Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g045160.3.1
CDS Infomation	ATP-dependent 6-phosphofructokinase (AHRD V3.3 *** M5W6F1_PRUPE)
Sequence	ATGGGATCATTGGATGATAATTTTGCAGTGCATAATTTGAATAATATAAGTTGTTCAATG GGAGAAGTGACTAATTCACAGCAGCAGAAGAAGAAAATCGTGATTGGTGACGATGGTTAT GTTCTAGAAGATGTTCCTCATTTGTCTGATTACATTCCGAATCTTCCTACATATACTAAT CCATTGCAGCATAATCCTTCATATTCAGTCGTTAAGCAGTATTTTGTCAATGAGGATGAT ACAGTTGCCGAAAAGGTTGTTGTCCACAAGAACAGTCCAAGGGGGATACATTTTCGTCGA GCTGGTCCTTGCCAAAAAGTTTATTTTGAGCCAGATGATGTTTATGCATGTATTGTAACA TGTGGAGGCTTATGTCCCGGTCTCAATACAGTTATCAGGGAAATAGTATGTGGCCTACAC TACATGTATGGCGTAAGCAGAGTCATGGGGATAGATGGAGGATATCGAGGTTTCTATTCC AAAAACACGATTCCATTGACACCAAAGGTTGTCAATAATATCCATAAACGCGGTGGAACA ATTCTTGGGACATCTCGAGGAGGTCATGTTACCAAGAAAATAGTAGATAGCATTCAGGAC CGGGGTATCAATCAGGTTTATATAATCGGAGGAGACGGAACCCAGAGAGGGGCTGCGGTG ATATTTGAGGAAATTAGAAGACGTGGTCTCAATGTTGCAGTTGCTGGAATCCCCAAGACA ATCGATAATGATATACCGGTTATTGACAAGTCATTTGGTTTTGACTCCGCCGTTGAGGAA GCCCAACGTGCTATCAGTGCTGCTCATGTTGAAGCTACCAGTTTTGAGAATGGAATTGGC CTTGTGAAGTTAATGGGACGGGACAGTGGGTTCATCGCGATGTATGCTACTCTTGCTAGT CGAGATGTTGACTGCTGTTTGATTCCAGAATCCCCTTTCTATCTTGAAGGAAGCGGTGGA CTGTTTGAGTATATCGAACATAGACTCAAAGACAATGGACATATGGTTATAGTCATAGCT GAAGGTGCTGGACAAGAGCTAGTTTCCGAGAGTTTGAAATCCACTGATCCTTCAGGGAAT AAACTTTTACAAGATGTTGGCTTATGGATCTCGGAAAGGATAAAGGAGCATTTCTCGAAA CAAAAGAAGATGCTCATTAATCTTAAATACATAGATCCCACATACATGATTCGGGCTATT CCGAGTAATGCATCTGACAATGTGTATTGCACTCTTCTAGCGCAAAGCGCTGTACATGGA GCAATGGCTGGCTACACAGGCTTCACGGTTGGTCCTGTCAATAACAGAAATGCTTACATA CCCTTTAATAGAATCATTGAGAAACAAAACAAGGTTGTGATTACAGACAGGATGTGGGCG AGACTTCTATCTTCAACGAATCAACCTAGCTTCTTGAGAACGAGAGTCGATATAATTAAA GCAAACAAGGACGAAGAACCACCTACTCAATTATCAGACGATGCAACGACAGATGATAAT TTGATGGAGAAACAAATCCTAACTTTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g045160.3.1
PEP Infomation	ATP-dependent 6-phosphofructokinase (AHRD V3.3 *** M5W6F1_PRUPE)
Sequence	MGSLDDNFAVHNLNNISCSMGEVTNSQQQKKKIVIGDDGYVLEDVPHLSDYIPNLPTYTN PLQHNPSYSVVKQYFVNEDDTVAEKVVVHKNSPRGIHFRRAGPCQKVYFEPDDVYACIVT CGGLCPGLNTVIREIVCGLHYMYGVSRVMGIDGGYRGFYSKNTIPLTPKVVNNIHKRGGT ILGTSRGGHVTKKIVDSIQDRGINQVYIIGGDGTQRGAAVIFEEIRRRGLNVAVAGIPKT IDNDIPVIDKSFGFDSAVEEAQRAISAAHVEATSFENGIGLVKLMGRDSGFIAMYATLAS RDVDCCLIPESPFYLEGSGGLFEYIEHRLKDNGHMVIVIAEGAGQELVSESLKSTDPSGN KLLQDVGLWISERIKEHFSKQKKMLINLKYIDPTYMIRAIPSNASDNVYCTLLAQSAVHG AMAGYTGFTVGPVNNRNAYIPFNRIIEKQNKVVITDRMWARLLSSTNQPSFLRTRVDIIK ANKDEEPPTQLSDDATTDDNLMEKQILTF*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g045160.3.1
Transcript Infomation	ATP-dependent 6-phosphofructokinase (AHRD V3.3 *** M5W6F1_PRUPE)
Sequence	TTAAATTACACTAAAACAATTATAAATAAAAATAATACTAATTATTTTTAATAGAGAGAT TTTACCGTGAAAGAAAATTGTTCGAATTTATGAATAAAGAGTATATTTTTCACATGAATA TACTTTAGGTATCTAATAGCTTAACAACTTCAAAAGTAATAAAACCACGTAATTTATGGA TTTTGTAGTTCAAGAAAAAAATTATATTAAGAACAAAATGAAAAATTATAATTTTTTTTT AATTTTAAATTTCTAAAATTTAAGATAATTGCTTTTAAGGAAAATGATAAATAATTTCAG ACAAATAAAGGAACAAGACTAATAACCTCCATCCCAAAAAGTAAGTGTAAAATAATTTGT TTTAATTTTAGAATAACAACGTTTTAAAAAACATCAATTTTATCTAACACTTATTTTAAA ACGAAAAAAATATTAGGTTCGTGATAAAATGAAAATTTATGGCATGTATTTGGACGAGAG AAAAAACAACAACTGTCAGTTGATTGGTGAATAGAAAAATTGAAGATAATTAAGGCGTGG GGCTTGACGATTGACATGCTACACTTAACGTCAATTTAGTAAAATATTGAGAGTGTTAGC TCATTATTGACCTCACCTTTATTTTTATTTTGTCTATCTATTATTTAATAATAAATTAAA TCCATATTTGACAGAATCTAGAATATAATTAGAGAATCTTCTAATTTCCAGAACACCTCA AAACAATTTGAGTCCTTTTTGTTATTTTTTTGTAATTACTTTTTCGTGAACTTCTGACCA AAAAAGGAAAAAACCCCACGAGAAAATTCAATAAACAGTTGCCATCTGTGTATTATTTGT ATTTTTTTTTTGTTGTTGTTTGACTATTATTAGTTGAAAGTTCATAGAAGGTCTGCTCAA CTTTTGTTTTAGCAATAATTCATTTATTTCATTTTGAGATAAATATATTTAAATTGAATT ATGGGATCATTGGATGATAATTTTGCAGTGCATAATTTGAATAATATAAGTTGTTCAATG GGAGAAGTGACTAATTCACAGCAGCAGAAGAAGAAAATCGTGATTGGTGACGATGGTTAT GTTCTAGAAGATGTTCCTCATTTGTCTGATTACATTCCGAATCTTCCTACATATACTAAT CCATTGCAGCATAATCCTTCATATTCAGTCGTTAAGCAGTATTTTGTCAATGAGGATGAT ACAGTTGCCGAAAAGGTTGTTGTCCACAAGAACAGTCCAAGGGGGATACATTTTCGTCGA GCTGGTCCTTGCCAAAAAGTTTATTTTGAGCCAGATGATGTTTATGCATGTATTGTAACA TGTGGAGGCTTATGTCCCGGTCTCAATACAGTTATCAGGGAAATAGTATGTGGCCTACAC TACATGTATGGCGTAAGCAGAGTCATGGGGATAGATGGAGGATATCGAGGTTTCTATTCC AAAAACACGATTCCATTGACACCAAAGGTTGTCAATAATATCCATAAACGCGGTGGAACA ATTCTTGGGACATCTCGAGGAGGTCATGTTACCAAGAAAATAGTAGATAGCATTCAGGAC CGGGGTATCAATCAGGTTTATATAATCGGAGGAGACGGAACCCAGAGAGGGGCTGCGGTG ATATTTGAGGAAATTAGAAGACGTGGTCTCAATGTTGCAGTTGCTGGAATCCCCAAGACA ATCGATAATGATATACCGGTTATTGACAAGTCATTTGGTTTTGACTCCGCCGTTGAGGAA GCCCAACGTGCTATCAGTGCTGCTCATGTTGAAGCTACCAGTTTTGAGAATGGAATTGGC CTTGTGAAGTTAATGGGACGGGACAGTGGGTTCATCGCGATGTATGCTACTCTTGCTAGT CGAGATGTTGACTGCTGTTTGATTCCAGAATCCCCTTTCTATCTTGAAGGAAGCGGTGGA CTGTTTGAGTATATCGAACATAGACTCAAAGACAATGGACATATGGTTATAGTCATAGCT GAAGGTGCTGGACAAGAGCTAGTTTCCGAGAGTTTGAAATCCACTGATCCTTCAGGGAAT AAACTTTTACAAGATGTTGGCTTATGGATCTCGGAAAGGATAAAGGAGCATTTCTCGAAA CAAAAGAAGATGCTCATTAATCTTAAATACATAGATCCCACATACATGATTCGGGCTATT CCGAGTAATGCATCTGACAATGTGTATTGCACTCTTCTAGCGCAAAGCGCTGTACATGGA GCAATGGCTGGCTACACAGGCTTCACGGTTGGTCCTGTCAATAACAGAAATGCTTACATA CCCTTTAATAGAATCATTGAGAAACAAAACAAGGTTGTGATTACAGACAGGATGTGGGCG AGACTTCTATCTTCAACGAATCAACCTAGCTTCTTGAGAACGAGAGTCGATATAATTAAA GCAAACAAGGACGAAGAACCACCTACTCAATTATCAGACGATGCAACGACAGATGATAAT TTGATGGAGAAACAAATCCTAACTTTTTGAACATTATACATATATATATATATATGGTAT GTTGCAACAATAGTAGACATATTGTGACAGAATCCTATAGTTCTGTTATCTCAATGTGTG AGTATAACCAAACTTTGGTGAGTTTTACACGGTGTATTTTGTGACTCTAAATAATGTTAT ACATCAATGCAATAATTAACAAAAGAATACAGTGTTTTTTTTTCTTCAGAAACTACTATA CTTGTGTACTTGCAAA