Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc08g005230.3.1
CDS Infomation

GRIP/coiled-coil protein, putative (DUF1664) (AHRD V3.3 *** AT1G27000.1)
Sequence

ATGGCTATGCACGCTGGAGTAGGCTTAACAAAGATCGTGTTCATCGTCGGAGCAGGGTAT
ACTGGTACTTTGTTGTTTAAAAACGGAAAATTATCGGATGTGATAGGCGAGCTTCAGAAT
TTGGTCAAAAGTTATGAAAAGACGGGGGAATCAGATGGTGGAGACTCGGATGTCATTGCT
GCACAGGTTCGTAGATTGGCAATGGAGGTTCGGCAATTGGCTTCGGCACGATCAATTACT
GTTCTTAATGGAAGTTCTAGTGGTAACTGGACATCTCTGGTAATGCCAGCCGCTGCAGCA
GGTGCCTTGGGTTATGGATACATGTGGTGGAAGGGTTTGTCATTCTCTGACCTTATGTAT
GTAACAAAAAAGAATATGGCAACTGCTGTCTCAAATCTGACAAAACATCTTGATAATGTC
TCAGAGGCCCTTGCTGCTACAAAGAGGCACTTAACGCAGCGAATTGAGAATGTGGATGGA
AAATTGGATGAGCAAATGGAGATGTCAAAACTGATTAGGAGTGAGGTTAATGATGTGCAT
GGCGATCTGTCCCAGATTGGTTTTGATCTGGATCAACTAAACAGGATGGTTTCTGGTCTG
GATGGCAAGTTACTTTCTTTGGAAGGCAAGCAGGACCTTGCAAATGCTGGTGTTATGTAC
CTGTGTAATTTTATCAATGGAAAAACGGTGAAGATGCCTGAGACACTGCAGGAACAACTT
AAAATTGTGGGCAACTCTACACCTACTCTGATGGGCCTTAAAGAACTTGTGGATGCCTTA
CCAGAAGTAAACAGCAAGAGACTTATTACAGATGGCACTACTCAAGATGGTATTGATAAA
TTGAAAGAGCCACCTAGACCCCTGTTGAGGACTGCCTCTACCAAGTGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc08g005230.3.1
PEP Infomation

GRIP/coiled-coil protein, putative (DUF1664) (AHRD V3.3 *** AT1G27000.1)
Sequence

MAMHAGVGLTKIVFIVGAGYTGTLLFKNGKLSDVIGELQNLVKSYEKTGESDGGDSDVIA
AQVRRLAMEVRQLASARSITVLNGSSSGNWTSLVMPAAAAGALGYGYMWWKGLSFSDLMY
VTKKNMATAVSNLTKHLDNVSEALAATKRHLTQRIENVDGKLDEQMEMSKLIRSEVNDVH
GDLSQIGFDLDQLNRMVSGLDGKLLSLEGKQDLANAGVMYLCNFINGKTVKMPETLQEQL
KIVGNSTPTLMGLKELVDALPEVNSKRLITDGTTQDGIDKLKEPPRPLLRTASTKC*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc08g005230.3.1
Transcript Infomation

GRIP/coiled-coil protein, putative (DUF1664) (AHRD V3.3 *** AT1G27000.1)
Sequence

TAATCTCCTTTTTCAACATTCAACTCCAATATCCCTCGCCGGGAAACCAAAAAAATCTAG
GGTTTGTTGTTCACCGGACTAACGCCGACCATGGCTATGCACGCTGGAGTAGGCTTAACA
AAGATCGTGTTCATCGTCGGAGCAGGGTATACTGGTACTTTGTTGTTTAAAAACGGAAAA
TTATCGGATGTGATAGGCGAGCTTCAGAATTTGGTCAAAAGTTATGAAAAGACGGGGGAA
TCAGATGGTGGAGACTCGGATGTCATTGCTGCACAGGTTCGTAGATTGGCAATGGAGGTT
CGGCAATTGGCTTCGGCACGATCAATTACTGTTCTTAATGGAAGTTCTAGTGGTAACTGG
ACATCTCTGGTAATGCCAGCCGCTGCAGCAGGTGCCTTGGGTTATGGATACATGTGGTGG
AAGGGTTTGTCATTCTCTGACCTTATGTATGTAACAAAAAAGAATATGGCAACTGCTGTC
TCAAATCTGACAAAACATCTTGATAATGTCTCAGAGGCCCTTGCTGCTACAAAGAGGCAC
TTAACGCAGCGAATTGAGAATGTGGATGGAAAATTGGATGAGCAAATGGAGATGTCAAAA
CTGATTAGGAGTGAGGTTAATGATGTGCATGGCGATCTGTCCCAGATTGGTTTTGATCTG
GATCAACTAAACAGGATGGTTTCTGGTCTGGATGGCAAGTTACTTTCTTTGGAAGGCAAG
CAGGACCTTGCAAATGCTGGTGTTATGTACCTGTGTAATTTTATCAATGGAAAAACGGTG
AAGATGCCTGAGACACTGCAGGAACAACTTAAAATTGTGGGCAACTCTACACCTACTCTG
ATGGGCCTTAAAGAACTTGTGGATGCCTTACCAGAAGTAAACAGCAAGAGACTTATTACA
GATGGCACTACTCAAGATGGTATTGATAAATTGAAAGAGCCACCTAGACCCCTGTTGAGG
ACTGCCTCTACCAAGTGCTGATTAAGGGAAATATGTGAATTTCTCGTTTTGTTATTTCTT
TTTACCTTTTGATGTGATATATGAAGGCACAACATATGAAACAAGGGCGGGTGATGATTT
TTTTTTGTAATGAATAGCAATCTATCAGATTGCTTTTCTGGGTTTGTTATGATATGAACT
TGTCCTATGCTATTTTTTCACCCATGTTAGTAATTATACTCGCAGAAATTTGTACATGCT
AAAATAAGTACACGCCAGTGAATGGAAGAATACTGCAATGCTATGTTCTTTTTACCGTTT
CTTTGGAACAGGATTGTGCATTCTTTGGTTATTTTTGTATCTTAGGAGGCGCTACTTGTG
GAATT