Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g065790.2.1

CDS Infomation

LOW QUALITY:transmembrane protein C9orf5 protein (AHRD V3.3 *** AT5G55960.1)

Sequence

ATGGAGCTGGTGCCTTATTCAGACCCAAAAGCTGAATCAAGTGTTGTTAATCCACCTTGG
GAAGATATGTTTAGATCAGCTTCAATGAGGAAACCAGAAGAACCAAAGCCCCAGAACCAG
GTCCCTTCAGAGGCTCAGCCAAGAAAAGAAAATGAACCAAATCAAGATTCAGTGTCTGCT
GACCCTCAGGTGAGACTAGCCCTTTATATAGCTATGGCTCATGCTGGACTTGTATTTACA
TTTTTCATTATTTATGGTGTTGGTAAATTGCTTGAAGAGTATTTGAGAGCTATGTTATGG
GCTGTGCTTTGTTCAATTCCATTAAGGGGAATTCAACAAACCCTTGTTGCATTTTGGTCT
GAACCTTTGAAGTTAGGTCTTACTGAGACTATTTTAGCTGTCCCTGTAGCTGTTTTCAGT
GTTTTTCTAGGGACCCTTGTTGATATTAAAGAGAAGATTTTTAGGGTTGTTCTTAGGAGG
CCTAAAGGTAACACGACGAGGCGTCATACGAGTGGATTTTTCGTGTTGTTGAGGTGGCTT
ATGTCTTTTGGGGTGTTTGTGATTGCTTATGAGCAGATTGGTGGGATGGGATCAGTTGCA
CTTCTTGCATTGGGATTTATGTTTTCTGCTAATAGTGTGGATTCAACTATGAATGCAGTA
ACATCTTTAAGAAGTCATAGCTTTCGTAGGTTTGCTATTTCTGCTTTCTTTACTAGAGGG
ATATTGAAGAAGTTGAAGACGATTGTGGCGATTGGGTTGATTGTTGGATTGAGTGTGGGT
TCGTTAGCAGGTATGATTTTCTTCTCATATAAGATTGGTATGGAGGGGAAAGATGCTGTT
ATTGCGTTGAAATCCCATGTAGAGGAGAGTAATTATGCTGAGAAAATTGGCGTTAAGCAA
TGGATGGATGAAAATGATGTCCCCGGGATGGTGGATAGATACACCTCTCAAGTGTATGAG
ACCGTATTTACCCAGATAGATGGCTATGCTATGCAATATAATATGACGGAGTTTGTCTCT
GGGATAAAACATTTTGTAATAGTTCCTGCAAATAACACATTTAATCAATCTACGGCTTTG
GCATCCCCCTCTCCTTATGCAGAGAAACTCTTAAGCCTGAAAAGGAGGGTTAAAGATCGT
GAATGGGCACAAATATATACAGAAGTGGATGTAATGTTCAGGGAACTTCTGATCACTAGA
GAGGACTTGGTTGAGAAAGCCAAAGGGTTCGCTCTCCAAGGAGTAAATGTAATGCAACGG
ATACTGGTTAGTAGCACATCTGTCTTAGGTGGGAGCATGAAGGTCATGTTCTTGATCGGG
AATTCCATCGTTTCGGGTGCTGCTGGTCTTTTTAATTTTGTATCTCAGCTAATGGTATTC
ATTTGGGTACTTTATTATCTCATCACATCGGATTCTGGTGGAGTAACAGAACAAGTCATG
TCTATGCTCCCTATGTCACATTCCGCAAGGAGGCGAAGTGTTGAGGTTCTTGACAAAGCT
ATTTCTGGGGTTCTTCTAGCAACTGCTGAGATTGCACTCTTTCAGGGGTGTCTAACTTGG
CTCTTGTTCAGATTATTCTCCATACATTTTTTGTACATGTCAACAATCCTCGCATTTCTT
AGTCCTTTGTTTCCTATTTTCCCATCACTGTTTTCAACTATCCCAGCTGCTTTACAGTTG
GTGCTTGAAGGTCAATATGTATTGGCCATCAGCTTATCAATTATACATCTCGTACTTATG
GACTATGGTACATCCGAAATCATGGAGGATATACCTGGCTATAACGCGTATCTCACTGGT
CTCAGCATTATTGGAGGAATGACATTGTTCCCTTCAGCATTTGAGGGAGCAATAATGGGA
CCACTGATAACTACTGTTGTGATCGCGATTAAAGATTTGTATGTTGAATTTGTATTGGAA
GAACAGAAGGAATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g065790.2.1

PEP Infomation

LOW QUALITY:transmembrane protein C9orf5 protein (AHRD V3.3 *** AT5G55960.1)

Sequence

MELVPYSDPKAESSVVNPPWEDMFRSASMRKPEEPKPQNQVPSEAQPRKENEPNQDSVSA
DPQVRLALYIAMAHAGLVFTFFIIYGVGKLLEEYLRAMLWAVLCSIPLRGIQQTLVAFWS
EPLKLGLTETILAVPVAVFSVFLGTLVDIKEKIFRVVLRRPKGNTTRRHTSGFFVLLRWL
MSFGVFVIAYEQIGGMGSVALLALGFMFSANSVDSTMNAVTSLRSHSFRRFAISAFFTRG
ILKKLKTIVAIGLIVGLSVGSLAGMIFFSYKIGMEGKDAVIALKSHVEESNYAEKIGVKQ
WMDENDVPGMVDRYTSQVYETVFTQIDGYAMQYNMTEFVSGIKHFVIVPANNTFNQSTAL
ASPSPYAEKLLSLKRRVKDREWAQIYTEVDVMFRELLITREDLVEKAKGFALQGVNVMQR
ILVSSTSVLGGSMKVMFLIGNSIVSGAAGLFNFVSQLMVFIWVLYYLITSDSGGVTEQVM
SMLPMSHSARRRSVEVLDKAISGVLLATAEIALFQGCLTWLLFRLFSIHFLYMSTILAFL
SPLFPIFPSLFSTIPAALQLVLEGQYVLAISLSIIHLVLMDYGTSEIMEDIPGYNAYLTG
LSIIGGMTLFPSAFEGAIMGPLITTVVIAIKDLYVEFVLEEQKE*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g065790.2.1

Transcript Infomation

LOW QUALITY:transmembrane protein C9orf5 protein (AHRD V3.3 *** AT5G55960.1)

Sequence

TGAAGTTGTGGATACTAATAAAGACATCATTCATATTGAGTCTATGAATCAGTAATAGTA
AGTCCTCCAAAAAAAATTCCCATTGGGGGATTCACAAATCTGACAAATTCTTCCTCTGTC
AGCTTAGTCCAAAAATACACTCAACCCTGCAAATTCCCTTTAAAAAATCTTACTGTAAAA
CTTAAAGTCACCATTAATGGTGAATCAAGAAAGTCAATCTTAAGAATTTTCCCATTTTTG
AACAACCATAGTCATAAAGATTGAGTCTTTTGAGTTTTCTGAGGAAAAAAAAGCTATCTT
TATCAGAAATTAATGGAGCTGGTGCCTTATTCAGACCCAAAAGCTGAATCAAGTGTTGTT
AATCCACCTTGGGAAGATATGTTTAGATCAGCTTCAATGAGGAAACCAGAAGAACCAAAG
CCCCAGAACCAGGTCCCTTCAGAGGCTCAGCCAAGAAAAGAAAATGAACCAAATCAAGAT
TCAGTGTCTGCTGACCCTCAGGTGAGACTAGCCCTTTATATAGCTATGGCTCATGCTGGA
CTTGTATTTACATTTTTCATTATTTATGGTGTTGGTAAATTGCTTGAAGAGTATTTGAGA
GCTATGTTATGGGCTGTGCTTTGTTCAATTCCATTAAGGGGAATTCAACAAACCCTTGTT
GCATTTTGGTCTGAACCTTTGAAGTTAGGTCTTACTGAGACTATTTTAGCTGTCCCTGTA
GCTGTTTTCAGTGTTTTTCTAGGGACCCTTGTTGATATTAAAGAGAAGATTTTTAGGGTT
GTTCTTAGGAGGCCTAAAGGTAACACGACGAGGCGTCATACGAGTGGATTTTTCGTGTTG
TTGAGGTGGCTTATGTCTTTTGGGGTGTTTGTGATTGCTTATGAGCAGATTGGTGGGATG
GGATCAGTTGCACTTCTTGCATTGGGATTTATGTTTTCTGCTAATAGTGTGGATTCAACT
ATGAATGCAGTAACATCTTTAAGAAGTCATAGCTTTCGTAGGTTTGCTATTTCTGCTTTC
TTTACTAGAGGGATATTGAAGAAGTTGAAGACGATTGTGGCGATTGGGTTGATTGTTGGA
TTGAGTGTGGGTTCGTTAGCAGGTATGATTTTCTTCTCATATAAGATTGGTATGGAGGGG
AAAGATGCTGTTATTGCGTTGAAATCCCATGTAGAGGAGAGTAATTATGCTGAGAAAATT
GGCGTTAAGCAATGGATGGATGAAAATGATGTCCCCGGGATGGTGGATAGATACACCTCT
CAAGTGTATGAGACCGTATTTACCCAGATAGATGGCTATGCTATGCAATATAATATGACG
GAGTTTGTCTCTGGGATAAAACATTTTGTAATAGTTCCTGCAAATAACACATTTAATCAA
TCTACGGCTTTGGCATCCCCCTCTCCTTATGCAGAGAAACTCTTAAGCCTGAAAAGGAGG
GTTAAAGATCGTGAATGGGCACAAATATATACAGAAGTGGATGTAATGTTCAGGGAACTT
CTGATCACTAGAGAGGACTTGGTTGAGAAAGCCAAAGGGTTCGCTCTCCAAGGAGTAAAT
GTAATGCAACGGATACTGGTTAGTAGCACATCTGTCTTAGGTGGGAGCATGAAGGTCATG
TTCTTGATCGGGAATTCCATCGTTTCGGGTGCTGCTGGTCTTTTTAATTTTGTATCTCAG
CTAATGGTATTCATTTGGGTACTTTATTATCTCATCACATCGGATTCTGGTGGAGTAACA
GAACAAGTCATGTCTATGCTCCCTATGTCACATTCCGCAAGGAGGCGAAGTGTTGAGGTT
CTTGACAAAGCTATTTCTGGGGTTCTTCTAGCAACTGCTGAGATTGCACTCTTTCAGGGG
TGTCTAACTTGGCTCTTGTTCAGATTATTCTCCATACATTTTTTGTACATGTCAACAATC
CTCGCATTTCTTAGTCCTTTGTTTCCTATTTTCCCATCACTGTTTTCAACTATCCCAGCT
GCTTTACAGTTGGTGCTTGAAGGTCAATATGTATTGGCCATCAGCTTATCAATTATACAT
CTCGTACTTATGGACTATGGTACATCCGAAATCATGGAGGATATACCTGGCTATAACGCG
TATCTCACTGGTCTCAGCATTATTGGAGGAATGACATTGTTCCCTTCAGCATTTGAGGGA
GCAATAATGGGACCACTGATAACTACTGTTGTGATCGCGATTAAAGATTTGTATGTTGAA
TTTGTATTGGAAGAACAGAAGGAATAAGCAGAACAAATCTGTGTTTGCAATGCCTGAACC
TTTGAAGACATTGAGAAGAACCCCCTATTACTTTCTTTGATGGAAAAACATCGCAAGATA
AAGTGAATTCTTTTTTCTCCCAGTCAACTATTGTTTGTATTCTACCTGTGTTTGAGGATT
TTTTTTTTCTCTCAGAAAAAGCTGTTTATAGTGTGCAGAAAATTGGTAAATTATTAAAAT
TGGAGTATAGAATTGTGCATTGTATCTTCTTTGTAAAACCTTTAATCTTTTGAAGAGAAA
TAGAATTGTTTTGACATGTCA