGAGTTCAGCCGAGAGATCTATTGCAGCTTGGAATTCAATGATCTCTGCATATGGT
TTCCACAGCAATGGTCAGAAAGCAATTGACATCTTTCATGAGATGATTAATTCGGGACTT
ACTCCGTCTAAAGTCACATTTATCAACTTATTAACAGCTTGCAGCCACACAGGGCTTGTT
GACCAAGGCTTCTGGTATTACAATCATATGCTTGATGAGTTTGGAGTTCAACGTTCCACA
GAGCATCATGTCTGCGTGGTTGATATGTTAGGCCGATCAGGGAGGCTGCACGAGGCATAT
AATTTTGTAAAAGAGCTTCCAATCCCACCTGATCCAGGAATCTGGGGTGCTTTGCTCAGT
GCTTGCAATTATCATGGTGATCTTCAATTAGGGAAAGAAGTAGCAAGTCTACTGTTTCTG
TTGGAACCTGAGAATGTCGGATATCATCTTGCATTATCCAACATATATGTTGCTACTGGA
AGCTGGAAGGAAGCTGGAGAATTGAGGGACATTGTTCATATAAAAGGGTTAAAGAAATCT
GCTGCTTATAGTATTATTGATCTTGGCTCCAAGCATTTAGTTGAGTGTCTACAAGAAACT
ATCCAGCTCCTATTGGCCTTTGCTGTGCTCCCACCTTTTTGGAGGGTGCACCTACGAGGG
GTAATTTTGATCCTTAACTATGCTTTTTCGATAGATCAATTTGCAATCCTTTGGAGTTAT
TATCTGAATGTTATGTATCTCAAATACTTCGCGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g075350.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JUV7_CYNCS)

Sequence

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SRAKNLSSSLTLFAEIINKDVVTWNAIMTACIENNSFAFAVNIFAEMVNGGKQFDSATLV
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ITDAFDALHEMQFIRTIELDAVTLISIIPLVAEFMLLREGKATHAFAIRREMGEELSMMN
ALMDMYFNCGRVKDAEQLFLNMPKKDIVSWNTIISGYSQNGWCREAQSLLKKFHSGSSEC
SLSTLLAILPACDSPNLIQFGKLIHSWEVKLGFVNNTILVNSLMYMYTCSGDLVASFKLL
EEIAYTADVDSWNTVISGCTQNGHYWEALNAFKLMRLKSNIIHDTITLVNIIPAFGDLEL
TCEGKSIHALALKTSAGQDIRVQNALVTMYGKLSNVKSATKVFELCFYHNLCSWNCMISA
LAQNKNSKEAIELFRLLEFKPDEITIATVLSACRQLGIIRHGKQIHSHLIRSGFYKNAFV
SAALVDMYSSCGRLDIALQVFQSSAERSIAAWNSMISAYGFHSNGQKAIDIFHEMINSGL
TPSKVTFINLLTACSHTGLVDQGFWYYNHMLDEFGVQRSTEHHVCVVDMLGRSGRLHEAY
NFVKELPIPPDPGIWGALLSACNYHGDLQLGKEVASLLFLLEPENVGYHLALSNIYVATG
SWKEAGELRDIVHIKGLKKSAAYSIIDLGSKHLVECLQETIQLLLAFAVLPPFWRVHLRG
VILILNYAFSIDQFAILWSYYLNVMYLKYFA*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g075350.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118JUV7_CYNCS)

Sequence

ATGCAGAGGGTTTATTTCACATTCAATAATCATTTTGTGGACACTTTACTAAAACTAACT
CTCGGGTTGAACATAAAGAATAAAGAATGCTTACCATTCGAGCAACTCTCTCTTGTCCTC
GTGTATATACCTAACATATGTAGACTTCTAGTTTTGAGCAAATTTTACCATTTTCACTTT
CAAAAATATGGATCTAAAGCTCTCTTTTTTTGCCCATCACTGTCCAACAAAATCTCTCAA
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AAAGTGTCACAAAGAAGAATTCAAGATTTCAAGAATGGCAAAGGGGATGAAATATTTGAA
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GTGCTTAAAGTAGGCATGCTTGCTCATTTGCCCACTGTTACTACATTCCTCATTATCTAC
TCAAGAGCCAAGAATTTAAGCTCTTCATTGACCCTTTTTGCTGAAATTATCAACAAAGAT
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GTGAATATCTTTGCTGAAATGGTGAATGGAGGAAAGCAGTTTGATTCTGCCACGCTTGTT
ATTGTCATTTCTGCATTATCTAACATGAGAGATTTCAGAAAGGGATTGGTTGTTCATTGT
TTAGGTATGAAAATGGGAATGCTTTGGGATTCAATCTTGGGAAATGCTCTGATTGACTTT
TATGCAAAGTGTAGTTATTTGAGCTCAGCGGAGTGTGTATTTATCGATATAGAATGTAAA
GATGTTGTTTCCTGGAATTCAGTAATTAGTGGTTGTCTTTATAATGGTAATCCTGAGAAG
TCTTTATTGTACTTTAGGCAGATGGCTAATTTGGAAAAGGGTGCTGATAGCGTGAGTCTC
TCTTGTGCTATCACTGCTTCTGCATGTTTAGATGAGTTTTATTGTGGTCATACTATTCAT
GGATGGGGTATAAAGCTAGGATATGAGGAGAGATGCCACCTTTCAGTGGCAAATTCCCTC
ATTTCATTGTATTTCCGATCTGGGGATACTGATGCTGCTGAATATATCTTTAATAAAATG
GAGTGTACGGATATAATAACATGGAATTCAATGATAAGTGGATTCGCTTTGAATGGAAAA
ATTACTGATGCATTTGATGCTCTTCATGAAATGCAGTTCATAAGGACCATAGAACTGGAT
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AATTCGTTGATGTACATGTATACTTGTTCCGGTGATCTAGTAGCTTCTTTCAAATTGCTG
GAGGAGATAGCTTATACTGCTGATGTGGATAGCTGGAATACTGTGATTTCAGGATGCACA
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GTAATTTTGATCCTTAACTATGCTTTTTCGATAGATCAATTTGCAATCCTTTGGAGTTAT
TATCTGAATGTTATGTATCTCAAATACTTCGCGTGA