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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g064110.3.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SA19_RICCO)

Sequence

ATGCCCGGTTCCAAATCCAAAACCCTAACATCTTTGTTCCGTGCCGCTACTAAATTATCA
AAGCAATGGAAACCTGTTTCCCCTTCAACTTCAGCCAATGGTGTTGCCCTAAAACAATAT
GGATCTCCATCTTCTAAACCCTCTAATGATTCTTCTAAGTCTCTCAGTGAAATAGCTGCT
GAAAGTTTCAACTTTAAGTCTGCTGCTGACTATGGGGAATCATCAAAACTGTTGTCAAGT
GAAATATCATCGATACTCTGTGGTGATTTAGATTCTTATTTGAGCGATCCAGAAGAGAGT
AGTAATGCAAGTTGCTTGGAAAATGTATTGGATGTACCATGGTTATCAAATGTAGAAAAA
TGCAGCATTTCATTGCGGCGGAAAGAAATAGCACGAGAAAGGAAGGAAAAGTGGACCTTC
AAGAGTTCTCAGGTAGGTCGTTTCCACCAGTTAGTTGAACAATGTGCCTGTAAATTGGGG
ACTGATACTACCATTAAGGTGTTTGGTAAATTGGGACGAGAAACTGGCCTGAAAGAATAT
AATGCGCTGATAAGACTCTGTATAGAGAAGGCCAGAGAAAGTAATGATGAAGAGGTGTCG
TTGAAGCAGCTTTCAAAGGCATATCAACTACTAAAATCAATGAAGGAACAGGGTTTTCAA
TTAAAAGAGGAGAGCTATGGTTCAATTCTTATGTATTTTATTGATTTTGGCATGGTACAA
GATTTTGATTTTTACTGTGAGCTCATTACGGATGGAAATGCTGATTCACTTGTGAGATTA
ACTTACTATGAGATGTTGCTTTGGGCTAAGGTGGAAAATGAAGATAAAATAGAAGAACTC
CTCTACCATCTTTCTCTTTATGATGGTGCTGATAAATCTGCCTTTCAAGAAAACTACCTC
TTAGCACTGTGCGAAAGTGACCGAGTTGAGGATTTTGTGAGGGTTCTAAGAACTATTGAC
ATAACAAAAGTTTCATCTATTGATTTTGTCGCAAATATCTTCAAGTTCTTGGGGAAGTTG
CTATTGGAGTCCTTCGCTAAGATATTTCTTCAGGAGTTGGTAACAACAGGTATTGGAGCA
AAAGACATCTCAAAATTCATTTGTAATTATACAATTAGCATGCCAAGTGCGGTTGAAGAT
GTCATCCTTGAATTCAAAAATTTACATGCGGAGTTGGAGCTTAGGCCAACATTTTCCCAG
TATGAGAAGCTTATTCGGTACTGTTGTGAGTTATTTAAGGTACATGCTGCATTAGATATG
GTTGATCAAATGTTTGAAGCAGGTTTGACATTATCGTTGGAGACATTTAATTCCATACTT
GAAGCCTGCGATAAAAGCCGTGAGTATAATTTGGTTCATCGAATGTATCCAATGATACTT
CGTCATGATATCAAGCCAAATAGTGAGACCTTCAGGATTATGATAAACATGACTGTGAGA
ATAAAGGATTTTGAAGGTGCATATGACATGCTCAAGGATTTGGAGAAGTTTAACTTGATG
CCTACCACAAACATGTACAATGCCATAATGGGAGGATATTTCCGAGAGAAAGACACTCGT
GCTGCATTAGGGGTTCTCAAACGAATGGAAGATGCTAATGTGAAGTCAGACTCTCAGACT
TTCAGCTATCTGATAAGCAACTGCACGAATGAGGATGACATATCTAAGTTTCTCGATGAG
ATGAAAGATTCTGGAGTTCAACTCACAAAGCATGTATATATGGCCCTAATAAATGGATAT
GCAGCTTCTGGACAGTTTGAAAAGGCTAAACAGGTAATCTGTGATCAAGGAGTATCTGCA
AAGGGTTTCAATGAAATTAGAAGTGTGCTTATTTCAGCTCTTGCTTCACATGGGAAAATA
TCAGATGCCCTTGATATATATAAGGAAATGGAAGAAGCTCAATGCAAGTTGGAGCCAAAA
GCGGTCACCTGTCTTATTGAAAATCTTCAAGCTGAAGGAGATTTGCATAGATTGCTCAAC
CTACTTGAGCAATTAAATGGCCTCGATCAATGGGTGGATGCCTCCTATAGGGTCATAACA
TATTGTATTCGGAAAAATCATTTCAGATCTATTGTCGACTTGCTTAAAAGGCTGGTAGAT
GTATACAAGTCTGATGAAGTGGCTAAGGAAGTTCTATTCGATGAGGTTTTCTACCAGATT
GCGGAACAAGACCCAATAAATTTACAGTTAGGCTTGGATCTCCTTCAGGCTATTAAAAAA
GATATTGGTCTCCTCCCTTCACGACAAAGTCTTGATTTCCTCCTCAGTGCTTGTGTCAAT
GCCAAAGATTTACAAGCTTGTTATCTGATTTGGAAGGAGTACAGAATAGCTGGTCTTCCT
TACAATATTTTAAGTTATGTGAGGATGTATCGAGCCTTGTTGGCATTAGGGGACTACAAA
TCTGCAGCAAATATTCTCAATAATATACCAAGGGATGATTTTCATGTTTGCAATGTAGTC
AAAGCTTGTCAAACAGCTTATGGAACGTCTGCCTCCGCAAAAGGGAAAAAGAAAGAAAAC
AAGACTGGGAAGATTGTGACATATAAGATGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g064110.3.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SA19_RICCO)

Sequence

MPGSKSKTLTSLFRAATKLSKQWKPVSPSTSANGVALKQYGSPSSKPSNDSSKSLSEIAA
ESFNFKSAADYGESSKLLSSEISSILCGDLDSYLSDPEESSNASCLENVLDVPWLSNVEK
CSISLRRKEIARERKEKWTFKSSQVGRFHQLVEQCACKLGTDTTIKVFGKLGRETGLKEY
NALIRLCIEKARESNDEEVSLKQLSKAYQLLKSMKEQGFQLKEESYGSILMYFIDFGMVQ
DFDFYCELITDGNADSLVRLTYYEMLLWAKVENEDKIEELLYHLSLYDGADKSAFQENYL
LALCESDRVEDFVRVLRTIDITKVSSIDFVANIFKFLGKLLLESFAKIFLQELVTTGIGA
KDISKFICNYTISMPSAVEDVILEFKNLHAELELRPTFSQYEKLIRYCCELFKVHAALDM
VDQMFEAGLTLSLETFNSILEACDKSREYNLVHRMYPMILRHDIKPNSETFRIMINMTVR
IKDFEGAYDMLKDLEKFNLMPTTNMYNAIMGGYFREKDTRAALGVLKRMEDANVKSDSQT
FSYLISNCTNEDDISKFLDEMKDSGVQLTKHVYMALINGYAASGQFEKAKQVICDQGVSA
KGFNEIRSVLISALASHGKISDALDIYKEMEEAQCKLEPKAVTCLIENLQAEGDLHRLLN
LLEQLNGLDQWVDASYRVITYCIRKNHFRSIVDLLKRLVDVYKSDEVAKEVLFDEVFYQI
AEQDPINLQLGLDLLQAIKKDIGLLPSRQSLDFLLSACVNAKDLQACYLIWKEYRIAGLP
YNILSYVRMYRALLALGDYKSAANILNNIPRDDFHVCNVVKACQTAYGTSASAKGKKKEN
KTGKIVTYKM*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g064110.3.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SA19_RICCO)

Sequence

TTTTTAAAATCGAGGATCTAATAGTACTTGTGCAAATTTCACTTTAGCCTCGAAGAACCT
TTGTATTGTGAACGTTGTTGGCTCCTTTCATAGTCAGTTCCTTAATTTCTTCATTCACCA
AATTCCTTTCTTGGATTATGCAGTTTTAGATCAAATTCCTTTCTTGGATTATGCAGTTTT
AGATCAAATTAAACACTAATTTAACTCAACATAATCAAATCTAACTGTTAGAATTGAGTG
TTTCTGCAAAAAAGATTGAATCTTTTTGTTTAATCTGTGCTGTGGTAAGCTTTGAGTTGA
CAGTGAAGCAAGAATCCAGTTGGGTCATTGCTCATGCCCGGTTCCAAATCCAAAACCCTA
ACATCTTTGTTCCGTGCCGCTACTAAATTATCAAAGCAATGGAAACCTGTTTCCCCTTCA
ACTTCAGCCAATGGTGTTGCCCTAAAACAATATGGATCTCCATCTTCTAAACCCTCTAAT
GATTCTTCTAAGTCTCTCAGTGAAATAGCTGCTGAAAGTTTCAACTTTAAGTCTGCTGCT
GACTATGGGGAATCATCAAAACTGTTGTCAAGTGAAATATCATCGATACTCTGTGGTGAT
TTAGATTCTTATTTGAGCGATCCAGAAGAGAGTAGTAATGCAAGTTGCTTGGAAAATGTA
TTGGATGTACCATGGTTATCAAATGTAGAAAAATGCAGCATTTCATTGCGGCGGAAAGAA
ATAGCACGAGAAAGGAAGGAAAAGTGGACCTTCAAGAGTTCTCAGGTAGGTCGTTTCCAC
CAGTTAGTTGAACAATGTGCCTGTAAATTGGGGACTGATACTACCATTAAGGTGTTTGGT
AAATTGGGACGAGAAACTGGCCTGAAAGAATATAATGCGCTGATAAGACTCTGTATAGAG
AAGGCCAGAGAAAGTAATGATGAAGAGGTGTCGTTGAAGCAGCTTTCAAAGGCATATCAA
CTACTAAAATCAATGAAGGAACAGGGTTTTCAATTAAAAGAGGAGAGCTATGGTTCAATT
CTTATGTATTTTATTGATTTTGGCATGGTACAAGATTTTGATTTTTACTGTGAGCTCATT
ACGGATGGAAATGCTGATTCACTTGTGAGATTAACTTACTATGAGATGTTGCTTTGGGCT
AAGGTGGAAAATGAAGATAAAATAGAAGAACTCCTCTACCATCTTTCTCTTTATGATGGT
GCTGATAAATCTGCCTTTCAAGAAAACTACCTCTTAGCACTGTGCGAAAGTGACCGAGTT
GAGGATTTTGTGAGGGTTCTAAGAACTATTGACATAACAAAAGTTTCATCTATTGATTTT
GTCGCAAATATCTTCAAGTTCTTGGGGAAGTTGCTATTGGAGTCCTTCGCTAAGATATTT
CTTCAGGAGTTGGTAACAACAGGTATTGGAGCAAAAGACATCTCAAAATTCATTTGTAAT
TATACAATTAGCATGCCAAGTGCGGTTGAAGATGTCATCCTTGAATTCAAAAATTTACAT
GCGGAGTTGGAGCTTAGGCCAACATTTTCCCAGTATGAGAAGCTTATTCGGTACTGTTGT
GAGTTATTTAAGGTACATGCTGCATTAGATATGGTTGATCAAATGTTTGAAGCAGGTTTG
ACATTATCGTTGGAGACATTTAATTCCATACTTGAAGCCTGCGATAAAAGCCGTGAGTAT
AATTTGGTTCATCGAATGTATCCAATGATACTTCGTCATGATATCAAGCCAAATAGTGAG
ACCTTCAGGATTATGATAAACATGACTGTGAGAATAAAGGATTTTGAAGGTGCATATGAC
ATGCTCAAGGATTTGGAGAAGTTTAACTTGATGCCTACCACAAACATGTACAATGCCATA
ATGGGAGGATATTTCCGAGAGAAAGACACTCGTGCTGCATTAGGGGTTCTCAAACGAATG
GAAGATGCTAATGTGAAGTCAGACTCTCAGACTTTCAGCTATCTGATAAGCAACTGCACG
AATGAGGATGACATATCTAAGTTTCTCGATGAGATGAAAGATTCTGGAGTTCAACTCACA
AAGCATGTATATATGGCCCTAATAAATGGATATGCAGCTTCTGGACAGTTTGAAAAGGCT
AAACAGGTAATCTGTGATCAAGGAGTATCTGCAAAGGGTTTCAATGAAATTAGAAGTGTG
CTTATTTCAGCTCTTGCTTCACATGGGAAAATATCAGATGCCCTTGATATATATAAGGAA
ATGGAAGAAGCTCAATGCAAGTTGGAGCCAAAAGCGGTCACCTGTCTTATTGAAAATCTT
CAAGCTGAAGGAGATTTGCATAGATTGCTCAACCTACTTGAGCAATTAAATGGCCTCGAT
CAATGGGTGGATGCCTCCTATAGGGTCATAACATATTGTATTCGGAAAAATCATTTCAGA
TCTATTGTCGACTTGCTTAAAAGGCTGGTAGATGTATACAAGTCTGATGAAGTGGCTAAG
GAAGTTCTATTCGATGAGGTTTTCTACCAGATTGCGGAACAAGACCCAATAAATTTACAG
TTAGGCTTGGATCTCCTTCAGGCTATTAAAAAAGATATTGGTCTCCTCCCTTCACGACAA
AGTCTTGATTTCCTCCTCAGTGCTTGTGTCAATGCCAAAGATTTACAAGCTTGTTATCTG
ATTTGGAAGGAGTACAGAATAGCTGGTCTTCCTTACAATATTTTAAGTTATGTGAGGATG
TATCGAGCCTTGTTGGCATTAGGGGACTACAAATCTGCAGCAAATATTCTCAATAATATA
CCAAGGGATGATTTTCATGTTTGCAATGTAGTCAAAGCTTGTCAAACAGCTTATGGAACG
TCTGCCTCCGCAAAAGGGAAAAAGAAAGAAAACAAGACTGGGAAGATTGTGACATATAAG
ATGTGAAAAGTGGAATTCGTAGGGGATTTAGAAAATTCTTCGCAGTTGTATGAGATCAAC
ATTTTGCAGTTCATGTAGATGTACAACTTTTAGTGTTGAGAACTCGTTCGTGCTTTAAAG
TTGCCCTGAGACTAACAGCAAGTTGGAAGTTGATCAAGAGACGACACTTCTTTCGACTTC
TGGTATCATGCCTTAAAAAAGGTTGGTGTTCCTTCTGATCTTGAAAGAGAAACATATATT
CTGTATGGCATAGAAAGTGACGGACTGCAGCGTAGAGATGTTTAACAAGCTTTACGCATA
CAGAAAATGCTTCGTGGTGTTCGAATAATCTATCAGGGAGAACAACAATGAAATAATGAA
ATACAGACTTAAATACAGTACAAGTGAAACAAAGATGCTACAAATTTGTCAAAAAGAATT
AGCAACAAGAATGGCTTGCCTACAACGTGCTTTAGCTTGTTCAAGTCTTTTATTCAATGT
TTCTTCTTTAACAGCAGCACTCACCATAGCTAAATCCATTTCCATAAGCTTCAAAACTCT
GTACAATTCCGTCACCATTCTCTCCTCCACTTTTCCTTCGTCTTTCAACACTTCCGCTTC
TTCCCTAGCTCTTTCTGCAACTATTTCTCCAACTTTCGCTAACAACGCCGTCGACCCAAA
ATCCCTAGCCATTAACTCTTCCAATTTCTCCAAAAAATCCATTATCACATACCCAATTGG
CTTATCTAATGGAATTGGCTTTGTTCTCTTCCACCCAATTTCGAAATTTGGTGGGTCTTG
CTTTATAAGCTCAGTTCTTGATTTTCTCTCACGGATTATCTCGGATTTTCGACGTTTTTC
AATTGGGAATTTTTCTGGGCTAATTGTTGTTTCTGAATTTGGGGTTAGAAATTCTGGGTC
TGAAGAAGATTCAGGTGAAGTGCATTTGATAGTGAATTGCTTTACGCAAGAAATTGGATG
AATTGAAGGAAGAAGATGGAGATGGTGAAGTTGAAGAATATTTGAAGAAGAAGCCATTGT
TTTAAATTCTCCAACAAAGTTGATAAGGTCTTATATAGTGTAGTATTTACTTTTGTCAAT
ATACACTATTTGATAAAAGTGAATATCTAGATTGAGCTAAATATCTACCTGAAATACATT
GCGTTTCGAAATATTTGTCATGTTTAATTTTTGATATTGAGAAAAAGTACGACTTG