Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g053380.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XH40_CYNCS)

Sequence

ATGAGGAACACTACTTCACTGTCAAGAATTTCAAAGTTTTCTAAATATTTCTCTAATAAT
GGAGATAATATCAAGCCCCAAAGGCTCATTCAGTTACTTCAAGAACCAAATTGGATTCAA
TCTCTGGATGAAACTAAGGCTCTTCATGCACTCACAATCACAATTGGGCAAGACCCAACT
CAACCCTTTTTGGCGAATAACACTATCATGTTCAGGTATTCAATATTCGGTGATATCTGC
ATTGCACGCAAGGTGTTTGATAATATGTCGAAAAGAAATGTTGCGTCATATAATACAATG
ATTAGTGGTTATAGTCGAAACGGAAGTTTATTAGAGGCTTGGAAGTTGTTTTCTGAGATG
AGGGGTTGTGGATTTGTGCCGACTCAGTTTAGTTTTGGTGGGGTTTTGGGTTGTGAGTGT
TTGGATGTTATTCAAGGATTTCAGTTGCAAGCGTTGGCTGAAAAATTGGGGCTTTTTCTC
GTTGATGCTGTAACAGGGACTGCATTATTGGGTTTATTTGGAAGGAAAGGATGGTTAGAT
GAAGCTATGCAGGTTTTCGACGAAATGCCTAAAAGGAATTTGGTGACTTTGAATTGTATG
ATATCGTTGTTTGGGCTGTATGAATGTGTTGAGGAGTCAATGATGGTGTTAAGGAGGTTG
TTAAGGAGTGGAATGGCTCCTTCTGAGAGTACTTTCGTGGGCATATTAGTTGGTTTTGTT
GGGGAACTTGATTTAATATTAGGGGAACTAGTACATGGGTTGGTAGTGAAAGATGGACTG
GATTTTTCTGTTTCAGTGAATAATTCATTGATTAACATGTATGCGAAATGCTCTGACATT
CATAAGGCGGAGAAAATGTTTGAGGATGCTCCTGTTAAGGATGTTGTGTCCTGGAATACA
ATGGTTGGTGCAATGGCGAAGATTGGAAGAGCGGATAGGGCATTGGTTGTTTTTAGGAAG
ATGTCTGTAAGTGGCGTATTGCCTAATGATACGAGTTATGTGAGTGCACTAAGTTGCTGC
ACTAGCCAGCAGTTTCGATTGCTTGGGGAGTCCATCCATGCGAAAGTGATGCAGAAAAAG
TTTGAATCTGATGTATATGTTGGTAGTGCGTTACTTGACTTTTATGTTAAATGTGATGGA
TTAGATGATGCTCTTGTTTGCTTTGATGAAATATCGGAGAAAAATGTGGTTTCTTGGAAT
ACGTTGATGTTGGGTTACTCGAGTAAAGGTTCTTCTTATGTTATTACGCTGCTTCAACAA
ATGATTCACTCGGGTTGTGTTCCAACTGAGTTTTCTTTTTCTATTGCAGTGAAATCTTCA
GGACTATCAGAGGTACTTCAGCTACATTCCTTATCCATAAAAATGGGTTACATTGATAAT
GATTATGTCTCTAGCAGTTTCATTTCTTCATATGCAAAATCTAGTTCAGTTGATAATGCC
CTAAGGTTTGTCCCTACCAATGAAATGCCACTTCCTGCTTTTGCTTCCAATATGATCGCA
CATATTTATAACAGAAATGGTCAATTCGACAAGACTCAAGAGTTGTTTTCTGACCTTGAA
AATCCAGATACTGTATCTTGGAATATTTTGATTGCAGCCTGTTCTCGAAATGGTGATTAC
ACAGAAGTTTTTGAACTTCTTGGACACATGCGGATGGCTAGATTATCTCCTGATAGATAC
ACATATGTTAGCCTGTTTAGTGCGTGCACCAAGCTTTGTAACCTTGGTCTAGGTAGCTCA
CTTCATGGCCTCATTATAAAGACTGATTTTAAGCGTTGTGACACATTTGTCTGCAATATC
ATGATTGACATGTATGGCAAATGTGGGAGTCTTGCCAGTTCGATCAAGATTTTCAATGAA
ATGACAGATAAAAATGTGATCACAGGGACAACCATTGTTTCAGCCCTTGGACTACACGGT
TATGCACACGAGGCATTAGAGAAATTCAAGGAGATGGATATGACCGGGATTAAACCTGAT
AAGGTTGCTTTCATAGCTGTGCTTTCAGCATGTAGGCACGTTGGATTAGTGAAAGAGGGG
ATGGAATTGTTTGAACAGATGAAAGGAAAGTATGGGGTAGAACCAGAGATGGATCACTAT
CTTATTGCAGTAGACTTGTTGGCTAGGTATGGCTATCTGACAGAAGCCGAGCAGTTAATC
ACTGGGATGCCTTTCCCTCCAAATGCTCTAATATGGCGCATTTTTTTGGAAGGCTGCAAG
AAAAAGAGAAGCATAGACAATACTGTCGCTCTTGCTTCGTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g053380.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XH40_CYNCS)

Sequence

MRNTTSLSRISKFSKYFSNNGDNIKPQRLIQLLQEPNWIQSLDETKALHALTITIGQDPT
QPFLANNTIMFRYSIFGDICIARKVFDNMSKRNVASYNTMISGYSRNGSLLEAWKLFSEM
RGCGFVPTQFSFGGVLGCECLDVIQGFQLQALAEKLGLFLVDAVTGTALLGLFGRKGWLD
EAMQVFDEMPKRNLVTLNCMISLFGLYECVEESMMVLRRLLRSGMAPSESTFVGILVGFV
GELDLILGELVHGLVVKDGLDFSVSVNNSLINMYAKCSDIHKAEKMFEDAPVKDVVSWNT
MVGAMAKIGRADRALVVFRKMSVSGVLPNDTSYVSALSCCTSQQFRLLGESIHAKVMQKK
FESDVYVGSALLDFYVKCDGLDDALVCFDEISEKNVVSWNTLMLGYSSKGSSYVITLLQQ
MIHSGCVPTEFSFSIAVKSSGLSEVLQLHSLSIKMGYIDNDYVSSSFISSYAKSSSVDNA
LRFVPTNEMPLPAFASNMIAHIYNRNGQFDKTQELFSDLENPDTVSWNILIAACSRNGDY
TEVFELLGHMRMARLSPDRYTYVSLFSACTKLCNLGLGSSLHGLIIKTDFKRCDTFVCNI
MIDMYGKCGSLASSIKIFNEMTDKNVITGTTIVSALGLHGYAHEALEKFKEMDMTGIKPD
KVAFIAVLSACRHVGLVKEGMELFEQMKGKYGVEPEMDHYLIAVDLLARYGYLTEAEQLI
TGMPFPPNALIWRIFLEGCKKKRSIDNTVALAS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g053380.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103XH40_CYNCS)

Sequence

AAACTATAACAATTAAAAATTAACGGAGGTAGTATTTGATTTGAGATGTGCGAAGGCAGG
GCGAACCCACTTTCCCACGTTGAGTGAAGGGAGCAACTCCTCTTTTTAGAATTGTTGAAG
GAACTACTAACTCTAACTATCTAATTGCACCGACTCCTTGCATTACTTCGCCCAAACCGG
AGGCTAAGGAGAACAGAATAAGGTAAAGATAGATATCGCTCATCCAGAGCTTGGTTAAGT
GTCCAAGACCCTATGCCTTGCTGGTTAGATCTGAATCTGATCTACAGTTATTTAATCTCT
TTCTTTTTCCTACTCACTATGTTGGGAAGTACAAAGGTAGTTGCTTCGAAGTTGAAGGAG
CTCGTCCATTCACTATATATCCGTAATTTCATACATAAAAAAAACGATTAAAAACTCAGC
GACACTCCTTCCTTCAAAATTTTTAGTAAGCATATATTTGCCGACTGATTTTGTTGTTTG
AGGTTGGAGGTTCAAATCCAATTAGAAAACTTAAAATTAATCTAAATCAATGAGTCAAGG
ATATAATCTACTTATATGTATGATAATTAAACTTTTATGTTTCCTTCTATGAATATCGAT
ACTGCTTCCTAAATATTTTGTGTATATTAGTAAGTAAAAAAATCTCAATCATTTCATCAA
TTTTATTTAGCATGAAAAGGGACCCACTTAGCTTTTGCTTCTTCATTGACTTCATATTGA
TTGTTACATTTACCTATATATTTCGAAGTTAGTGCTAGTGAGTAGTGCATTTTTGACATC
CCATTAACCTAATTAATAAGCCCAAAACAATAAATAAACCAAAACAAGAGCAATATACAA
TCTCTCTTGGCCAGTAAACGAGATCATGCACCTATATTTTGTAAATTGTGTTTGCAACTT
TTCAATATGACTTTATCGAAAGTGTTTAATGAGTTTTTGTATTTGATTAAAAATAAGTAA
TTAACTAGATACGAGAATCTTGTTTTGACATGTGTATATGACCTAGCTTCGAAAAGTATA
TTATCTTTAGTGGAGCGTGACTAAAATAATATAAATTATGAGAATGAAACATAAAAAAGA
GAATATTTTTTTTGGTTGGATATTCGAACAAGTGTCAAATCACACTATATTAAAAGTATT
TTTAAACTGACTTAGCCGAATAATTGCTTTTTAGAGTCAGATTCGACTAGACAATTATGA
AAATGGTGAAGTGATAGTATGAGATTTGGTTTACTATATACCTTTAGAGTAGCTTGAAGA
TGGGTGCGCACACACAGGAAGAAGCTAGCTAGCTCTGAGTTTCGACGGAGCCTAAAATGC
TCGGTCATGTAGGTGGAATACAACAATCTCGGATTAAATATGTGGATTGGGTGATGAGTC
ATGTTAAACTTACTGCGAGAAGGAGATTATTGGGTGATGCAAACAAAGTTTTATATTGAT
AGTTAAAAAAATAAGAAAACTACATGTGAGTAATTGTTTGGTTACCCCTAATTGTATGAA
AGTGAGCCTTTTTTAAGGAAATCATGCAGAGAGTCGGAGTATCACACTATATCAAGAATA
TCTAAAGACTGAATTTGTTAGTATTATCATATTATATACTCATATATAAGAATAGAATGA
GCAAGGCTAGTAGGTTTACCCTTCACTTTATCTCTTTCATTTTGGTATTATAGCATCCAA
AACTCTTGAGATTAAATCTCACCTGTTAGACATATGAAAATGAATTTTCACGTATTTGGT
CCACATAAAAAAAAACAAAATTGTCACTGACCAAAAAAAAGTAGAATTTGACAAATCAAT
TGATTTTCACATACCACTTGCAAAACTAAATATATACAACTTTTATGACCTATAAAAATA
ACTTTATGTTAGGACAAATAGAAGTTGACTCTTCGATGCCTCACAAAGGAATGTTAAGAC
AACAAATTAAAAGTCATACTTCAATCTTTTCCAAACAACAAACTCTGAACAAGTGGCCAA
ATATTAATATAAAAGAAAGCCAAATTTTCTCTATATATATGTACGTTGAAAACTAGGTTA
CATCTATGTTTTAAGCATTTATCATCAATTAGGACACAATGTACCTAGGAAAATTTTATG
TATTTCTAATAGTTGTGCATATTATGGTGCAATATTCAAATATTGTTCATTCTACGGAGC
AGAAAAAGAGTTTAACCGAATCATTTCTCATATATTTCGAGAGAAAAAAAAATTTCGAGA
TACATTGTTACGACAGATATAAAAGCAAATTACAAAGTAGATACAAGCCAATGCGACGAA
GTCCAGGAGGACCTGACCCCAAACATCATTAATCCATAAATGAATTGTTGTCATTGAAGG
GAAAATAAGAACTTTGATATCATATGGTTCTAATACTTGCATTTTCACTTGTTTTCTTCA
TAAGTAGTACTAATATTAATATATCAAGAATTAAAAGACCATAGTATGATATTCAATAAT
GAATATGTATTCGTATTTCAAAAATTTTAGATTCGCTTTGTATGTTATATATATATGAAG
TGTTTTTAATCTCTATCTTTTATTTAAATCAATGATATTTGTTATTTTCGAATACAAAAT
TTATAAAGTTGGTAAATATAATAGATTCTTGTGATTCGTTCCTTTCTCGAATCAAAGTGT
ATGAGGAACACTACTTCACTGTCAAGAATTTCAAAGTTTTCTAAATATTTCTCTAATAAT
GGAGATAATATCAAGCCCCAAAGGCTCATTCAGTTACTTCAAGAACCAAATTGGATTCAA
TCTCTGGATGAAACTAAGGCTCTTCATGCACTCACAATCACAATTGGGCAAGACCCAACT
CAACCCTTTTTGGCGAATAACACTATCATGTTCAGGTATTCAATATTCGGTGATATCTGC
ATTGCACGCAAGGTGTTTGATAATATGTCGAAAAGAAATGTTGCGTCATATAATACAATG
ATTAGTGGTTATAGTCGAAACGGAAGTTTATTAGAGGCTTGGAAGTTGTTTTCTGAGATG
AGGGGTTGTGGATTTGTGCCGACTCAGTTTAGTTTTGGTGGGGTTTTGGGTTGTGAGTGT
TTGGATGTTATTCAAGGATTTCAGTTGCAAGCGTTGGCTGAAAAATTGGGGCTTTTTCTC
GTTGATGCTGTAACAGGGACTGCATTATTGGGTTTATTTGGAAGGAAAGGATGGTTAGAT
GAAGCTATGCAGGTTTTCGACGAAATGCCTAAAAGGAATTTGGTGACTTTGAATTGTATG
ATATCGTTGTTTGGGCTGTATGAATGTGTTGAGGAGTCAATGATGGTGTTAAGGAGGTTG
TTAAGGAGTGGAATGGCTCCTTCTGAGAGTACTTTCGTGGGCATATTAGTTGGTTTTGTT
GGGGAACTTGATTTAATATTAGGGGAACTAGTACATGGGTTGGTAGTGAAAGATGGACTG
GATTTTTCTGTTTCAGTGAATAATTCATTGATTAACATGTATGCGAAATGCTCTGACATT
CATAAGGCGGAGAAAATGTTTGAGGATGCTCCTGTTAAGGATGTTGTGTCCTGGAATACA
ATGGTTGGTGCAATGGCGAAGATTGGAAGAGCGGATAGGGCATTGGTTGTTTTTAGGAAG
ATGTCTGTAAGTGGCGTATTGCCTAATGATACGAGTTATGTGAGTGCACTAAGTTGCTGC
ACTAGCCAGCAGTTTCGATTGCTTGGGGAGTCCATCCATGCGAAAGTGATGCAGAAAAAG
TTTGAATCTGATGTATATGTTGGTAGTGCGTTACTTGACTTTTATGTTAAATGTGATGGA
TTAGATGATGCTCTTGTTTGCTTTGATGAAATATCGGAGAAAAATGTGGTTTCTTGGAAT
ACGTTGATGTTGGGTTACTCGAGTAAAGGTTCTTCTTATGTTATTACGCTGCTTCAACAA
ATGATTCACTCGGGTTGTGTTCCAACTGAGTTTTCTTTTTCTATTGCAGTGAAATCTTCA
GGACTATCAGAGGTACTTCAGCTACATTCCTTATCCATAAAAATGGGTTACATTGATAAT
GATTATGTCTCTAGCAGTTTCATTTCTTCATATGCAAAATCTAGTTCAGTTGATAATGCC
CTAAGGTTTGTCCCTACCAATGAAATGCCACTTCCTGCTTTTGCTTCCAATATGATCGCA
CATATTTATAACAGAAATGGTCAATTCGACAAGACTCAAGAGTTGTTTTCTGACCTTGAA
AATCCAGATACTGTATCTTGGAATATTTTGATTGCAGCCTGTTCTCGAAATGGTGATTAC
ACAGAAGTTTTTGAACTTCTTGGACACATGCGGATGGCTAGATTATCTCCTGATAGATAC
ACATATGTTAGCCTGTTTAGTGCGTGCACCAAGCTTTGTAACCTTGGTCTAGGTAGCTCA
CTTCATGGCCTCATTATAAAGACTGATTTTAAGCGTTGTGACACATTTGTCTGCAATATC
ATGATTGACATGTATGGCAAATGTGGGAGTCTTGCCAGTTCGATCAAGATTTTCAATGAA
ATGACAGATAAAAATGTGATCACAGGGACAACCATTGTTTCAGCCCTTGGACTACACGGT
TATGCACACGAGGCATTAGAGAAATTCAAGGAGATGGATATGACCGGGATTAAACCTGAT
AAGGTTGCTTTCATAGCTGTGCTTTCAGCATGTAGGCACGTTGGATTAGTGAAAGAGGGG
ATGGAATTGTTTGAACAGATGAAAGGAAAGTATGGGGTAGAACCAGAGATGGATCACTAT
CTTATTGCAGTAGACTTGTTGGCTAGGTATGGCTATCTGACAGAAGCCGAGCAGTTAATC
ACTGGGATGCCTTTCCCTCCAAATGCTCTAATATGGCGCATTTTTTTGGAAGGCTGCAAG
AAAAAGAGAAGCATAGACAATACTGTCGCTCTTGCTTCGTAA