Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g067080.2.1
CDS Infomation	Ammonium transporter (AHRD V3.3 *** K4CLT4_SOLLC)
Sequence	ACCAGCAAAACAAAATCAAGAAATATGAGTTTATCATCTCCACCAGCCTTTAACTTTTCT GTGCTCCCATCAAACTTGATTCCGGGGGATGCGAATCCTCCGTGGATGAGCAAAGGTGAC AATGCATGGCAACTTGTAGCAGCCACCTTAGTGGGGCTACAAAGTGTACCAGGCCTTATA ATACTCTATGGAGGAGCAGTTAAAAAAAAATGGGCAGTAAATTCAGCTTTCATGGTTTTA TATGCCTTTGCTTGTGTACTACTATGTTGGGTTTGTTGGGGATATAGAATGTCATTTGGA GAAAAACTAATACCAATATGGGGTAAAATAGACGTTGCGTTAGAACAAGATTACCTCTTC CAGAAAGCATTTCTGGGGATGTTTCCTAACGCGACTATGGTGTTTTTCCAGTTTGTATTC GCGGCTATCACTCTGGTTCTGATAGCGGGTGCATTGCTTGGAAGGATGAATTTTTATGCT TGGATGTTGTTTGTACCATTGTGGCTAACATTTTCTTATACTTTTGGTGCATATACTATT TGGTCTTCTAATGGTTGGTTGTCTGTTAATGGTATTATTGACTATTCTGGTGGATATGTC ATTCATCTCTCTTCTGGTGTAGCTGGTTTTACTGCTGCTTATTGGGTGGGTCCAAGATCA ACCAAGGACAGAGAGAGATTTCCACCAAATAACATACTTCTGATGTTGGCTGGGGCAGGA CTCCTGTGGATGGGGTGGTCAGGGTTCAATGGAGGTGATCCATATGCAGCCAACATTGAT GCATCCTTGGCCGTGTTAAACACACATGTTGCTGCTGCTACAAGCTTGTTAACATGGCTC ATTCTTGATGTCATCTTCTTTGGAAAGCCTTCTGTTATTGGTGCTGTCCAAGGCATGATC ACTGGCTTAGTTGCAATCACACCTGCTGCAGGTGTTATACAGGGATGGGCAGCCATAGCT GTAGGACTATGTTCAGGCTCAATTCCATGGTTCACAATGATGGTAGTCCACAAGAAATCT GAGCTTCTTCAAAAAGTGGACGACACAATGGCTGTCTTCCACACCCATGCTGTGGCTGGA TGCCTAGGAGGACTCCTCACGGGGCTCTTTGCTCACCCGAGACTATGTTACCTTTTCTAT GGCTACTATAACAACTATTATGGCCTCTTCTATGGGCTTCACGACGGACAAGCCCACAAA GGACTCAGGCAAATGGGTCTCCAACTTCTTGGGATTCTGTTCATCGTGGTGGTGAACGTT GTGATGACAAGCTTGATATGTTTGTTGGTGCAGCTCATTGTACCACTCAGAATGTCAGAG GAAGATATGGAAATTGGAGATGAAGCTGCACATGGTGAGGAAGCTTATGCTATTTGGGGA CAAGGTGATAGGCTTGAGAAATCTGCAGGATTTTCTGATACTGCTGCTGGAGCTGCTAAG TCTAGTTATAATACGTCTAGAAGTCAGGTCGAAATGGTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g067080.2.1
PEP Infomation	Ammonium transporter (AHRD V3.3 *** K4CLT4_SOLLC)
Sequence	TSKTKSRNMSLSSPPAFNFSVLPSNLIPGDANPPWMSKGDNAWQLVAATLVGLQSVPGLI ILYGGAVKKKWAVNSAFMVLYAFACVLLCWVCWGYRMSFGEKLIPIWGKIDVALEQDYLF QKAFLGMFPNATMVFFQFVFAAITLVLIAGALLGRMNFYAWMLFVPLWLTFSYTFGAYTI WSSNGWLSVNGIIDYSGGYVIHLSSGVAGFTAAYWVGPRSTKDRERFPPNNILLMLAGAG LLWMGWSGFNGGDPYAANIDASLAVLNTHVAAATSLLTWLILDVIFFGKPSVIGAVQGMI TGLVAITPAAGVIQGWAAIAVGLCSGSIPWFTMMVVHKKSELLQKVDDTMAVFHTHAVAG CLGGLLTGLFAHPRLCYLFYGYYNNYYGLFYGLHDGQAHKGLRQMGLQLLGILFIVVVNV VMTSLICLLVQLIVPLRMSEEDMEIGDEAAHGEEAYAIWGQGDRLEKSAGFSDTAAGAAK SSYNTSRSQVEMV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g067080.2.1
Transcript Infomation	Ammonium transporter (AHRD V3.3 *** K4CLT4_SOLLC)
Sequence	ACCAGCAAAACAAAATCAAGAAATATGAGTTTATCATCTCCACCAGCCTTTAACTTTTCT GTGCTCCCATCAAACTTGATTCCGGGGGATGCGAATCCTCCGTGGATGAGCAAAGGTGAC AATGCATGGCAACTTGTAGCAGCCACCTTAGTGGGGCTACAAAGTGTACCAGGCCTTATA ATACTCTATGGAGGAGCAGTTAAAAAAAAATGGGCAGTAAATTCAGCTTTCATGGTTTTA TATGCCTTTGCTTGTGTACTACTATGTTGGGTTTGTTGGGGATATAGAATGTCATTTGGA GAAAAACTAATACCAATATGGGGTAAAATAGACGTTGCGTTAGAACAAGATTACCTCTTC CAGAAAGCATTTCTGGGGATGTTTCCTAACGCGACTATGGTGTTTTTCCAGTTTGTATTC GCGGCTATCACTCTGGTTCTGATAGCGGGTGCATTGCTTGGAAGGATGAATTTTTATGCT TGGATGTTGTTTGTACCATTGTGGCTAACATTTTCTTATACTTTTGGTGCATATACTATT TGGTCTTCTAATGGTTGGTTGTCTGTTAATGGTATTATTGACTATTCTGGTGGATATGTC ATTCATCTCTCTTCTGGTGTAGCTGGTTTTACTGCTGCTTATTGGGTGGGTCCAAGATCA ACCAAGGACAGAGAGAGATTTCCACCAAATAACATACTTCTGATGTTGGCTGGGGCAGGA CTCCTGTGGATGGGGTGGTCAGGGTTCAATGGAGGTGATCCATATGCAGCCAACATTGAT GCATCCTTGGCCGTGTTAAACACACATGTTGCTGCTGCTACAAGCTTGTTAACATGGCTC ATTCTTGATGTCATCTTCTTTGGAAAGCCTTCTGTTATTGGTGCTGTCCAAGGCATGATC ACTGGCTTAGTTGCAATCACACCTGCTGCAGGTGTTATACAGGGATGGGCAGCCATAGCT GTAGGACTATGTTCAGGCTCAATTCCATGGTTCACAATGATGGTAGTCCACAAGAAATCT GAGCTTCTTCAAAAAGTGGACGACACAATGGCTGTCTTCCACACCCATGCTGTGGCTGGA TGCCTAGGAGGACTCCTCACGGGGCTCTTTGCTCACCCGAGACTATGTTACCTTTTCTAT GGCTACTATAACAACTATTATGGCCTCTTCTATGGGCTTCACGACGGACAAGCCCACAAA GGACTCAGGCAAATGGGTCTCCAACTTCTTGGGATTCTGTTCATCGTGGTGGTGAACGTT GTGATGACAAGCTTGATATGTTTGTTGGTGCAGCTCATTGTACCACTCAGAATGTCAGAG GAAGATATGGAAATTGGAGATGAAGCTGCACATGGTGAGGAAGCTTATGCTATTTGGGGA CAAGGTGATAGGCTTGAGAAATCTGCAGGATTTTCTGATACTGCTGCTGGAGCTGCTAAG TCTAGTTATAATACGTCTAGAAGTCAGGTCGAAATGGTTTAATTCAAAGTAACTTCGCGA TATTGGTCATATACTAATGCATTTCTTGTGATGTGTGTTTTCTTAAATTCTGGTTTAGTT TTCTTTTTTCATAAGAATATAACTGATCATGATGATGTTACGTGATCAATTTGAACTAGC TGCAGGCTGCAAGAGTGCTTTTGGCATTCATTGAATGTATTTCCTGAGGAAGTGAAAATA ATTAATAAGAAATACAAGGTTTCATCTTCTTGTTATATAAGAATAGTGGCAAGGCATCAA TTGGTTTGTTTGTTAGTTCACATATGTATGTTTTTGTTACTTTTCTTCTTCCTGCAAATT TTCCAATATAAAGAAAAGGTGAAAA