Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g060970.3.1
CDS Infomation

polygalacturonase AF118567
Sequence

ATGGAGGGCCAAGCACTTATCTTTCTGATTTGTATTACTACATTTCTTATTGAAAGAAGT
GTTGCTGGTATTTTTGATGTAACATGTTATGGCGCTTTTGGAGATGGAGTGCACGATGAC
ACTCAAGCATTCAAACAAGTTTGGAGAGCTGCGTGTAGCGATGAAAATCCATCAATACTT
ATACCAAGTGAAAAATCATTTCTAGTAGGGCCTATAACATTTCAAGGGCCTTGTAAGTCA
GCCAATATTCATCTACAATTATTAGGATCCATTGTAGCACCCAAGGACCCAGTGGCATGG
ACAGGAGTTGCTGGTCTTTTTATCAATGGTTCTGGTACTATCAATGGCAATGGTCAACGA
TGGTGGGATACTCCTAGCCGTACCAGGGTCAACGGAACTTGCACTAAACCAACGGTTGTT
CAATTTAATTACTGTAATGGACTTCGATTGAATGGAATAAAGCTAGTGAATAGTTCAAGG
GACCATATAATTCTTACTTATAACAAGGGAGTAACGATCTCAAATATTCATATAAGTGCA
CCAAATTATAGTCGTAATACCGATGGTATCGATATCTTTTTCTCTAGACAAGTTCAAATT
AGAGACTCCATTATTCAAACAGGTGATGACTGCATTGGCATCAATACTGGATGCTCTGAT
ATCAATATTACTGGTATTAGATGTGGACCAGGTCATGGTATAAGTATTGGAAGTTTAGGT
CCAAATAATACATTTGCTAATGTGGAAAACGTTTATATTACGAATTGCCACTTAGAGGAT
ACCCAAAATGGTGTAAGAATTAAGACATGGCAGGGTGGTTCAGGATATGCTAGATCTATA
CATTTTGAGAATATTAACCTCAAAAATGTGGAAAACCCAATCATTATTGATCAAAATTAT
TGCAATAGTGTCCATTCATGTCAACCTCAGGTAAGTGCAGTTAAAGTGAGCAATGTAACA
TACAAGAAAATATATGGAACTACAAGCAGCAAGCTAGCAATAAAGATGAATTGTAGTAAT
AGCACAGCTTGCACTAATGTTGAGTTGGAGAATATATACATAACTTCAGTTGAGCCTGGA
AAAAAGATTTTTGCTACTTGTAATAATGTTAAAGGAAAAGCTTCTTCAAACTCACCTCAT
GTATCTTGTTTGTCACAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g060970.3.1
PEP Infomation

polygalacturonase AF118567
Sequence

MEGQALIFLICITTFLIERSVAGIFDVTCYGAFGDGVHDDTQAFKQVWRAACSDENPSIL
IPSEKSFLVGPITFQGPCKSANIHLQLLGSIVAPKDPVAWTGVAGLFINGSGTINGNGQR
WWDTPSRTRVNGTCTKPTVVQFNYCNGLRLNGIKLVNSSRDHIILTYNKGVTISNIHISA
PNYSRNTDGIDIFFSRQVQIRDSIIQTGDDCIGINTGCSDINITGIRCGPGHGISIGSLG
PNNTFANVENVYITNCHLEDTQNGVRIKTWQGGSGYARSIHFENINLKNVENPIIIDQNY
CNSVHSCQPQVSAVKVSNVTYKKIYGTTSSKLAIKMNCSNSTACTNVELENIYITSVEPG
KKIFATCNNVKGKASSNSPHVSCLSQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g060970.3.1
Transcript Infomation

polygalacturonase AF118567
Sequence

TTAACTAAGAAAAGCTTCTCTCCTCCCTCTCTCTTTCCTTTCTACTGCTACTAAATACCA
ACAATTTCTGCTCATCTTTCTTCATTCTCTCTCTCTTTGATTCACACTTTTTCCAACTTC
AAAACACAAACAAAAGCTTAACTCCAAAAAACAAAGCACCTAATAATCAAATCAAATTCC
TCTCTCGCGCTCAGGTTGTTGGAGATTCAATTGCATTTGCACTGGGATTGGCAACCACAC
TAGCATTATTGGGTATTGCGGCTGCATATGCTGGAAAGGCATATGGCCAAATAGGACAAG
GATTGCCCGTGGCTGCTTCCTTTTTAGCTATTGTTATGGGGCTAAACCTGTTAGAGCCAT
AATTCACACATCCAAACTGTTTCTACAATTTAATTCCTTCGATCGTTCGCCCACAGGCTC
CTGTCCGAGTCCAGTTCCTGTAATCAGCTATGGAGGGCCAAGCACTTATCTTTCTGATTT
GTATTACTACATTTCTTATTGAAAGAAGTGTTGCTGGTATTTTTGATGTAACATGTTATG
GCGCTTTTGGAGATGGAGTGCACGATGACACTCAAGCATTCAAACAAGTTTGGAGAGCTG
CGTGTAGCGATGAAAATCCATCAATACTTATACCAAGTGAAAAATCATTTCTAGTAGGGC
CTATAACATTTCAAGGGCCTTGTAAGTCAGCCAATATTCATCTACAATTATTAGGATCCA
TTGTAGCACCCAAGGACCCAGTGGCATGGACAGGAGTTGCTGGTCTTTTTATCAATGGTT
CTGGTACTATCAATGGCAATGGTCAACGATGGTGGGATACTCCTAGCCGTACCAGGGTCA
ACGGAACTTGCACTAAACCAACGGTTGTTCAATTTAATTACTGTAATGGACTTCGATTGA
ATGGAATAAAGCTAGTGAATAGTTCAAGGGACCATATAATTCTTACTTATAACAAGGGAG
TAACGATCTCAAATATTCATATAAGTGCACCAAATTATAGTCGTAATACCGATGGTATCG
ATATCTTTTTCTCTAGACAAGTTCAAATTAGAGACTCCATTATTCAAACAGGTGATGACT
GCATTGGCATCAATACTGGATGCTCTGATATCAATATTACTGGTATTAGATGTGGACCAG
GTCATGGTATAAGTATTGGAAGTTTAGGTCCAAATAATACATTTGCTAATGTGGAAAACG
TTTATATTACGAATTGCCACTTAGAGGATACCCAAAATGGTGTAAGAATTAAGACATGGC
AGGGTGGTTCAGGATATGCTAGATCTATACATTTTGAGAATATTAACCTCAAAAATGTGG
AAAACCCAATCATTATTGATCAAAATTATTGCAATAGTGTCCATTCATGTCAACCTCAGG
TAAGTGCAGTTAAAGTGAGCAATGTAACATACAAGAAAATATATGGAACTACAAGCAGCA
AGCTAGCAATAAAGATGAATTGTAGTAATAGCACAGCTTGCACTAATGTTGAGTTGGAGA
ATATATACATAACTTCAGTTGAGCCTGGAAAAAAGATTTTTGCTACTTGTAATAATGTTA
AAGGAAAAGCTTCTTCAAACTCACCTCATGTATCTTGTTTGTCACAATGATAACTATATA
GCAAAATATTTCTATAACCATTTTTTAAGACTGGTAATTAAATTTGACAAAAAAACTTAA
CTAGTGATCCACTAAGGTTTGGAGTTGAGTGAGTATTATCAGATACCTCACAATTGTTAT
AT