Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g055300.3.1

CDS Infomation

Trehalose-6-phosphate synthase, putative (AHRD V3.3 *** B9S8D6_RICCO)

Sequence

ATGATGTCTAGATCGTATACAAATCTTTTGGATTTGGCATCTGGGAATTTTCCTGTAATG
GGAAGAGAGAGAGATAGGCGACGGATGTCGCGGGTAATGACAGTGCCTGGGAGTATATGT
GAACTCGATGATGACCAGGCTGTTAGTGTTTCTTCTGATAATCAATCTTCACTTGCCGGT
GATCGGATGATTGTTGTGGCGAATCAGTTGCCATTGAAAGCGAAAAGGAGACCGGATAAT
AAGGGCTGGAGTTTTAGTTGGAATGAGGATTCTTTGCTTTTGAGACTTAAGGATGGTTTA
CCTGAAGATATGGAAGTATTGTTTGTTGGGTCTTTATCTGTTGATGTTGATCCAATTGAA
CAGGATGATGTTTCTAGCTATCTTTTGGATAAATTCAGATGTGTGCCGACGTTTCTTCCA
CCTAATATTGTGGAAAAATACTATGAGGGATTCTGCAAGAGGCATTTGTGGCCACTTTTT
CACTACATGTTGCCTTTTTCACCCGACCATGGAGGCCGCTTTGATCGTTCTATGTGGGAA
GCATATGTTTCTGCCAACAAGATGTTTTCACAGAAAGTGGTTGAGGTGCTTAATCCTGAG
GATGATTTTGTTTGGATTCATGATTATCATTTAATGGTGTTGCCCACGTTCTTGAGAAGG
CGGTTCAATCGATTGAGAATTGGGTTTTTCCTTCATAGTCCATTTCCTTCATCTGAGATT
TACAGGACACTTCCTGTTAGAGAGGAAATACTTAAGGCTCTTCTATGTTCTGACCTTGTT
GGATTCCACACTTTCGACTATGCTCGACATTTCCTTTCGTGTTGCAGTCGAATGTTGGGT
TTAGAGTACCAGTCTAAAAGAGGTTATATAGGATTGGAATATTATGGAAGGACAGTAGGT
ATCAAGATTATGCCCGTAGGGATACACATGGGTCACATTGAGTCTATGAAGAAAATTGCA
GATAAAGAGCTGAAGTTAAAGGAGCTCAAACAACAATTTGAAGGAAAAACTGTTCTGCTT
GGAGTTGATGACTTGGATATTTTCAAAGGTATAAACTTAAAGCTTCTAGCGATGGAGCAC
ATGCTCAAACAGCACCCCAGTTGGCAAGGGCAGGCTGTGCTTGTTCAGATTGCCAATCCT
ATGAGGGGTAAAGGAATAGATTTAGAGGAAATACAGGCTGAGATACAGGAAAGCTTCAAG
AGGATTAATAAGCAATTTGGCAAGCCTGGATATGAACCTGTAGTTTATATTGATAGGTCC
GTGTCAAGTAGCGAGCGCATGGCTTATTATAGTGTTGCTGAATGTGTTGTTGTCACAGCT
GTTAGGGATGGGATGAACCTGACTCCATATGAATACATCGTCTGTCGACAGGGTGTATCG
GGTGCAGAAACAGATTCAGGTGTAGGTGGACCTGCCAAGAGCATGCTAGTTGTGTCAGAA
TTCATTGGGTGTTCTCCTTCCTTAAGTGGGGCGATCCGTATTAATCCATGGAATGTTGAG
GCAACTGCTGAGGCAATGAATGAGGCTGTAGCAATGGCTGAACAAGAGAAACAGCTACGG
CATGAGAAGCATTACCGTTATGTCAGCACCCACGATGTTGCTTATTGGTCGAAAAGTTTC
TTGCAAGATATGGAGAGAACTTGTGCTGATCACTTTAGGAAAAGATGCTATGGCATTGGT
TTAGGCTTTGGGTTTAGAGTTGTTTCCCTAGATCCCAACTTCAGGAAGCTGTCAATTGAT
GATATTGTGAATGCTTATATCAAGTCTAAGAGCAGGGCCATATTCCTGGACTATGATGGA
ACTGTGATGCCGCAGAATTCTATCATTAAGTCTCCTAGTGCTAATGTTATCTCCATCCTG
AATAAACTTTCTGGTGATCCAAACAACACAGTCTTCATTGTTAGTGGAAGAGGGAGGGAA
AGCCTAACCAAGTGGTTTTCTCCTTGTAGAAAACTAGGACTTGCAGCAGAACATGGCTAC
TTTTTGAGATGGGAACTAGAACAGAAATGGGAAGTATGCAGTCAGACCTCTGATTTTGGT
TGGATGCAACTTGCTGAACCCGTGATGCAATCCTATACAGACGCTACAGATGGTTCTTGC
ATAGAAAGAAAGGAAAGTGCTATAGTGTGGCAGTATCGTGATGCAGATTCTGGATTTGGG
TTTTCTCAGGCAAAGGAGATGCTTGATCATCTGGAGAGTGTTTTAGCGAATGAACCCGTT
GCCGTGAAAAGCGGTCAGCACATTGTGGAAGTAAAGCCTCAGGGGGTCACCAAAGGTTTA
GTTGCAGAAAAAGTCTTTACATCTTTAGCGGAGAAAGGAAAACTGGCGGATTTTGTGCTT
TGCATTGGTGATGATAGATCAGATGAAGATATGTTTGAAATCATTGGCGATGCTTTGTCC
AGAAATATTATTTCATATGATGCCAAGGTATTTGCTTGCACAGTTGGACAAAAACCTAGC
AAAGCAAAGTATTACTTGGATGACACATCTGAGGTGGTGCTTATGCTAGACTCCCTTGCT
GATGCCACTGATACTCCAGTGACTTCTGATGACGATGAACCTGCGGACTCCGACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g055300.3.1

PEP Infomation

Trehalose-6-phosphate synthase, putative (AHRD V3.3 *** B9S8D6_RICCO)

Sequence

MMSRSYTNLLDLASGNFPVMGRERDRRRMSRVMTVPGSICELDDDQAVSVSSDNQSSLAG
DRMIVVANQLPLKAKRRPDNKGWSFSWNEDSLLLRLKDGLPEDMEVLFVGSLSVDVDPIE
QDDVSSYLLDKFRCVPTFLPPNIVEKYYEGFCKRHLWPLFHYMLPFSPDHGGRFDRSMWE
AYVSANKMFSQKVVEVLNPEDDFVWIHDYHLMVLPTFLRRRFNRLRIGFFLHSPFPSSEI
YRTLPVREEILKALLCSDLVGFHTFDYARHFLSCCSRMLGLEYQSKRGYIGLEYYGRTVG
IKIMPVGIHMGHIESMKKIADKELKLKELKQQFEGKTVLLGVDDLDIFKGINLKLLAMEH
MLKQHPSWQGQAVLVQIANPMRGKGIDLEEIQAEIQESFKRINKQFGKPGYEPVVYIDRS
VSSSERMAYYSVAECVVVTAVRDGMNLTPYEYIVCRQGVSGAETDSGVGGPAKSMLVVSE
FIGCSPSLSGAIRINPWNVEATAEAMNEAVAMAEQEKQLRHEKHYRYVSTHDVAYWSKSF
LQDMERTCADHFRKRCYGIGLGFGFRVVSLDPNFRKLSIDDIVNAYIKSKSRAIFLDYDG
TVMPQNSIIKSPSANVISILNKLSGDPNNTVFIVSGRGRESLTKWFSPCRKLGLAAEHGY
FLRWELEQKWEVCSQTSDFGWMQLAEPVMQSYTDATDGSCIERKESAIVWQYRDADSGFG
FSQAKEMLDHLESVLANEPVAVKSGQHIVEVKPQGVTKGLVAEKVFTSLAEKGKLADFVL
CIGDDRSDEDMFEIIGDALSRNIISYDAKVFACTVGQKPSKAKYYLDDTSEVVLMLDSLA
DATDTPVTSDDDEPADSD*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g055300.3.1

Transcript Infomation

Trehalose-6-phosphate synthase, putative (AHRD V3.3 *** B9S8D6_RICCO)

Sequence

AAATTTTTTTTTTTAAAAATTTTTTTTTCTCCGGATATTCATAATCCAGCAACTTTCTTT
GTACCCATTGGAGATCACCTTTTTTTTTTTCTTTCACATATATAGAGAGCAAATCCCAAA
TCTTTGTTGTTTGTATGCTTTATCAAACCCTAAAATCCACCCCCTTCAACTCTAAAGATC
GAGTCTTTCACTGAAAAAGATCCAAGATTTGGTGCTTTTTGAATCCTAGAGAAAGTTGAA
ATACCCAAATTAGAGGAAGTCAAGAATCTTTGTTAGAATGATGTCTAGATCGTATACAAA
TCTTTTGGATTTGGCATCTGGGAATTTTCCTGTAATGGGAAGAGAGAGAGATAGGCGACG
GATGTCGCGGGTAATGACAGTGCCTGGGAGTATATGTGAACTCGATGATGACCAGGCTGT
TAGTGTTTCTTCTGATAATCAATCTTCACTTGCCGGTGATCGGATGATTGTTGTGGCGAA
TCAGTTGCCATTGAAAGCGAAAAGGAGACCGGATAATAAGGGCTGGAGTTTTAGTTGGAA
TGAGGATTCTTTGCTTTTGAGACTTAAGGATGGTTTACCTGAAGATATGGAAGTATTGTT
TGTTGGGTCTTTATCTGTTGATGTTGATCCAATTGAACAGGATGATGTTTCTAGCTATCT
TTTGGATAAATTCAGATGTGTGCCGACGTTTCTTCCACCTAATATTGTGGAAAAATACTA
TGAGGGATTCTGCAAGAGGCATTTGTGGCCACTTTTTCACTACATGTTGCCTTTTTCACC
CGACCATGGAGGCCGCTTTGATCGTTCTATGTGGGAAGCATATGTTTCTGCCAACAAGAT
GTTTTCACAGAAAGTGGTTGAGGTGCTTAATCCTGAGGATGATTTTGTTTGGATTCATGA
TTATCATTTAATGGTGTTGCCCACGTTCTTGAGAAGGCGGTTCAATCGATTGAGAATTGG
GTTTTTCCTTCATAGTCCATTTCCTTCATCTGAGATTTACAGGACACTTCCTGTTAGAGA
GGAAATACTTAAGGCTCTTCTATGTTCTGACCTTGTTGGATTCCACACTTTCGACTATGC
TCGACATTTCCTTTCGTGTTGCAGTCGAATGTTGGGTTTAGAGTACCAGTCTAAAAGAGG
TTATATAGGATTGGAATATTATGGAAGGACAGTAGGTATCAAGATTATGCCCGTAGGGAT
ACACATGGGTCACATTGAGTCTATGAAGAAAATTGCAGATAAAGAGCTGAAGTTAAAGGA
GCTCAAACAACAATTTGAAGGAAAAACTGTTCTGCTTGGAGTTGATGACTTGGATATTTT
CAAAGGTATAAACTTAAAGCTTCTAGCGATGGAGCACATGCTCAAACAGCACCCCAGTTG
GCAAGGGCAGGCTGTGCTTGTTCAGATTGCCAATCCTATGAGGGGTAAAGGAATAGATTT
AGAGGAAATACAGGCTGAGATACAGGAAAGCTTCAAGAGGATTAATAAGCAATTTGGCAA
GCCTGGATATGAACCTGTAGTTTATATTGATAGGTCCGTGTCAAGTAGCGAGCGCATGGC
TTATTATAGTGTTGCTGAATGTGTTGTTGTCACAGCTGTTAGGGATGGGATGAACCTGAC
TCCATATGAATACATCGTCTGTCGACAGGGTGTATCGGGTGCAGAAACAGATTCAGGTGT
AGGTGGACCTGCCAAGAGCATGCTAGTTGTGTCAGAATTCATTGGGTGTTCTCCTTCCTT
AAGTGGGGCGATCCGTATTAATCCATGGAATGTTGAGGCAACTGCTGAGGCAATGAATGA
GGCTGTAGCAATGGCTGAACAAGAGAAACAGCTACGGCATGAGAAGCATTACCGTTATGT
CAGCACCCACGATGTTGCTTATTGGTCGAAAAGTTTCTTGCAAGATATGGAGAGAACTTG
TGCTGATCACTTTAGGAAAAGATGCTATGGCATTGGTTTAGGCTTTGGGTTTAGAGTTGT
TTCCCTAGATCCCAACTTCAGGAAGCTGTCAATTGATGATATTGTGAATGCTTATATCAA
GTCTAAGAGCAGGGCCATATTCCTGGACTATGATGGAACTGTGATGCCGCAGAATTCTAT
CATTAAGTCTCCTAGTGCTAATGTTATCTCCATCCTGAATAAACTTTCTGGTGATCCAAA
CAACACAGTCTTCATTGTTAGTGGAAGAGGGAGGGAAAGCCTAACCAAGTGGTTTTCTCC
TTGTAGAAAACTAGGACTTGCAGCAGAACATGGCTACTTTTTGAGATGGGAACTAGAACA
GAAATGGGAAGTATGCAGTCAGACCTCTGATTTTGGTTGGATGCAACTTGCTGAACCCGT
GATGCAATCCTATACAGACGCTACAGATGGTTCTTGCATAGAAAGAAAGGAAAGTGCTAT
AGTGTGGCAGTATCGTGATGCAGATTCTGGATTTGGGTTTTCTCAGGCAAAGGAGATGCT
TGATCATCTGGAGAGTGTTTTAGCGAATGAACCCGTTGCCGTGAAAAGCGGTCAGCACAT
TGTGGAAGTAAAGCCTCAGGGGGTCACCAAAGGTTTAGTTGCAGAAAAAGTCTTTACATC
TTTAGCGGAGAAAGGAAAACTGGCGGATTTTGTGCTTTGCATTGGTGATGATAGATCAGA
TGAAGATATGTTTGAAATCATTGGCGATGCTTTGTCCAGAAATATTATTTCATATGATGC
CAAGGTATTTGCTTGCACAGTTGGACAAAAACCTAGCAAAGCAAAGTATTACTTGGATGA
CACATCTGAGGTGGTGCTTATGCTAGACTCCCTTGCTGATGCCACTGATACTCCAGTGAC
TTCTGATGACGATGAACCTGCGGACTCCGACTGA