Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g075030.3.1
CDS Infomation

Pectinacetylesterase family protein (AHRD V3.3 *** AT4G19420.2)
Sequence

ATGAAAATTGAGGTTGTTCATGAAATTCACATGAGGGGTTTGACAAAAACATTTTTTTTG
GCTTTGCTAGCACTACTTTGTATAACTCATGTTCTTGGCACCGATGATAATTATTCGTAC
ATTAATATCACAGTACTTCATAGTGCAACTGCCCAAGGCGCAGTATGTCTCGATGGAAGT
CCGCCAGCATATCATCTGGATAGGGGACATGGTACCGGACTTCACAGCTGGGTAATCTAC
TTAGATGGAGGCGGTTGGTGTAACAATATCTCAGATTGTCTTAATCGTTCAACTAAGTTC
TTAGGTTCTTCCACCAAGATGAAACGACAAAGTTTTTTTGGTGGGATACTTCATAATACC
TCCAAAGAAAATCCAGAGTTTCACAATTGGAATCGAGTGAGGGTGAAGTATTGTGATGGT
GCATCTTTCACTGGTGATGTTGAACAAATCAACCCTGAGAATAAGTTATATTTTCGAGGG
GCAAGAATATTTAAGGCAATTATGGAGGATTTATGGTGCAAAGGAATGAAAAATGCTGAA
AATGCAATTCTAACCGGAACATCAGCCGGAGGGTTGGCAACAATCTTGAACTGTGACAAG
TTCAAAAGCCTTCTTCCAGGGAGTGCCAGAGTAAAATGTGTTGCAAGTGCTGGCTTCTTC
ATCGACGGCAAGACAATAACTGGTACTTCACATATTCAAGAGATGTATGAAGAAATTGTT
AGCCTACATGGATCGGCCAAGAATTTACCATCAGCTTGCACGTCTGCAATGGAACCAAGT
TTGTGTTTTTTCCCTCAAAATGTTGTTTCATATATTCAGACTCCACTATTCATAATCAAC
TCAGTTTATGATTCCTGGCAGATTAATAACACTTTGGTTCCTTCGTACCTTGATCCTCAA
CATGCTTGGAAGGGTTGCATCAAGAACATAAGTAGTTGCACATCTAGCCAACTTATAATT
ATTCGAGCCTTCGGAGTTGAATTCTTGAAGATATTTGGCGCACTACCCCCTTGTTTTACA
AGGGGTTATTTCCTCACATCTTGCTATTCACATGGTGATATTCTATCAACATCATACTGG
TATAATACTACCTCTCCAAGGTTACTTAGTAAGACAATTGCTGAAGCTGTTGGGGATTGG
TACTTTGAGAGAGCAGGATTTCAACATATAGACCCGTATCCTGATGTTAAAAATTGCAAA
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g075030.3.1
PEP Infomation

Pectinacetylesterase family protein (AHRD V3.3 *** AT4G19420.2)
Sequence

MKIEVVHEIHMRGLTKTFFLALLALLCITHVLGTDDNYSYINITVLHSATAQGAVCLDGS
PPAYHLDRGHGTGLHSWVIYLDGGGWCNNISDCLNRSTKFLGSSTKMKRQSFFGGILHNT
SKENPEFHNWNRVRVKYCDGASFTGDVEQINPENKLYFRGARIFKAIMEDLWCKGMKNAE
NAILTGTSAGGLATILNCDKFKSLLPGSARVKCVASAGFFIDGKTITGTSHIQEMYEEIV
SLHGSAKNLPSACTSAMEPSLCFFPQNVVSYIQTPLFIINSVYDSWQINNTLVPSYLDPQ
HAWKGCIKNISSCTSSQLIIIRAFGVEFLKIFGALPPCFTRGYFLTSCYSHGDILSTSYW
YNTTSPRLLSKTIAEAVGDWYFERAGFQHIDPYPDVKNCK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g075030.3.1
Transcript Infomation

Pectinacetylesterase family protein (AHRD V3.3 *** AT4G19420.2)
Sequence

TGTGTATTCGTGGGAACACTCCTTTTACCTCTTTTTGTAAATGAAATCGGGTACAGATTT
TTTTTTCTTTGGATTTTTTTATGTAGAAGAATATGCTATTATTTGATCAGAACAAGTAAT
ATAATAAAAATGAAATTAGTTGTAAATTGCACTTTTGGATTTGAAAATATAGTTAAGTAG
TTCATATTCTTTTTTATTTTCTATCAAAATCTTTTAAATTTATCGTAGAGGCCTTTAATA
TATTAAATTATTAATTAATGATGAGTAAATTTATTGCATGAATCGTGTGATTGCCAATTT
TCATATATGCATTTAATAAAGGGAACACTTAAAAGAAAACCTTAAATTGAGGAGCTTTAA
ATTTAATATGAACCTCCTAAATTGCAGAGGTCTATATAAACCCTTCCGATTTTTGTGCAA
TGCTTCAAAATTAAAATTATATAATTTAAGTCGTTCACTTGATCATTTTCTCAAATTTAT
ATCGGAATTGAGTTTTACTCAACTTTCGTTAATTGAGTTTTACTCAACTTTCGTTTAATA
ACTAGCTTTATTCTTCAAATTCCGTCATACTATCCGGCCATTTATAGCTCTGATTACTTT
CGAATCAATCAAAATTACCCAATTTTCCAAATAATTATCATATTCATCCAAATCCCTCCT
TAAACCCAATCAAAATGTACTAAACTAACTATATCCATACAAATTAAACCCCCATTAACA
AACACATTGATTAACGATTAAAAGATGAAAATTGAGGTTGTTCATGAAATTCACATGAGG
GGTTTGACAAAAACATTTTTTTTGGCTTTGCTAGCACTACTTTGTATAACTCATGTTCTT
GGCACCGATGATAATTATTCGTACATTAATATCACAGTACTTCATAGTGCAACTGCCCAA
GGCGCAGTATGTCTCGATGGAAGTCCGCCAGCATATCATCTGGATAGGGGACATGGTACC
GGACTTCACAGCTGGGTAATCTACTTAGATGGAGGCGGTTGGTGTAACAATATCTCAGAT
TGTCTTAATCGTTCAACTAAGTTCTTAGGTTCTTCCACCAAGATGAAACGACAAAGTTTT
TTTGGTGGGATACTTCATAATACCTCCAAAGAAAATCCAGAGTTTCACAATTGGAATCGA
GTGAGGGTGAAGTATTGTGATGGTGCATCTTTCACTGGTGATGTTGAACAAATCAACCCT
GAGAATAAGTTATATTTTCGAGGGGCAAGAATATTTAAGGCAATTATGGAGGATTTATGG
TGCAAAGGAATGAAAAATGCTGAAAATGCAATTCTAACCGGAACATCAGCCGGAGGGTTG
GCAACAATCTTGAACTGTGACAAGTTCAAAAGCCTTCTTCCAGGGAGTGCCAGAGTAAAA
TGTGTTGCAAGTGCTGGCTTCTTCATCGACGGCAAGACAATAACTGGTACTTCACATATT
CAAGAGATGTATGAAGAAATTGTTAGCCTACATGGATCGGCCAAGAATTTACCATCAGCT
TGCACGTCTGCAATGGAACCAAGTTTGTGTTTTTTCCCTCAAAATGTTGTTTCATATATT
CAGACTCCACTATTCATAATCAACTCAGTTTATGATTCCTGGCAGATTAATAACACTTTG
GTTCCTTCGTACCTTGATCCTCAACATGCTTGGAAGGGTTGCATCAAGAACATAAGTAGT
TGCACATCTAGCCAACTTATAATTATTCGAGCCTTCGGAGTTGAATTCTTGAAGATATTT
GGCGCACTACCCCCTTGTTTTACAAGGGGTTATTTCCTCACATCTTGCTATTCACATGGT
GATATTCTATCAACATCATACTGGTATAATACTACCTCTCCAAGGTTACTTAGTAAGACA
ATTGCTGAAGCTGTTGGGGATTGGTACTTTGAGAGAGCAGGATTTCAACATATAGACCCG
TATCCTGATGTTAAAAATTGCAAATAATTACAAGTTCCTTGAGATACTAATGAAGTTTTA
GTACATATCAATGGATAGATGATATAGTTGTGGAGTGTGAATGTATACTAATTTACAACA
TCATCTTACTATAGTATAATTGTTCATTTTCAAGTCACTTATGTTTGATTTTGGACTTGT
ATCAATAGAAGATAACAGTGAGCAGCTTGAAAGATAAGAATCTTTTATCTTAATATTTTA
AAGATTTTTTTAGTTATCAAGA