Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g064510.3.1
CDS Infomation

RNA-binding family protein (AHRD V3.3 *** A0A061FD24_THECC)
Sequence

ATGATGCCACAAAGTGGAGTTGCTCAGCCAGCAATGGCACCTATGTCAATGGATCAGTAT
CAGCAGCAAGCTCCGCCGACGCAGCAGCAACAACAATGGATGATGCAACCTCCGCAAGCT
CAACAACCTCAATTTCAACCTTCTTGGGGTCAGCAGCAACAACAGCCATCGCAAACTATG
TCTCAACAGTATGTTGCGACTAATTCTAGCCCTAGCTCGAATGTTAATCCAAATGAGGTT
AGGTCTCTTTGGATTGGGGACTTGCAGTATTGGATGGATGAGAGTTATCTCTCCACTTGT
TTCTATCACACCGGCGAGCTTGTTTCTGCTAAGGTCATCAGGAACAAGCAAAGTGGCCAG
TCTGAAGGTTATGGATTCCTCGAATTCAGGAGTCATGCGGCTGCAGAAACTGTTTTACAA
ACATATAATGGCGCCTTGATGCCAAATGTGGAACAGAATTTCCGTATGAACTGGGCATCT
CTTGGTGCCGGTGAGAGGCGAGATGATTCACCCGAGTACACAATATTTGTTGGTGATTTG
GCTGCTGATGTGACGGATTATGTGCTACAAGAGACATTCAAACCCGTGTATTCATCAGTA
AAAGGTGCAAAAGTTGTAACAGATAGAATTACTGGACGTACCAAGGGATATGGATTTGTC
AAGTTCTCTGATGAGAGTGAACAATTGCGTGCTATGACTGAAATGAATGGTGTACTTTGT
TCATCTAGGCCCATGAGGATTGGCCCGGCTGCAAACAAGAAACCAATGGGTACCCCCCAG
AAAGCTACCTACCAAAATCCTCAAGCTACTCAAGGCGAAAGTGACCCCAATAATACAACT
ATATTTGTTGGTGGTTTGGATCCCAGTGTTGCAGAAGAGCATTTGCGACAAGTTTTCTCC
CCATATGGTGAATTGGTTCACGTGAAGATAGTGGCTGGAAAGCGCTGTGGCTTTGTTCAG
TTTGGTAGTAGAGCTTCTGCTGAGCAGGCTTTGTCAAGCTTGAATGGCACACAATTGGGA
GGACAAAGCATTCGGCTTTCTTGGGGGCGTAGCCCCTCTAACAAACAGTCCGATCAGGCT
CAATGGGGTGGAAGTGCCGGTGCTGGTGCTGGTGCATATTATGGGTATGCCCAAGGATAT
GAGGCTTATGGATATGCTCCTCCCGCTCAGGACCCTAATATGTATTATGGGAATTACCCA
GGATATGGGAATTATCAGCAGCCACAGCAGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g064510.3.1
PEP Infomation

RNA-binding family protein (AHRD V3.3 *** A0A061FD24_THECC)
Sequence

MMPQSGVAQPAMAPMSMDQYQQQAPPTQQQQQWMMQPPQAQQPQFQPSWGQQQQQPSQTM
SQQYVATNSSPSSNVNPNEVRSLWIGDLQYWMDESYLSTCFYHTGELVSAKVIRNKQSGQ
SEGYGFLEFRSHAAAETVLQTYNGALMPNVEQNFRMNWASLGAGERRDDSPEYTIFVGDL
AADVTDYVLQETFKPVYSSVKGAKVVTDRITGRTKGYGFVKFSDESEQLRAMTEMNGVLC
SSRPMRIGPAANKKPMGTPQKATYQNPQATQGESDPNNTTIFVGGLDPSVAEEHLRQVFS
PYGELVHVKIVAGKRCGFVQFGSRASAEQALSSLNGTQLGGQSIRLSWGRSPSNKQSDQA
QWGGSAGAGAGAYYGYAQGYEAYGYAPPAQDPNMYYGNYPGYGNYQQPQQ*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g064510.3.1
Transcript Infomation

RNA-binding family protein (AHRD V3.3 *** A0A061FD24_THECC)
Sequence

ACAAAGGCCCACGCACGCACCCCCACCCAGTAACCTTATCTTCGTCACCGTTCCATTTTT
TTTCTCTCTCTTTCATACCCCTAGGGTTTCATCTTAGCTCGTTCGATTTCGCCTGAAAAA
TGATGCCACAAAGTGGAGTTGCTCAGCCAGCAATGGCACCTATGTCAATGGATCAGTATC
AGCAGCAAGCTCCGCCGACGCAGCAGCAACAACAATGGATGATGCAACCTCCGCAAGCTC
AACAACCTCAATTTCAACCTTCTTGGGGTCAGCAGCAACAACAGCCATCGCAAACTATGT
CTCAACAGTATGTTGCGACTAATTCTAGCCCTAGCTCGAATGTTAATCCAAATGAGGTTA
GGTCTCTTTGGATTGGGGACTTGCAGTATTGGATGGATGAGAGTTATCTCTCCACTTGTT
TCTATCACACCGGCGAGCTTGTTTCTGCTAAGGTCATCAGGAACAAGCAAAGTGGCCAGT
CTGAAGGTTATGGATTCCTCGAATTCAGGAGTCATGCGGCTGCAGAAACTGTTTTACAAA
CATATAATGGCGCCTTGATGCCAAATGTGGAACAGAATTTCCGTATGAACTGGGCATCTC
TTGGTGCCGGTGAGAGGCGAGATGATTCACCCGAGTACACAATATTTGTTGGTGATTTGG
CTGCTGATGTGACGGATTATGTGCTACAAGAGACATTCAAACCCGTGTATTCATCAGTAA
AAGGTGCAAAAGTTGTAACAGATAGAATTACTGGACGTACCAAGGGATATGGATTTGTCA
AGTTCTCTGATGAGAGTGAACAATTGCGTGCTATGACTGAAATGAATGGTGTACTTTGTT
CATCTAGGCCCATGAGGATTGGCCCGGCTGCAAACAAGAAACCAATGGGTACCCCCCAGA
AAGCTACCTACCAAAATCCTCAAGCTACTCAAGGCGAAAGTGACCCCAATAATACAACTA
TATTTGTTGGTGGTTTGGATCCCAGTGTTGCAGAAGAGCATTTGCGACAAGTTTTCTCCC
CATATGGTGAATTGGTTCACGTGAAGATAGTGGCTGGAAAGCGCTGTGGCTTTGTTCAGT
TTGGTAGTAGAGCTTCTGCTGAGCAGGCTTTGTCAAGCTTGAATGGCACACAATTGGGAG
GACAAAGCATTCGGCTTTCTTGGGGGCGTAGCCCCTCTAACAAACAGTCCGATCAGGCTC
AATGGGGTGGAAGTGCCGGTGCTGGTGCTGGTGCATATTATGGGTATGCCCAAGGATATG
AGGCTTATGGATATGCTCCTCCCGCTCAGGACCCTAATATGTATTATGGGAATTACCCAG
GATATGGGAATTATCAGCAGCCACAGCAGTGAAGTTTAATTATTTTCAAGGAGGCTAAGA
AGTAGACGACGTTCAAATTTCCAGTGCTTAGGCTGATCTTTCCCGTCGGTGTGACTGGTT
GTACAATGAATTTGATAAACTGAGTGATTGTGAGTTTTTGTGGGACATTTTCTTTTCTCC
TGTCTGTAACTTGAGTTTGCTATTACACTAACGTGTACCGAAACATTCCAAACTGTACCT
TGACCTGTGTGTAGACTCTGTTAAGTTTTTTCTTACCATTTCTGATTTGCAGTATTCGAT
TGCATTTGGTTTGCTTGTGAGCAGCATCTAGTAAATGTGATGCTTATAATTGACGAAACA
AAGATGGTAGAGTAGCTGTATTTTAGTATGTGAAATTCTTTATGTTATATGATACATAAA
GAGTCTTCTACTGTTTAGATGTCTTAAATAATTTTGAGTTGTTTCTTTATGTTATGTGAT
ACAAACTATGCTTAAAAA