Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g016160.3.1
CDS Infomation	Cation/H(+) antiporter (AHRD V3.3 *** A0A0K9NPK0_ZOSMR)
Sequence	ATGGCAGATCCAGAGCCATTGGTTGATGTTGGAAAGTTAAATGAAAAAGTTCTATGTTAT GCACAAACAATTTATAGATTTAATGGAGTTTGGGAAGGACCAGATCCTCTAACACCAATT ATCCCTCTTTTCTTTATTCAAGTTTCATTAGCTATCTTGATCACTCGTTTTGTCTCCTTT GTCTTAAAACCTACCAAGCAACCTCCTTTTGTTGCTGAGATTATTAGTGGCATACTTTTA GGTCCTACAGCACTTGGAAGGATCATGAGGTTTAGGAGGCTGCTTTTCCCAAACTACAAT TTCCATGTTATTGAGACAATGGCTCATGTAGCCCTTGTGTTCTATGGGTTTCTAGTGGGA TTGCAGATGGATTTGAAATCCGTTCTTCGAATTGGAGTAAAGGCTAGAAATGTTGCTATT ATCGGTATCATCATCCCTTTTGTCTTGGGAACAATATTATATTTCTCACTTGCTCACGAC GAAGAAGTTAGAGGCTTCATTTTCTATGGTGGTGGTCTTACTATAACAGGGTTCTCTGTT CTGTCTAAGATACTTGATAAACAAAAGATCCTCCAAACTGATATAGGGAAAATGGCTATG TCTTCAGCTGTAATCAATGATATTGGTGCATGGTTTATTCTTACACTAGGATATGTTGTC ACAGGGAGTACAGCTAACATCCATTGGGCATTAATTTGCACGATTGCTTACGCCTTGTTC TGTGTCTTTTATCTTCGTCGTGCCATTGGCTGGATCATTAGAAAAATGCCAGAAGGACAA GGGTATAGTGAGTTCTTTATATGTTCAATCCTTGCTGGTATGGCTATTTCCGGAGTTATA ACCGATGCTTTAGGGACACATCCTATTATTGGAGCTTTTCTCTTTGGACTTAGTATACCT AACCAACTGCTTCAAGCAGAAATTATCGATAAGCTTGATGACTTTGTCACAGGCATTTTT ATGCCATCTTTCTTTGTTGTTTGTGGACTCAGAACCAATTTCGGAGAAATGGGCAGCATT TACGAAATTGTTGGCTATGTACTTCTATTCGTTTCAGCCAAAATCTTGAGCTCAATAGCT GCCACTTTCTTCTCTGAAATGACTATTAAGGAGGCCTTAGCTGTTGGAGTACTTAGCAAC ACCAAGAGCATCATGGCATTGATCATTATCGAAGCTGGTCAGGCACAACAGGTTTTGAGC ACACAATTGTATTCCCTTATGGTGGCTGGCATTTTGGTGATGACGGTGCTAGTCACACCT ATGACTATGCTCTATCGTCCCTCACAGGAAATTGCACCCCACAAACGAAGGACTATACAG AAGGCAAGAATAGATGAGGAACTTCGGGTCCTTGCTTGCATCCATGGCACACAAGACATC CCTTCAGTCATCAACCTTCTTGGCTCGTCGCATTCTACACCAGCATCCCCAATAACTGTC TTTGCTCTACAAGTAGTCGAACTAGTAGGGCGTGCATCATCTATGCTAGAAGTCCATAGC TCAGGAAAACGAGGCTCGCGAAGTCTTGGACACGAGGAGACACAAACAAGACAGATCATC ACTGCTTTCGACAACTATGAGCTACGATCAGATGGAGTGATGGTACAAGTACTTACAGCA AGATCTGCTATGTCCACCATGGATGAAGATATGTGCAACATTGCCAAAGACAAGCGTGTA GCTTTCATCATTCTCCCTTTCCACAAACAACGAGGTATTGATGGTGAAATGGAGGATGTC AACCCTGAAATTCGGGCTGTCAACGAAGGTGTGCTAGCTAATGCCCCTTGTTCTGTGGGA ATCCTCATCGATCGTGGCCTCTCTGAGACCAGTGACTATGCAAAAAATATTGTTGTCCTC TTTTTCGGAGGTGCTGATGACAGGGAAGCTCTGGCTTATGCTTTGAGAATGGTTGATCGT CCAGATACACGCCTAACTGTTGTAAAGTTCATTCCAGACGAAGGCGCTTCTGATGTAGAG CAAACGGAATTTGCTGATGAAAGTCATGTGAATGTCCAGATTGACAAAGAGAGTGAAAAG TTGATGGACGACGAGTTCTTAAACAGGTTCAAGATCAGCACAGCCAATGACAAATCAGTG ACATACATAGAACTGGTGCTGAATGATGTGGAAGAAGCTGTCAAGGCCATAAAACTAATG GATCAGCATAACTATGATCTCTACATCGTAGGAAAAGGCCGAGGCGTAGTGTCACCACTA ACAGCTGGCCTAGTCGATTGGTGTGACTGTCCTGAGCTTGGGGCTATTGGTGATCTTTTA GTGACATCAGAATTTGACTCCACATTCTCGGTGTTGGTGATGCAACAGTACGTTAAGCCA ATTGGAGATGGTTCAGTAACTTCTTATGGATCAATGAGTGAGAGGATAGCAGGCATTGGG ATGGACATGGACATGGACATGCAACACGCGGATAGTGAATCAGGGGACGTGTTCTCCAGT TTTAGAAGGCGAACGGAACCTATGCCACGAGCCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g016160.3.1
PEP Infomation	Cation/H(+) antiporter (AHRD V3.3 *** A0A0K9NPK0_ZOSMR)
Sequence	MADPEPLVDVGKLNEKVLCYAQTIYRFNGVWEGPDPLTPIIPLFFIQVSLAILITRFVSF VLKPTKQPPFVAEIISGILLGPTALGRIMRFRRLLFPNYNFHVIETMAHVALVFYGFLVG LQMDLKSVLRIGVKARNVAIIGIIIPFVLGTILYFSLAHDEEVRGFIFYGGGLTITGFSV LSKILDKQKILQTDIGKMAMSSAVINDIGAWFILTLGYVVTGSTANIHWALICTIAYALF CVFYLRRAIGWIIRKMPEGQGYSEFFICSILAGMAISGVITDALGTHPIIGAFLFGLSIP NQLLQAEIIDKLDDFVTGIFMPSFFVVCGLRTNFGEMGSIYEIVGYVLLFVSAKILSSIA ATFFSEMTIKEALAVGVLSNTKSIMALIIIEAGQAQQVLSTQLYSLMVAGILVMTVLVTP MTMLYRPSQEIAPHKRRTIQKARIDEELRVLACIHGTQDIPSVINLLGSSHSTPASPITV FALQVVELVGRASSMLEVHSSGKRGSRSLGHEETQTRQIITAFDNYELRSDGVMVQVLTA RSAMSTMDEDMCNIAKDKRVAFIILPFHKQRGIDGEMEDVNPEIRAVNEGVLANAPCSVG ILIDRGLSETSDYAKNIVVLFFGGADDREALAYALRMVDRPDTRLTVVKFIPDEGASDVE QTEFADESHVNVQIDKESEKLMDDEFLNRFKISTANDKSVTYIELVLNDVEEAVKAIKLM DQHNYDLYIVGKGRGVVSPLTAGLVDWCDCPELGAIGDLLVTSEFDSTFSVLVMQQYVKP IGDGSVTSYGSMSERIAGIGMDMDMDMQHADSESGDVFSSFRRRTEPMPRA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g016160.3.1
Transcript Infomation	Cation/H(+) antiporter (AHRD V3.3 *** A0A0K9NPK0_ZOSMR)
Sequence	TGGTAAAAAATCAAGTTCTTACTATTTTTTTCACATGGTGATAACCATACCTTTAGTTTT GCTCATGTTCCATTTTATATCTATCTCCATTTGTTGTGGTGGCTAAATATCAAAAATAGG GTTGTAGCCAGGGTTATTCCCTGCCCTGGCACAAGAAATAGACAAAACAAAACAAAAGGG TGTTCAAGAAAAAATAATGTACAAATTTTGATTGTACAATTTTTGTGATTTAAGAGGGAA AAAATCTTTTTGTTGTGGTTATTGTTGTTAAACATTAGAAAGACAAAAAATGGCAGATCC AGAGCCATTGGTTGATGTTGGAAAGTTAAATGAAAAAGTTCTATGTTATGCACAAACAAT TTATAGATTTAATGGAGTTTGGGAAGGACCAGATCCTCTAACACCAATTATCCCTCTTTT CTTTATTCAAGTTTCATTAGCTATCTTGATCACTCGTTTTGTCTCCTTTGTCTTAAAACC TACCAAGCAACCTCCTTTTGTTGCTGAGATTATTAGTGGCATACTTTTAGGTCCTACAGC ACTTGGAAGGATCATGAGGTTTAGGAGGCTGCTTTTCCCAAACTACAATTTCCATGTTAT TGAGACAATGGCTCATGTAGCCCTTGTGTTCTATGGGTTTCTAGTGGGATTGCAGATGGA TTTGAAATCCGTTCTTCGAATTGGAGTAAAGGCTAGAAATGTTGCTATTATCGGTATCAT CATCCCTTTTGTCTTGGGAACAATATTATATTTCTCACTTGCTCACGACGAAGAAGTTAG AGGCTTCATTTTCTATGGTGGTGGTCTTACTATAACAGGGTTCTCTGTTCTGTCTAAGAT ACTTGATAAACAAAAGATCCTCCAAACTGATATAGGGAAAATGGCTATGTCTTCAGCTGT AATCAATGATATTGGTGCATGGTTTATTCTTACACTAGGATATGTTGTCACAGGGAGTAC AGCTAACATCCATTGGGCATTAATTTGCACGATTGCTTACGCCTTGTTCTGTGTCTTTTA TCTTCGTCGTGCCATTGGCTGGATCATTAGAAAAATGCCAGAAGGACAAGGGTATAGTGA GTTCTTTATATGTTCAATCCTTGCTGGTATGGCTATTTCCGGAGTTATAACCGATGCTTT AGGGACACATCCTATTATTGGAGCTTTTCTCTTTGGACTTAGTATACCTAACCAACTGCT TCAAGCAGAAATTATCGATAAGCTTGATGACTTTGTCACAGGCATTTTTATGCCATCTTT CTTTGTTGTTTGTGGACTCAGAACCAATTTCGGAGAAATGGGCAGCATTTACGAAATTGT TGGCTATGTACTTCTATTCGTTTCAGCCAAAATCTTGAGCTCAATAGCTGCCACTTTCTT CTCTGAAATGACTATTAAGGAGGCCTTAGCTGTTGGAGTACTTAGCAACACCAAGAGCAT CATGGCATTGATCATTATCGAAGCTGGTCAGGCACAACAGGTTTTGAGCACACAATTGTA TTCCCTTATGGTGGCTGGCATTTTGGTGATGACGGTGCTAGTCACACCTATGACTATGCT CTATCGTCCCTCACAGGAAATTGCACCCCACAAACGAAGGACTATACAGAAGGCAAGAAT AGATGAGGAACTTCGGGTCCTTGCTTGCATCCATGGCACACAAGACATCCCTTCAGTCAT CAACCTTCTTGGCTCGTCGCATTCTACACCAGCATCCCCAATAACTGTCTTTGCTCTACA AGTAGTCGAACTAGTAGGGCGTGCATCATCTATGCTAGAAGTCCATAGCTCAGGAAAACG AGGCTCGCGAAGTCTTGGACACGAGGAGACACAAACAAGACAGATCATCACTGCTTTCGA CAACTATGAGCTACGATCAGATGGAGTGATGGTACAAGTACTTACAGCAAGATCTGCTAT GTCCACCATGGATGAAGATATGTGCAACATTGCCAAAGACAAGCGTGTAGCTTTCATCAT TCTCCCTTTCCACAAACAACGAGGTATTGATGGTGAAATGGAGGATGTCAACCCTGAAAT TCGGGCTGTCAACGAAGGTGTGCTAGCTAATGCCCCTTGTTCTGTGGGAATCCTCATCGA TCGTGGCCTCTCTGAGACCAGTGACTATGCAAAAAATATTGTTGTCCTCTTTTTCGGAGG TGCTGATGACAGGGAAGCTCTGGCTTATGCTTTGAGAATGGTTGATCGTCCAGATACACG CCTAACTGTTGTAAAGTTCATTCCAGACGAAGGCGCTTCTGATGTAGAGCAAACGGAATT TGCTGATGAAAGTCATGTGAATGTCCAGATTGACAAAGAGAGTGAAAAGTTGATGGACGA CGAGTTCTTAAACAGGTTCAAGATCAGCACAGCCAATGACAAATCAGTGACATACATAGA ACTGGTGCTGAATGATGTGGAAGAAGCTGTCAAGGCCATAAAACTAATGGATCAGCATAA CTATGATCTCTACATCGTAGGAAAAGGCCGAGGCGTAGTGTCACCACTAACAGCTGGCCT AGTCGATTGGTGTGACTGTCCTGAGCTTGGGGCTATTGGTGATCTTTTAGTGACATCAGA ATTTGACTCCACATTCTCGGTGTTGGTGATGCAACAGTACGTTAAGCCAATTGGAGATGG TTCAGTAACTTCTTATGGATCAATGAGTGAGAGGATAGCAGGCATTGGGATGGACATGGA CATGGACATGCAACACGCGGATAGTGAATCAGGGGACGTGTTCTCCAGTTTTAGAAGGCG AACGGAACCTATGCCACGAGCCTAAACAACACAATGTCTTGGCTTAGGCTGATGACAAAC ACTTGAAAATGTTGTAACTTCACATTCAAAAGTTCCTAAATGATGTACTGGTTTTCATCT GGAACTGGAAAAGAGTAATTTAAGTGGAGTTGAATGATGATTGTTTGCTTTATTTTCAGG TTGTAATAACAATGTGGGCTAAATATTCTCTTACACTATTAAACTTGTGACATAAGAATT CAAGAAACTCAAACTTGTGATATATTACTATTGGTGTTAACCTAGCAAAAGTATGTAAAG CTATCATACTTGTAAAATTTGAACAATTTCCACTAACTTGGCATTGAGAAATTAGAATTC ATAATATATTGTAATGTGATAGGCATTTCAGCACTAAAGGTTTTAAATAGAAACTAAGGA CATTATCAACACACGAATTCATACAAAACAATTTCTCTTTTCGATAGAGGTAATAGGAGA ATAATAACAACGATGCAGATAAGAAAAAGTTGACACACTACACCAA