Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g068860.3.1

CDS Infomation

Eukaryotic aspartyl protease family protein (AHRD V3.3 *** A0A061GIP5_THECC)

Sequence

ATGGCTTGGATGTATAAACATATTCCTACAATATGCTTCTTTTTGGTCATGTGTTACCTA
ACAATAAAAACAGTGCCTATTCTTGGAGAAAAAACACCTCACTCACAGTCTCAGGTGGAA
CCAAAACCTATCTGCCAGAGCTCAGGTCCAATAATTGGATCGCGAAGAGTTTCAAATCCT
TGTTCTCCAAATGCTAATTGGACGAAAACTCCATCATCTGGCGAACTTGTAAACGAGAAT
GAAGCTAGAGTTCGTTCAATCAATAAGAAACAGAATCGCCATGATCGTTACACTCGTTCT
GATACTGAGTATGATCCGGATGCTGATTTTGGATTGTTTACCGTTAAGATAAGTTTGGGC
TTACCACAACAATATTATAGTTTGATTGTGGACACTGGTAGCCGTTGGACTTGGGTACGT
TGTCGATTTTGCAGAGTAGGTTGCGATTCAGACGATCCTCTGTATGATCCTACAAAATCA
TTGTGCAAAGCTAGATTATTGAACCACTTCTATGTCAATTATGGGGATAAGTCATATATA
AACGGCATTTGGGGATGTGATACTCTCAATATAGGTGATGATCTTAGTTCAATAATGAAC
TTCCGATTTGGTTGTGCCCTAAATATCTTCGATGACAGTGGAGATAATTTTGCTAATGCA
TCTGGATATCTTGGACTTGGTAAAGGATACTCCTCTTTGGTATCTCAAGGTGGTGCATCA
ATGCAAGTGTTTAGCTATTTTGTCCCAGGAAATGGTGGTGGTGCAGATCTACAATTTGGG
GATAAAGCCAGAGAAAAATCGAATACTTGTACAAATCAATTCACACCAATGGTACGAGGG
AGCGATCCAGAGAAATACTATATCGATTTAGTTGGTATAAGTGTAGATGGAAACGAACTG
AACGTTCCATCGACTGAATTAATGTCTCGAGGGACAATTATAGACAGTGGAACGACCATT
ACTCGATTGCCAGAAGTGGTATACTCTGCATTTCGTGATGCAGTTAGAGAGTCCATGTCG
AGTTATACATTATTAGATGGTATTGATGAGCTCATGGACACTTGCTATAGCTTAGAGGGG
TTAATCGAACCAATCGCATTTCCAGAGATTAAGTTCCATTTCGGGGAAGTGGATACTATT
GATGTGATTTTGACAAAGGAAGGAACTATATGGAGGAAAACTGATACAGTAAATTGTTTG
GCTTTTGCTGCAGCAGAAGGCTGTAGCATTATTGGTATGGTTCAACAGCGTGGATTCAAT
GTGCTTTATGATTTAGAAGGCGAAACAATTGGATTTGGCACGAACTGTACGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g068860.3.1

PEP Infomation

Eukaryotic aspartyl protease family protein (AHRD V3.3 *** A0A061GIP5_THECC)

Sequence

MAWMYKHIPTICFFLVMCYLTIKTVPILGEKTPHSQSQVEPKPICQSSGPIIGSRRVSNP
CSPNANWTKTPSSGELVNENEARVRSINKKQNRHDRYTRSDTEYDPDADFGLFTVKISLG
LPQQYYSLIVDTGSRWTWVRCRFCRVGCDSDDPLYDPTKSLCKARLLNHFYVNYGDKSYI
NGIWGCDTLNIGDDLSSIMNFRFGCALNIFDDSGDNFANASGYLGLGKGYSSLVSQGGAS
MQVFSYFVPGNGGGADLQFGDKAREKSNTCTNQFTPMVRGSDPEKYYIDLVGISVDGNEL
NVPSTELMSRGTIIDSGTTITRLPEVVYSAFRDAVRESMSSYTLLDGIDELMDTCYSLEG
LIEPIAFPEIKFHFGEVDTIDVILTKEGTIWRKTDTVNCLAFAAAEGCSIIGMVQQRGFN
VLYDLEGETIGFGTNCT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g068860.3.1

Transcript Infomation

Eukaryotic aspartyl protease family protein (AHRD V3.3 *** A0A061GIP5_THECC)

Sequence

TTGAAGTCCTAAGGTATTGACCTGTTCAAGTATATGAAATTGTGGTTGATCCTATAATAA
ACAAATTAAAGGAGTCAAGAAGCACAACAACACACAACACAAAATAATTCTGTTTTGGAT
ACTTACATTCAATACAAATATGGCTTGGATGTATAAACATATTCCTACAATATGCTTCTT
TTTGGTCATGTGTTACCTAACAATAAAAACAGTGCCTATTCTTGGAGAAAAAACACCTCA
CTCACAGTCTCAGGTGGAACCAAAACCTATCTGCCAGAGCTCAGGTCCAATAATTGGATC
GCGAAGAGTTTCAAATCCTTGTTCTCCAAATGCTAATTGGACGAAAACTCCATCATCTGG
CGAACTTGTAAACGAGAATGAAGCTAGAGTTCGTTCAATCAATAAGAAACAGAATCGCCA
TGATCGTTACACTCGTTCTGATACTGAGTATGATCCGGATGCTGATTTTGGATTGTTTAC
CGTTAAGATAAGTTTGGGCTTACCACAACAATATTATAGTTTGATTGTGGACACTGGTAG
CCGTTGGACTTGGGTACGTTGTCGATTTTGCAGAGTAGGTTGCGATTCAGACGATCCTCT
GTATGATCCTACAAAATCATTGTGCAAAGCTAGATTATTGAACCACTTCTATGTCAATTA
TGGGGATAAGTCATATATAAACGGCATTTGGGGATGTGATACTCTCAATATAGGTGATGA
TCTTAGTTCAATAATGAACTTCCGATTTGGTTGTGCCCTAAATATCTTCGATGACAGTGG
AGATAATTTTGCTAATGCATCTGGATATCTTGGACTTGGTAAAGGATACTCCTCTTTGGT
ATCTCAAGGTGGTGCATCAATGCAAGTGTTTAGCTATTTTGTCCCAGGAAATGGTGGTGG
TGCAGATCTACAATTTGGGGATAAAGCCAGAGAAAAATCGAATACTTGTACAAATCAATT
CACACCAATGGTACGAGGGAGCGATCCAGAGAAATACTATATCGATTTAGTTGGTATAAG
TGTAGATGGAAACGAACTGAACGTTCCATCGACTGAATTAATGTCTCGAGGGACAATTAT
AGACAGTGGAACGACCATTACTCGATTGCCAGAAGTGGTATACTCTGCATTTCGTGATGC
AGTTAGAGAGTCCATGTCGAGTTATACATTATTAGATGGTATTGATGAGCTCATGGACAC
TTGCTATAGCTTAGAGGGGTTAATCGAACCAATCGCATTTCCAGAGATTAAGTTCCATTT
CGGGGAAGTGGATACTATTGATGTGATTTTGACAAAGGAAGGAACTATATGGAGGAAAAC
TGATACAGTAAATTGTTTGGCTTTTGCTGCAGCAGAAGGCTGTAGCATTATTGGTATGGT
TCAACAGCGTGGATTCAATGTGCTTTATGATTTAGAAGGCGAAACAATTGGATTTGGCAC
GAACTGTACGTGATTACTTTGTATAATCGTTTTTAATGCTTCTTCTTGTCGTAGTATTGC
TTGTTCCCAGGGTTAAAATTTATTCCTGCCGAATGTTTGCGTCAAGTTAATCAATACTTG
TTTGTAATGTGTTTTTTCGTATGCCTCTCTCATTGAATTGCTTAATTATGATAAGTTGAT
TGGACGGGAATATTCTGTACACATAAATTTTTACCCTCTTAGAAGCATTGGTAGATTCAG
GAATCATAGCAAGTGGTTTAATATTTTCAAAGGATTGTAGTGA