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All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g005550.3.1
CDS Infomation

alternative oxidase 1c
Sequence

ATGATTATACGTGGCGCATTGAGGTTGGCGCGTTCTATGATGTCTCACATTGGTCCACGT
TACTATTCAACTATACGTCCGGTGGCCGGAAATGAAGCCAAAAACGGGGTTATTACTCGT
GCATCGTTCAATTTCTTGCATGAAAATTCTATCAAGGGTTTCGAAAAGATTATGATGACA
CGCGTTAGGTATTTTTCAACTACGAATTCGTGTAACACAAGTATAATAAACTTGAGCGAC
AAGGAAAAAAATGAACAAACTAGTCAAGAAAAAATTGATCAGAACGGCGACGCAGAATTC
AAAGTCACCGTTCTTACTAGTGGTGGAAATAATAATAATATTAATAATGTTAGCTATTGG
GGTATTCAACCCCCTAAGGTTACAAAAGAAGATGGTACTCCATGGAAGTGGAATTGTTTT
ATGCCATGGGAGACATACAAGGCAGATTTATCAATTGATATGAAAAAACACCATGAGCCT
ATAACGTTGTTGGATAAATTGGCTTATTGGACTGTCAAGGCCCTTAGGGTACCCACAGAC
TTATTCTTTCAGAAGAGGTACGGTTGTCGAGCAATGATGTTGGAAACCGTGGCGGCAGTC
CCCGGTATGGTAGGAGGAATGTTATTACACTGTAAATCTTTAAGGCGATTCGAGCACAGT
GGTGGATGGATCAAAGCACTATTAGAAGAAGCAGAAAATGAAAGAATGCACTTAATGACA
TTTATGGAAGTATCAAAACCAAAATGGTACGAACGTGGACTTGTCTTAATGGTACAAGGC
ATATTCTTCAATGTCTATTTTATGACTTATATTTTGTCACCAAAATTGGCACATCGAATT
GTTGGTTACTTAGAAGAAGAAGCTATTCATTCCTACACACAATTTCTTAAAGAATTAGAT
GAGGGAAATATTGAAAACGTAGCTGCTCCGGCTATCGCTATTGATTATTGGCGTTTGACG
CAAGACGCGACTCTTAAAGATGTTGTCATGGTGGTTAGGGCGGACGAGGCTCATCATCGC
GATGTTAACCACTTTGCATCGGATATTTATTACCATGGGCAAGAACTGAAGGACTGTCCA
GCTCCACTTGGGTATCACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g005550.3.1
PEP Infomation

alternative oxidase 1c
Sequence

MIIRGALRLARSMMSHIGPRYYSTIRPVAGNEAKNGVITRASFNFLHENSIKGFEKIMMT
RVRYFSTTNSCNTSIINLSDKEKNEQTSQEKIDQNGDAEFKVTVLTSGGNNNNINNVSYW
GIQPPKVTKEDGTPWKWNCFMPWETYKADLSIDMKKHHEPITLLDKLAYWTVKALRVPTD
LFFQKRYGCRAMMLETVAAVPGMVGGMLLHCKSLRRFEHSGGWIKALLEEAENERMHLMT
FMEVSKPKWYERGLVLMVQGIFFNVYFMTYILSPKLAHRIVGYLEEEAIHSYTQFLKELD
EGNIENVAAPAIAIDYWRLTQDATLKDVVMVVRADEAHHRDVNHFASDIYYHGQELKDCP
APLGYH*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g005550.3.1
Transcript Infomation

alternative oxidase 1c
Sequence

CCTATATAAACAAGTGTCTTATACCCTTTTTGTTTATAAACAAGTGTCTCAAACTTTGCC
TTTTCCTCTAAGTTACTATCCAAACTTCTTGCAATTCTTCAATTAATTTCACTTTAATTC
AAATTAGTTCAAATAACAAAGATGATTATACGTGGCGCATTGAGGTTGGCGCGTTCTATG
ATGTCTCACATTGGTCCACGTTACTATTCAACTATACGTCCGGTGGCCGGAAATGAAGCC
AAAAACGGGGTTATTACTCGTGCATCGTTCAATTTCTTGCATGAAAATTCTATCAAGGGT
TTCGAAAAGATTATGATGACACGCGTTAGGTATTTTTCAACTACGAATTCGTGTAACACA
AGTATAATAAACTTGAGCGACAAGGAAAAAAATGAACAAACTAGTCAAGAAAAAATTGAT
CAGAACGGCGACGCAGAATTCAAAGTCACCGTTCTTACTAGTGGTGGAAATAATAATAAT
ATTAATAATGTTAGCTATTGGGGTATTCAACCCCCTAAGGTTACAAAAGAAGATGGTACT
CCATGGAAGTGGAATTGTTTTATGCCATGGGAGACATACAAGGCAGATTTATCAATTGAT
ATGAAAAAACACCATGAGCCTATAACGTTGTTGGATAAATTGGCTTATTGGACTGTCAAG
GCCCTTAGGGTACCCACAGACTTATTCTTTCAGAAGAGGTACGGTTGTCGAGCAATGATG
TTGGAAACCGTGGCGGCAGTCCCCGGTATGGTAGGAGGAATGTTATTACACTGTAAATCT
TTAAGGCGATTCGAGCACAGTGGTGGATGGATCAAAGCACTATTAGAAGAAGCAGAAAAT
GAAAGAATGCACTTAATGACATTTATGGAAGTATCAAAACCAAAATGGTACGAACGTGGA
CTTGTCTTAATGGTACAAGGCATATTCTTCAATGTCTATTTTATGACTTATATTTTGTCA
CCAAAATTGGCACATCGAATTGTTGGTTACTTAGAAGAAGAAGCTATTCATTCCTACACA
CAATTTCTTAAAGAATTAGATGAGGGAAATATTGAAAACGTAGCTGCTCCGGCTATCGCT
ATTGATTATTGGCGTTTGACGCAAGACGCGACTCTTAAAGATGTTGTCATGGTGGTTAGG
GCGGACGAGGCTCATCATCGCGATGTTAACCACTTTGCATCGGATATTTATTACCATGGG
CAAGAACTGAAGGACTGTCCAGCTCCACTTGGGTATCACTGATAACAACAATTTTGATCT
AATAAATGTTTTGAAACAATTAAAGAACACAAAATAGTGAAAAAGATCACAATTTACTAA
TATTTTTGAGTATTGATGTACAC