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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g005460.3.1

CDS Infomation

Protein BREVIS RADIX (AHRD V3.3 *** BRX_ARATH)

Sequence

ATGCTGACGTGTATAACTTGTAAGCAAAAAATAGATGATGATGGAGGAGAAGAGGGTCCA
CGTGGGACCCCTAATACTAAAGAATCAGTAAAAAGCTTGACTGCCCAGATAAAAGATATT
GCATTAAAGGTCTCTGGTAAAAGCAGCAAGTCTAGCACACCAACAAGTGGTTACAGGAGA
GGAGGGGGCAGAGCATATCCTGATTTTGAAACAATTTCAGAGGAAGTTCCATATCAACCT
GGAAGTTCAAGTTCTACTCCAGCTTGGGATTTTACCCGTAATCATCGAACACCTCGAGCA
GATCCAAGATTTTTCGGAGGATATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGATGAAAAGAGAGAA
TCCGTCTACTCTCAGACAGGTGATATGGTGCTGCCAGATGAGGAGGGGCCAAAAGAGTGG
ATAGCTCAGGTGGAGCCTGGTGTTCAGATTACTTTTGTCTCACTTCCAACTGGTGGAAAT
GATCTCAAACGAATCCGCTTTAGTCGGGATATGTTCGATAAATGGCAAGCTCAAAGATGG
TGGGGTGAGAATTTTGACAGAATTATGGAGCTCTACAATGTCCAGAAATTCAATCAGCAA
GCTATGGACACTCCTGGGCGGTCTGAGCTTGGAAGAGATTCTAATTATTCAAGGCTTGGA
TCACCTAGGGAAAGCAAAGAGTGGACTCAGAGAAATTATAGACCATCAAGTAGCAGCCAA
TATAACTATGGAGGACCCAGTTCTTATGCCTCCGGCTTTCCGAAGGGTGAGATGTCATCT
ATGGATCCATCAAGGATGACAACTGACTCAAGAGATGACGCTTCAGTATCCATGAGCATT
GCTGGTGATGGAGAGTCAGAATGGATAGCAGAAGATGAGCCAGGAGTATATATAACCATC
AGACAACTAGCTGATGGCACTAGAGAGCTACGGCGTGTAAGATTCAGCCGCGAAAAATTT
GGGGAGGTGAACGCGAAGCAGTGGTGGGAACAAAACAGGGATAGAATACAAGATCAATAC
CTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g005460.3.1

PEP Infomation

Protein BREVIS RADIX (AHRD V3.3 *** BRX_ARATH)

Sequence

MLTCITCKQKIDDDGGEEGPRGTPNTKESVKSLTAQIKDIALKVSGKSSKSSTPTSGYRR
GGGRAYPDFETISEEVPYQPGSSSSTPAWDFTRNHRTPRADPRFFGGYGGGGGGDDEKRE
SVYSQTGDMVLPDEEGPKEWIAQVEPGVQITFVSLPTGGNDLKRIRFSRDMFDKWQAQRW
WGENFDRIMELYNVQKFNQQAMDTPGRSELGRDSNYSRLGSPRESKEWTQRNYRPSSSSQ
YNYGGPSSYASGFPKGEMSSMDPSRMTTDSRDDASVSMSIAGDGESEWIAEDEPGVYITI
RQLADGTRELRRVRFSREKFGEVNAKQWWEQNRDRIQDQYL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g005460.3.1

Transcript Infomation

Protein BREVIS RADIX (AHRD V3.3 *** BRX_ARATH)

Sequence

TTCAAATTTCATAATTTTCATAATAAAATTGAAATTATGTATTGTGAATGCACTGACACA
TATGGGAAAATTAACACATGGGGATTAAAACTTCTGATAAGATCTTTTGGACCCCAATAT
CTTGAATTCTGAAAATCATCATTAATAAAAAGAAAATGCACAAATAACATTTGTAATTAA
CAAGGAAATAAAATTTTGAGTTTTCAAATTTGATAAATTTACTAAATTCATATTCAATAT
TGTATTTTCGCCCTTAATTAAGGATACATTCTTTTAAAAAATTTTAATCAAATAGTTTCT
CATTTATTCAATAAATTTTGTCGAAAAAAGATACTTCTATTATTAATTTTTTTGAATTTC
TAACCAAATGTGAAATGATCCCTAGAAAGAAAAAAAAGGAAACATGATTTTTTTTAATAT
TTTGGAATATATATAAACCACAATTACATATCTTCTAATATAAGTGAACGGAATATTGAT
TTTGATTATAAATCATCAATTATTTTGATAATAATAGAAACAATTTTTCAAATTTATCCA
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TTGAAGAAAACACCACACTAATTTAAAAAAAAAACATTTATCTTCTATGCGTTTAATATA
AAAAATCCAAAAAATTATAAGGTGAGAAAAAAAAAATTAAGAAAAAAAATTATTAGATCC
CCTTAATGGTTGACAAAAAGAGAAATATCCACCCTCATGGTCTTCAACCATTCATGTATT
GACACGTGTTCCCATGTTTTAACATTATTTTACCAACTAGACATGTGGGCCCATTTGGTC
CACCCCAACCATGACCACATATATGCGAAATGGTATGATAAAGCCGTATAGTATTTGTAT
TCTGAAATATGATAATTTAATACTTGTTAATTAATATTTTTAATTCATTAAAATAAAATA
TTTTAGAACGTCCAACCTCTTAACCACAACATACAACACAACAAAGCATGACCTCGAGCC
TGCTCATAACATATTGTGTATAATCATATAAATATAGTTTGGAAAATATCATATGCGTTT
AAATTTTACTGTTATTTTTATGAGATTGAGAAACTATTTTTTAGTAGACTAAAAATTAAC
AATAGATACAATCAAAGGAAAAAAAATTCATAAAAAATCCGTAATCACCAAAAACTGTTA
TGAAATAATAAGTAGTCATTTATTTCTAATCAAAAGTTCTGAATTATTACCCTCCTACGC
ACAAAATTACTTTTATTAGAAAACGTTTTGCTCTCAACATAGAACTTTCAAGGTGAATCG
ACGCCACGTCGACTACCTATATCCAATATATGGAGTACAAAAATACACATTTTCCGTTAG
ATAACGACACCACAAAAAACGACAGCGTCACTTGTGTTGATTCTATAAATACCTCAAACA
TTATCCCGTCTTCTTCTCTACTTTGTCTCCATTCTATATTTGTTTTCTTCCCAAATTTAC
ACACAAACACACTCACTGTGTGTATTTTATAATATATATATATATATAGTATCTGTAGAT
TCTGATTCGGTCACTATAAACGTAAAATCGGGAGAAGAGAATCTGATTTTCTTTCCCGAT
TTGAAACGCTCTGTAGAATCTCTTTGAAAATTCGCCGGCGGTGAGTTGCGCCGGCGCCCG
GCGAATATTCCGTTTTTAGCTGAAGATTCGTTGGAAGAGATTTTTTTGTTACAGCTCATT
GATTTGATTTTACCTAGGGTTTTGAGTTCCCATTTTTGACGAAGACAGAAAAAAAAATTA
GCGATTTCGATGCAGATGCTAAATTCAACTGATTTCGAGTAGATTTTTGATGAATTTGAG
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AAATGCTGACGTGTATAACTTGTAAGCAAAAAATAGATGATGATGGAGGAGAAGAGGGTC
CACGTGGGACCCCTAATACTAAAGAATCAGTAAAAAGCTTGACTGCCCAGATAAAAGATA
TTGCATTAAAGGTCTCTGGTAAAAGCAGCAAGTCTAGCACACCAACAAGTGGTTACAGGA
GAGGAGGGGGCAGAGCATATCCTGATTTTGAAACAATTTCAGAGGAAGTTCCATATCAAC
CTGGAAGTTCAAGTTCTACTCCAGCTTGGGATTTTACCCGTAATCATCGAACACCTCGAG
CAGATCCAAGATTTTTCGGAGGATATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGATGAAAAGAGAG
AATCCGTCTACTCTCAGACAGGTGATATGGTGCTGCCAGATGAGGAGGGGCCAAAAGAGT
GGATAGCTCAGGTGGAGCCTGGTGTTCAGATTACTTTTGTCTCACTTCCAACTGGTGGAA
ATGATCTCAAACGAATCCGCTTTAGTCGGGATATGTTCGATAAATGGCAAGCTCAAAGAT
GGTGGGGTGAGAATTTTGACAGAATTATGGAGCTCTACAATGTCCAGAAATTCAATCAGC
AAGCTATGGACACTCCTGGGCGGTCTGAGCTTGGAAGAGATTCTAATTATTCAAGGCTTG
GATCACCTAGGGAAAGCAAAGAGTGGACTCAGAGAAATTATAGACCATCAAGTAGCAGCC
AATATAACTATGGAGGACCCAGTTCTTATGCCTCCGGCTTTCCGAAGGGTGAGATGTCAT
CTATGGATCCATCAAGGATGACAACTGACTCAAGAGATGACGCTTCAGTATCCATGAGCA
TTGCTGGTGATGGAGAGTCAGAATGGATAGCAGAAGATGAGCCAGGAGTATATATAACCA
TCAGACAACTAGCTGATGGCACTAGAGAGCTACGGCGTGTAAGATTCAGCCGCGAAAAAT
TTGGGGAGGTGAACGCGAAGCAGTGGTGGGAACAAAACAGGGATAGAATACAAGATCAAT
ACCTTTAAAGCATGTTTATTTTTTCTCATTACTAAGTTGCTGCCAATATCCTAAGAATAT
TATCAAGGTATTCCCTGGGAAATGCAACACTTGAGATCCAATGTAGATTCAACTATCGAT
TCACTTTTGTGATCGAGGAGGTCCAGTTTGGACCACCACGGCTCCTCTCTTCTCGAGAAG
TCATACATCCCTTATCAGTGTACGGACATCTACCTCTCGAGCCTTGGTTCTTCTGAGTGA
TTAACTTAAAACTCACCTTGCACGATATCGTCAAGCACTATTCTTGGCATTGGTAGAGAT
TACACCAGACTCATATTGAAGTATATAGTTTTTATCTTGCAGTTGGATTGCTTCATTCTA
TAGAAGAAAGCTCCTAGTCACTTTTTTTGTCATGGCATTTTTTTGATCTCTGATTATACC
TGATTTTTTTTTGTTTTTGACAAATTCTTTTTATTTTTTGGGCTTTATTTTGCCTTCAGT
TTTTTTGGTTGAATGGCTTGGTGGATCTCCTAGTTTTTACTTGGATGTTTGTAACACAAA
CTTTCTATTAAAGGAAACGGAATCAAAAACTGATGATGTTTTTAGAACTAGTCCGTTAAT
TTCTCGAAATATGTATAATCAAC