Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g065590.2.1
CDS Infomation	Vacuolar processing enzyme (AHRD V3.3 *** Q9SMD0_SOLLC)
Sequence	ATGGGAGGGCCTGCACCCAAAAAGTTGGTGTATACCATGGAATTGACAGTGATTACTAGT TATCCTAATGAAGACATAGCTGGATCAACAAGAGCAGTGATAAGAGTAATGATAGCAGGA TCAATGTATGAGGAAAAAGTGGAGGGAAGTAGCCTCCATGTAGTAGAAGCTGGAACAATA AAAGGGAAACACAGACTCTCTGAACATAACATCCCTATGGAGGCTGATGTGTGCCACGCT TACCAAATATTGAAGGTTGGTGGTCTTAAGGATGAGAACATCATTGTATTCATGTACGAT GATATTGCTAACAATACAGCAAACCCTAGACCTGGTGTCATAATCAATAACCCACATGGT CATAATGTTTATAAAGGTGTCCCAAAGGATTATGTAGGTGATGATGTTAATGCTAAAAAC TTTTTCAATGTCATCCTTGCCAACAAAAGTGGTGTTGTTGGGGGAAGTGGTAAAGTTTTG AAGAGTGGTCCAAATGACCATATCTTCATATACTATACTGATCATGGTAGCCCTGGAATG ATTATAATGCCAAGTGGAGAGCCGATTTATGCAGATGAACTATTTAACGTGTTGAAAAAG AAGCATGCATCAAAGACGTATGACAAACTGGTGTTTTACCTAGAAGCCTGTGAATCTGGA AGCATATTTGACGGTATTCTCCCCAAAGGACTTAATATCTATGCCATGACTGCATCTAAA CCCAATGAAGATAGTTTTGGCACATACTGTGGTGAGAGTACTCCTATTGATTCCTGTTGG GGTCAGTGCCCCCCTCCGGAGTTTAAGGGTCTTTGCTTAGGAGACTTGTTCAGTGTTGCC TGGATGGAAGATAGTGATGTACAAGATAGAAAAACTAACACCTTGCATGGGCAGTATATT CGAGTTGCAAAAAGAACTGCTGCCAACTTAACATATGATAAGTATGGCTCCCATGTCAAA GAATATGGTGATAAAGTGGTGAGTTTTGATCCTCTTGTTGTATATATGGGTGAAACTTCC AAAAATCACAGCCATGACTCTGTGGATGCAAAGTCATTCTCAACATCATCATCAAGGAAT GTGGATCAGAGAAGTACTGAACTTTTCTATTTGGTCATAAAACACCAAAATGCTCCTGAA GGCTCTGATGAGAAATATGAAGCTCGTGTGAAACTAAATGAAGTTATGTCACAGAGAAGT CAAGTTGACAACAATGTAAAACATCTAGCGGATCTTCTTTTTGGTGTTGAAAAAGGTAAT GAGATACTACACAGCGTTCGACCTGCTGGACAACCACTTGTTGATAACTGGGATTGCCTT AAGTCTTATGTCAAGATATTTGAAACACATTGTGGAAGATTAACAGTTTACGGAAGGAAA CATGTACGTGGTATCGCCAACATCTGCAATGCTGGGATTACAAGTGAGAAAATGGATGCT ATGTCTGCTCAAGCACCTGGTGTCATCATCAATAACCCACATGGCCATGATGTTTACAAA GGTGTCCCTAAGGACTATGTAGGTGATGATGTTAACGCTAAAAACTTATTCAGTGTCATC CTTGCCAACAGAAGTGGTGTTGTTGGGAGAAGTGGTAAAGTTTTGAAGAGTGGTCAAATG ACCATATCTTCATATACTATGCTGATCATGGTGCCCCTAGATTTATTTGTGATTGACCTA GAAGTCTGTGAGTCTGGAAGCATGTTTGATGGTATTCCCCCCAAAGGACTTAATATCTAT GCCATGACTGCATCTAAACCTGATGAAGACAGTTTTGGCACATATGATGTACAAGATCGA AAAACTAACACCTTGCATGGGCAGTATAGTCGAGTTGCAAAAAGAACAGCAGCCAACTTA ACATATCGTAACTATGGCTCCCATGTCCATAAATATGGTGATAAAGTGGTGGTTTTTGAT CCTCTTGCCGCGTATATGGGTGAAACTTCCAAAAATCACAGTCATAACTCTCTGGATGCA AAGCCATTCTCGACATCATCATCAAGGAATGTGGATCAGTGCAGTACTGAACTTTTCTAT TTGTTCACCAAATACAAAAATGCTCCTGAAGGCTCCGATGAGAAATATGACGCTCTTAAA AGTCAAGTGGACAGCAATGTAAAACATCTAGGGGAGCTTCTTTTAGGTGTTGAAAAAGGT AATGAGGTACTACATACCGTTCGATCTGCTGAACAACCACTTGTTGACAACTGGGACTGC CTCAAGTCTTATGTGAAGATATTTGAGGCACATTGTGGAAGATTAACAGCTTATGGAAGG AAACACGTACGTGGCATCGCCAGCATCTGCAATGCTGGGATTACGAGTGAGAAGATGGCT GCTATGTCTGCACAAGCATTTTCAACTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g065590.2.1
PEP Infomation	Vacuolar processing enzyme (AHRD V3.3 *** Q9SMD0_SOLLC)
Sequence	MGGPAPKKLVYTMELTVITSYPNEDIAGSTRAVIRVMIAGSMYEEKVEGSSLHVVEAGTI KGKHRLSEHNIPMEADVCHAYQILKVGGLKDENIIVFMYDDIANNTANPRPGVIINNPHG HNVYKGVPKDYVGDDVNAKNFFNVILANKSGVVGGSGKVLKSGPNDHIFIYYTDHGSPGM IIMPSGEPIYADELFNVLKKKHASKTYDKLVFYLEACESGSIFDGILPKGLNIYAMTASK PNEDSFGTYCGESTPIDSCWGQCPPPEFKGLCLGDLFSVAWMEDSDVQDRKTNTLHGQYI RVAKRTAANLTYDKYGSHVKEYGDKVVSFDPLVVYMGETSKNHSHDSVDAKSFSTSSSRN VDQRSTELFYLVIKHQNAPEGSDEKYEARVKLNEVMSQRSQVDNNVKHLADLLFGVEKGN EILHSVRPAGQPLVDNWDCLKSYVKIFETHCGRLTVYGRKHVRGIANICNAGITSEKMDA MSAQAPGVIINNPHGHDVYKGVPKDYVGDDVNAKNLFSVILANRSGVVGRSGKVLKSGQM TISSYTMLIMVPLDLFVIDLEVCESGSMFDGIPPKGLNIYAMTASKPDEDSFGTYDVQDR KTNTLHGQYSRVAKRTAANLTYRNYGSHVHKYGDKVVVFDPLAAYMGETSKNHSHNSLDA KPFSTSSSRNVDQCSTELFYLFTKYKNAPEGSDEKYDALKSQVDSNVKHLGELLLGVEKG NEVLHTVRSAEQPLVDNWDCLKSYVKIFEAHCGRLTAYGRKHVRGIASICNAGITSEKMA AMSAQAFST*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g065590.2.1
Transcript Infomation	Vacuolar processing enzyme (AHRD V3.3 *** Q9SMD0_SOLLC)
Sequence	ATGGGAGGGCCTGCACCCAAAAAGTTGGTGTATACCATGGAATTGACAGTGATTACTAGT TATCCTAATGAAGACATAGCTGGATCAACAAGAGCAGTGATAAGAGTAATGATAGCAGGA TCAATGTATGAGGAAAAAGTGGAGGGAAGTAGCCTCCATGTAGTAGAAGCTGGAACAATA AAAGGGAAACACAGACTCTCTGAACATAACATCCCTATGGAGGCTGATGTGTGCCACGCT TACCAAATATTGAAGGTTGGTGGTCTTAAGGATGAGAACATCATTGTATTCATGTACGAT GATATTGCTAACAATACAGCAAACCCTAGACCTGGTGTCATAATCAATAACCCACATGGT CATAATGTTTATAAAGGTGTCCCAAAGGATTATGTAGGTGATGATGTTAATGCTAAAAAC TTTTTCAATGTCATCCTTGCCAACAAAAGTGGTGTTGTTGGGGGAAGTGGTAAAGTTTTG AAGAGTGGTCCAAATGACCATATCTTCATATACTATACTGATCATGGTAGCCCTGGAATG ATTATAATGCCAAGTGGAGAGCCGATTTATGCAGATGAACTATTTAACGTGTTGAAAAAG AAGCATGCATCAAAGACGTATGACAAACTGGTGTTTTACCTAGAAGCCTGTGAATCTGGA AGCATATTTGACGGTATTCTCCCCAAAGGACTTAATATCTATGCCATGACTGCATCTAAA CCCAATGAAGATAGTTTTGGCACATACTGTGGTGAGAGTACTCCTATTGATTCCTGTTGG GGTCAGTGCCCCCCTCCGGAGTTTAAGGGTCTTTGCTTAGGAGACTTGTTCAGTGTTGCC TGGATGGAAGATAGTGATGTACAAGATAGAAAAACTAACACCTTGCATGGGCAGTATATT CGAGTTGCAAAAAGAACTGCTGCCAACTTAACATATGATAAGTATGGCTCCCATGTCAAA GAATATGGTGATAAAGTGGTGAGTTTTGATCCTCTTGTTGTATATATGGGTGAAACTTCC AAAAATCACAGCCATGACTCTGTGGATGCAAAGTCATTCTCAACATCATCATCAAGGAAT GTGGATCAGAGAAGTACTGAACTTTTCTATTTGGTCATAAAACACCAAAATGCTCCTGAA GGCTCTGATGAGAAATATGAAGCTCGTGTGAAACTAAATGAAGTTATGTCACAGAGAAGT CAAGTTGACAACAATGTAAAACATCTAGCGGATCTTCTTTTTGGTGTTGAAAAAGGTAAT GAGATACTACACAGCGTTCGACCTGCTGGACAACCACTTGTTGATAACTGGGATTGCCTT AAGTCTTATGTCAAGATATTTGAAACACATTGTGGAAGATTAACAGTTTACGGAAGGAAA CATGTACGTGGTATCGCCAACATCTGCAATGCTGGGATTACAAGTGAGAAAATGGATGCT ATGTCTGCTCAAGCACCTGGTGTCATCATCAATAACCCACATGGCCATGATGTTTACAAA GGTGTCCCTAAGGACTATGTAGGTGATGATGTTAACGCTAAAAACTTATTCAGTGTCATC CTTGCCAACAGAAGTGGTGTTGTTGGGAGAAGTGGTAAAGTTTTGAAGAGTGGTCAAATG ACCATATCTTCATATACTATGCTGATCATGGTGCCCCTAGATTTATTTGTGATTGACCTA GAAGTCTGTGAGTCTGGAAGCATGTTTGATGGTATTCCCCCCAAAGGACTTAATATCTAT GCCATGACTGCATCTAAACCTGATGAAGACAGTTTTGGCACATATGATGTACAAGATCGA AAAACTAACACCTTGCATGGGCAGTATAGTCGAGTTGCAAAAAGAACAGCAGCCAACTTA ACATATCGTAACTATGGCTCCCATGTCCATAAATATGGTGATAAAGTGGTGGTTTTTGAT CCTCTTGCCGCGTATATGGGTGAAACTTCCAAAAATCACAGTCATAACTCTCTGGATGCA AAGCCATTCTCGACATCATCATCAAGGAATGTGGATCAGTGCAGTACTGAACTTTTCTAT TTGTTCACCAAATACAAAAATGCTCCTGAAGGCTCCGATGAGAAATATGACGCTCTTAAA AGTCAAGTGGACAGCAATGTAAAACATCTAGGGGAGCTTCTTTTAGGTGTTGAAAAAGGT AATGAGGTACTACATACCGTTCGATCTGCTGAACAACCACTTGTTGACAACTGGGACTGC CTCAAGTCTTATGTGAAGATATTTGAGGCACATTGTGGAAGATTAACAGCTTATGGAAGG AAACACGTACGTGGCATCGCCAGCATCTGCAATGCTGGGATTACGAGTGAGAAGATGGCT GCTATGTCTGCACAAGCATTTTCAACTTAG