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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g055310.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061E4M2_THECC)

Sequence

ATGGGACAGTCTTGTTTGAGACCTCTGAGATTTCTTCCCCTCCGATCAGCAAACACTCGC
CGGTTCTCGGCAGCCGGCACTGAGCTTTCAATTCTATGTTCTCAAGGTTACGTAAAAGAA
GCTTTCAACAAGTTCTCTTTCTTAATATGGGACAACCCATCGCATTTCTCTTACCTTTTA
CAAGCATGCATCCAAGAAAAGTCCTTTTTCCTAACCAAACAGCTGCATTCTCTCATAGTA
ACATCTGGGTGTTTCAGGGACAAGTTTGTTTCCAATCACCTGCTCAATGCTTACTCAAAA
TTGGGTCAGCTAGATATTGCAGTTACACTGTTTGATAAATTGCCTAAAAGAAATGTAATG
TCTTTTAACATTTTGATTGGTGGGTATGTTCAAATTGGCGATTTGGATAGTGCCTCTAAG
GTGTTTGATGAAATGGGTGAGAGAAATTTGGCTTCTTGGAATGCAATGATTACTGGGTTG
ACTCAGTTTGAGTTTAATGAGAGGGCGTTGAGTTTGTTTGCGCGAATGTATGGGTTGGGT
TACTTGCCTGATGCATTTACTCTTGGAAGTGTTTTAAGAGGTTGTGCTGGTTTGAAGGAT
TTGAATAAGGGCAGGCAGGTTCATGGTTGTGGATTGAAATTGGGTTTAGAGGGGGATTTT
GTTGTTGCAAGTTCATTGGCACACATGTATATGAGGTCTGGTAGCTTAAGCGAGGGAGAG
ATTGTGATCATGTCGATGCCAGATCAAACTATGGCAGCTTGGAATACTCTTATTGCTGGT
AGGGCTCAGAATGGGTGTTTTGAAGGTGCATTGGAGCTGTATAATTTGGTGAAAATCGCC
GGGTTTAGACCAGATAAGATAACGTTTGTTAGCGTGATCAGCTCGTGTTCAGAGCTGGCT
ACAATAGGACAGGGGCAGCAGATTCATTCTGACGTTATAAAAACTGGTGTAATTTCTGTG
GTTGCAGTTGTAAGTTCCTTGATTAGCATGTATTCAAAATGTGGATGTTTGGATGAGGCT
GAGAAGATTTTTGAGGAAAGGAAGGAAGCTGATCTTGTTTTGTGGAGTGCTATGATTTCT
GCTTATGGGTTTCATGGTAGGGGAAAGAACGCAGTTGAGTTGTTTCATCGTATGGAGCAA
GAAGGACTAGCACCTAACCATATAACTCTCTTGAGTTTGCTCTATGCCTGTAGTCATAGT
GGGATGAAGGATGAAGGGCTTGAATTTTTCGACTTGATGGTGGAGAAGTACAATGTAGAA
CCTCAACTGGTGCACTATACATGTGTCGTTGACCTCCTAGGAAGAGCAGGCCGTTTGCAG
GAGGCTGAAGCTCTTATTAGATCTATGCCTGTGAAGCCAGACGGTGTCATATGGAAGACA
TTGCTATCGGCCTGTAAAATTCATAAAAATGCAGATATGGCTAGAAGTATAGCTGAAGAA
GTTTTGAGGATTGACCCTCAGGATTCAGCTTCATATGTGCTCCTTGCTAATGTTCAAGCA
TCTGCTAAAAGATGGAAGAGTGTTTCTGAAGTGAGGAAATCAATGAAGGATAGGGGAGTA
AAGAAAGAACCAGGAATAAGCTGGCTGGAGTTGAAGAACCAGGTTCACCACTTCATTATT
GGTGATAAATCTCATCCACAATCGGACGAGGTTGATGTATACTTAAAGGAATTGATTGCA
GAACTGAAGTTAGAAGGCTATGTTCCTGATACAGGATCTGTTTTGCATGATATGGAATTA
GAGGAAAAAGAGTATAACTTGGTCCATCACAGTGAAAAATTAGCCATTGCTTTCGCGCTG
ATGAACACCCCGGAGGGTTTTCCAATTAGGATAATGAAGAATTTACGAATTTGTAGTGAT
TGTCACATGGCTATCAAGTACATATCCAAGATGAAAAAACGAGAGATAATTGTACGTGAT
TCCAGTAGGTTTCATCACTTCAAAGAGGGATGTTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g055310.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061E4M2_THECC)

Sequence

MGQSCLRPLRFLPLRSANTRRFSAAGTELSILCSQGYVKEAFNKFSFLIWDNPSHFSYLL
QACIQEKSFFLTKQLHSLIVTSGCFRDKFVSNHLLNAYSKLGQLDIAVTLFDKLPKRNVM
SFNILIGGYVQIGDLDSASKVFDEMGERNLASWNAMITGLTQFEFNERALSLFARMYGLG
YLPDAFTLGSVLRGCAGLKDLNKGRQVHGCGLKLGLEGDFVVASSLAHMYMRSGSLSEGE
IVIMSMPDQTMAAWNTLIAGRAQNGCFEGALELYNLVKIAGFRPDKITFVSVISSCSELA
TIGQGQQIHSDVIKTGVISVVAVVSSLISMYSKCGCLDEAEKIFEERKEADLVLWSAMIS
AYGFHGRGKNAVELFHRMEQEGLAPNHITLLSLLYACSHSGMKDEGLEFFDLMVEKYNVE
PQLVHYTCVVDLLGRAGRLQEAEALIRSMPVKPDGVIWKTLLSACKIHKNADMARSIAEE
VLRIDPQDSASYVLLANVQASAKRWKSVSEVRKSMKDRGVKKEPGISWLELKNQVHHFII
GDKSHPQSDEVDVYLKELIAELKLEGYVPDTGSVLHDMELEEKEYNLVHHSEKLAIAFAL
MNTPEGFPIRIMKNLRICSDCHMAIKYISKMKKREIIVRDSSRFHHFKEGCCSCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g055310.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061E4M2_THECC)

Sequence

ATGGGACAGTCTTGTTTGAGACCTCTGAGATTTCTTCCCCTCCGATCAGCAAACACTCGC
CGGTTCTCGGCAGCCGGCACTGAGCTTTCAATTCTATGTTCTCAAGGTTACGTAAAAGAA
GCTTTCAACAAGTTCTCTTTCTTAATATGGGACAACCCATCGCATTTCTCTTACCTTTTA
CAAGCATGCATCCAAGAAAAGTCCTTTTTCCTAACCAAACAGCTGCATTCTCTCATAGTA
ACATCTGGGTGTTTCAGGGACAAGTTTGTTTCCAATCACCTGCTCAATGCTTACTCAAAA
TTGGGTCAGCTAGATATTGCAGTTACACTGTTTGATAAATTGCCTAAAAGAAATGTAATG
TCTTTTAACATTTTGATTGGTGGGTATGTTCAAATTGGCGATTTGGATAGTGCCTCTAAG
GTGTTTGATGAAATGGGTGAGAGAAATTTGGCTTCTTGGAATGCAATGATTACTGGGTTG
ACTCAGTTTGAGTTTAATGAGAGGGCGTTGAGTTTGTTTGCGCGAATGTATGGGTTGGGT
TACTTGCCTGATGCATTTACTCTTGGAAGTGTTTTAAGAGGTTGTGCTGGTTTGAAGGAT
TTGAATAAGGGCAGGCAGGTTCATGGTTGTGGATTGAAATTGGGTTTAGAGGGGGATTTT
GTTGTTGCAAGTTCATTGGCACACATGTATATGAGGTCTGGTAGCTTAAGCGAGGGAGAG
ATTGTGATCATGTCGATGCCAGATCAAACTATGGCAGCTTGGAATACTCTTATTGCTGGT
AGGGCTCAGAATGGGTGTTTTGAAGGTGCATTGGAGCTGTATAATTTGGTGAAAATCGCC
GGGTTTAGACCAGATAAGATAACGTTTGTTAGCGTGATCAGCTCGTGTTCAGAGCTGGCT
ACAATAGGACAGGGGCAGCAGATTCATTCTGACGTTATAAAAACTGGTGTAATTTCTGTG
GTTGCAGTTGTAAGTTCCTTGATTAGCATGTATTCAAAATGTGGATGTTTGGATGAGGCT
GAGAAGATTTTTGAGGAAAGGAAGGAAGCTGATCTTGTTTTGTGGAGTGCTATGATTTCT
GCTTATGGGTTTCATGGTAGGGGAAAGAACGCAGTTGAGTTGTTTCATCGTATGGAGCAA
GAAGGACTAGCACCTAACCATATAACTCTCTTGAGTTTGCTCTATGCCTGTAGTCATAGT
GGGATGAAGGATGAAGGGCTTGAATTTTTCGACTTGATGGTGGAGAAGTACAATGTAGAA
CCTCAACTGGTGCACTATACATGTGTCGTTGACCTCCTAGGAAGAGCAGGCCGTTTGCAG
GAGGCTGAAGCTCTTATTAGATCTATGCCTGTGAAGCCAGACGGTGTCATATGGAAGACA
TTGCTATCGGCCTGTAAAATTCATAAAAATGCAGATATGGCTAGAAGTATAGCTGAAGAA
GTTTTGAGGATTGACCCTCAGGATTCAGCTTCATATGTGCTCCTTGCTAATGTTCAAGCA
TCTGCTAAAAGATGGAAGAGTGTTTCTGAAGTGAGGAAATCAATGAAGGATAGGGGAGTA
AAGAAAGAACCAGGAATAAGCTGGCTGGAGTTGAAGAACCAGGTTCACCACTTCATTATT
GGTGATAAATCTCATCCACAATCGGACGAGGTTGATGTATACTTAAAGGAATTGATTGCA
GAACTGAAGTTAGAAGGCTATGTTCCTGATACAGGATCTGTTTTGCATGATATGGAATTA
GAGGAAAAAGAGTATAACTTGGTCCATCACAGTGAAAAATTAGCCATTGCTTTCGCGCTG
ATGAACACCCCGGAGGGTTTTCCAATTAGGATAATGAAGAATTTACGAATTTGTAGTGAT
TGTCACATGGCTATCAAGTACATATCCAAGATGAAAAAACGAGAGATAATTGTACGTGAT
TCCAGTAGGTTTCATCACTTCAAAGAGGGATGTTGTTCTTGTGGAGATTATTGGTGA