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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g062820.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G18520.1)

Sequence

ATGTTTTCACCTTCAATTTGCTTTCCAACAACAATTCTTCAAATTCAGCCAGATAACAGA
AGTCGGTTCAGAACCCACAAATGTAAAAGCTATACTGATGACAGAAAACTTCCCTGTTTC
TCTTTCAAAGACCCATCTTCCTCAGCTCGTTTTGATGTTTCTGCAAGTTTTTGTAGAGAC
AATGAATTAGTTTGTCAATTGGAAGTTCCAGGTGATAAAATTTGTTCAGTGAATAGTTTT
GTGGCTGATTCAAGTTTGCTTGGTCGTTTGCTTCAATCTAGTTCTAGTTTAAAAGAAGTT
AAAATACTTCATGCGATTGTTTTAAAGTGTTTGAGGAGCAGTACTATATTTGTTGAGAAT
AATTTGATTAGTGTGTTGGTGAAATTTGGGCGTTTGGATGATGCTCGTAAGGTGTTCGAT
CATATGCTCGAGAGGAATGTGGTTTCTTGGACTGCTATGCTTAATGGGTATTTGAGATAT
GGGTTAGATGATGAAGCTTTTGATTTTTTCGCGGAGTTTGTTCGATGTGGTTTGTTGTGG
AATTCCAAGACTTATGTGTGTGTGTTAAGCATGGCTGGGAGGTGTTGTTATTTTGAGCTG
GGGAAGCAAGTGCATGCTGGTGTTGTAAAGGGTGGATTAAGTAATTTGATCTTAGATAGT
TCGGTTGTGTCTTTTTACGCGCAATGTGGGGATTTGGCAAGTGCTTTCCGCGTTTTTGAC
GTGATAAAACGCCCTGATGTAGTTTGTTGGACAACTATGATCACTGCTTGTTCACAGCAT
GGGAGAGGGAAGGAAGCTTTACTAATGTTCTTGCAGTTGTTCTCTGATGGTTTTGATGCT
AACGAGTTTACTGTCTGCAGTATCTTGAATGCGTGTGGGGAGGAGAGGGAGTTAAAATTC
GGGAAGCAACTACATGCTGCAGTTATTAAGAACAGATTTAGAATGGATGTCTTCATAGGC
ACCTCATTGGTAGATATGTACGCAAAGTGTAGTAAGATAGATGATGCTAGGACAGTGTTT
GATGGGATGGGAAAAAGGAACACGGTGACTTGGACGTCTATTATTGCAGGATATGCACGT
AATGGTCACGCAGAAGAGGCCATAAGACTCTTTCGGATAATGAAAAGGCGAAAGATCTTT
GCTAATAACTTGACTATGGTAAGCATCCTTCGAGCTTGTGGCCTACTTAGAGCTTTACCA
ACTGGAAAGGAAGTGCATGCACAAATTATCAAGAATTCTCTCCAAGATAATATTTATTTA
GGAAGTACATTAGTGTGGCTTTATTGCAAATGCAGTGAAAATTCTACAGCACATAAGGTC
CTTCAGGAAATGCCTATTAGGGATGTAGTTTCATGGACTGCGATGATTTCTGGTTGTGCC
CATTTAGGACATGAGTACGAGGCTCTTGAATACTTGAAGGAGATGCTAGGTGAAGGCGTA
GCCCCCAATCCATTTACGTATTCATCAGCCCTGAAAGCATGTGCAAAGCTGGAAGATATC
GAGAGAGGGAAGCTGATCCATTCCTCTATAAGCAAGACACCTGCTCTGTCCAATGTGTTT
GTGGGCAGTGCATTGATCAATATGTATGCAAAATGTGGACATCTTCCTGAGGCAATTCAA
ATATTTGATAACATGCCTGAGAAGAATTTGGTTTCTTGGAAGGCGATGATTGTTGCTTAT
GCTAAAAACGGGAACTGTGGAGAGGCATTGAAGCTCATGTATCGTATGCAAGTAGAGGGT
ATTGAGGTGGATGATTATATCCTTGCTACTGTTCTCACAGCATGTGGAGAATATAAGGAA
ACTATCAAGTCCAAATCGAAGTATTTCTTGCATCCAAATAGTTCTATAACCTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g062820.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G18520.1)

Sequence

MFSPSICFPTTILQIQPDNRSRFRTHKCKSYTDDRKLPCFSFKDPSSSARFDVSASFCRD
NELVCQLEVPGDKICSVNSFVADSSLLGRLLQSSSSLKEVKILHAIVLKCLRSSTIFVEN
NLISVLVKFGRLDDARKVFDHMLERNVVSWTAMLNGYLRYGLDDEAFDFFAEFVRCGLLW
NSKTYVCVLSMAGRCCYFELGKQVHAGVVKGGLSNLILDSSVVSFYAQCGDLASAFRVFD
VIKRPDVVCWTTMITACSQHGRGKEALLMFLQLFSDGFDANEFTVCSILNACGEERELKF
GKQLHAAVIKNRFRMDVFIGTSLVDMYAKCSKIDDARTVFDGMGKRNTVTWTSIIAGYAR
NGHAEEAIRLFRIMKRRKIFANNLTMVSILRACGLLRALPTGKEVHAQIIKNSLQDNIYL
GSTLVWLYCKCSENSTAHKVLQEMPIRDVVSWTAMISGCAHLGHEYEALEYLKEMLGEGV
APNPFTYSSALKACAKLEDIERGKLIHSSISKTPALSNVFVGSALINMYAKCGHLPEAIQ
IFDNMPEKNLVSWKAMIVAYAKNGNCGEALKLMYRMQVEGIEVDDYILATVLTACGEYKE
TIKSKSKYFLHPNSSIT*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g062820.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT4G18520.1)

Sequence

ATGTTTTCACCTTCAATTTGCTTTCCAACAACAATTCTTCAAATTCAGCCAGATAACAGA
AGTCGGTTCAGAACCCACAAATGTAAAAGCTATACTGATGACAGAAAACTTCCCTGTTTC
TCTTTCAAAGACCCATCTTCCTCAGCTCGTTTTGATGTTTCTGCAAGTTTTTGTAGAGAC
AATGAATTAGTTTGTCAATTGGAAGTTCCAGGTGATAAAATTTGTTCAGTGAATAGTTTT
GTGGCTGATTCAAGTTTGCTTGGTCGTTTGCTTCAATCTAGTTCTAGTTTAAAAGAAGTT
AAAATACTTCATGCGATTGTTTTAAAGTGTTTGAGGAGCAGTACTATATTTGTTGAGAAT
AATTTGATTAGTGTGTTGGTGAAATTTGGGCGTTTGGATGATGCTCGTAAGGTGTTCGAT
CATATGCTCGAGAGGAATGTGGTTTCTTGGACTGCTATGCTTAATGGGTATTTGAGATAT
GGGTTAGATGATGAAGCTTTTGATTTTTTCGCGGAGTTTGTTCGATGTGGTTTGTTGTGG
AATTCCAAGACTTATGTGTGTGTGTTAAGCATGGCTGGGAGGTGTTGTTATTTTGAGCTG
GGGAAGCAAGTGCATGCTGGTGTTGTAAAGGGTGGATTAAGTAATTTGATCTTAGATAGT
TCGGTTGTGTCTTTTTACGCGCAATGTGGGGATTTGGCAAGTGCTTTCCGCGTTTTTGAC
GTGATAAAACGCCCTGATGTAGTTTGTTGGACAACTATGATCACTGCTTGTTCACAGCAT
GGGAGAGGGAAGGAAGCTTTACTAATGTTCTTGCAGTTGTTCTCTGATGGTTTTGATGCT
AACGAGTTTACTGTCTGCAGTATCTTGAATGCGTGTGGGGAGGAGAGGGAGTTAAAATTC
GGGAAGCAACTACATGCTGCAGTTATTAAGAACAGATTTAGAATGGATGTCTTCATAGGC
ACCTCATTGGTAGATATGTACGCAAAGTGTAGTAAGATAGATGATGCTAGGACAGTGTTT
GATGGGATGGGAAAAAGGAACACGGTGACTTGGACGTCTATTATTGCAGGATATGCACGT
AATGGTCACGCAGAAGAGGCCATAAGACTCTTTCGGATAATGAAAAGGCGAAAGATCTTT
GCTAATAACTTGACTATGGTAAGCATCCTTCGAGCTTGTGGCCTACTTAGAGCTTTACCA
ACTGGAAAGGAAGTGCATGCACAAATTATCAAGAATTCTCTCCAAGATAATATTTATTTA
GGAAGTACATTAGTGTGGCTTTATTGCAAATGCAGTGAAAATTCTACAGCACATAAGGTC
CTTCAGGAAATGCCTATTAGGGATGTAGTTTCATGGACTGCGATGATTTCTGGTTGTGCC
CATTTAGGACATGAGTACGAGGCTCTTGAATACTTGAAGGAGATGCTAGGTGAAGGCGTA
GCCCCCAATCCATTTACGTATTCATCAGCCCTGAAAGCATGTGCAAAGCTGGAAGATATC
GAGAGAGGGAAGCTGATCCATTCCTCTATAAGCAAGACACCTGCTCTGTCCAATGTGTTT
GTGGGCAGTGCATTGATCAATATGTATGCAAAATGTGGACATCTTCCTGAGGCAATTCAA
ATATTTGATAACATGCCTGAGAAGAATTTGGTTTCTTGGAAGGCGATGATTGTTGCTTAT
GCTAAAAACGGGAACTGTGGAGAGGCATTGAAGCTCATGTATCGTATGCAAGTAGAGGGT
ATTGAGGTGGATGATTATATCCTTGCTACTGTTCTCACAGCATGTGGAGAATATAAGGAA
ACTATCAAGTCCAAATCGAAGTATTTCTTGCATCCAAATAGTTCTATAACCTAA