Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g053520.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061E036_THECC)
Sequence	ATGCCGAGTCTCTTCTATCGTACTGAATCCATCAAATCCAACTCCATAATAGCTCATTAT TGCCTCAACTTTACCCGTTCATTCTCTTCAACTTCTGATCTCCATTCTTCATCTCTCTGG AACCTCTTAAAAGGCCGTATTACCCATAATCACCTTCGACAAATCCATGCTCGGGTTTTC CGTATTGGTGCTCATCAAGACAACCTCATAGCTACTCGCCTTATTGGTCAATACCCATCA AACTTTTCTCTTCGTATATTTCATCAGCTAAAGATACCCAACATATTCCCCTTTAACGCT ATTATTAGAATACTAAGTGAAGAAGGAAGTTTTACTGATGCATTCTTGGTATTTAACAAG TTGAGGGGCCAGTCCCTTTTGCCTAATGAATTGACCTTTTCTTTTCTTCTTAAAGCTTGT TCTCGTTCTGGGAATTCATATTATGTTCAACAGGTTCATACCCTTGTTGTGAAATTGGGA TTTGGTGAGGACCCATCTCTATGTAATGGGTTGTTAAGTGTTTATGCCAGGGGTTTGAAA GAATTACATTCTGCGCGTAAGGTATTTGATGAAATGCCTGAGAAGGATGTTGTTTGTTGG ACTTGTTTGATTTCTGGGTATGCTAAGTTTGGTATGTCTGAAGAAGCTTTGGGTTTGTTT TTATGTATGGTAAAGAAGAGTTTGATCCCTGAAAATGATACTATGATTAATGTTTTATCT GCATGTTCAAAACTTGATATGTTAAATATTGAGAGATGGATTGGGAATTTTTGGTATTCA ATGCAACAGTATGATTTGGGATGTTCTGGATGTGACTCAGTTAATACTGTTCTTGTTTAC TTATATGGGAAGTGGGGAAAGGTTGATAAGAGTAGGGAAATATTTGAACAGATTTCTGGT GATGGGAAGAGAAGTTTGGTTCCTTGGAATGCTATGATAGGCGCGTACGTTCAGAACGGC TGTGCTCTGGATGGTTTATGTGTTTTCCGGTTAATGATGGAGCTTAATTGTTGTTGCCCC AATCATGTGACAATGGTTAGTGTGCTCTCAGCTTGTACTCAAGTTGGTGATTTGAACCTT GGTGTGTGGGTTCATGAGTACATGCAAGGTAGTAGGCAAAAAAGCTTTTTACTTTCAAAT GCAAATCTTGCAACTGCTTTGATAGATATGTACTCTAAATGCGGGAGTTTAGAGAGAGCA GAGGATGTTTTTGACCAATTGTTTGTAAAAGATGTGGTTTCTTTCAATGCGATGATCATG GGTCTTGCAGTAAATGGTAAAGGTAAGGAGGCGTTAAAACTTTTCTCACAAATGCTTGAC CTCAATTTGCGTCCAAATGCTGGGACGTTCCTTGGTTTGCTATGTGCTTGCAGTCACGCA GGGCTGGCAGCAGAAGGCCGTCAAATATTTAAGGAAATGAGCCAATGTTTTAGAATTGCT CCTAGATTGGAACATTATGCTAGCTATATTGATCTCCTTGCTCGAGTAGGTTATGTTGAG GAAGCACTTCAAGTTGCTACCTCAATGCCTTTTAAACCCAATAATTTTGTATGGGGAGCT TTACTTGGTGGCTGCATGCTACATAACAGATTGGAATTGGCCCGGATTATTTCCTCCATT CTTGTTGAAGTGGACCCTAACAATTCTGCTGGCTATGTGATGTTGTCCAATACATATGCC ATTGATCATCACTGGGGTGCTATTTCACGGCTGAGGTTGTCTATGAAGGAAAAAGGAGTT GTAAAGCAGCCAGGATGTAGCTGGATCAACGTTGATGGAGTAGTGCATGAATTTCTGGCT GGTTCCTCGTCGCATCCTCAGAATGAACGCTTGCATACTGAATTGCAGGTCTTACAGAAG GAGATGAAGCTAGCAAGTGTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g053520.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061E036_THECC)
Sequence	MPSLFYRTESIKSNSIIAHYCLNFTRSFSSTSDLHSSSLWNLLKGRITHNHLRQIHARVF RIGAHQDNLIATRLIGQYPSNFSLRIFHQLKIPNIFPFNAIIRILSEEGSFTDAFLVFNK LRGQSLLPNELTFSFLLKACSRSGNSYYVQQVHTLVVKLGFGEDPSLCNGLLSVYARGLK ELHSARKVFDEMPEKDVVCWTCLISGYAKFGMSEEALGLFLCMVKKSLIPENDTMINVLS ACSKLDMLNIERWIGNFWYSMQQYDLGCSGCDSVNTVLVYLYGKWGKVDKSREIFEQISG DGKRSLVPWNAMIGAYVQNGCALDGLCVFRLMMELNCCCPNHVTMVSVLSACTQVGDLNL GVWVHEYMQGSRQKSFLLSNANLATALIDMYSKCGSLERAEDVFDQLFVKDVVSFNAMIM GLAVNGKGKEALKLFSQMLDLNLRPNAGTFLGLLCACSHAGLAAEGRQIFKEMSQCFRIA PRLEHYASYIDLLARVGYVEEALQVATSMPFKPNNFVWGALLGGCMLHNRLELARIISSI LVEVDPNNSAGYVMLSNTYAIDHHWGAISRLRLSMKEKGVVKQPGCSWINVDGVVHEFLA GSSSHPQNERLHTELQVLQKEMKLASV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g053520.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A061E036_THECC)
Sequence	ATGCCGAGTCTCTTCTATCGTACTGAATCCATCAAATCCAACTCCATAATAGCTCATTAT TGCCTCAACTTTACCCGTTCATTCTCTTCAACTTCTGATCTCCATTCTTCATCTCTCTGG AACCTCTTAAAAGGCCGTATTACCCATAATCACCTTCGACAAATCCATGCTCGGGTTTTC CGTATTGGTGCTCATCAAGACAACCTCATAGCTACTCGCCTTATTGGTCAATACCCATCA AACTTTTCTCTTCGTATATTTCATCAGCTAAAGATACCCAACATATTCCCCTTTAACGCT ATTATTAGAATACTAAGTGAAGAAGGAAGTTTTACTGATGCATTCTTGGTATTTAACAAG TTGAGGGGCCAGTCCCTTTTGCCTAATGAATTGACCTTTTCTTTTCTTCTTAAAGCTTGT TCTCGTTCTGGGAATTCATATTATGTTCAACAGGTTCATACCCTTGTTGTGAAATTGGGA TTTGGTGAGGACCCATCTCTATGTAATGGGTTGTTAAGTGTTTATGCCAGGGGTTTGAAA GAATTACATTCTGCGCGTAAGGTATTTGATGAAATGCCTGAGAAGGATGTTGTTTGTTGG ACTTGTTTGATTTCTGGGTATGCTAAGTTTGGTATGTCTGAAGAAGCTTTGGGTTTGTTT TTATGTATGGTAAAGAAGAGTTTGATCCCTGAAAATGATACTATGATTAATGTTTTATCT GCATGTTCAAAACTTGATATGTTAAATATTGAGAGATGGATTGGGAATTTTTGGTATTCA ATGCAACAGTATGATTTGGGATGTTCTGGATGTGACTCAGTTAATACTGTTCTTGTTTAC TTATATGGGAAGTGGGGAAAGGTTGATAAGAGTAGGGAAATATTTGAACAGATTTCTGGT GATGGGAAGAGAAGTTTGGTTCCTTGGAATGCTATGATAGGCGCGTACGTTCAGAACGGC TGTGCTCTGGATGGTTTATGTGTTTTCCGGTTAATGATGGAGCTTAATTGTTGTTGCCCC AATCATGTGACAATGGTTAGTGTGCTCTCAGCTTGTACTCAAGTTGGTGATTTGAACCTT GGTGTGTGGGTTCATGAGTACATGCAAGGTAGTAGGCAAAAAAGCTTTTTACTTTCAAAT GCAAATCTTGCAACTGCTTTGATAGATATGTACTCTAAATGCGGGAGTTTAGAGAGAGCA GAGGATGTTTTTGACCAATTGTTTGTAAAAGATGTGGTTTCTTTCAATGCGATGATCATG GGTCTTGCAGTAAATGGTAAAGGTAAGGAGGCGTTAAAACTTTTCTCACAAATGCTTGAC CTCAATTTGCGTCCAAATGCTGGGACGTTCCTTGGTTTGCTATGTGCTTGCAGTCACGCA GGGCTGGCAGCAGAAGGCCGTCAAATATTTAAGGAAATGAGCCAATGTTTTAGAATTGCT CCTAGATTGGAACATTATGCTAGCTATATTGATCTCCTTGCTCGAGTAGGTTATGTTGAG GAAGCACTTCAAGTTGCTACCTCAATGCCTTTTAAACCCAATAATTTTGTATGGGGAGCT TTACTTGGTGGCTGCATGCTACATAACAGATTGGAATTGGCCCGGATTATTTCCTCCATT CTTGTTGAAGTGGACCCTAACAATTCTGCTGGCTATGTGATGTTGTCCAATACATATGCC ATTGATCATCACTGGGGTGCTATTTCACGGCTGAGGTTGTCTATGAAGGAAAAAGGAGTT GTAAAGCAGCCAGGATGTAGCTGGATCAACGTTGATGGAGTAGTGCATGAATTTCTGGCT GGTTCCTCGTCGCATCCTCAGAATGAACGCTTGCATACTGAATTGCAGGTCTTACAGAAG GAGATGAAGCTAGCAAGTGTTTAGACAACTAACAAGCATATTCTGGTTAGGAGTTACTTT GAGTAGCATCGTCTTTCTACCATAAAGATTTTCCCAGAATTAAGTATGGGCTCCGTGGGA TAGAGCTGCATTGAAGATCTCTGTTGTTTGGAAAGTTTGGCAGTCTCAAAATTGGCGAGG CAGGACGTTTGACTTGTTTGAATAATAACCAGAACTATTTGAGGAATGGCCTAAATAGGA TTGTTAGTGCAGAAACAATTTGCCTTTAGCTGACTGTCAAATACTACAAGAAGACAATCC TCTCTAGCCATGCAGATGTTCTGGACTCACTTGGCAGAGATACTCAGGAAAAACTCTCTT CCTCTTATAATTTATTCTTTTTAATTGGTGGGGCAGCTTCTTTGAAAGCTAGCTTGACTT AGACTAACATCCTAACGAGGGCCAAGAGCTTGGCAAGCTAGTATTATTTTTGGGAAAACA CTATTGATACTCTAAACCTACACTCTGAGTTGGTTCAATGTTTGTGGCACATGCCTTTCA TTGTTCAAAATATCTAGTGCATGGAGCTTGGTTCTGTCATAGTCCAAGATCGTTTGCCTG ACTGGCATGGAGTCAAGATTGGTAAAACCAAATGGATTATTTATAATGCATCCTCCTGTT GTTTGAAGGAAAAGGGGCGGAATCTGTGAAGATAGAGGTCCTTTCTTTTTCTTAAGTTTT GCTTAGAAATGCTAGCCCCTGCTTGTGGGCTTTCCTTTGGAGAAATGGGCAAACTGGTGT TTTGGGAAGTGTGAATGATACTACCAGACCCAGTGTTTAAGCTAGGGATATGTTCATACA TCCCAAGATGTCTCAAGAACGTGCACACCTAGCCTAGCTAAGGAGTTCAAGGATTGGACT TCCAGTCGCCACCTCAAAGGCGAAGAGGGTGCTCGGAATGAAGGGCTTAACAACATGATA ACATGGAAGCACAAGGCTCCACCTAAAAGAGTACCCGGAGCTGAAAAGAGGTTCCTAACT TTCATCATCAACATTGCCAGCACCTACGTCTTCA