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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g006170.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K1X6_CYNCS)

Sequence

ATGGGATTTCGGAGATTTCTCAAATCAATTCCTAAACCAATGGCTTCTGATCGGACTTCA
TTGCTACCTCTTGCTGTAAGAACGATAGATTCTTCAATGTGTAGCACTAACAACCTCACA
CCTGTTGCCCAAAACCAACTGAACCAACTCGTGGAAACCCACCTCAAACCCTCTTTCACT
GCCAAAGATTTCCTCTCTTTTCTCAAGAACCGTGTCCATTACCACCCTATCCTCACTAAC
CTTGACTTCTACCTCTTCAACTATGCTGCTTCTGTAGATTCATTCCGCCATGATCACACC
ACTTTTGAGTGGATGGTCCGCACTCTTGCCACCACACACCGCCTCCAGTTTCTTACTACT
CTCCTCCAATTTATTTCTTCTAATCCCTGCCCGTGTGCTGATGGTATTTTCTCTTGCCCC
AAAACTGAACCAATTTTTCGTTTTGCCATTAATGCTTATTGCAAGGCTGGTAGATTTGAT
GATGCTTTGTTAGCTTTTGACACAATGAGAAGATTGATTGATGGGAAGCCTGATGTTGCT
GTTTGCAATATAATAATTCATGGATTTGTGAAGTTTAAGCATTTTGATAAGGCTCAGGAG
TTTTACCATAGGATGATTGGAGATCGAGTAAAGCCTGATGTAATTACATTCAATACTTTG
ATTTCTGGGTACTGTAAGAACTCGCAATTGGGCTCGGCTTTACAAATGTTTAAGGATATG
AAAACTCATGGATGTGCTCCAAATGTAGTTAGTTTCAATACTTTAATTAAATGGTTTCTT
TTGGATGGTAAGATTGAGGAGGGGATTGGGATGGCCTTTGAGATGACTGAGATGGGATGG
GAGATTTCAGCAGTGACTTGTGAGATTTTGGTTGATGGGCTTTGCAGGAAAGGAATGGTG
TTGAAAGCGTGTGATTTATTGGTTGACTTTTCAAGGAAAGGGGTGCTGCCAAGAACATTT
GATTATTTTGGGTTAGTTGAGAGGCTTTGTGGGGAAGAGAATGTGGCCAGAGCAATAGAA
TTGGTGCATGAGTTATGGAGGAATGGGAATTCTCCAAGCTTGATCGCTTGTACGACCTTA
ATTGAAGGTTTAAGGAGAACAAGAAAGATTGATGAAGCATATGAAATTATGGAGAAAATG
CTGCAGGAATGTATGCTTCCAGATAGTGTAACGTTTAATTGTCTTCTTAGTGACATGTGT
GAAGCAGGAAGAGCGAAGGAAGCAAATAAGATGAGGTTATTGGGTTTAAACAAGGGCTTG
GATCCTGATACTGTGACATATAATATTTTGGTATCAGGTTTTAAGAGGGAGGGTAAAAAG
AAGGAAGCGGAAGCTTTGGTGGAAGAGATGTTGGATTTGGGGTTTATACCTGATATTGCT
ACTTATAACAGGTTGATCAATGGAGAAACTAAATCAAAACGTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g006170.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K1X6_CYNCS)

Sequence

MGFRRFLKSIPKPMASDRTSLLPLAVRTIDSSMCSTNNLTPVAQNQLNQLVETHLKPSFT
AKDFLSFLKNRVHYHPILTNLDFYLFNYAASVDSFRHDHTTFEWMVRTLATTHRLQFLTT
LLQFISSNPCPCADGIFSCPKTEPIFRFAINAYCKAGRFDDALLAFDTMRRLIDGKPDVA
VCNIIIHGFVKFKHFDKAQEFYHRMIGDRVKPDVITFNTLISGYCKNSQLGSALQMFKDM
KTHGCAPNVVSFNTLIKWFLLDGKIEEGIGMAFEMTEMGWEISAVTCEILVDGLCRKGMV
LKACDLLVDFSRKGVLPRTFDYFGLVERLCGEENVARAIELVHELWRNGNSPSLIACTTL
IEGLRRTRKIDEAYEIMEKMLQECMLPDSVTFNCLLSDMCEAGRAKEANKMRLLGLNKGL
DPDTVTYNILVSGFKREGKKKEAEALVEEMLDLGFIPDIATYNRLINGETKSKR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g006170.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K1X6_CYNCS)

Sequence

ATGGGATTTCGGAGATTTCTCAAATCAATTCCTAAACCAATGGCTTCTGATCGGACTTCA
TTGCTACCTCTTGCTGTAAGAACGATAGATTCTTCAATGTGTAGCACTAACAACCTCACA
CCTGTTGCCCAAAACCAACTGAACCAACTCGTGGAAACCCACCTCAAACCCTCTTTCACT
GCCAAAGATTTCCTCTCTTTTCTCAAGAACCGTGTCCATTACCACCCTATCCTCACTAAC
CTTGACTTCTACCTCTTCAACTATGCTGCTTCTGTAGATTCATTCCGCCATGATCACACC
ACTTTTGAGTGGATGGTCCGCACTCTTGCCACCACACACCGCCTCCAGTTTCTTACTACT
CTCCTCCAATTTATTTCTTCTAATCCCTGCCCGTGTGCTGATGGTATTTTCTCTTGCCCC
AAAACTGAACCAATTTTTCGTTTTGCCATTAATGCTTATTGCAAGGCTGGTAGATTTGAT
GATGCTTTGTTAGCTTTTGACACAATGAGAAGATTGATTGATGGGAAGCCTGATGTTGCT
GTTTGCAATATAATAATTCATGGATTTGTGAAGTTTAAGCATTTTGATAAGGCTCAGGAG
TTTTACCATAGGATGATTGGAGATCGAGTAAAGCCTGATGTAATTACATTCAATACTTTG
ATTTCTGGGTACTGTAAGAACTCGCAATTGGGCTCGGCTTTACAAATGTTTAAGGATATG
AAAACTCATGGATGTGCTCCAAATGTAGTTAGTTTCAATACTTTAATTAAATGGTTTCTT
TTGGATGGTAAGATTGAGGAGGGGATTGGGATGGCCTTTGAGATGACTGAGATGGGATGG
GAGATTTCAGCAGTGACTTGTGAGATTTTGGTTGATGGGCTTTGCAGGAAAGGAATGGTG
TTGAAAGCGTGTGATTTATTGGTTGACTTTTCAAGGAAAGGGGTGCTGCCAAGAACATTT
GATTATTTTGGGTTAGTTGAGAGGCTTTGTGGGGAAGAGAATGTGGCCAGAGCAATAGAA
TTGGTGCATGAGTTATGGAGGAATGGGAATTCTCCAAGCTTGATCGCTTGTACGACCTTA
ATTGAAGGTTTAAGGAGAACAAGAAAGATTGATGAAGCATATGAAATTATGGAGAAAATG
CTGCAGGAATGTATGCTTCCAGATAGTGTAACGTTTAATTGTCTTCTTAGTGACATGTGT
GAAGCAGGAAGAGCGAAGGAAGCAAATAAGATGAGGTTATTGGGTTTAAACAAGGGCTTG
GATCCTGATACTGTGACATATAATATTTTGGTATCAGGTTTTAAGAGGGAGGGTAAAAAG
AAGGAAGCGGAAGCTTTGGTGGAAGAGATGTTGGATTTGGGGTTTATACCTGATATTGCT
ACTTATAACAGGTTGATCAATGGAGAAACTAAATCAAAACGTTAA