Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g056220.3.1

CDS Infomation

Vacuolar protein sorting-associated protein 16-like protein (AHRD V3.3 *** W9QLH6_9ROSA)

Sequence

ATGGCGGCAGTCACTGTGGCCGCAGAATGGCAGCTCCTTTACAATCGCTACTACCGGAAA
CCTGAAATTTACCTGATGCAATGGAAGCACGTCGACCTCACGCGTAACAAAGTCGCCTGC
GCTCCTTTCGGTGGTCCAATCGCTGTCATACGTGACGATGCTAAGATCGTCCAGCTTTAC
GCTGAATCTGCCCTTCGTAAGCTTAGAATTTTCAATTCCGCTGGTGTTCAGATCTCTGAA
ACAGTATGGAAGAATCCTGGCGGTCGACTTATCGGTATGTCATGGACTGATGATCAAATT
CTAGTTTGTATTACTCAGGATGGTACTGTTTATCGTTATAACATACATGCCGAGCCTATT
GAACCGAATTCTCAGCTTACGTTAGGTGCGGACTGTTTTACTCATAGTGTAGTTGAGTGT
GTTTTCTGGGGGAATGGTGTTGTTTGTATCAATGAGGCGTTTCAGGTTTATTGTATACCT
GATTTCAATAATCCAAAACCTGTCAAATTGGCGGATACTGGTTTGGAGGATTTTCCTTTA
TGTATGGCTGTGATTGAACCGCAGTATACTATGTCTGGCAATGTGGAGGTACTGATGGGG
GTTGCTGATCATGTGCTGTTGGTGGAAGAGGATGGCGTTCAGGAGGTTGGACTTGGAATT
GGGCCTCTACAGAAAATGGTGGTTTCCCGGAATGGGAAGCTTTTGGCATCTTTTACACAT
GATGGAAGGCTTCTTGTTATGTCCACGGACTTCTCCAGTGTCATTTTCGAGTATCCTTGT
GAGTCAGCCTTACCCCCTGAGCAGCTAGCTTGGTGTGGAATGGACAGTGTACTACTTTAC
TGGGATGATATGCTTCTGATGGTGGGTCCTTATGGAGACCCTGTACGCTACTTTTATGAT
GAACCAGTTCTCCTTATCCCTGAATGTGATGGCGTTAGAATACTCTCCAATATGAGTATG
GAATTTCTTCATCGAGTTCCAGATTCAACTGTCTCCATATTTCAGATTGGTAGCACACTA
CCTGCAGCTTTGCTTTATGATGCCTTAGATCATTTTGACAGGCGGAGTGCCAAGGCTGAT
GAGAATCTGAGACTAATACGGTCTTCGCTGCCCGAGGCGGTTGAAGCATGTATTGATGCA
GCAGGTCATGAATTTGACGTCTCACAGCAGCGGACGCTTTTAAGAGCAGCAAGCTACGGC
CAAGCCTTTTGCAGCCATTTTCAACGGGACCGCATTCAAGAGATGAGTAAAACTTTACGA
GTATTAAATGCTGTACGTCACCCAGATATTGGCATTCCTCTCAGTATTCAACAGTATAAG
TCGCTTACACCTGCTGTTCTGATTGCTCGTCTTATTAATGCTCATCGCCACCTTCTTGCA
CTACAAATATCAGAATATCTTAGTATGAATCAGGAGGTTGTTGTCATGCACTGGGCATCT
ACAAAGATAACCGCATCGGCGGCAATCCCTGATGCCACTCTTCTAGAGATGTTACTTGAT
AAGCTGAAGATATGCAAGGGAATATCTTATGCTGCAGTTGCTGCTCATGCGGATAAAAAT
GGCCGTCGGAAGTTGGCTGCCATGCTTGTTGAACATGAACCACGTTCATCTAAGCAGGTT
CCTCTCTTGCTAAGCATTGGAGAAGAGGATACTGCTCTAATGAAGTCAACTGAAAGTGGT
GATACTGATTTAGTTTATCTTGTCCTGTTCCACATCTGGCAAAAGAGACCAGCTTTGGAT
TTCTTTGGGACAATACAGGCCAGACCTCTAGCTCGTGATTTGTTTGTTAATTATGCACGG
CATTACAAGCATGAATTTTTGAAGGACTTTTTTCTATCTACGGGGCAACTTCAGGATGTA
GCTTTTCTGTTATGGAAAGAGTCATGGGAATTGTCTAAGAATCCCATGGCTAGCAAAGGA
TCTCCACTTCATGGTCCAAGAGTAAAACTCATTGAGAAGGTCCAGCATCTATTTGTAGAA
ACAAAGGAAAATTTTTTTGAATCAAAAGCTGCTGAAGAGCATGCAAAATTGTTAAGGATA
CAACATGAGATTGAGGTGAATACAAAACAGGCCATCTTTATGGATTCAAGTATAAGTGAT
ACAATTCGTACATGCATTGTGCTGGGTAACCATCGTGGTGCCAATAGAGTCAAAACAGAA
TTTAAGGTATCTGAAAAGCGATGGTATTGGCTTAAAGTTTTTGCTCTGGCAACAATTAGG
GATTGGGATGCCTTGGAAAAGTTTTCAAAGGAAAAAAGGCCACCAATTGGTTACCGCCCA
TTTGTCGAAGCATGTGTTGATGCAAATGAGAAAGGTGAAGCACTAAAGTACATACCAAAG
CTGACTGATCCTCGTGAAAGAGCAGAGGCTTACGCTCGAATTGGAATGGCCAAGGAGGCT
GCTGATGCTGCTACTCAGGCTAAAGATAATGAATTACTTGGGAGGCTGAAGCAGACATTT
TCTCAAAATGCAGCCGCTTCATCAATTTTTGACACACTGCGAGATCGGTTATCCTTCCCA
AGTGTTTCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g056220.3.1

PEP Infomation

Vacuolar protein sorting-associated protein 16-like protein (AHRD V3.3 *** W9QLH6_9ROSA)

Sequence

MAAVTVAAEWQLLYNRYYRKPEIYLMQWKHVDLTRNKVACAPFGGPIAVIRDDAKIVQLY
AESALRKLRIFNSAGVQISETVWKNPGGRLIGMSWTDDQILVCITQDGTVYRYNIHAEPI
EPNSQLTLGADCFTHSVVECVFWGNGVVCINEAFQVYCIPDFNNPKPVKLADTGLEDFPL
CMAVIEPQYTMSGNVEVLMGVADHVLLVEEDGVQEVGLGIGPLQKMVVSRNGKLLASFTH
DGRLLVMSTDFSSVIFEYPCESALPPEQLAWCGMDSVLLYWDDMLLMVGPYGDPVRYFYD
EPVLLIPECDGVRILSNMSMEFLHRVPDSTVSIFQIGSTLPAALLYDALDHFDRRSAKAD
ENLRLIRSSLPEAVEACIDAAGHEFDVSQQRTLLRAASYGQAFCSHFQRDRIQEMSKTLR
VLNAVRHPDIGIPLSIQQYKSLTPAVLIARLINAHRHLLALQISEYLSMNQEVVVMHWAS
TKITASAAIPDATLLEMLLDKLKICKGISYAAVAAHADKNGRRKLAAMLVEHEPRSSKQV
PLLLSIGEEDTALMKSTESGDTDLVYLVLFHIWQKRPALDFFGTIQARPLARDLFVNYAR
HYKHEFLKDFFLSTGQLQDVAFLLWKESWELSKNPMASKGSPLHGPRVKLIEKVQHLFVE
TKENFFESKAAEEHAKLLRIQHEIEVNTKQAIFMDSSISDTIRTCIVLGNHRGANRVKTE
FKVSEKRWYWLKVFALATIRDWDALEKFSKEKRPPIGYRPFVEACVDANEKGEALKYIPK
LTDPRERAEAYARIGMAKEAADAATQAKDNELLGRLKQTFSQNAAASSIFDTLRDRLSFP
SVS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g056220.3.1

Transcript Infomation

Vacuolar protein sorting-associated protein 16-like protein (AHRD V3.3 *** W9QLH6_9ROSA)

Sequence

GGGGCAGTTGACCCAAATAAAAAAAGGGCCATAAAACGGAGCTGCCCCCGACCCGACATA
AGTCGCATTGATCCAATGGTACTTTACTCCATTTTTTCAATTTCGGATCCATTCATATCT
TTGATCGGAAATTAAACTCAACCTACAAATCCTCCGATGGCGGCAGTCACTGTGGCCGCA
GAATGGCAGCTCCTTTACAATCGCTACTACCGGAAACCTGAAATTTACCTGATGCAATGG
AAGCACGTCGACCTCACGCGTAACAAAGTCGCCTGCGCTCCTTTCGGTGGTCCAATCGCT
GTCATACGTGACGATGCTAAGATCGTCCAGCTTTACGCTGAATCTGCCCTTCGTAAGCTT
AGAATTTTCAATTCCGCTGGTGTTCAGATCTCTGAAACAGTATGGAAGAATCCTGGCGGT
CGACTTATCGGTATGTCATGGACTGATGATCAAATTCTAGTTTGTATTACTCAGGATGGT
ACTGTTTATCGTTATAACATACATGCCGAGCCTATTGAACCGAATTCTCAGCTTACGTTA
GGTGCGGACTGTTTTACTCATAGTGTAGTTGAGTGTGTTTTCTGGGGGAATGGTGTTGTT
TGTATCAATGAGGCGTTTCAGGTTTATTGTATACCTGATTTCAATAATCCAAAACCTGTC
AAATTGGCGGATACTGGTTTGGAGGATTTTCCTTTATGTATGGCTGTGATTGAACCGCAG
TATACTATGTCTGGCAATGTGGAGGTACTGATGGGGGTTGCTGATCATGTGCTGTTGGTG
GAAGAGGATGGCGTTCAGGAGGTTGGACTTGGAATTGGGCCTCTACAGAAAATGGTGGTT
TCCCGGAATGGGAAGCTTTTGGCATCTTTTACACATGATGGAAGGCTTCTTGTTATGTCC
ACGGACTTCTCCAGTGTCATTTTCGAGTATCCTTGTGAGTCAGCCTTACCCCCTGAGCAG
CTAGCTTGGTGTGGAATGGACAGTGTACTACTTTACTGGGATGATATGCTTCTGATGGTG
GGTCCTTATGGAGACCCTGTACGCTACTTTTATGATGAACCAGTTCTCCTTATCCCTGAA
TGTGATGGCGTTAGAATACTCTCCAATATGAGTATGGAATTTCTTCATCGAGTTCCAGAT
TCAACTGTCTCCATATTTCAGATTGGTAGCACACTACCTGCAGCTTTGCTTTATGATGCC
TTAGATCATTTTGACAGGCGGAGTGCCAAGGCTGATGAGAATCTGAGACTAATACGGTCT
TCGCTGCCCGAGGCGGTTGAAGCATGTATTGATGCAGCAGGTCATGAATTTGACGTCTCA
CAGCAGCGGACGCTTTTAAGAGCAGCAAGCTACGGCCAAGCCTTTTGCAGCCATTTTCAA
CGGGACCGCATTCAAGAGATGAGTAAAACTTTACGAGTATTAAATGCTGTACGTCACCCA
GATATTGGCATTCCTCTCAGTATTCAACAGTATAAGTCGCTTACACCTGCTGTTCTGATT
GCTCGTCTTATTAATGCTCATCGCCACCTTCTTGCACTACAAATATCAGAATATCTTAGT
ATGAATCAGGAGGTTGTTGTCATGCACTGGGCATCTACAAAGATAACCGCATCGGCGGCA
ATCCCTGATGCCACTCTTCTAGAGATGTTACTTGATAAGCTGAAGATATGCAAGGGAATA
TCTTATGCTGCAGTTGCTGCTCATGCGGATAAAAATGGCCGTCGGAAGTTGGCTGCCATG
CTTGTTGAACATGAACCACGTTCATCTAAGCAGGTTCCTCTCTTGCTAAGCATTGGAGAA
GAGGATACTGCTCTAATGAAGTCAACTGAAAGTGGTGATACTGATTTAGTTTATCTTGTC
CTGTTCCACATCTGGCAAAAGAGACCAGCTTTGGATTTCTTTGGGACAATACAGGCCAGA
CCTCTAGCTCGTGATTTGTTTGTTAATTATGCACGGCATTACAAGCATGAATTTTTGAAG
GACTTTTTTCTATCTACGGGGCAACTTCAGGATGTAGCTTTTCTGTTATGGAAAGAGTCA
TGGGAATTGTCTAAGAATCCCATGGCTAGCAAAGGATCTCCACTTCATGGTCCAAGAGTA
AAACTCATTGAGAAGGTCCAGCATCTATTTGTAGAAACAAAGGAAAATTTTTTTGAATCA
AAAGCTGCTGAAGAGCATGCAAAATTGTTAAGGATACAACATGAGATTGAGGTGAATACA
AAACAGGCCATCTTTATGGATTCAAGTATAAGTGATACAATTCGTACATGCATTGTGCTG
GGTAACCATCGTGGTGCCAATAGAGTCAAAACAGAATTTAAGGTATCTGAAAAGCGATGG
TATTGGCTTAAAGTTTTTGCTCTGGCAACAATTAGGGATTGGGATGCCTTGGAAAAGTTT
TCAAAGGAAAAAAGGCCACCAATTGGTTACCGCCCATTTGTCGAAGCATGTGTTGATGCA
AATGAGAAAGGTGAAGCACTAAAGTACATACCAAAGCTGACTGATCCTCGTGAAAGAGCA
GAGGCTTACGCTCGAATTGGAATGGCCAAGGAGGCTGCTGATGCTGCTACTCAGGCTAAA
GATAATGAATTACTTGGGAGGCTGAAGCAGACATTTTCTCAAAATGCAGCCGCTTCATCA
ATTTTTGACACACTGCGAGATCGGTTATCCTTCCCAAGTGTTTCTTGAAGTCAGCCATCT
CCTTGCTCCTTACCCTTTTGTCTGAAGCCTGTTGTTACGTATCTTCTAAATTAACATCGA
TTGAGGATTGTTACTGTTGGAGTAATGCTGTTCCACAGCACGATAAAAGAAGCCCTTGGA
ACCCATCCGCTGCATATCCTCCCTCCTTACCTGTTTATTTTCTATGTATCCGTGGCATTT
GAGATTGTGGAAATGTTTGAATCTGGCAAAGATTCGTTTTGTGTTTTTCTACAGCCTGTA
AATAGCTTGGCTGGAAATGATATATGAAAGCATGTGCTGATGTTTCTCCCTGAATTGGTA
ATAGAATTCATCTGAGCTCTAACCTTTCCATGGGCTTGTAGTTTCCATTTTTATGTGACT
GAGTGGTGAACTGTTCCAAAATAAACTTGACTCTACCTGCTGGTATTATTGCTCATTTGG
ATTGTTTTTATCCTCTGTACATTCCGGAATACTTTGCTGGTTCGGAGAATAATTACTCTG
GATCTAGTAAATTGAGAGATTTTATAACAAGTTGCTATTTAAAGCTAGTGTCAAGTGATT
GATAGTTTGATACTGAGTGGACAATTCATATTGTGCTTGTGTATCTGTACTGAATGATTT
GATGAGTATCTAATTGCTATGTTTTTATTTGTGTTTTTGACGCCTCATTTTACGTAAACA
GTCCCAGCTTTATACGAGTTCTTTTTCAAGTTTGCATATTAGGTTGGATTGCATATGTGA
AGCAGTTTGAATTATGTGTGGTGAAAGTACTATTTGATGGTTAGTAGTAATGTTTATGTC
ATAGGAATCTATACAACTGGTTATCTTTGATCAATTATCAAATCTCATATTTATGATCAA
TTCATTCAACATTTTCTTTTTTATAGAAGACAATTTTTCACATTTAAATTATGTATTAGA
TATACCCTACTACAATCATCTGAAAATCTTAATTTGAATCTAGGGTTCACCAAAAATATG
GACAAAACTACTACTCTAGAAAATGTGAATTCATTAAAATTGAGGGTGTACCACATTGGG
TAGATATATTAATTATCTTTCTCCATTCAACAGAACTAATTAAAGTCACCTTTTTAGTTG
ATTAAGTTTTTATGTGTGGAAGAAGTGAGAGGTTATCAATTCTCTTTATGACTAACAAGA
AAACAGTTGACTGATGTATTATTTTGCCGCCACTTAAAAAAGGGAATTGACAAGGAAGAA
ACACATTAACAAATGACGTTTATTTATTTTTAAAAAATAATGATACTATATACCCAAAAA
AAAAATGCTCTTATGTTTTGTTTAAGATGACAAGTTTATAATTTTATTTTATTCAAAAAA
TATTTCTAATATTTTACCA