Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g061820.3.1

CDS Infomation

F-box / LRR-repeat protein (AHRD V3.3 *** F8WLC8_CITUN)

Sequence

ATGAGGATTTGGTGTTGTTTATGTTTTGGAGAAGAAGAAGATAATAAGAAGGGCTACAAG
AGTATGAGGGACCCGATTTTGGGGAATAACGGTGACGAATCTCCAGATGAGAATTCGGCA
TTTGACTGGAGGAATGTTTTTGAAGGTGTCAATGTTGCAGCAGTGGTGAGTCCACAAGCG
GGCGCTGTAGGTGATCTTGGTGTTCCCAAGAATGAGGAGATTGATTTTGATAGTAACTGG
ACATCCAGTACAGTGGAGGTGAAGAATGAAAGTTATAGTGGTGAGAAAATGTTGGATGTT
AATTTGAATTTGGGTTTGAGTGGAGAGGCTTCATCCTCAACAGTGCTGAAAGAGGATTCT
GATCCTTTTACCTGTAGTAAAAGGCCCAAAGTTAACTCCTTTTCGCTGGATTGGGACAAC
CACTTGTTGCAGGAAACCAGTTACCTATGTCCAATGAACGAGGGTGGTGGAGATGTGAGT
TTATCTAACTTACTTGGTGCAACAGATGATGAGGGGAAAGATTCTAAAATGGAGGATTTA
GATGTGCGGATGGATCTTACTGATGACTTGTTGCATATGGTGTTCTCCTTTTTGGACCAT
ATTGATCTTTGTCGAGCTGCAAGTGTATGTAGCCAGTGGAGAGCAGCTAGCTCTCATGAA
GACTTTTGGCGATATCTGAATTTTGAGAACAAACAGATATCCTCAAATCAGTTTGAGGAC
ATGTGTCGGCGATACCCAAATGCAACAACAATCAACTTATATGGAACTCCTAATATTCAC
CCACTAGCAATGAAAGCCGTTTCTTCTTTAAGGAATCTTGAGACTCTGTCATTGGGCAGA
GGTCAATTGGGGGAAACATTTTTTCAAGCCTTGACAGATTGCCATGTGTTGAGGAGTTTG
ACCATTAATGATGCCACTCTTGGAAATGGCATTCAAGAGATACCAATTTCTCATGATAGC
TTGCGTCTTCTGCAGCTAGTGAAGTGTCGTGTGCTTCGAGTTTCTATCAGATGTCCGCAA
CTTGAAACATTGTCACTGAAGCGCAGTAGCATGCCACATGCAGTGCTTAATTGCCCTCTT
TTACATGACCTTGATATAGCTTCCTGTCACAAACTTTCCGACGCTGCTATTCGTTCGGCT
GCCACCGCATGCCCTCTTTTAGAATCTTTGGATATGTCAAATTGTTCATGTGTCAGTGAT
GAAACACTGCGTGATATAGCTCAAACTTGTGGACATCTTCGAGTTTTGGATGCTTCATAC
TGCCCAAACATTTCTCTTGAGTCTGTGAGGCTGGTTATGCTGACTGTTCTCAAGCTTCAT
AGTTGTGAGGGCATAACATCAGCTTCCATGGCTGCCATAGCCCATAGCTATATGTTAGAG
GTTCTGGAGCTTGATAATTGCAGTTTATTGACATCAGTGTCCTTGGATCTTCCTCGCCTT
CAGAGCATTAGACTAGTACATTGTCGCAAGTTTATTGACCTTAACTTGCATTGTGGAATG
TTATCATCAATTACTGTTTCTAATTGCCCATTGCTTCAAAGAATCAATATAACTTCAAGT
GCTCTCAAAAAATTAGTTTTGCAGAAGCAGGAAAGCTTGACAACAATTGCATTACAGTGT
CCGAATTTGCTAGAAGTAGACCTTACTGAGTGTGAATCGCTCACCAATTCTGTTTGTGAA
GTTTTCAGTGATGGTGGTGGCTGTCCTGTGCTTAAATCCTTAGTTCTGGATAACTGTGAG
AGCTTGACACTTGTGGCTTTCTGCAGCACTTCTTTGGTTTCTCTTTCACTTGGTGGTTGC
CGTGCTTTAATTTCTCTTGCGCTTAGGTGCCCATATCTTGAACAAGTATCTTTAGATGGT
TGTGATCATCTTGAAGTAGCATCATTTTGCCCCGTTGGTCTTAGGTCACTTAATCTTGGT
ATATGCCCCAAAATGAATATGCTTCATATTGAAGCTCCACAAATGGCTTCACTTGAGCTG
AAGGGCTGTGGTGTGCTCTCTGAAGCATCTATTAATTGCCCCCTGTTAACCTCTTTTGAT
GCTTCATTCTGCAGCCAACTCAAGGATGATTGTTTATCTGCCACGACTTCGTCGTGCCCC
CTCATCGAGTCATTAGTATTAATGTCATGTCCATCTGTTGGCTGTGATGGACTCCTCTCT
TTGCAGTCCCTCCCAAACTTGACCTACCTTGATCTATCCTATACGTTTTTGGTTACCTTG
CAACCTGTTTATGAATCATGCTTGCAGTTAAAGGTCCTAAAGTTGCAAGCATGCAAGTAT
CTCACTGATACATCTTTGGAACCCCTCTATAAAGAAAATGCTCTTCCAGCCCTTTGTGAG
TTGGATCTGTCGTATGGGACCTTATGCCAATCAGCCATTGAGGAATTGCTTGCTTGCTGC
ACACATTTGAGTCATGTCAGCTTGAATGGATGTATTAATATGCATGATTTAAATTGGGGA
TTTTCTGGAGATCAACTGTCACAAATACCCAGTGTTAGTATACCTCATGTATCTTCCCTG
GGAGAACAGCAGTTGTCAAATGAACAACCAAAGCGTTTGCTAGAGAACCTTAACTGTGTA
GGCTGCCCAAATATAAAAAAGGTGCTTATTCCAATGGCACAAGGTTTCCTTTTGTCATCA
TTAAACCTTTCCCTGTCTGGGAATTTGAAGGAGGTTGATATAGCTTGTTACAACTTGTGC
GTTCTCAATTTGAGCAATTGCTGTTCATTGGAATCATTGCAACTGGAATGTCCAAGATTA
AGTAGCCTCTTTCTTCAGTCCTGCAACGTTGATGAGGAATCAGTTGAAGCTGCTGTGTCA
CGATGTATGATGCTTGAGACGCTTGACGTTCGCTTTTGTCCCAAGATTTGTCCATTGAAC
ATGACGAGGTTGCGGGTTGCATGTCCCAGTTTGAAACGCATCTTCAGCAGCCTAGTCCCA
TCGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g061820.3.1

PEP Infomation

F-box / LRR-repeat protein (AHRD V3.3 *** F8WLC8_CITUN)

Sequence

MRIWCCLCFGEEEDNKKGYKSMRDPILGNNGDESPDENSAFDWRNVFEGVNVAAVVSPQA
GAVGDLGVPKNEEIDFDSNWTSSTVEVKNESYSGEKMLDVNLNLGLSGEASSSTVLKEDS
DPFTCSKRPKVNSFSLDWDNHLLQETSYLCPMNEGGGDVSLSNLLGATDDEGKDSKMEDL
DVRMDLTDDLLHMVFSFLDHIDLCRAASVCSQWRAASSHEDFWRYLNFENKQISSNQFED
MCRRYPNATTINLYGTPNIHPLAMKAVSSLRNLETLSLGRGQLGETFFQALTDCHVLRSL
TINDATLGNGIQEIPISHDSLRLLQLVKCRVLRVSIRCPQLETLSLKRSSMPHAVLNCPL
LHDLDIASCHKLSDAAIRSAATACPLLESLDMSNCSCVSDETLRDIAQTCGHLRVLDASY
CPNISLESVRLVMLTVLKLHSCEGITSASMAAIAHSYMLEVLELDNCSLLTSVSLDLPRL
QSIRLVHCRKFIDLNLHCGMLSSITVSNCPLLQRINITSSALKKLVLQKQESLTTIALQC
PNLLEVDLTECESLTNSVCEVFSDGGGCPVLKSLVLDNCESLTLVAFCSTSLVSLSLGGC
RALISLALRCPYLEQVSLDGCDHLEVASFCPVGLRSLNLGICPKMNMLHIEAPQMASLEL
KGCGVLSEASINCPLLTSFDASFCSQLKDDCLSATTSSCPLIESLVLMSCPSVGCDGLLS
LQSLPNLTYLDLSYTFLVTLQPVYESCLQLKVLKLQACKYLTDTSLEPLYKENALPALCE
LDLSYGTLCQSAIEELLACCTHLSHVSLNGCINMHDLNWGFSGDQLSQIPSVSIPHVSSL
GEQQLSNEQPKRLLENLNCVGCPNIKKVLIPMAQGFLLSSLNLSLSGNLKEVDIACYNLC
VLNLSNCCSLESLQLECPRLSSLFLQSCNVDEESVEAAVSRCMMLETLDVRFCPKICPLN
MTRLRVACPSLKRIFSSLVPS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g061820.3.1

Transcript Infomation

F-box / LRR-repeat protein (AHRD V3.3 *** F8WLC8_CITUN)

Sequence

GAGCTGCGTAAAGAAAAAAAGAAGTATAAATTGATTTTTGAGAGATAAAGTGGTGAGATA
CAGACATATATACAAGGCAAAATGAAGTAGCTCTATTGTCTATATTATTTTTCCCACAAA
TCTCCGTTTGCCGATCTTTCCAAAGCTCAATCCCAGAAAAGCGTCACCACTGCCAGCCTT
CGATCCTTCGAAAGATCCGATCAGATCTCTCTCACTGCACTTCTCATACAGTTTTCTTTC
TCTCTCTATGCATACACCTGTATCGATTGTTTTCTGCTACTCCATTCTCCGGTTTGTCGA
AAATTCTTGAACAAGAATTTGTTAGACTCTGTGAACTGTGTAATTTGTGTGCTTTGTCGT
GAAAAAGGAGTCGTTTGGTGTAATTTGTTGAAAAGTTAGGTTTTTTGGGGGGAAAGTTTT
AGATCGTGACCTAGGGTTTCTGAAGATCAGAAATTGATAAAAAAAATTGGGTCTATTCTT
TATTTTTCTTGCTTTCTTAGTGTGGTGTGAGTGAGTGTATGAGGATTTGGTGTTGTTTAT
GTTTTGGAGAAGAAGAAGATAATAAGAAGGGCTACAAGAGTATGAGGGACCCGATTTTGG
GGAATAACGGTGACGAATCTCCAGATGAGAATTCGGCATTTGACTGGAGGAATGTTTTTG
AAGGTGTCAATGTTGCAGCAGTGGTGAGTCCACAAGCGGGCGCTGTAGGTGATCTTGGTG
TTCCCAAGAATGAGGAGATTGATTTTGATAGTAACTGGACATCCAGTACAGTGGAGGTGA
AGAATGAAAGTTATAGTGGTGAGAAAATGTTGGATGTTAATTTGAATTTGGGTTTGAGTG
GAGAGGCTTCATCCTCAACAGTGCTGAAAGAGGATTCTGATCCTTTTACCTGTAGTAAAA
GGCCCAAAGTTAACTCCTTTTCGCTGGATTGGGACAACCACTTGTTGCAGGAAACCAGTT
ACCTATGTCCAATGAACGAGGGTGGTGGAGATGTGAGTTTATCTAACTTACTTGGTGCAA
CAGATGATGAGGGGAAAGATTCTAAAATGGAGGATTTAGATGTGCGGATGGATCTTACTG
ATGACTTGTTGCATATGGTGTTCTCCTTTTTGGACCATATTGATCTTTGTCGAGCTGCAA
GTGTATGTAGCCAGTGGAGAGCAGCTAGCTCTCATGAAGACTTTTGGCGATATCTGAATT
TTGAGAACAAACAGATATCCTCAAATCAGTTTGAGGACATGTGTCGGCGATACCCAAATG
CAACAACAATCAACTTATATGGAACTCCTAATATTCACCCACTAGCAATGAAAGCCGTTT
CTTCTTTAAGGAATCTTGAGACTCTGTCATTGGGCAGAGGTCAATTGGGGGAAACATTTT
TTCAAGCCTTGACAGATTGCCATGTGTTGAGGAGTTTGACCATTAATGATGCCACTCTTG
GAAATGGCATTCAAGAGATACCAATTTCTCATGATAGCTTGCGTCTTCTGCAGCTAGTGA
AGTGTCGTGTGCTTCGAGTTTCTATCAGATGTCCGCAACTTGAAACATTGTCACTGAAGC
GCAGTAGCATGCCACATGCAGTGCTTAATTGCCCTCTTTTACATGACCTTGATATAGCTT
CCTGTCACAAACTTTCCGACGCTGCTATTCGTTCGGCTGCCACCGCATGCCCTCTTTTAG
AATCTTTGGATATGTCAAATTGTTCATGTGTCAGTGATGAAACACTGCGTGATATAGCTC
AAACTTGTGGACATCTTCGAGTTTTGGATGCTTCATACTGCCCAAACATTTCTCTTGAGT
CTGTGAGGCTGGTTATGCTGACTGTTCTCAAGCTTCATAGTTGTGAGGGCATAACATCAG
CTTCCATGGCTGCCATAGCCCATAGCTATATGTTAGAGGTTCTGGAGCTTGATAATTGCA
GTTTATTGACATCAGTGTCCTTGGATCTTCCTCGCCTTCAGAGCATTAGACTAGTACATT
GTCGCAAGTTTATTGACCTTAACTTGCATTGTGGAATGTTATCATCAATTACTGTTTCTA
ATTGCCCATTGCTTCAAAGAATCAATATAACTTCAAGTGCTCTCAAAAAATTAGTTTTGC
AGAAGCAGGAAAGCTTGACAACAATTGCATTACAGTGTCCGAATTTGCTAGAAGTAGACC
TTACTGAGTGTGAATCGCTCACCAATTCTGTTTGTGAAGTTTTCAGTGATGGTGGTGGCT
GTCCTGTGCTTAAATCCTTAGTTCTGGATAACTGTGAGAGCTTGACACTTGTGGCTTTCT
GCAGCACTTCTTTGGTTTCTCTTTCACTTGGTGGTTGCCGTGCTTTAATTTCTCTTGCGC
TTAGGTGCCCATATCTTGAACAAGTATCTTTAGATGGTTGTGATCATCTTGAAGTAGCAT
CATTTTGCCCCGTTGGTCTTAGGTCACTTAATCTTGGTATATGCCCCAAAATGAATATGC
TTCATATTGAAGCTCCACAAATGGCTTCACTTGAGCTGAAGGGCTGTGGTGTGCTCTCTG
AAGCATCTATTAATTGCCCCCTGTTAACCTCTTTTGATGCTTCATTCTGCAGCCAACTCA
AGGATGATTGTTTATCTGCCACGACTTCGTCGTGCCCCCTCATCGAGTCATTAGTATTAA
TGTCATGTCCATCTGTTGGCTGTGATGGACTCCTCTCTTTGCAGTCCCTCCCAAACTTGA
CCTACCTTGATCTATCCTATACGTTTTTGGTTACCTTGCAACCTGTTTATGAATCATGCT
TGCAGTTAAAGGTCCTAAAGTTGCAAGCATGCAAGTATCTCACTGATACATCTTTGGAAC
CCCTCTATAAAGAAAATGCTCTTCCAGCCCTTTGTGAGTTGGATCTGTCGTATGGGACCT
TATGCCAATCAGCCATTGAGGAATTGCTTGCTTGCTGCACACATTTGAGTCATGTCAGCT
TGAATGGATGTATTAATATGCATGATTTAAATTGGGGATTTTCTGGAGATCAACTGTCAC
AAATACCCAGTGTTAGTATACCTCATGTATCTTCCCTGGGAGAACAGCAGTTGTCAAATG
AACAACCAAAGCGTTTGCTAGAGAACCTTAACTGTGTAGGCTGCCCAAATATAAAAAAGG
TGCTTATTCCAATGGCACAAGGTTTCCTTTTGTCATCATTAAACCTTTCCCTGTCTGGGA
ATTTGAAGGAGGTTGATATAGCTTGTTACAACTTGTGCGTTCTCAATTTGAGCAATTGCT
GTTCATTGGAATCATTGCAACTGGAATGTCCAAGATTAAGTAGCCTCTTTCTTCAGTCCT
GCAACGTTGATGAGGAATCAGTTGAAGCTGCTGTGTCACGATGTATGATGCTTGAGACGC
TTGACGTTCGCTTTTGTCCCAAGATTTGTCCATTGAACATGACGAGGTTGCGGGTTGCAT
GTCCCAGTTTGAAACGCATCTTCAGCAGCCTAGTCCCATCGTGAGGCAAAATGAAATATT
TGATAGGTTTGTGTAGGCTGGCTAGGGACGGACATATTTGACTAGAGAGGTTCATATTTT
ATGTATAGTTTAGCTAGTTATGTTGCTGTGATTGGTGAAAACATACAGCGAGCTTCATAC
ATGTAACACCTTAAACTTAATATTTTAACTATTTATGTTGTGATTGGTGAAACATACAGC
GAGCGTACACCTTAATATTTTGGTGTTGGCTTTTACATTTTATGATTCGGTTAGTGCACT
ACTTAATGCAACTTTATTCAGATGTCATGGATGAAGAAAATAAAACTAGAGCCTTCTTGC
CCTTCTCAGTAAATGAATGCGTAAATTTTGGTTGCCCCTAAAAACAAGGTTACAAAAAAT
AGTTGGCTCATCTCTTTGGGATGCAAAAAGCAAATTAATTTTGTCTCGTCTGCCCAAAGA
AATTTCTCTGCTTCCTTTTTATCTAGACTAGGCTCAATTTGCCTTGAGTTTGTTTGATGC
CATTACAATGTTATTGATGCTCA