Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g060840.1.1
CDS Infomation	FAR1 (AHRD V3.3 *** A0A178UYQ0_ARATH)
Sequence	ATGGTTGATCATGGCGATGTTGTGCAAAGTAGTGTTCAATTGACTGGTGATATGGTTGAT GCTGTAGATAAGTCATGTCTCAGTAGGGATGGCGGAGTTTCTCGTTCTCCAAAGAGAAGT ATTACTGGAGTTGAAGAACATGCAGATTTTGAGCCACATGATGGGATAGAATTTGAGTCC CATGAGGCTGCGTATGCATTTTACCAAGAGTATGCCAAGTCCATGGGATTCACAACCTCA ATTAAGAACAGCCGTCGCTCCAAGAAATCAAAAGAATTTATCGATGCTAAATTTGCATGT TCTAGATATGGCACTACTCCAGAATCAGATACTGGCAGTAGTAGGCGTCCTAGTGTCAAA AAGACTGATTGCAAAGCAAGCATGCACGTTAAGAGAAAGCGTGATGGAAAATGGTATGTC CATGAGTTTATAAAAGATCATAATCATGGGCTTTTACCAGCCTTGGCTTATCATTTCCGA ATCCACAGGAATGTTAAACTTGCAGAGAAAAATAACATTGATATTCTTAATGCTGTAAGT GAACGAACAAGAAAGATGTATGTTGAGATGTCTAGACAATGTGGTGGAAGTCAAGAAGTT GGCTTGCTGACTAATGATTTAAATTACCAGTTTGACAAAGGTCGGTGCTTGTCATTAGAA GAGGGAGATGCTCATATTATGCTCGAGTATTTTATGCATGTCCAGAAAGAAAATCCATGT TTCTTTTATGCAACTGATCTCAATGAAGATCAACGCTTAAGGAACTTATTCTGGATTGAT GCCAAAAGTAGGAAAGACTATGTAAGCTTTAATGATGTGGTTTTCTTTGACACCAGCTAT ATGAAAAGCAATGAGAAGATGCCGTTTGCTCTTTTGATTGGGGTAAACCATCATTGTCAA CCGATGTTGCTTGGATGTGCACTTATAGCAGATGAGACCAAACCAACATTTGTGTGGTTA ATGAAGACGTGGCTTAGAGCAGTGGGTGGGAAGGCTCCAAAAGTAATAATCGCTGATCAA GATAAGTCACTCAAATCCGCTCTTGAAGAAGTTTTCCCATGTTCAAGTCACTGCTTTGCG CTTTGGCATGTGCTTGAAAGAATCCCGGAAACACTTGCTCATGTAGTAAAGCAGCATGAG AATTTCATGCAAAAATTCAGCAAGTGTATATTTAAGTCGTTAACAGATGAACAATTTGAT TTAAGATGGTGGAAGATGGTTAGCAGATTTGAACTGCAAGAGAATGAATGGATTCATACA CTGTATGAGGACCGCAAAAAGTGGATTCCAGCTTACATGAGAGGCAGTTTTATGGCTGGA ATGTCAACAGCTCAAAGGTCGGAGAGTATAAGCTCCTTCTTTGACAAGTACATTCATAAG AAAATCAGTCTCAAAGAGTTTATGAGACAATATGGAATGATTCTGCAAAATCGATATGAA GAGGAAGCAATAGCAGACTTTGATACATTGCACAAACTACCAGCTTTGAAGTCACCTTCC CCTTGGGAAAAGCAGATGTCTACAATTTATACACATACAATCTTTAAGAAATTTCAAGTT GAAGTATTGGGTGTAGTTGGGTGTCATCCAAAGAAGGAAGCTGTAAATGGGGAAAATGTA ACTTTTAGAGTTGATGACTGCGAGAAAGATGAAAATTTTATGGTCACGTGGAATGAGGCA AGATCAGATGTTTCTTGTTCGTGCCTTCTATTTGAATACAATGGTTTCCTCTGTAGGCAT GCAATGATTGTTCTTCAGATGTGTGGTCTTTCAATCATCCCATCCCAATATATTTTGAAG AGGTGGACCAAAGATGCAAAGAATATACAGTTAATATCTGAGGGGACTGAAAGAATTCGA AACAGAGTACAAAGATACAATGATCTATGTAGAAGGGCAATTGAACTGGGTGTGGAGGGT TCTTTATCTGAGGAGAGTTACGGCGTTGCCTTCCGTGCCCTAGATGAAGCTCTAAAGAAC TGTGTGAATGTTAACAATAGAAGTTCTGCATTAACAGAATGTAGCAGCAGTGCAGTTGGA CTTCGTGATCTTGAAGAAGATACTCAAGGGATTCATGCAATTAAAACAAGTAGGAAGAAA AATACAAACAAGAAGCGGAAGATGCACTCTGAACCAGAAGCTGCAATTGTTGAAGCAAAA GACAGCTTACAACAAATGGATAGTCTTACTGTGGGTGGAATGACGTTGAATGGCTATTAT GGTACACATCAGAATGTGCAGGGACTGATACAGTTAAATTTGATGGAACCTCCCCATGAT GGCTATTATGTTAACCAACAGAATATGCAAGGACTGGGACAACTCAATACAATTGCACCT GGCCATGATGGTTTTTTTGGGTCTCAACAAAGCATTCCAGGACTAGGGCATTTGGATTTT AGGCAGCCGAGTTTCACATATGGTTTGCAGGATGAGCCTAGTCTAAGAGCTGCTCAGCTG CATGGAAACAATGCTAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g060840.1.1
PEP Infomation	FAR1 (AHRD V3.3 *** A0A178UYQ0_ARATH)
Sequence	MVDHGDVVQSSVQLTGDMVDAVDKSCLSRDGGVSRSPKRSITGVEEHADFEPHDGIEFES HEAAYAFYQEYAKSMGFTTSIKNSRRSKKSKEFIDAKFACSRYGTTPESDTGSSRRPSVK KTDCKASMHVKRKRDGKWYVHEFIKDHNHGLLPALAYHFRIHRNVKLAEKNNIDILNAVS ERTRKMYVEMSRQCGGSQEVGLLTNDLNYQFDKGRCLSLEEGDAHIMLEYFMHVQKENPC FFYATDLNEDQRLRNLFWIDAKSRKDYVSFNDVVFFDTSYMKSNEKMPFALLIGVNHHCQ PMLLGCALIADETKPTFVWLMKTWLRAVGGKAPKVIIADQDKSLKSALEEVFPCSSHCFA LWHVLERIPETLAHVVKQHENFMQKFSKCIFKSLTDEQFDLRWWKMVSRFELQENEWIHT LYEDRKKWIPAYMRGSFMAGMSTAQRSESISSFFDKYIHKKISLKEFMRQYGMILQNRYE EEAIADFDTLHKLPALKSPSPWEKQMSTIYTHTIFKKFQVEVLGVVGCHPKKEAVNGENV TFRVDDCEKDENFMVTWNEARSDVSCSCLLFEYNGFLCRHAMIVLQMCGLSIIPSQYILK RWTKDAKNIQLISEGTERIRNRVQRYNDLCRRAIELGVEGSLSEESYGVAFRALDEALKN CVNVNNRSSALTECSSSAVGLRDLEEDTQGIHAIKTSRKKNTNKKRKMHSEPEAAIVEAK DSLQQMDSLTVGGMTLNGYYGTHQNVQGLIQLNLMEPPHDGYYVNQQNMQGLGQLNTIAP GHDGFFGSQQSIPGLGHLDFRQPSFTYGLQDEPSLRAAQLHGNNAR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g060840.1.1
Transcript Infomation	FAR1 (AHRD V3.3 *** A0A178UYQ0_ARATH)
Sequence	ATGGTTGATCATGGCGATGTTGTGCAAAGTAGTGTTCAATTGACTGGTGATATGGTTGAT GCTGTAGATAAGTCATGTCTCAGTAGGGATGGCGGAGTTTCTCGTTCTCCAAAGAGAAGT ATTACTGGAGTTGAAGAACATGCAGATTTTGAGCCACATGATGGGATAGAATTTGAGTCC CATGAGGCTGCGTATGCATTTTACCAAGAGTATGCCAAGTCCATGGGATTCACAACCTCA ATTAAGAACAGCCGTCGCTCCAAGAAATCAAAAGAATTTATCGATGCTAAATTTGCATGT TCTAGATATGGCACTACTCCAGAATCAGATACTGGCAGTAGTAGGCGTCCTAGTGTCAAA AAGACTGATTGCAAAGCAAGCATGCACGTTAAGAGAAAGCGTGATGGAAAATGGTATGTC CATGAGTTTATAAAAGATCATAATCATGGGCTTTTACCAGCCTTGGCTTATCATTTCCGA ATCCACAGGAATGTTAAACTTGCAGAGAAAAATAACATTGATATTCTTAATGCTGTAAGT GAACGAACAAGAAAGATGTATGTTGAGATGTCTAGACAATGTGGTGGAAGTCAAGAAGTT GGCTTGCTGACTAATGATTTAAATTACCAGTTTGACAAAGGTCGGTGCTTGTCATTAGAA GAGGGAGATGCTCATATTATGCTCGAGTATTTTATGCATGTCCAGAAAGAAAATCCATGT TTCTTTTATGCAACTGATCTCAATGAAGATCAACGCTTAAGGAACTTATTCTGGATTGAT GCCAAAAGTAGGAAAGACTATGTAAGCTTTAATGATGTGGTTTTCTTTGACACCAGCTAT ATGAAAAGCAATGAGAAGATGCCGTTTGCTCTTTTGATTGGGGTAAACCATCATTGTCAA CCGATGTTGCTTGGATGTGCACTTATAGCAGATGAGACCAAACCAACATTTGTGTGGTTA ATGAAGACGTGGCTTAGAGCAGTGGGTGGGAAGGCTCCAAAAGTAATAATCGCTGATCAA GATAAGTCACTCAAATCCGCTCTTGAAGAAGTTTTCCCATGTTCAAGTCACTGCTTTGCG CTTTGGCATGTGCTTGAAAGAATCCCGGAAACACTTGCTCATGTAGTAAAGCAGCATGAG AATTTCATGCAAAAATTCAGCAAGTGTATATTTAAGTCGTTAACAGATGAACAATTTGAT TTAAGATGGTGGAAGATGGTTAGCAGATTTGAACTGCAAGAGAATGAATGGATTCATACA CTGTATGAGGACCGCAAAAAGTGGATTCCAGCTTACATGAGAGGCAGTTTTATGGCTGGA ATGTCAACAGCTCAAAGGTCGGAGAGTATAAGCTCCTTCTTTGACAAGTACATTCATAAG AAAATCAGTCTCAAAGAGTTTATGAGACAATATGGAATGATTCTGCAAAATCGATATGAA GAGGAAGCAATAGCAGACTTTGATACATTGCACAAACTACCAGCTTTGAAGTCACCTTCC CCTTGGGAAAAGCAGATGTCTACAATTTATACACATACAATCTTTAAGAAATTTCAAGTT GAAGTATTGGGTGTAGTTGGGTGTCATCCAAAGAAGGAAGCTGTAAATGGGGAAAATGTA ACTTTTAGAGTTGATGACTGCGAGAAAGATGAAAATTTTATGGTCACGTGGAATGAGGCA AGATCAGATGTTTCTTGTTCGTGCCTTCTATTTGAATACAATGGTTTCCTCTGTAGGCAT GCAATGATTGTTCTTCAGATGTGTGGTCTTTCAATCATCCCATCCCAATATATTTTGAAG AGGTGGACCAAAGATGCAAAGAATATACAGTTAATATCTGAGGGGACTGAAAGAATTCGA AACAGAGTACAAAGATACAATGATCTATGTAGAAGGGCAATTGAACTGGGTGTGGAGGGT TCTTTATCTGAGGAGAGTTACGGCGTTGCCTTCCGTGCCCTAGATGAAGCTCTAAAGAAC TGTGTGAATGTTAACAATAGAAGTTCTGCATTAACAGAATGTAGCAGCAGTGCAGTTGGA CTTCGTGATCTTGAAGAAGATACTCAAGGGATTCATGCAATTAAAACAAGTAGGAAGAAA AATACAAACAAGAAGCGGAAGATGCACTCTGAACCAGAAGCTGCAATTGTTGAAGCAAAA GACAGCTTACAACAAATGGATAGTCTTACTGTGGGTGGAATGACGTTGAATGGCTATTAT GGTACACATCAGAATGTGCAGGGACTGATACAGTTAAATTTGATGGAACCTCCCCATGAT GGCTATTATGTTAACCAACAGAATATGCAAGGACTGGGACAACTCAATACAATTGCACCT GGCCATGATGGTTTTTTTGGGTCTCAACAAAGCATTCCAGGACTAGGGCATTTGGATTTT AGGCAGCCGAGTTTCACATATGGTTTGCAGGATGAGCCTAGTCTAAGAGCTGCTCAGCTG CATGGAAACAATGCTAGATGA