Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g067960.3.1

CDS Infomation

RING finger and CHY zinc finger protein (AHRD V3.3 *** G7JNA1_MEDTR)

Sequence

ATGGGAGACATAGTGATTGAACATTCAGGGTCGCCACATTATGAGGCCTTGAACTTGCAA
AATGTTACAACATCTGAGAATGATGCTGATCTGGTTCGGAGTTACTGTGGGGGCTTCTTT
CCTGAGGGTAGTACACATGAAGAAAAATCCACTTGCACCGAAGCCCTCGACAGAGGATTC
TTTGAATATGGATGTTCCCACTATCGCCGTAGATGTCGCATTAGAGCCCCATGCTGCGAT
GAGATGTTTGACTGCAGGCATTGTCATAATGAATCTAAGAACAATATCAACATTGACCAG
AAACTTCGACATGAGATTCCTCGTCACAAGGTGGAAAGGATTATATGCTCACTTTGTAAT
ACAGAGCAAGAGGTTCGGCAAGTTTGCATCAATTGCGGTGTGTGCATGGGGAGATATTTC
TGTGAAACGTGTAAGCTATTTGATGATGATATATCCAAAAGACAGTATCACTGCAGTGGT
TGTGGGATATGCAGGATTGGTGGGATGGAGAACTTCTTCCACTGTCCCAAATGCAGATGT
TGTCATTCTGTTCTATTGAGGAACAGCCACCCCTGTGTAGAGGGGGCAATGCATCATGAC
TGTCCTGTTTGTTTTGAGTATCTCTTTGAGTCGATAAATGATGTAACAGTCATGCCTTGT
GGACACACTATTCATAAGAACTGTTTGAAGGAGATGCAGGAACACTACCAATATGCTTGT
CCTCTCTGCTGTAAGTCGGTATGTGATATGTCAAAGGTGTGGGAGAAATTTGACATGGAA
ATTGCTGCAACACCAATGCCCGAACCTTATCAAGACAAGAAGGTTTGGATCCTTTGTAAT
GATTGTGGAATCACCTCAGAAGTGCAATATCACTTTGTGGCCCAGAAATGTCCATGTTGC
AAATCTTACAACACCCGCCAAACAAGAGGTGGATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g067960.3.1

PEP Infomation

RING finger and CHY zinc finger protein (AHRD V3.3 *** G7JNA1_MEDTR)

Sequence

MGDIVIEHSGSPHYEALNLQNVTTSENDADLVRSYCGGFFPEGSTHEEKSTCTEALDRGF
FEYGCSHYRRRCRIRAPCCDEMFDCRHCHNESKNNINIDQKLRHEIPRHKVERIICSLCN
TEQEVRQVCINCGVCMGRYFCETCKLFDDDISKRQYHCSGCGICRIGGMENFFHCPKCRC
CHSVLLRNSHPCVEGAMHHDCPVCFEYLFESINDVTVMPCGHTIHKNCLKEMQEHYQYAC
PLCCKSVCDMSKVWEKFDMEIAATPMPEPYQDKKVWILCNDCGITSEVQYHFVAQKCPCC
KSYNTRQTRGG*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g067960.3.1

Transcript Infomation

RING finger and CHY zinc finger protein (AHRD V3.3 *** G7JNA1_MEDTR)

Sequence

CCTATAAAACCACTCACATTCGAACCCTATTCACAAAAATCCACCATTTTCTCTGTGTGC
GCATTTATCTGTATACATTATTCGGCATTTGCAGGTCGGAGAATCTGATCGGAGCAAGTT
GTGATCGACGATCGGAGTTGAAAGTTCGTTATTCAAAGTGTTCTGCGTTAGCTTCCTTTT
ATATTTCACTTTTGTTTTTGCTCCGTAATTCCGTTTTTCGCTCTTCTCATTTCTATTGAA
TTTACTTATATAGGTAGGTGGATTATATGAATTTTGCGCTATTATATAGTTTCCTCCAAG
TATTATTAGACCTGTAATGACGCCTATCTACTGATCTCTATTTTTCGTCTTATTCTTCTG
ATTTGTCGTTCGTTGCATTTCATCCTCTATGTCGGAATCTATGAAATGTTTGTGCTGGTG
AATTTATAGGTTTTGTTTGCTTAGAGTGATTATAATGGATTTGCCTTTGTTTGTATGTGG
AGAGATACTTTTGATGGAGTTCGTAGAATTTGTGTTGTGTTGATTGTGCTCTCGTCTAGG
TTCCATTTGTTGTGGAATCTATAAGATTTGTGATTGTTGTGTTATGGAAAAAAGAAAGAG
AAAGCGACTCTGTTGAGATTATGTTTCAGTGCCATGAGATCATGAATAATTGGTTTGCGT
GCTATTGTGTTATGAATGGTTGCCTTGCAAATGCCTATGTTGAATTAGATGGTTATGTAG
CGTATGTATCTTAGTGGAATGCTGCTTTATATCACTGAGCTTTTGAGCTTTGTGGTTATA
TTAATCCTATCCACAATTTTTTATTCACGTAGTGTATAATCCTCAGTTTCAGGGCTTTTG
CCTTGGCTGATTGATTGCATGAGACCTTCACTTTTGATTGATTGAGTGGCAGCAAAATAT
ATCCGTAGGAACGATTGACAACTAATTTGGCATTCTTTGGGCTTAGAATAGTTGATGAAA
TTATCTAGTTTTACTCTTAGCCTTGAAAAAATCATAGTTAAATATATAGGTACCCACAGG
TTTAAGATATGGGGTACCTGTGTGGGTGGTTTAGCTATATTGATGTTTTGTGACGGTTTA
TAAACTGCAGTTATCAAGTAAAATTCCAGTGAGAAGATGATGAGGAATTTAAAGAAAAAG
CATATAGTAAAGATCTTGATTAAACAAATACTCTTCTTTTTTCCTGTTCGGTCCCTTTTT
GGTTATGAAGACGGAGACTATAAACACAAGCATTTATAAGCATGTATTTGGTCAATCTGA
AGTTGCAAAGCTGGTGTCTCGATCAAATGCAAGTAGTAGTCATGATAGTGCCATACTCAT
TGGACATCTATGTCAATCTTCTGTTCAGTTTGTTCATCACTCTTTCCTTTTTCTATTTTG
CGTTAAACTTCTGATGCTGGTATCCGTCGAGGCTATTGGTATTTGCAACTCACTTTTCTT
TCAATAATAATAGGCTGACTTAGGATAGGGAGTTTCTAGTGCTTTCCAAGCCTTCTGGTA
TGCTTTATCTTCCAACCAATCTAATTTTGGGCTCTTGAAGGAGATCATCTGGTATATGTG
GTTGTAGCTGTTCTTGACTGCTATAATGGAAGTGTAAACTCTACCTACTTTCACATGAGA
GGTAGACACTGGACTGTGGAAAAATAAGATATCGTGGCACATGATGCTTTTTGTTTTGCA
ACTTTAGTTTTTGTGAATTTTAGTAAAATGCTAGGCATGTGCGATGATGAGGTCTTTCGT
TAACAAAGATAGGCCTTGGGGTGAAAAGGTGAACAAAAAAGAAAGGAAAATAGAAAGATG
ACCACCGGAGGCTGGAGAGTATGGATCAGTTGGATGTTGTAACCCAACAGATAAGATTTT
CCTTTCTGACAATGAAAAAATCCAACTAACAGACTGTAGGAATTTATAAAATTCTTCTTC
AGGGTAAGATTCCCTTGTTAAAGTGACATGGTGCAGAAGCTCAGACAGAGGTTGGACTTC
CCTTCATCAGTATCTCTTTAAATGGAGTTCTCCAAGAATGAAGTCATCATGCAATCATTA
TTAGCTACTGCTGGATGCTTTGGAGCTCCTCAATGCTTCACGATAGTTCTAGTTTGGTTC
CTTTTGAACCTACTTGTGGATTCTTGTAGATCAACTTGTTTTGATGAAATTCTCATGGTG
GAGTTTGCTGATTGGAGCTGTCAACCTTTGTTGGAATTTGTTGTTGCTGGTTTCAATTGG
TGTTCATGTGCGACAACAAGAACATTGTCTGAGGTGTTTTGCCCATTTGGAGGGCCAAGT
AGTCATGCCTTTGTAGGTTTAGGATTTTTTCCCTTGACTATTTTCTGAATGCAGGGCTTG
TAGTTGTTAAATTCATCCATAAGGCTAAATGGGAGACATAGTGATTGAACATTCAGGGTC
GCCACATTATGAGGCCTTGAACTTGCAAAATGTTACAACATCTGAGAATGATGCTGATCT
GGTTCGGAGTTACTGTGGGGGCTTCTTTCCTGAGGGTAGTACACATGAAGAAAAATCCAC
TTGCACCGAAGCCCTCGACAGAGGATTCTTTGAATATGGATGTTCCCACTATCGCCGTAG
ATGTCGCATTAGAGCCCCATGCTGCGATGAGATGTTTGACTGCAGGCATTGTCATAATGA
ATCTAAGAACAATATCAACATTGACCAGAAACTTCGACATGAGATTCCTCGTCACAAGGT
GGAAAGGATTATATGCTCACTTTGTAATACAGAGCAAGAGGTTCGGCAAGTTTGCATCAA
TTGCGGTGTGTGCATGGGGAGATATTTCTGTGAAACGTGTAAGCTATTTGATGATGATAT
ATCCAAAAGACAGTATCACTGCAGTGGTTGTGGGATATGCAGGATTGGTGGGATGGAGAA
CTTCTTCCACTGTCCCAAATGCAGATGTTGTCATTCTGTTCTATTGAGGAACAGCCACCC
CTGTGTAGAGGGGGCAATGCATCATGACTGTCCTGTTTGTTTTGAGTATCTCTTTGAGTC
GATAAATGATGTAACAGTCATGCCTTGTGGACACACTATTCATAAGAACTGTTTGAAGGA
GATGCAGGAACACTACCAATATGCTTGTCCTCTCTGCTGTAAGTCGGTATGTGATATGTC
AAAGGTGTGGGAGAAATTTGACATGGAAATTGCTGCAACACCAATGCCCGAACCTTATCA
AGACAAGAAGGTTTGGATCCTTTGTAATGATTGTGGAATCACCTCAGAAGTGCAATATCA
CTTTGTGGCCCAGAAATGTCCATGTTGCAAATCTTACAACACCCGCCAAACAAGAGGTGG
ATAAAAGGACCAAATATCAATAGCCAATCTGGCTTTCAAGTGAAAATGATCCCACACCCT
ATGTGGCTAGGGTGGTACCTCTGAGTGGGAATGATTGGGCTTTACAAGCTAAGCTTGTAG
AAGAAATAACGGAAAGAAGGGGTTCTAATATGATCCTGCTTGTAACACTTCTGAGGTTAT
CGTGTTTTCGCGTTTTAGTAGTACGTGCGTTTTATATGCCAGTGCAATTTTCAAGACACT
GATTATTTGTTCAGTGTTAGCCCTATTATTGTTGGCATGTGTGATTCAATCCTTTATAGC
ACAAAGCGAGTTGGACTGTGGCATGTTAAGTGGCTGAGAGACTTGATGTGTTGTGTGATA
TGTATTTTCCAGTTAATTACTCACTTGAAGATAAATTTGTATTATTACTTCATATTTATT
AAGTAGTATATTTCTTTAAGAAAATTATGACGTAGTTAAATTGTCCTAAGTTCCTGACTC
TGCATTCTTAGAGTGCAAGGTATCGAAACAAAGAAAGGAAAAAGCTAGTCCTTTCGATTT
TCT