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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g055220.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T3G5_RICCO)

Sequence

ATGAAAAATGCTTACCATCATTACCCGAATTCAGAAACAGAAATCCACTGGTACTCCGTC
GTATTGAAGTTTTCCGGTGGTGGTGTTGCTACCGGCAGAGTATTATTGTATATCCGAGCA
TCTCTTTGTAAAGCGAAACAATTGGAGAAAGCTGAAGTTGTAATAGTTGATGGCATAAGA
ATTGGAGTACAACCAGATGTGGTCACTTATAATACACTGATTACCGCATATTGTCGCTTT
GTTGGCATTGATGCAGGTTATTCCGTCCTTTATAGGATGAAAGAGGCTGGAATTTATCCT
GATACTATTACATATAACTCTTTAATAGCTGGAGCTACCAGATATTGCATGATATCTCGA
TGTTTCGATCTGTTTGAAGAAATGCTTGAGATGAGTATTCTTCCTGATATTTGGAGTTAC
AATACATTAATGCATTGCTTCTTTAAATTGAGAAAGCCAGATGAAGCATACAGGGTTTTT
CAGGATATTCTTTTGAAAAATATTTCTGTTCATCCAGCAACATTCAATATATTAATTAAT
GGTCTTTGTATGAATGGATATACAGAGAATGCCTTAATGTTATTTAGGAGTATAAAACGT
CATGGATTTATTCCCCAATTAGCAACTTACAACATTCTTATTCATGGACTGTGCAAGTCA
GGACGGGGTAAAACTGCAAGAGAATTTCTCAACGAGCTGGTAGAATCAGGTCATATCCCC
AATGCCATCACTTATACGACAGTAATGAAATGCTGCTTCAAATGTGAACAATTTGAAGAA
GGCCTTAAGATCTTTGCAGAGATGAGAAGGAAAGGATATACATATGATGCCTTCGCTTAC
TGTACAGTTGCAAGTATGTTACTTAAAACTGGGAAGATGAATGAGGCCAACGAGTACCTG
GGCTATATAATTACAAATGGTTTTGACCTTGATATGGTGTCTTTTAATACCATTGTTAAT
CTATATTGTAAGGAAGGTCAGCTGGATAATGCTTATAAATTGTTACACGAGGCAGAAAAA
AAAGGGTTGGAGTCTGACAAGTACACCCACACTATCTTTATTGATGGCTTGTGCAGGACT
GGTAATTTCAAGGAGGCCCAGCAACATTTGGACTATATGAGTATGATGGGTTTTGATTCT
AACTTGGTTGCTTTGAATTCTTTTATTAACGGGTTGTGTAAAGCTGGTCACCTTGATCAT
GCTCTACGGATGTTTGAATCAATGGATGCCAAAGATTCTATTACTTACTCCACTATGGTG
CATAGTCTTTGCAATGCCAGGAGATTCCGTGCAGCATCTAAGCTATTACTATCGTGTATA
AGAGGCGGCATGAGAATTCTTAAATCAGATAAACGTGGTGTTATTGATGGCCTTCGTGGT
TCTGGATATTCGCAAGAAGCAAAGAAGATCCAGTCTAAAATTCGATTGGCTAAGATACTG
CAAAATTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g055220.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T3G5_RICCO)

Sequence

MKNAYHHYPNSETEIHWYSVVLKFSGGGVATGRVLLYIRASLCKAKQLEKAEVVIVDGIR
IGVQPDVVTYNTLITAYCRFVGIDAGYSVLYRMKEAGIYPDTITYNSLIAGATRYCMISR
CFDLFEEMLEMSILPDIWSYNTLMHCFFKLRKPDEAYRVFQDILLKNISVHPATFNILIN
GLCMNGYTENALMLFRSIKRHGFIPQLATYNILIHGLCKSGRGKTAREFLNELVESGHIP
NAITYTTVMKCCFKCEQFEEGLKIFAEMRRKGYTYDAFAYCTVASMLLKTGKMNEANEYL
GYIITNGFDLDMVSFNTIVNLYCKEGQLDNAYKLLHEAEKKGLESDKYTHTIFIDGLCRT
GNFKEAQQHLDYMSMMGFDSNLVALNSFINGLCKAGHLDHALRMFESMDAKDSITYSTMV
HSLCNARRFRAASKLLLSCIRGGMRILKSDKRGVIDGLRGSGYSQEAKKIQSKIRLAKIL
QN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g055220.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T3G5_RICCO)

Sequence

TCCCTACTTTAAAGTTCAAATGTATTTTGACCATTACATAAATACTTTTTTTTACACACT
TAAGTGGGTTAGTTTGGTAAACAATACGAGCTGAGAGAGAGAGCCCAAATGGACAATAAC
GCGGCCCAGCCCAAAAATGAAAAATGCTTACCATCATTACCCGAATTCAGAAACAGAAAT
CCACTGGTACTCCGTCGTATTGAAGTTTTCCGGTGGTGGTGTTGCTACCGGCAGAGTATT
ATTGTATATCCGAGCATCTCTTTGTAAAGCGAAACAATTGGAGAAAGCTGAAGTTGTAAT
AGTTGATGGCATAAGAATTGGAGTACAACCAGATGTGGTCACTTATAATACACTGATTAC
CGCATATTGTCGCTTTGTTGGCATTGATGCAGGTTATTCCGTCCTTTATAGGATGAAAGA
GGCTGGAATTTATCCTGATACTATTACATATAACTCTTTAATAGCTGGAGCTACCAGATA
TTGCATGATATCTCGATGTTTCGATCTGTTTGAAGAAATGCTTGAGATGAGTATTCTTCC
TGATATTTGGAGTTACAATACATTAATGCATTGCTTCTTTAAATTGAGAAAGCCAGATGA
AGCATACAGGGTTTTTCAGGATATTCTTTTGAAAAATATTTCTGTTCATCCAGCAACATT
CAATATATTAATTAATGGTCTTTGTATGAATGGATATACAGAGAATGCCTTAATGTTATT
TAGGAGTATAAAACGTCATGGATTTATTCCCCAATTAGCAACTTACAACATTCTTATTCA
TGGACTGTGCAAGTCAGGACGGGGTAAAACTGCAAGAGAATTTCTCAACGAGCTGGTAGA
ATCAGGTCATATCCCCAATGCCATCACTTATACGACAGTAATGAAATGCTGCTTCAAATG
TGAACAATTTGAAGAAGGCCTTAAGATCTTTGCAGAGATGAGAAGGAAAGGATATACATA
TGATGCCTTCGCTTACTGTACAGTTGCAAGTATGTTACTTAAAACTGGGAAGATGAATGA
GGCCAACGAGTACCTGGGCTATATAATTACAAATGGTTTTGACCTTGATATGGTGTCTTT
TAATACCATTGTTAATCTATATTGTAAGGAAGGTCAGCTGGATAATGCTTATAAATTGTT
ACACGAGGCAGAAAAAAAAGGGTTGGAGTCTGACAAGTACACCCACACTATCTTTATTGA
TGGCTTGTGCAGGACTGGTAATTTCAAGGAGGCCCAGCAACATTTGGACTATATGAGTAT
GATGGGTTTTGATTCTAACTTGGTTGCTTTGAATTCTTTTATTAACGGGTTGTGTAAAGC
TGGTCACCTTGATCATGCTCTACGGATGTTTGAATCAATGGATGCCAAAGATTCTATTAC
TTACTCCACTATGGTGCATAGTCTTTGCAATGCCAGGAGATTCCGTGCAGCATCTAAGCT
ATTACTATCGTGTATAAGAGGCGGCATGAGAATTCTTAAATCAGATAAACGTGGTGTTAT
TGATGGCCTTCGTGGTTCTGGATATTCGCAAGAAGCAAAGAAGATCCAGTCTAAAATTCG
ATTGGCTAAGATACTGCAAAATTAA