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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g007180.3.1

CDS Infomation

Light harvesting-like protein (AHRD V3.3 *** I3SI55_MEDTR)

Sequence

ATGTCTATGGCCTTGTTCTCATCTCCTCCACTCCATTTCCCATCTCTCTCTCCTCCAAAA
CCCCATTTAACCCATAAGCCATTTCTCCCTTTACCTCTCAAAAAACCCTTTTTTATTTCC
CCTAAATCCATTGATGATGCTTCTTCTTCTGCTGCTGTCAGTATAGAGCAAGAAAAGGAT
GAGGGATCTAATGGGGTGCTGTTAAACTCAAATGGGTCGTCGCCAGCGGTGGTCGCCGGA
GCTCCGGTGACGGAGACTGAGGAGGTGAGGAAGTTTCAGGATGCTAGATGGGTTGGAGGA
ACTTGGGATTTGAAGAAATTTGAGAAAGATGGGAAGGTTCATTGGGATTCTGTAATTGAT
GCAGAGGTTAGGAGAAGGAAGTGGTTAGAAGATAACCCCGAGTCATCAAGTAATGAAGAT
CCTGTGCTTTTCGACACCTCAATTATTCCTTGGTGGGCATGGATGAAGAGGTTCCATCTT
CCTGAAGCAGAACGTCTCAATGGTCGTGCTGCAATGATTGGTTTCTTTATGGCCTACTTT
GTGGATAGCTTGACCGATATAGGCCTCGTCGACCAAATGGGGAATTTCTTTTGCAAAACA
CTATTGTTTGTAGCCGTGGCTGGTGTCCTCCTAATCCGCAAGAATGAGGATTTAGAAACT
ATCAAAAAGTTGTTGGAAGAGACTACTTTCTATGACAAGCAATGGCAAGCATCTTGGAAA
GATGAGACCTCAAGCAGTTCGAAGGATTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g007180.3.1

PEP Infomation

Light harvesting-like protein (AHRD V3.3 *** I3SI55_MEDTR)

Sequence

MSMALFSSPPLHFPSLSPPKPHLTHKPFLPLPLKKPFFISPKSIDDASSSAAVSIEQEKD
EGSNGVLLNSNGSSPAVVAGAPVTETEEVRKFQDARWVGGTWDLKKFEKDGKVHWDSVID
AEVRRRKWLEDNPESSSNEDPVLFDTSIIPWWAWMKRFHLPEAERLNGRAAMIGFFMAYF
VDSLTDIGLVDQMGNFFCKTLLFVAVAGVLLIRKNEDLETIKKLLEETTFYDKQWQASWK
DETSSSSKDS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g007180.3.1

Transcript Infomation

Light harvesting-like protein (AHRD V3.3 *** I3SI55_MEDTR)

Sequence

AAAAGCTTATACAAAGTTCCCATTTTTGAGGCTGAGTTAAGTTCTTCTTCTTCTCTATCA
AATTCACAGCTCCAACAACAATGTCTATGGCCTTGTTCTCATCTCCTCCACTCCATTTCC
CATCTCTCTCTCCTCCAAAACCCCATTTAACCCATAAGCCATTTCTCCCTTTACCTCTCA
AAAAACCCTTTTTTATTTCCCCTAAATCCATTGATGATGCTTCTTCTTCTGCTGCTGTCA
GTATAGAGCAAGAAAAGGATGAGGGATCTAATGGGGTGCTGTTAAACTCAAATGGGTCGT
CGCCAGCGGTGGTCGCCGGAGCTCCGGTGACGGAGACTGAGGAGGTGAGGAAGTTTCAGG
ATGCTAGATGGGTTGGAGGAACTTGGGATTTGAAGAAATTTGAGAAAGATGGGAAGGTTC
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GGATGAAGAGGTTCCATCTTCCTGAAGCAGAACGTCTCAATGGTCGTGCTGCAATGATTG
GTTTCTTTATGGCCTACTTTGTGGATAGCTTGACCGATATAGGCCTCGTCGACCAAATGG
GGAATTTCTTTTGCAAAACACTATTGTTTGTAGCCGTGGCTGGTGTCCTCCTAATCCGCA
AGAATGAGGATTTAGAAACTATCAAAAAGTTGTTGGAAGAGACTACTTTCTATGACAAGC
AATGGCAAGCATCTTGGAAAGATGAGACCTCAAGCAGTTCGAAGGATTCTTGAGATTGTT
CCTCGTATAACATTAGTTTTTCATACTTACAGGAAGATGTAATCCAGGTAGTTCTTCTAT
GCTAATCGAAGGAGAATTCGTATTCTCCATTTTGTTGTAGTGCTTGGTCTGCCATGTAAT
TTTTATTTTTTTGGCCTTTTTCTGTTTCTGGGAAATGATTTTATATTTAGTTCTTTTGCC
ATTGTTGTAAAGTCTTTTTGCTGATCATGAGTATTGTTTTTCTAATCCTTTTAGTGCAAA
AATAACTTCACAACTTTACTTGCTAGTGATGCTTTGATTTTCCAGGATCGAAGTCGAAAA
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AAAAGCTATGCGTTTTTGATGGATTAGACACATAGTACAACAACATTATTGGAAAGTCCG
AGCACAGAATTCACTAGTAGTTTAATTCCTATGATTATGGGTTACTATAAGATTATTGGT
AGTCTAAGAGACTATGGTTTCAAGTCTGGCAACAGCCGTATCTGGATAGAAGTTATCACA
TTAACATTATTTGAGACTTATTAAACTAAATTAAGACCTTGACTATTCATCCAGTTGGCC
TTCACGGCCATTCCGACCCATTTTAAAGGTCAAACAAGCTTCGAAGCGCATACTCCATCT
CGACGATTTTCGTGTGTTATATAGCAACCTATTTTTTGGGTTATTCGGATTTCGACGTAA
AAAATGACTAACTTTTTGGTGGACGTCCGTCAAGACCTTGGCTATGCAGCCGGTTGGCCC
TCACGGCCAGTCCGACCCATTTTGAAGGTCAAACGAGCCCAAAAGCGAGCAAACCTCCCA
TTTCGACAATTTTCGTGTGCTATAGCAAACCATTTTTTGGGTGATCCGGATTAAGACGTC
GAGAAATCCAAAAAAAATTGTGGACGTCCGTCACTACCTTTGCTATGCAGCCAGTTGGCC
ATCACGGTCAAATGAGCCCCGAAGCGCGCATACCCCCCATTTAGACGATTTTCGTGTTCT
ATAGCAAACCATTTTTTGGGTGATCCGGATTTCGACGTCAAAAATATCAAAAACTTTTGT
GGACGTCCGTCAAGACCTTGGCTATGCATCTAATTGGCCTTCACAGCCAGTTCGACCAAT
TTTCAAGGTCAAACGAGCCCCGAAGCGCGCATACCATTTAGATGATTTTCGTGTGCTATA
GCAAATCATTTTTTGGATTATCCACATTCCGACGTCAAAAATGTCAAACTTTTTTCTGGA
CGTCCGTCAAGACCT