Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g049430.3.1
CDS Infomation	GDSL esterase/lipase (AHRD V3.3 *** W9STE9_9ROSA)
Sequence	ATGACTTATTACACTCTGATGAGTATAATTCTAAGTCATTATTTGTTACTAGTGACTAAA ACATTGGCTGGAAAAGTTCCAGCAATTATAGTGTTCGGCGATTCGTCGGTCGATTCAGGG AATAACAACCAGATCTCCACCGTTCTAAAGAGCAATTTCGAACCGTACGGCCGCGATTTC TACGATAAAAAGGCAACTGGTAGGTTCTGCAATGGGCGAATTCCACCGGATTTTATATCG GAAGGTTTTGGGCTGAGGCCATTTGTTCCAGCTTATTTAGATCCGGCGTTTAGTATATCT GATTTTGCACAAGGTGTTTGTTTTGCTTCTGCTGGTACTGGTTATGATAATGCCACTTCT CATGTGCTCAATGTGATACCATTATGGAAGGAAGTGGAGTACTACAAAGAATATCAAAAG AAACTAAAAGCATACGCAGGTAAAAAGAAATCGAAATACATAATAAAAGAGTCACTCTAT TTAATCAGCATTGGAACAAATGACTTCTTGGAAAATTACTACTCAATGCAAAGCCAACGT TCTTCTCAATACACAGAAGATCAATTTCAAGATTTTCTTCTTCAACTTGCTCGGAACTTC GTGCACCAAATTTATCGCATGGGTGCTAGGAAAATTTCGTTAACTGGAGTTCCTCCAATG GGTTGTTTGCCATTGGAAAGAGCAACAAATTATGTAGGTGGAAATGGAGATGGATGCAAT GAGAAATATAATAATGTTGCTAAGCATTTTAATGTTATGTTGAGTGGTTTGGTTGAAAGG TTAAATGAAGAGCTTCCTGGGATTAGAGTGGTCTTTGCTGATGCTTATAATCTCTTGCTT CAAATGATTACAAAACCTTCTTCATATGGGTTTGAAGTGGCAAGTGTAGCATGTTGTGGC ACAGGATTATTTGAGATGGGTTTATTGTGCGATAAATTAAGTCCATTGACATGCACAGAT GCAAATAAGTTTGTATTTTGGGACGCATTTCATGTAACAGACAAAACAAATCACATTATT TCTGATTTCTTGATGGAACATGTCCTTCACCAATTTTTATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g049430.3.1
PEP Infomation	GDSL esterase/lipase (AHRD V3.3 *** W9STE9_9ROSA)
Sequence	MTYYTLMSIILSHYLLLVTKTLAGKVPAIIVFGDSSVDSGNNNQISTVLKSNFEPYGRDF YDKKATGRFCNGRIPPDFISEGFGLRPFVPAYLDPAFSISDFAQGVCFASAGTGYDNATS HVLNVIPLWKEVEYYKEYQKKLKAYAGKKKSKYIIKESLYLISIGTNDFLENYYSMQSQR SSQYTEDQFQDFLLQLARNFVHQIYRMGARKISLTGVPPMGCLPLERATNYVGGNGDGCN EKYNNVAKHFNVMLSGLVERLNEELPGIRVVFADAYNLLLQMITKPSSYGFEVASVACCG TGLFEMGLLCDKLSPLTCTDANKFVFWDAFHVTDKTNHIISDFLMEHVLHQFL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g049430.3.1
Transcript Infomation	GDSL esterase/lipase (AHRD V3.3 *** W9STE9_9ROSA)
Sequence	TAAAAAAAACTAAGCTTAATTTGGTAAAATTTTGTCCATTATTATCACTTATTGTAGCTG ATATTACCAAACTTTACATCACTGTATTAATTAACTGTTCGCTATAACTTGTAGGATGGT CTTCTACACTTCGACTGTATCGCACCTCCATTGCATTTATAAAAGACTACTCGTACATTT ATTATAAGTTGTAATCTACTTCTTTTGTTTAAATTTTATTTCTCTAATTTGCACATTTTT TTAAAAATAAAATGATTAATATAAGTGATTGATGCAAAGGATAAAAGATAGGTATCCAAA CTGATAGATCAAACTATATTTAATTGAAAGAAATATTACGTATTATTTCATAATGTATCG TATTATTTTTATATTTGGAAATCCAGGCGTAACGCAGATCTACGGAAAAACAATTTAAGA ATCGGAGAAGAGTGACATAACTGCAATTTCTGGTTCATAATTAAAGAACAGAGTCTCATT AATTGCTTCCACTCAACTTTTTTCTGAACTTTTTGCTAGTCATAATAATTTTGGCAGCCA TTAATAATCTCAACAAACTCTTCATCCCACCCAATTTTATCACGCATATAAACTAAAATC ACCAAATTCACTCAAAATCCCAGCTCCACAATGACTTATTACACTCTGATGAGTATAATT CTAAGTCATTATTTGTTACTAGTGACTAAAACATTGGCTGGAAAAGTTCCAGCAATTATA GTGTTCGGCGATTCGTCGGTCGATTCAGGGAATAACAACCAGATCTCCACCGTTCTAAAG AGCAATTTCGAACCGTACGGCCGCGATTTCTACGATAAAAAGGCAACTGGTAGGTTCTGC AATGGGCGAATTCCACCGGATTTTATATCGGAAGGTTTTGGGCTGAGGCCATTTGTTCCA GCTTATTTAGATCCGGCGTTTAGTATATCTGATTTTGCACAAGGTGTTTGTTTTGCTTCT GCTGGTACTGGTTATGATAATGCCACTTCTCATGTGCTCAATGTGATACCATTATGGAAG GAAGTGGAGTACTACAAAGAATATCAAAAGAAACTAAAAGCATACGCAGGTAAAAAGAAA TCGAAATACATAATAAAAGAGTCACTCTATTTAATCAGCATTGGAACAAATGACTTCTTG GAAAATTACTACTCAATGCAAAGCCAACGTTCTTCTCAATACACAGAAGATCAATTTCAA GATTTTCTTCTTCAACTTGCTCGGAACTTCGTGCACCAAATTTATCGCATGGGTGCTAGG AAAATTTCGTTAACTGGAGTTCCTCCAATGGGTTGTTTGCCATTGGAAAGAGCAACAAAT TATGTAGGTGGAAATGGAGATGGATGCAATGAGAAATATAATAATGTTGCTAAGCATTTT AATGTTATGTTGAGTGGTTTGGTTGAAAGGTTAAATGAAGAGCTTCCTGGGATTAGAGTG GTCTTTGCTGATGCTTATAATCTCTTGCTTCAAATGATTACAAAACCTTCTTCATATGGG TTTGAAGTGGCAAGTGTAGCATGTTGTGGCACAGGATTATTTGAGATGGGTTTATTGTGC GATAAATTAAGTCCATTGACATGCACAGATGCAAATAAGTTTGTATTTTGGGACGCATTT CATGTAACAGACAAAACAAATCACATTATTTCTGATTTCTTGATGGAACATGTCCTTCAC CAATTTTTATAGCTATCTTGGATCATCTAATATGGATTTTGTAGGAGACTTGCTTTTATT GCTATTTTACTTTTGTTTAGTGTTTGATTTTTGGATATTGTGGTGGGAAGAATACGAAAA AGAATATTTGTTGTACGTACATTTTTTTTTGATTCTCAAGGATATTGTATTATTTCAACT ACG