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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g014560.2.1

CDS Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G43880.1)

Sequence

ATGATATGGAGGGATTATATATTCTTTATAAATATACACATTATTAATCTTCATTCTTAT
AATAACAACCTTAAACTCCTCACATTACTCCAAAACAACATGTCCAACTTCAAATCAATT
GTATCATTACAATTTTTCTTTCTCTCTTCAATTTCACTCTTCTTGATTATACCTTATTGT
TTAGCTTACAATGTGGTTAATTTTGGTGCTAAAGGAGATGGAAAGACAGACTCAACCGCG
CCATTTCTTCGCGCTTGGATGTCTGCATGCAGCTCAACTAGTCCATCTAACGTGTACGTT
CCTAAGGGAACGTACCTTATAAGGCCAGTGACATTCACTGGCCCTTGCCGGAGCAGAATT
GAGTTCCGTAATGACGGAACAATTGTTGCTCCGGTTGATTATAATGTCATTGGAGGTTCA
AATTTTTGGATTTTGTTTTATAAAGTTAGTAGACTTTCAATTTATGGTGGAACAATTGAT
GCTAAAGGACATAGTTTTTGGTCATGTAGAAGATCTGGACATTCTTGTCCTCCTGGAGCT
AGGTCAATTACATTATTATGGTGTGATAATGTAGTGGTAAGTGGATTAAAATCATTAAAT
AGTCAGATAATGAATATGGCAATTGATTATAGTAGCCATGTAAGAGTTGAGAAAATAAGA
ATAAGATCTCCCGGTGGAAGTCCAAATACTGATGGAATTCATATAGAAAATTCAAGAGAT
GTTACAATCACAGATAGCATTATTCAAACTGGGGATGATTGTATATCTATTGGCACTGGT
TCTATGAATATGTGGATTCAAAAGATTGGTTGTGGCCCTGGACATGGCATAAGCATAGGA
AGTTTGGCTAATAGCCTAAATGAAGCAGGAGTACAGAATATAACAGTGGCAAATTCAGTA
TTCACAAAGACACAAAATGGTGTGAGGGTAAAGTCATGGGCAAGGCCAAGTAATAGCTAT
GCTAAAAATGTCATATTCAGAAATCTTGTTATGAGGAATGTTGGCTACCCTATTCTCATT
GATCAAAACTATTGCCCTGATAAGAATTGTCCTCACCAGAATTCAGGAGTGAAGGTAAGT
CAAGTAACATACAAGAATATAAAGGGGACATCATCAACACAAGAAGCTATAAAATTAGAT
TGCAGCCAAACAAATCCGTGTAGTGGTATTACATTGCAAGATATAAAGCTCACTTTTGTG
GATCCTCGTTTGAAAAGACAAGCCTTAACATATTGTAAAAATGCACAAGGCACACATCGC
GGGACGATCCTTCCTCGGAGTTGTTTCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g014560.2.1

PEP Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G43880.1)

Sequence

MIWRDYIFFINIHIINLHSYNNNLKLLTLLQNNMSNFKSIVSLQFFFLSSISLFLIIPYC
LAYNVVNFGAKGDGKTDSTAPFLRAWMSACSSTSPSNVYVPKGTYLIRPVTFTGPCRSRI
EFRNDGTIVAPVDYNVIGGSNFWILFYKVSRLSIYGGTIDAKGHSFWSCRRSGHSCPPGA
RSITLLWCDNVVVSGLKSLNSQIMNMAIDYSSHVRVEKIRIRSPGGSPNTDGIHIENSRD
VTITDSIIQTGDDCISIGTGSMNMWIQKIGCGPGHGISIGSLANSLNEAGVQNITVANSV
FTKTQNGVRVKSWARPSNSYAKNVIFRNLVMRNVGYPILIDQNYCPDKNCPHQNSGVKVS
QVTYKNIKGTSSTQEAIKLDCSQTNPCSGITLQDIKLTFVDPRLKRQALTYCKNAQGTHR
GTILPRSCF*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g014560.2.1

Transcript Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT2G43880.1)

Sequence

ATGATATGGAGGGATTATATATTCTTTATAAATATACACATTATTAATCTTCATTCTTAT
AATAACAACCTTAAACTCCTCACATTACTCCAAAACAACATGTCCAACTTCAAATCAATT
GTATCATTACAATTTTTCTTTCTCTCTTCAATTTCACTCTTCTTGATTATACCTTATTGT
TTAGCTTACAATGTGGTTAATTTTGGTGCTAAAGGAGATGGAAAGACAGACTCAACCGCG
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TCTATGAATATGTGGATTCAAAAGATTGGTTGTGGCCCTGGACATGGCATAAGCATAGGA
AGTTTGGCTAATAGCCTAAATGAAGCAGGAGTACAGAATATAACAGTGGCAAATTCAGTA
TTCACAAAGACACAAAATGGTGTGAGGGTAAAGTCATGGGCAAGGCCAAGTAATAGCTAT
GCTAAAAATGTCATATTCAGAAATCTTGTTATGAGGAATGTTGGCTACCCTATTCTCATT
GATCAAAACTATTGCCCTGATAAGAATTGTCCTCACCAGAATTCAGGAGTGAAGGTAAGT
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