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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g045780.3.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RVL0_RICCO)

Sequence

ATGGAGCTTCATTTTGCAGGCGCATCGTATTTGATGAAAGAAGGTATAAAACGGCGAGGT
TTGATTATCAAATCATCAAGCAGTAGTACTTCACAAGGGCTGCAGAAATGTTCAAAGAAA
AACCTTTCTCGTATACTTAGAACAGAAGCCGCCATTAGAGGTATCCACAGGAAAGCCAAC
TCAGAAAAATACACTAATCTTTGGCCCAAGGCCGTTCTGAAGGCTCTCGATGATGCTATT
AGGGACAATCGCTGGGACTCTGCTCTTAAGATTTTCGACCTTCTTCGCAAGCAACATTGG
TATGAGCCAAGATGCCATACATATGCTAAGCTTTTGGTAATGCTCGGCAAGTGCAAGCAG
CCAAGTCAAGCTAACTTGCTTTTTGAGATTATGCTAGCGGATGGGCTTCAACCAACAGTA
GATGTTTATACTGCACTTGTAAATGCATATGGTCTTAGTGGCCTCCTTGATGAGGCTCTG
CGAACTATTGATGATATGAAATCAGTTAGTAATTGCAAGCCTGATGTGTATACTTACTCG
ATCCTAATTAAATGCTGCACTAAAGTTCGTCGTTTTGATATGATTGAATACATTTTGGCT
GAGATGGTGTATTTGGGAATTGAATGTAGTTCTGTGACATACAATACCATAATTGATGGC
TATGGTAAAGCTAAGCTATTTGAGCAGATGGAATGCTCCTTGACCGATATGATAGAAAAT
GAGACTGCCTTTCCAGATGTTTTCACCTTGAATTCAGTAATTGGGTCCTATGGCAGCTGT
GGGAAGCTTGAGGAAATGGAGAAGTGGTTTGAAGAATTTCAGGTAATGGGAATAAAGCCA
GATGTTATGACATTTAACATTTTAATCAAGTCATATGGAAGAGCTGGCATGTACCAGAAA
ATGGAGTGTGTACTTGATTTCATGAGGAATTGGTTCTATTCTCCAACAGTTGTGACTTAC
AATATCATCATTGAGACATTGGGGAAAGCTTGCCTCATTAAGAACATGGAACAGTTTTTC
CTACAGATGAAGCATGAAGGGGTGAAGCCAAGTTCATTCACTTATTGCTCTCTTGTCAGT
GCGTATAGTAGAGCTGCACTTATGGAAAATGTTGATTCAATCATGAGGCAAGTTGAGAAT
TCAGATGTAGTTCTAGATACTCCTTTTTTCAATTGCATCATCAGTGCTTACGGTCAAGTT
GGTGATATAGAGAGGATGGTGGCATTGTTCTTGGAAATGAAGGTCAGAAAATGTAAACCA
GACTACATCACATTTTCTACCATGATTCAGGCGTACAATTCACAAGGAATGACTGAAGCT
GCAATGGACTTGAAGACAGAAATGATTACTTCTTGTGGTACTTGTACTATGATTACTTCT
TGTGGTACTTGTACTATTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g045780.3.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RVL0_RICCO)

Sequence

MELHFAGASYLMKEGIKRRGLIIKSSSSSTSQGLQKCSKKNLSRILRTEAAIRGIHRKAN
SEKYTNLWPKAVLKALDDAIRDNRWDSALKIFDLLRKQHWYEPRCHTYAKLLVMLGKCKQ
PSQANLLFEIMLADGLQPTVDVYTALVNAYGLSGLLDEALRTIDDMKSVSNCKPDVYTYS
ILIKCCTKVRRFDMIEYILAEMVYLGIECSSVTYNTIIDGYGKAKLFEQMECSLTDMIEN
ETAFPDVFTLNSVIGSYGSCGKLEEMEKWFEEFQVMGIKPDVMTFNILIKSYGRAGMYQK
MECVLDFMRNWFYSPTVVTYNIIIETLGKACLIKNMEQFFLQMKHEGVKPSSFTYCSLVS
AYSRAALMENVDSIMRQVENSDVVLDTPFFNCIISAYGQVGDIERMVALFLEMKVRKCKP
DYITFSTMIQAYNSQGMTEAAMDLKTEMITSCGTCTMITSCGTCTI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g045780.3.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RVL0_RICCO)

Sequence

ATATCAAACTGTTAACAAAGATATTTTTATTCAATTTAATCACATTTTAATTTTTCTGGA
AGAGAGGGGACTAAAATGTAGTAATTGGAGATATGTAATTGTATATAATAGTGTTTTGCG
GCCCTTATCGTCTTGTTTGTGGAGTGAGAGTGAGTGGGTATGGAGCTTCATTTTGCAGGC
GCATCGTATTTGATGAAAGAAGGTATAAAACGGCGAGGTTTGATTATCAAATCATCAAGC
AGTAGTACTTCACAAGGGCTGCAGAAATGTTCAAAGAAAAACCTTTCTCGTATACTTAGA
ACAGAAGCCGCCATTAGAGGTATCCACAGGAAAGCCAACTCAGAAAAATACACTAATCTT
TGGCCCAAGGCCGTTCTGAAGGCTCTCGATGATGCTATTAGGGACAATCGCTGGGACTCT
GCTCTTAAGATTTTCGACCTTCTTCGCAAGCAACATTGGTATGAGCCAAGATGCCATACA
TATGCTAAGCTTTTGGTAATGCTCGGCAAGTGCAAGCAGCCAAGTCAAGCTAACTTGCTT
TTTGAGATTATGCTAGCGGATGGGCTTCAACCAACAGTAGATGTTTATACTGCACTTGTA
AATGCATATGGTCTTAGTGGCCTCCTTGATGAGGCTCTGCGAACTATTGATGATATGAAA
TCAGTTAGTAATTGCAAGCCTGATGTGTATACTTACTCGATCCTAATTAAATGCTGCACT
AAAGTTCGTCGTTTTGATATGATTGAATACATTTTGGCTGAGATGGTGTATTTGGGAATT
GAATGTAGTTCTGTGACATACAATACCATAATTGATGGCTATGGTAAAGCTAAGCTATTT
GAGCAGATGGAATGCTCCTTGACCGATATGATAGAAAATGAGACTGCCTTTCCAGATGTT
TTCACCTTGAATTCAGTAATTGGGTCCTATGGCAGCTGTGGGAAGCTTGAGGAAATGGAG
AAGTGGTTTGAAGAATTTCAGGTAATGGGAATAAAGCCAGATGTTATGACATTTAACATT
TTAATCAAGTCATATGGAAGAGCTGGCATGTACCAGAAAATGGAGTGTGTACTTGATTTC
ATGAGGAATTGGTTCTATTCTCCAACAGTTGTGACTTACAATATCATCATTGAGACATTG
GGGAAAGCTTGCCTCATTAAGAACATGGAACAGTTTTTCCTACAGATGAAGCATGAAGGG
GTGAAGCCAAGTTCATTCACTTATTGCTCTCTTGTCAGTGCGTATAGTAGAGCTGCACTT
ATGGAAAATGTTGATTCAATCATGAGGCAAGTTGAGAATTCAGATGTAGTTCTAGATACT
CCTTTTTTCAATTGCATCATCAGTGCTTACGGTCAAGTTGGTGATATAGAGAGGATGGTG
GCATTGTTCTTGGAAATGAAGGTCAGAAAATGTAAACCAGACTACATCACATTTTCTACC
ATGATTCAGGCGTACAATTCACAAGGAATGACTGAAGCTGCAATGGACTTGAAGACAGAA
ATGATTACTTCTTGTGGTACTTGTACTATGATTACTTCTTGTGGTACTTGTACTATTTAG
CCTCTGTTTCTCCTGTCCATATCATTTTGCTTCATAAAGTATGAATCCTTTCAGACTCAA
AGTTTGTATCATAAATTCAGCTATTTAGGTTAGCTCTATGATATTTCTAGCTAAGTGCAG
ATGATAATAAAAGGAAGTAGTATTTGCTAAACCAAGTTATCATTTAATGAACTGCTTGAT
ATCTGACACTTTGTTGTTACATTTTATTAGAATCAAATGAATTGATCAGCAGCTAGTACA
ATCTATCTGCTACCGAAGGGAACCGTTCACTTGGAATTCTGTTCATCAATCTCAATGTTG
TGAAAGTGGGCAGAGTGTTATCTGCATGTGAGCTTAAGGATGATATAGAAATCCGTTAAT
CAGATGGCATGGATCCAAGGAAAAGAACATTGTGAGTCTACTTGCAGCAATGTGATTTCT
CTTACATATTTCTGTGAACTTTCGACGGCCTTAACCCACAACTAGAGAGATTTGCAGTTT
CCAAAAGCTCTTGTTAGTTGTTAGGGAATAGTGTGGTTTAACTTCTCTGAGTAGCTTTCC
AGTTTGTTTGCCTATGTATGTTATTTCTTGATTTCTTTTTTTCTTGTATTAGCATATGTA
TCTACAGGTAAGAGAGGGAGGGAGCAGTTAAAGTTCTTCTGCTTACTATGTTCACGGAAC
AGCCAAACGTGCTGTGATGTCTGTAGTTACAACCTGTGGGTTCATATTCAGTTGAAAACC
TCAGTTATGCTTGGGTGAATGAAGATTTTATCAGTAGTGGGTGATTACGATGGATAATTA
ACTCCTCGGTTACATTGAGGGTCTACACTATTTCAGCTGCCACTGTGGGGTTGTCTACTG
CAGTACTAATAGTCATGCAGCAAGGCCTTTTTTTTTACTAACCAGAGCTGACTCAACCAT
ACATATGGGTTTTGAACAGGTCAGTGATTTAACAGGACTGACTTCTTTCGAAAGAGCAAA
GCCATGGGAAAGATAGAGCATTATTAGGACACTTGCTGATTCTTCCTTCTAGTCGGTTTG
TTTTACCTCTTACTGGTTGCAAGTCTTGCGCAACAGATATATAGAGCAATATAGTGTAAG
ATAGTTTTACCATTTTTCAGACCCTCGCCATTTCACTTGTTACTGTGGAAATGAATTACA
GCATTATGTTTGATATACTACTTGAGCAGCGGGTGAACATCACTTATTTTACTTTGCTTT
CTTAGAAGTGGATTAAAATGTCCAGACACCGTTTGACTTTCTGTAGAGCTGCAATCGCCA
AACGACCTGTGGATGGATGGACCTTATTACAACACGTATGTACAACCACTCCAATTTTTA
TATTGTAATTGGAGAAGTTCTTCTACTTCAAGCTTTTAACAGTGTCCTTCAAACTGACCT
CTAGAAGAGTGAAATTGATGCCTAAGCTGTTTCCCCATTCTAAGACCGGAAAGGTGGCAC
CATAGGCAGCAGCTCCTCTTTATACCTAAATGCCACATTCAAGAATTTGAGATACCAAAA
TTCTCAAGATAGTTGATAACTTATACAAGTTAAATTAAGCTATAATGAATGAAAATGCAG
TGTCAGTTTCTTATATAATTTGAAGACTTCAATTTCTAGGTTATCAATATCTTTCAGGTT
TATTTACTTTAGATTCACCAAATTACACATTGTTACTTGTGAGCGTATTTCTGAATTCTA
TGTAGAGTTAGTGAGTTATAAGAAAAAAAATTGTTTTATGCTCACCAAGATAAAAAATGT
TATCTAGATATTACATGTTAAATAACTCAAAAATATCAACGACTTACTTTCCAGGGATGC
TGAGTTTGTTTTTCTTTCACAAATTGGGTCTTGTGCTTTTTCTAT