Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g054680.3.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T4W4_RICCO)

Sequence

ATGGTAGCAGCTGCTTTCAATGGCAGAGCAAAGCTGACCACTTTAACTTTCCTATTATGT
CGTTCTTGTTTTAATCAATTGAACTATAGTGTTTCTGTTGGGGTACACTCTTCTGCTAAA
GGATTTTGGGCACTCAACACATTGCATCGCTCTGGAAATTTCTTTCTTTATAATTATATT
AAATCCATCCCAGTTGGAGTCCTCCTCAATTGGCCAACTTTTGCCCCTAGTATTTTTGGC
TGCTGCCAATCATTCTCAACCCAGGCATCCCCCGCTGAAATTGTGGATGATGTGTTGGCA
GAAATTCTCATGGTTATGGCCAATTCTCAAAGTTCAGGAGAGGAACTCTGTGCTACATAT
ATTGATAAGTTTTGCAATGACAGAAATCTATCAGGAGCCATTAGGCTAGTGCGAACCTTG
CATGATAAAAGTATCCACCTCCGCCCTAGTGCATACGATCGCCTTCTGAAAGCTGCAATC
GAGGAAAGCGATATTCACCTCCTATGTCAGTGTTTCAAGGATCTGTTAGTATCTTGCAAA
CCTCTGAATTCATCTACATATCTTATCTTTGCTCAGGCATTTATCAAGGAAAATGATGTT
GCCTGCTTACTAAGATTTGTCCGGGAGATTTCGGAGTTAATATTTCCAAGTAGTACTCCA
GTTATGAATAGGATCATCTTTGCCTTTGCTGAATGTGGACAGCTTGACAAGTCATTGCTG
ATTTTTGATCAGATGAAGAGTTTGAAATCCAAACCTGATGTGATCACATATAACACCATT
TTGGGACTCTTAGGGAAGTGTGGTAGAATAGATGAAATGCTTAATCAGTTTGTGGCAATG
AAAGAGGATGGTCTAATTCCTGATATTGTTTCGTATAATACCTTAATTACTGGATTGCGA
AAGGTTGGCAGGCTTGAGTTGTGCTTAGTATTTTTCAGGGAGATGTGCGAGAGAGAAATT
GAACCAGATTTGCGGACATATAGTGCTTTGATTGACAGCTTTGGAAAATCTGGTAATATT
GAAGAATCACTGCGACTTTTTAATGAGATGAAGCACAGGGGTATCTGCCCATCAATTCAT
GTTTACAAATTACTGATCAGTAATTTAAAAAAAATGGGGAAGTTTGAGTTGGCTATTGCC
TTTTCAAATGAGATGAAGGAATCAGTCTCAAATCATCGTGGGTCAAACTATAATCGACAG
AAAAACAGATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g054680.3.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T4W4_RICCO)

Sequence

MVAAAFNGRAKLTTLTFLLCRSCFNQLNYSVSVGVHSSAKGFWALNTLHRSGNFFLYNYI
KSIPVGVLLNWPTFAPSIFGCCQSFSTQASPAEIVDDVLAEILMVMANSQSSGEELCATY
IDKFCNDRNLSGAIRLVRTLHDKSIHLRPSAYDRLLKAAIEESDIHLLCQCFKDLLVSCK
PLNSSTYLIFAQAFIKENDVACLLRFVREISELIFPSSTPVMNRIIFAFAECGQLDKSLL
IFDQMKSLKSKPDVITYNTILGLLGKCGRIDEMLNQFVAMKEDGLIPDIVSYNTLITGLR
KVGRLELCLVFFREMCEREIEPDLRTYSALIDSFGKSGNIEESLRLFNEMKHRGICPSIH
VYKLLISNLKKMGKFELAIAFSNEMKESVSNHRGSNYNRQKNR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g054680.3.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T4W4_RICCO)

Sequence

ATTGTGTTTTAAAAACATCAGATAGGCAATAATACACGTTGTCCCAGTCCTTCCACAGCC
GAAAATGCGAACTAAGGGTTTTTCTATTAGCTCTTGAGACACCATGAAAGTTAGGGGTTT
TAGGCTCTTCCCCCAATTCACCTTCGCTTCTGAACAGACATCGAATCTACAATTTCGCCA
CTCGATGCAGTTAAAACCCTAATTTGGGTTTCATAAAACCCCTAAAATCTCTGCAGAAAA
GATGGTAGCAGCTGCTTTCAATGGCAGAGCAAAGCTGACCACTTTAACTTTCCTATTATG
TCGTTCTTGTTTTAATCAATTGAACTATAGTGTTTCTGTTGGGGTACACTCTTCTGCTAA
AGGATTTTGGGCACTCAACACATTGCATCGCTCTGGAAATTTCTTTCTTTATAATTATAT
TAAATCCATCCCAGTTGGAGTCCTCCTCAATTGGCCAACTTTTGCCCCTAGTATTTTTGG
CTGCTGCCAATCATTCTCAACCCAGGCATCCCCCGCTGAAATTGTGGATGATGTGTTGGC
AGAAATTCTCATGGTTATGGCCAATTCTCAAAGTTCAGGAGAGGAACTCTGTGCTACATA
TATTGATAAGTTTTGCAATGACAGAAATCTATCAGGAGCCATTAGGCTAGTGCGAACCTT
GCATGATAAAAGTATCCACCTCCGCCCTAGTGCATACGATCGCCTTCTGAAAGCTGCAAT
CGAGGAAAGCGATATTCACCTCCTATGTCAGTGTTTCAAGGATCTGTTAGTATCTTGCAA
ACCTCTGAATTCATCTACATATCTTATCTTTGCTCAGGCATTTATCAAGGAAAATGATGT
TGCCTGCTTACTAAGATTTGTCCGGGAGATTTCGGAGTTAATATTTCCAAGTAGTACTCC
AGTTATGAATAGGATCATCTTTGCCTTTGCTGAATGTGGACAGCTTGACAAGTCATTGCT
GATTTTTGATCAGATGAAGAGTTTGAAATCCAAACCTGATGTGATCACATATAACACCAT
TTTGGGACTCTTAGGGAAGTGTGGTAGAATAGATGAAATGCTTAATCAGTTTGTGGCAAT
GAAAGAGGATGGTCTAATTCCTGATATTGTTTCGTATAATACCTTAATTACTGGATTGCG
AAAGGTTGGCAGGCTTGAGTTGTGCTTAGTATTTTTCAGGGAGATGTGCGAGAGAGAAAT
TGAACCAGATTTGCGGACATATAGTGCTTTGATTGACAGCTTTGGAAAATCTGGTAATAT
TGAAGAATCACTGCGACTTTTTAATGAGATGAAGCACAGGGGTATCTGCCCATCAATTCA
TGTTTACAAATTACTGATCAGTAATTTAAAAAAAATGGGGAAGTTTGAGTTGGCTATTGC
CTTTTCAAATGAGATGAAGGAATCAGTCTCAAATCATCGTGGGTCAAACTATAATCGACA
GAAAAACAGATAGTATAGCAGTTCAAAATTGATCATGGACTCCAGTTGAGTAATGTATAC
AAAGAGCATCAGTTTGCTGCATGCTGTTGCCGGCGACTGCTGCTATCTTCAACAAAAAGG
ATATGTTGTGGCCAGTAAAGTTGAAGAACCTAACCAGCCATCTGGTCCAATGATAGGTTG
ACTTCCCCACGTTTGATGGTTGGATCTAGAAATGACTACACACCTGAATTTTTCAAAGTG
TTATTCCTCGTGGGGATTGACCTAAATACGCTCTTATTCTGTATGATAAGGGAGAAGAGA
TGCGTCTAGTTGATGTTTAATGGTGTAAATATCAAATTATTTTGTGGATATTGTAACCTC
GTTTATAGTTTGGTGCATCATGTAAGTGGTGTAAAAGGGCTTCTCTACTATCTGAGCTCC
TTTTTTTTAGAAGAATAAACAGAGAGATATTACAATTGTATGATGTGGTTCATCCACCTT
TACATGAGAAAAAAATCCCTTGTTCTCGTACCTCATTGATGTAACTTTCTAGTGATTAAT
GATATAGAATACTTGCCAGTAATGGTGGGACTACGATCAATTGATCTCTGTTTTTTCATT
TCTGCTTCTGGCCCCTGCTTGCAAGCAGTGAAATGCCATTGCTATAAGAAACAAGTCGAA
TTATGTAATGTATGTCCTTTGTAAGAGCCAGAAAGGCTAGTCGAGTTCTAAAGAATAACG
ATAAAATATTACTTGGAA