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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g048500.3.1

CDS Infomation

RNA-binding KH domain protein (AHRD V3.3 *** G7IP63_MEDTR)

Sequence

ATGGGTGAGACTGGAAAAAGATCGCGTAGGGATGATGGGGATAACAAGAACCAGAAGAGG
AGGACAGATAGGGACGAGAAAAACGATGATGAGCTAATAGTTTACAGAATTCTGTGTCCA
AATAATGTGATTGGAAGTGTTATAGGAAAGAATGGAAAAGTTATAAATTCAATTAGGTCT
GAGACTAAGGCGAAGGTCAAGGTGGTGGATCCATTTCCAGGTGCTAAGGATAGAGTTATA
CTCGTTTATTGCTATGTAAAGGAAAAGGAAGATGTTGAGGTTGATCAGGATTTCAATGAG
AAACAACCTCTTTGCACGGCTCAGGATGCTCTTCTCAAGGTTTATACGGCAATTGCAAAT
GCTTTGGCTGCAATTGGAGAATCTGATAAGAAGCGGAAGGATAAAGAGGAGTGTCAGCTT
CTTGCTCCTTCAAGCCAGTCTGCTAATATCATTGGTAAATCTGGTACCACCATAAAGAAG
TTGAGAAGCAAGATGAGGGCCAATATTAAAGTAGTTGCCAGAGATGCTAGTGATCCAACA
CATTCTTGTGCACTCGAGTTTGATAACTTTGTTCTGATAACTGGTGACCCAGAATCTGTT
AGGAGATCACTCTTTGCTATTTCTGCAATCATGTACAAATTCACACCTAAGGAAGAAATT
CCTCTTACTACCAATGTTCCTGAAGTACGTCCAAGTATTATTATCCCTTCAGATGTTCCC
ATATATCCAGGAGCTGGGATTTATCCAAATGTGGATCCTATTATGCCATCTCGTTCTGTT
CCATCTGTTTTGGGTACCACACAAATACCAGAGCTTCCGGGTTATGTGGATGCAGGAAGC
ACATGGCCTCTTTATTCTTCTGGTCTTCCCATGGTTTCTGGTTACAGTGGTGCCTCTCAA
ACTGAGGAATTGACTATTAGAGTGCTGTGTCCAACTAACAATATTGGTCGTGTTATTGGC
AAGGGAGGAGCTTCAATTAAAAGTGTAAGGCAAACAAGTGGTGCTCGTATCGAGGTTTGT
GATGCCAAAGCTGATCGTGATCAGTGCATTATCACAGTCATTTCCACTGAGTCAGTGGAT
GATCTTAAATCCATGGCAGTTGAAGCTGTACTTCTGCTGCAAGGGAAAATAAATGACGAA
GATGAGGATACTGTAACTTTTCGTCTACTTGTTCCATCTAAGATTATTGGATGTATCATT
GGGAAAGGTGGTTCAATCATTAATGAAATCCGGAAGAGAACTAGAGCTGATGTACGTATC
TCAAAAGGCGAGAGGCCCAAATGTGCGGATTCAAATGATGAACTTGTTGAGGTGTCTGGA
GAAGTTAGTAGTGTGAGGGACGCCCTTATCCAGATTGTACTGAGGCTCAGAGATGATGTT
ATAAAAGGCCAAGAAGGTAATCATAATCCATCTGCAGCTTTACGCGCTGGTGCTACTGGT
TTCTCATTGGCTCCAGTGTTGCCCAACGTTCCTCCAGCTGCTCCTTTGAGCTTTGAACAT
AGGATTGAAACTGGGAATGGTGTTGGAATGCGTTCTTCAGGCAGCCGATATGGTCATGAG
TCGCTCTCGATAGGGGAAGATACCTATGGAACGTTCTCTTCATATTCCTCAAAGTTATAT
GGCGGATTGCCTCCACCCTCAGCTGTAGAGATGGTTATCCCAGGACATGCAGTCGGTAAA
GTTATGGGTAAAGGTGGCTCAAACATAGATAATATTCGCAAGATATCTGGAGCAGCTGTG
GATATAATTGATTCCAAATCCTCTAGAGGTGATCAGATTGCTATAATATCTGGTACGCAG
GAACAGAAGCGTGCTGCTGAGAACTTAATTCAGGCATTCATAATGGCGACATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g048500.3.1

PEP Infomation

RNA-binding KH domain protein (AHRD V3.3 *** G7IP63_MEDTR)

Sequence

MGETGKRSRRDDGDNKNQKRRTDRDEKNDDELIVYRILCPNNVIGSVIGKNGKVINSIRS
ETKAKVKVVDPFPGAKDRVILVYCYVKEKEDVEVDQDFNEKQPLCTAQDALLKVYTAIAN
ALAAIGESDKKRKDKEECQLLAPSSQSANIIGKSGTTIKKLRSKMRANIKVVARDASDPT
HSCALEFDNFVLITGDPESVRRSLFAISAIMYKFTPKEEIPLTTNVPEVRPSIIIPSDVP
IYPGAGIYPNVDPIMPSRSVPSVLGTTQIPELPGYVDAGSTWPLYSSGLPMVSGYSGASQ
TEELTIRVLCPTNNIGRVIGKGGASIKSVRQTSGARIEVCDAKADRDQCIITVISTESVD
DLKSMAVEAVLLLQGKINDEDEDTVTFRLLVPSKIIGCIIGKGGSIINEIRKRTRADVRI
SKGERPKCADSNDELVEVSGEVSSVRDALIQIVLRLRDDVIKGQEGNHNPSAALRAGATG
FSLAPVLPNVPPAAPLSFEHRIETGNGVGMRSSGSRYGHESLSIGEDTYGTFSSYSSKLY
GGLPPPSAVEMVIPGHAVGKVMGKGGSNIDNIRKISGAAVDIIDSKSSRGDQIAIISGTQ
EQKRAAENLIQAFIMAT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g048500.3.1

Transcript Infomation

RNA-binding KH domain protein (AHRD V3.3 *** G7IP63_MEDTR)

Sequence

TCTGCATAAAAATGCATATGCAATTAAATAACTTTTCCATAAAATAACCTCTTTTAGTAC
ATTATCTGGTAAAAGAGAGAGCCCACAATACCAAAGGAGCAAAACCGGTGTAAACAAGTC
ATCACAAAACTAAAAACCCTAATTTTGGAATATCATCACAGGCAGGACTCAATCACAGGG
GTAATTCGATGGGTGAGACTGGAAAAAGATCGCGTAGGGATGATGGGGATAACAAGAACC
AGAAGAGGAGGACAGATAGGGACGAGAAAAACGATGATGAGCTAATAGTTTACAGAATTC
TGTGTCCAAATAATGTGATTGGAAGTGTTATAGGAAAGAATGGAAAAGTTATAAATTCAA
TTAGGTCTGAGACTAAGGCGAAGGTCAAGGTGGTGGATCCATTTCCAGGTGCTAAGGATA
GAGTTATACTCGTTTATTGCTATGTAAAGGAAAAGGAAGATGTTGAGGTTGATCAGGATT
TCAATGAGAAACAACCTCTTTGCACGGCTCAGGATGCTCTTCTCAAGGTTTATACGGCAA
TTGCAAATGCTTTGGCTGCAATTGGAGAATCTGATAAGAAGCGGAAGGATAAAGAGGAGT
GTCAGCTTCTTGCTCCTTCAAGCCAGTCTGCTAATATCATTGGTAAATCTGGTACCACCA
TAAAGAAGTTGAGAAGCAAGATGAGGGCCAATATTAAAGTAGTTGCCAGAGATGCTAGTG
ATCCAACACATTCTTGTGCACTCGAGTTTGATAACTTTGTTCTGATAACTGGTGACCCAG
AATCTGTTAGGAGATCACTCTTTGCTATTTCTGCAATCATGTACAAATTCACACCTAAGG
AAGAAATTCCTCTTACTACCAATGTTCCTGAAGTACGTCCAAGTATTATTATCCCTTCAG
ATGTTCCCATATATCCAGGAGCTGGGATTTATCCAAATGTGGATCCTATTATGCCATCTC
GTTCTGTTCCATCTGTTTTGGGTACCACACAAATACCAGAGCTTCCGGGTTATGTGGATG
CAGGAAGCACATGGCCTCTTTATTCTTCTGGTCTTCCCATGGTTTCTGGTTACAGTGGTG
CCTCTCAAACTGAGGAATTGACTATTAGAGTGCTGTGTCCAACTAACAATATTGGTCGTG
TTATTGGCAAGGGAGGAGCTTCAATTAAAAGTGTAAGGCAAACAAGTGGTGCTCGTATCG
AGGTTTGTGATGCCAAAGCTGATCGTGATCAGTGCATTATCACAGTCATTTCCACTGAGT
CAGTGGATGATCTTAAATCCATGGCAGTTGAAGCTGTACTTCTGCTGCAAGGGAAAATAA
ATGACGAAGATGAGGATACTGTAACTTTTCGTCTACTTGTTCCATCTAAGATTATTGGAT
GTATCATTGGGAAAGGTGGTTCAATCATTAATGAAATCCGGAAGAGAACTAGAGCTGATG
TACGTATCTCAAAAGGCGAGAGGCCCAAATGTGCGGATTCAAATGATGAACTTGTTGAGG
TGTCTGGAGAAGTTAGTAGTGTGAGGGACGCCCTTATCCAGATTGTACTGAGGCTCAGAG
ATGATGTTATAAAAGGCCAAGAAGGTAATCATAATCCATCTGCAGCTTTACGCGCTGGTG
CTACTGGTTTCTCATTGGCTCCAGTGTTGCCCAACGTTCCTCCAGCTGCTCCTTTGAGCT
TTGAACATAGGATTGAAACTGGGAATGGTGTTGGAATGCGTTCTTCAGGCAGCCGATATG
GTCATGAGTCGCTCTCGATAGGGGAAGATACCTATGGAACGTTCTCTTCATATTCCTCAA
AGTTATATGGCGGATTGCCTCCACCCTCAGCTGTAGAGATGGTTATCCCAGGACATGCAG
TCGGTAAAGTTATGGGTAAAGGTGGCTCAAACATAGATAATATTCGCAAGATATCTGGAG
CAGCTGTGGATATAATTGATTCCAAATCCTCTAGAGGTGATCAGATTGCTATAATATCTG
GTACGCAGGAACAGAAGCGTGCTGCTGAGAACTTAATTCAGGCATTCATAATGGCGACAT
GAGCAATAAAGACACATCTCCTTTCTGAAGGTGCGACCTTGACTAAATATCGAGGTTCCT
TCTTCCGAAGTTCCTCTCTAGAATATGGTAGGTTCTCGTGCTGGAGAGTGTCATTTGCGT
AGGTTTGATAAATTTCTTCTCTGTAGGAACGTTTGCAAGTAAAATTCATGTAGTTGGACC
ATTTGTTCTGTTTTCTGCCTATATAGGTTCAGCCATGTTGCCTGATAGGCTCTTTTCATC
TGCTCTGGTTAGAACTTCGTAGGACATTATCTTTCCTTTGTTAGTCTGTCATCAGTTCTT
ATCATTTGATGAATACCGCTTCCAACTTTCTCCTACTTTCCCATGCTCTGTTTACTTTAT
ACGGAACTTTATCTATTATCAGCTGTCAAGCTCATGTTACACGGATTTCAGTATCTTGTT
GCTGATTCCTCTTTGCTCTTAGCTTCTTCAGTAAGATCAGGTGTTGCTGATATGACCTTT
GGTTCATGTGCTCATTCTGTGAGTTTGTATAAGTTCTCTGCTGTGTGCATTAGCACTACA
AGATATATCCTAATAACCAGTGAGCGTCTCCAAATTCTCAAGATCCTCTAAAGAAGGAAA
ATATCTGGTGCTTAACTTGGGCTAAAGCATTTACTGTTCCATATAATCATAGTTCTGCAG
TTTCCGGTGCCAATTGCTTCCAAGATCTCTCATTGAGTATATGTTTCTATCTAATTTGCT
GCGGTCCCTTTCACCTTTAGCTATCTTCTATCTATTTTTGGAATCTTTCACTTCATCTAT
TCACTTTACTAAAAAAGAAAAGGGAAGACAAATCTATTTCAGTCTGACAGCCTTTTAGTT
CTTTGATTCAGAAGAGTAGAACTGAAATTAAATTTAGGAACAGAGAATTATAAGCAAAAA
AGGCAAACAATTTGTTCAATTTACTCATTGATTGCCTTGTGACTATTGTATGCGCATGAT
ATTGATCTGCCACCTCTTTGTGTTTTATTTAATTACATCTTAAAATATCTTAGTACTAGC
AAGATAATCTCTTAGAGAAATTAATTCCCAAGTGTTTGGACTTTTTCCATCTAAATCCTT
CATCAAAAGGTTCTCTCTGGAAGGGGAAAGACACTTCTGCACATCTTTTCACTTGTTTAT
GCTTTGTTATCTCATCTTTTCTTGGTGAAGGTCATTGAGTCTTAGTATAAGACATGAGCT
GTTTAGCAACTTGCTTGTTTATTATTTCCAATCTATCGACAGTCCACCAATTATTCTTAG
CAAGTGTTAGCTAATTGAATCTTGTTCCCCTCCGCTCTATTCGTGCCTTCTGTTCTAGAA
AAAATTTGGTGTTCCTCAGCATTTTAGAGTTTCTTTAAATCTCACACTTATGTTTCACTG
GTAAGATATCTCTAATCATATTTGAAAGACTCTTGGTTAACACCGGACCTAATGTACGGT
TTAAGCTACATTTCTCCGTTTAGCTCCAACCACCATAATGTACACTTAATTATGTGCTCA
TGTGAGATATGTAGGG