Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g049570.3.1
CDS Infomation

3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (AHRD V3.3 *** K4CF58_SOLLC)
Sequence

ATGAGGGGAAGAAGATGGTTAGGATTCGTTCCAACGGGATTTCAGTTACGTCGTTTCAGT
TCATTTGAAGCTCCTCCTGTTCCTCCTCTTCGAAGAGTTGTTGTTACTGGTGTAGGGATG
GTGACTCCCCTTGGGTGTGGAGTGGAAACCACATGGAAGAGGCTAATAGAAGGGGAATGT
GGTGTAAGAGCAATAGGTCCTGATGATTTGAAGATGAATGGTTTTGAACCGGAAGTTAAG
ATGTATACATTTGATCAGTTGACATCCAAAGTTGCTGCAGTTGTGCCCTATGGTTCTAGC
TCAGGTGAATTCGACGAGCAGTTGTGGCTAAACTCGAAGGAGCATAGATCGATTGCAAGA
TTTATAGGATATGCTTTATGTGCTGCTGATGAAGCTCTTAAAGATGCTAATTGGATGCCC
ACTGAGCAAAATGAAAAGGAACAGACGGGTGTTTCCTTAGGTGCTGGAACTGGAAGTATC
AGTGACATATTGGAAGCGTCCAGAATGATCTGTGAAAAGAATATACGCCGGCTTAGTCCA
TTTTTCATCCCACGGATATTGATCAACATGGCTTCTGGTCATGTAAGCATGAAGTATGGA
TTTCAGGGACCAAATCATTCTTCAGTTACAGCTTGTGCCACTGGAGCTCATTCAATTGGT
GATGCTGCCAGGATGATTCAGTTTGGAGATACAAATGTGATGGTTGCAGGGGGGACAGAA
GCCAGCATTGATGCTTTATCTATTGCTGGATTCTGTAGGTTAAGGGCGTTGAGTACCAAG
TATAATTCAAAACCCCATGAAGCCTCCAGGCCATTTGATTGTGGCCGTGATGGATTTGTG
ATAGGTGAGGGGTCTGGTGTCATGGTATTAGAGGAATTGGAGCATGCAAGAAAGCGAGGA
GCTAAGATATACGCAGAGCTACGTGGCTATGGAACATCAGGTGATGCACATCATATTACA
CAGCCACATATTGGTGGAAGAGGTGCAGTTTTGGCTATGACTCGTGCTTTGAAACAGTCT
GGTCTTCATCCTAGTCAAGTGGATTATATAAATGCTCACGCAACATCTACACCCCTTGGT
GATGCAGCAGAAGCAAATGCAATAAAATGTGTATTCTCTGATCATGCTACATCAGGGGCC
CTGTCCGTATCCTCTACAAAGGGTGCTACTGGTCATCTCCTTGGAGCCGCTGGAGCTGTT
GAAGCAATTTTTACTGTCTTGGCAATACACCACGGTGTCGCGCCTTTGACACTGAACCTT
TCTGAACCAGATCCAGTATTCAATGGTGGTTTCATGCCCTTGACTGCTTCAAAGGAGATG
ACCATTAAATCTGGTTTATCAAACTCATTTGGATTTGGAGGAACGAATTCTTGCTTGCTT
TTTACTTCAACCAATTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g049570.3.1
PEP Infomation

3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (AHRD V3.3 *** K4CF58_SOLLC)
Sequence

MRGRRWLGFVPTGFQLRRFSSFEAPPVPPLRRVVVTGVGMVTPLGCGVETTWKRLIEGEC
GVRAIGPDDLKMNGFEPEVKMYTFDQLTSKVAAVVPYGSSSGEFDEQLWLNSKEHRSIAR
FIGYALCAADEALKDANWMPTEQNEKEQTGVSLGAGTGSISDILEASRMICEKNIRRLSP
FFIPRILINMASGHVSMKYGFQGPNHSSVTACATGAHSIGDAARMIQFGDTNVMVAGGTE
ASIDALSIAGFCRLRALSTKYNSKPHEASRPFDCGRDGFVIGEGSGVMVLEELEHARKRG
AKIYAELRGYGTSGDAHHITQPHIGGRGAVLAMTRALKQSGLHPSQVDYINAHATSTPLG
DAAEANAIKCVFSDHATSGALSVSSTKGATGHLLGAAGAVEAIFTVLAIHHGVAPLTLNL
SEPDPVFNGGFMPLTASKEMTIKSGLSNSFGFGGTNSCLLFTSTN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g049570.3.1
Transcript Infomation

3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (AHRD V3.3 *** K4CF58_SOLLC)
Sequence

TATAATCCCAATTATGTCGAGTCAATAAATTTTAAGGCAAAAACGCTTATATTGTGAGCA
ATGAGGGGAAGAAGATGGTTAGGATTCGTTCCAACGGGATTTCAGTTACGTCGTTTCAGT
TCATTTGAAGCTCCTCCTGTTCCTCCTCTTCGAAGAGTTGTTGTTACTGGTGTAGGGATG
GTGACTCCCCTTGGGTGTGGAGTGGAAACCACATGGAAGAGGCTAATAGAAGGGGAATGT
GGTGTAAGAGCAATAGGTCCTGATGATTTGAAGATGAATGGTTTTGAACCGGAAGTTAAG
ATGTATACATTTGATCAGTTGACATCCAAAGTTGCTGCAGTTGTGCCCTATGGTTCTAGC
TCAGGTGAATTCGACGAGCAGTTGTGGCTAAACTCGAAGGAGCATAGATCGATTGCAAGA
TTTATAGGATATGCTTTATGTGCTGCTGATGAAGCTCTTAAAGATGCTAATTGGATGCCC
ACTGAGCAAAATGAAAAGGAACAGACGGGTGTTTCCTTAGGTGCTGGAACTGGAAGTATC
AGTGACATATTGGAAGCGTCCAGAATGATCTGTGAAAAGAATATACGCCGGCTTAGTCCA
TTTTTCATCCCACGGATATTGATCAACATGGCTTCTGGTCATGTAAGCATGAAGTATGGA
TTTCAGGGACCAAATCATTCTTCAGTTACAGCTTGTGCCACTGGAGCTCATTCAATTGGT
GATGCTGCCAGGATGATTCAGTTTGGAGATACAAATGTGATGGTTGCAGGGGGGACAGAA
GCCAGCATTGATGCTTTATCTATTGCTGGATTCTGTAGGTTAAGGGCGTTGAGTACCAAG
TATAATTCAAAACCCCATGAAGCCTCCAGGCCATTTGATTGTGGCCGTGATGGATTTGTG
ATAGGTGAGGGGTCTGGTGTCATGGTATTAGAGGAATTGGAGCATGCAAGAAAGCGAGGA
GCTAAGATATACGCAGAGCTACGTGGCTATGGAACATCAGGTGATGCACATCATATTACA
CAGCCACATATTGGTGGAAGAGGTGCAGTTTTGGCTATGACTCGTGCTTTGAAACAGTCT
GGTCTTCATCCTAGTCAAGTGGATTATATAAATGCTCACGCAACATCTACACCCCTTGGT
GATGCAGCAGAAGCAAATGCAATAAAATGTGTATTCTCTGATCATGCTACATCAGGGGCC
CTGTCCGTATCCTCTACAAAGGGTGCTACTGGTCATCTCCTTGGAGCCGCTGGAGCTGTT
GAAGCAATTTTTACTGTCTTGGCAATACACCACGGTGTCGCGCCTTTGACACTGAACCTT
TCTGAACCAGATCCAGTATTCAATGGTGGTTTCATGCCCTTGACTGCTTCAAAGGAGATG
ACCATTAAATCTGGTTTATCAAACTCATTTGGATTTGGAGGAACGAATTCTTGCTTGCTT
TTTACTTCAACCAATTGAACACTGAAATTCAGCTGGAACAAGAGTTTTATTAGGCATTAG
ACTATAGTTAGCCAGGCGAGGCAAACAAAAGCCCTCCGCCCATCTCAATAATCAAATACA
AGAGGAAGCAAGTGGAAGGAGATCGGAGGTTTGAGGCTGCTATAATACGCTTAAAATAAG
CGTTTTTAGCCAACTCTTCTCTTGCCTTGAAACTCCAGTTTCCTTCTGATTTCTTTAATT
CATTATCATTATTGTAGTTCTATTGTTTTTTCCCCTTAGATGTGTCCCGAGAACAAGTAG
AAAATGCGGAGGACTTCTAATGCCAGAGAGCATAAGTTTTTCCACAAATATTTGATTGAG
TTGTTGACATTGATGGTATGGATTCTTGTAATCGATTACAACTATATTGGCACTGTGGTG
TAATTGTTATTGTTGTCATTGTCTTGTAAACCACATTGTGTTATAGAAAGGTAGGTGTTG
GGCTGAAACAGTTTGAAATACCCTTAACGTAACGTGATATAGTTTGCTTTGAACTATTAA
TAGTATCATCACACCCTTTTATGTAGCTTCTTTTTTCTTTTC