Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc08g005350.3.1
CDS Infomation	F-box family protein (AHRD V3.3 *** B9GFH4_POPTR)
Sequence	ATGGTGAAAAGAATCATGGCGATTGAAGATGGACTCAGTGATTTTCCTGAGGCAATTCTA GTTCACATTCTTTCTATGTTGCCGGACGGTAAAGAAATAGTGAGAAGTAGTGTGTTAGCT AAGCGATGGAGGTATCTTTGGAGGTCTGTTCCAATATCCCTGGATTTTAGCCACCCTGAG AATGCTTATTTTGGTCGCCCTGAGTTGGGGGAATTGGAGATTTTCGATTTCGTGAATTCC ATCCATAGGGAGCTTCTGTATTGGGGGTCTGGTCAGAAAATCAGAAAATTTAAGATGGCT GTCAATTTTTCTGCTCCGGATAGGTTCGATAAAGATATCGATTTGTGGGTTTATTTTGCG ATGAAGAAAGCTAATGTTGAGGATCTTACTTTTGAGTGTTTTTCTGGATACAAGTTACCT CAGTTTGCGTTTGAGAGTCCGTTGGTGAGGAATTTGAATTTTCAGTACTGTAAGATGAAA TTGGAACCTTCCGTTAATGTGAACTGGAGAAATCTAGTATCTCTATCAGTTGGATATGTG AAACTGACTGAGGGTGTCATGAGAAAAATATTGTCGGGTTGTCCTAACTTAGAGTGCTTG CTATTGGACTTCGTTTGGGGCTTTGATCGTCTTGAAATCAGCAATGTGAAGTTGAAAAAG TTGACCCTAAACAGCTATGAAACTAGTGACGGTGATGTTTGGCTTGAAATATTAGCTCCG CATATTCAAAGTTTGGTACTTTTGGGGTATTCCAGTGGGATACGCTTGGAAAATGTGGCT TCACTTGTCACTGCATTCTTTCGTATAGATTTTATGTTTGATTTTGGAGAGGTAGAAATA TTGGACCAGCGTGAGATTAGTTGTCTGAAGGAACTTCTTCACAGCGTTGCCCATGTCAAG AATCTGGAATTGAGTCACTGGTGCATTGAGTGCATGTCCAAACTGGCATTGGAAGGCTTC CAGTATCAACCATCGAGCTCAAGATTCTTAAAACTTCACACAAACAATGAAGAGTTGGAC CTACCAGGAATTTGCAGCGTTATACAGAATTCATCAAATATTGAGACATTGATCATTGAC TGGCACCATCAAGATCGAGGAAGCTCAGCTTTGTCAAAAGTGAAAATGCATAGCAAAATC ACAACAATGGAAGACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc08g005350.3.1
PEP Infomation	F-box family protein (AHRD V3.3 *** B9GFH4_POPTR)
Sequence	MVKRIMAIEDGLSDFPEAILVHILSMLPDGKEIVRSSVLAKRWRYLWRSVPISLDFSHPE NAYFGRPELGELEIFDFVNSIHRELLYWGSGQKIRKFKMAVNFSAPDRFDKDIDLWVYFA MKKANVEDLTFECFSGYKLPQFAFESPLVRNLNFQYCKMKLEPSVNVNWRNLVSLSVGYV KLTEGVMRKILSGCPNLECLLLDFVWGFDRLEISNVKLKKLTLNSYETSDGDVWLEILAP HIQSLVLLGYSSGIRLENVASLVTAFFRIDFMFDFGEVEILDQREISCLKELLHSVAHVK NLELSHWCIECMSKLALEGFQYQPSSSRFLKLHTNNEELDLPGICSVIQNSSNIETLIID WHHQDRGSSALSKVKMHSKITTMED*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc08g005350.3.1
Transcript Infomation	F-box family protein (AHRD V3.3 *** B9GFH4_POPTR)
Sequence	CACTTCCCTCATGACCCCAAATACCTAACCCCCAAATTAGTTCTTCATTTCATCAATGGT GAAAAGAATCATGGCGATTGAAGATGGACTCAGTGATTTTCCTGAGGCAATTCTAGTTCA CATTCTTTCTATGTTGCCGGACGGTAAAGAAATAGTGAGAAGTAGTGTGTTAGCTAAGCG ATGGAGGTATCTTTGGAGGTCTGTTCCAATATCCCTGGATTTTAGCCACCCTGAGAATGC TTATTTTGGTCGCCCTGAGTTGGGGGAATTGGAGATTTTCGATTTCGTGAATTCCATCCA TAGGGAGCTTCTGTATTGGGGGTCTGGTCAGAAAATCAGAAAATTTAAGATGGCTGTCAA TTTTTCTGCTCCGGATAGGTTCGATAAAGATATCGATTTGTGGGTTTATTTTGCGATGAA GAAAGCTAATGTTGAGGATCTTACTTTTGAGTGTTTTTCTGGATACAAGTTACCTCAGTT TGCGTTTGAGAGTCCGTTGGTGAGGAATTTGAATTTTCAGTACTGTAAGATGAAATTGGA ACCTTCCGTTAATGTGAACTGGAGAAATCTAGTATCTCTATCAGTTGGATATGTGAAACT GACTGAGGGTGTCATGAGAAAAATATTGTCGGGTTGTCCTAACTTAGAGTGCTTGCTATT GGACTTCGTTTGGGGCTTTGATCGTCTTGAAATCAGCAATGTGAAGTTGAAAAAGTTGAC CCTAAACAGCTATGAAACTAGTGACGGTGATGTTTGGCTTGAAATATTAGCTCCGCATAT TCAAAGTTTGGTACTTTTGGGGTATTCCAGTGGGATACGCTTGGAAAATGTGGCTTCACT TGTCACTGCATTCTTTCGTATAGATTTTATGTTTGATTTTGGAGAGGTAGAAATATTGGA CCAGCGTGAGATTAGTTGTCTGAAGGAACTTCTTCACAGCGTTGCCCATGTCAAGAATCT GGAATTGAGTCACTGGTGCATTGAGTGCATGTCCAAACTGGCATTGGAAGGCTTCCAGTA TCAACCATCGAGCTCAAGATTCTTAAAACTTCACACAAACAATGAAGAGTTGGACCTACC AGGAATTTGCAGCGTTATACAGAATTCATCAAATATTGAGACATTGATCATTGACTGGCA CCATCAAGATCGAGGAAGCTCAGCTTTGTCAAAAGTGAAAATGCATAGCAAAATCACAAC AATGGAAGACTAAATAAGTGATTTTCCCAAGTTCATCGGATCTCGAGACATTCGTGGTTG ACCAGTGCTATCACAGACCAATGGTACTAGCTGATCAGAGGAAATGCCAATGGAATTGAT GATGGATGCAAATGAGTGAAGATGTTGACAAATGGGTGCATTTTGCTACTAAACTTACTA ATGTTGAAGATTTTACTCTTCAAAATTATGGAGTAGTCTAGTTTCTCTTTCAATTGGTCT AGTTACACATCCGTTCAACATTAGCTGGTTTAGTTGCAGAATATTCTCGTAAACGTCTAA GCGCTAGTGGTTTCTTTGGATGTTTATTCTACTATCACTCGATTTCACCTTCCCCAGTAA TGAAAATCAAAATGGTGCTGTTGATCACCAGAAAATCCAGAATTTCAGGTATGAGAAGTG TTATTTGTTGATTTATGGAAACAGTTTTCTACTCAACTTGCTACTGTAAAGATTTTACAC TTGCACTTTTCTGCATAAATGACTACAGGTACGAGTTTCCTCAGTTTGCATATAAACATT CATTGTTGCGGAATCTGGTTTTATGACATTGTCAACTGAACCCTTGTGGTAGGTTAATGG AGTTATCTCGTTGAACAGAAGATTGAACTGAATCTTCGAGGATGAGCTATGAGAATAAAG AGTTTTCAAATGGACAGAACAACATTAAAAATTTGAGTTGATTTATAATTATGTAGTTTT CCAAAGTTCTTAAAGTTCATTGTTGGATAATAGCTCTCTGTTTATATACTGCATTTTGCA TCCTCTGAATGTTGTTGAATGAAGTTCTGCTTTTTCCTCATTCAAAGAAAACGTCATCTT TGAATTTTTAAACCAACCTAGGACACTTTTATGTGGAAAAACGTGGTCTTTTAGTCCAAG TTACTTTTACAAAGTATTCACAATTTTCATGGCATTTGTTAAGTATGTTGCATTTCTTTG TTTTCACATAATTGGTTTATAAGTGCCTGTCTATACTAGTGTTGAAAGGGTGGTGGTCTC CACCATCTAGCTGGAAAGTTTTACTACTTAATACAGCCACAGTACTGTTGGGCGTCCCTG GATTGACAGCTTTCTATAGATCTTGAGACGGTGATTGAACGGAAACCAAGAGTACTAGCT AAATGCCAATGGAATTAGTGGTGGATGCAAATCGGTTGAGATGTTTGTATTGTAGCATCT TGTGTGGCTCCCTGAGTGACTATGATCAGACATGGCTTGCTCCGGAGGACAGAGGGCCAC TACTTCAGAACAAGAGGACACATATCAAACAACTCTTTGAAACAATGGTCAGACACCCCT TTTTCCATTGACTCTATTTGTTTTAATCTTGAACAAGTCTGATCTGTTTGAGGAGACGGT TGCTCGTGTATCATTGGACTCTTATGAGTGAGTCAGCAATTTCTGTCTAGTGTGGGACCA TAGTAACCATTCGCAATGAAGTTTAAAGACCTCTATGCTATTTGTGTGGCAAGCTCGGGC AATAGACAGAGTGACAGCTGATGAGGTGTTCAAGTATGTTTGTTTGGTTGTGAAGTGGAA CGAGAAAAAGGAAGAGACGTACTATGCCACATAATGATATCACCATGACCTAGTGGGGCT ACATATGCCAAATAATGATATCACCAGAAGAGTTCCTCACTATATGCCACCTGGTCTACG TCGTCCTTGTCTTCAACTGCCAACCCTGTTTAGATCAGCTCTTGGAAAGTGTAGTTCAGA TTCTGGAAATGTAATTTGAAAGCGTAGTTTAGATTCTGGAAAGCGTCCTTGTCTACCTAC ATTTGGTTGATCTTTTATTCCTACAAGGGAGTTCTCTTCTTTTGGTTACAAATTTCTTGA AAGACATACGGTGATGACCTTCAGTTCCTATACATGACAGTTTAATGCTTCTTTGGTTAA CAGACAGAAAACCTAATATAATCAAAGCAAGAAACAGTGCTCATGACATATTCCAGCAGA ACTCGGAAGGTAAGTATGTTTGGATGAGAGTATCAATGTGATTTTCAGTATAAAAGCATG GTCAGGATTCAACAATATGTATTGAAATCACAAAACATTAAGAACAAGATGGTTAAGAGA ATGAACACATTGTCGTTTACTACTAATACCTCCTTGGATACAGGCAAGTGCAATCCAAGT CTTGTCTATCAGCTCAATCCAGTTTCAAACATAAAGTCACAGATGAAGAGGATCTTGGAA AGTGCAGGAACTCCTCTACTATTTCGACATACGCATCACTGCTTTTGCTTCTGGGAACAA TGACAAAT