Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g043270.3.1
CDS Infomation	FAR1 (AHRD V3.3 *** A0A178UYQ0_ARATH)
Sequence	ATGGATATAGATCTTCGTCTGCCTTCTCAAGACCATGATAAGGAAGAAGAAGAAGAGGAA CAAAATGGAATTATAAATATGCTTGACAATGAAGAAAAAATACATGGTGATGACGGAATG CATGGGATGTTGGTTATTGAAGAGAAGATGCATGCAGAAGATAGAGGGGATATGAACACT CCCGTAGGAACTATGATAGACTTTAAGGAGGATGTGAACCTTGAACCGCTGGCTGGCATG GAATTTGAGTCACATGGTGAGGCTTATGCCTTTTATCAAGAGTATGCTCGGTCGATGGGA TTCAATACAGCCATACAAAACAGCCGTCGCTCAAAGACGTCAAGGGAATTCATTGATGCA AAATTCGCATGTTCTAGATATGGAACTAAACGGGAATATGAGAAGTCTGCAAATCGGCCA CGTAGTAGGCAAGGAAACAAACAGGATCCAGAAAATGCTACTGGTCGGCGAGCATGTGCA AAGACAGATTGCAAAGCAAGTATGCATGTGAAAAGAAGGCCCGATGGGAAATGGATAATT CATAGATTCGAGAAAGAACATAATCATGAACTTCTACCTGCCCAAGCTGTCAGTGAACAA ACAAGAAGAATGTATGCTGCAATGGCAAGACAATTTGCTGAATACAAAAATGTTGTTGGT CTGAAAAGTGACACAAAAGTTCTATTTGACAAAGGTCGAAATTCAGCAATTGAAGGGGGA GACATAAGTGTTCTATTAGAGTTCTTTATTCAGATGCAAAATCTTAATTCCAACTTCTTT TATGCTGTTGATGTGGGTGAAGATCAACGTGTAAAGAACTTGTTCTGGGTTGATGCCAAA GCTAGGCATGATTATGTGAATTTCAGCGATGTTGTCTCTTTTGATACTACCTATGTCAGA AACAAATATAAGATGCCCCTGGCTCTTTTTGTTGGGGTCAATCAGCATTTTCAGTTCATG CTACTTGGATGTGCTTTGGTCTCTGAAGAGAGTGCGTCAACATTTTCTTGGGTAATGCGG ACATGGTTGAAGGCAATGGGCGGTCAAGCTCCGAAGACAGTGATCACCGATCATGACCTG GTATTGAAGTCAGTCATTTCAGAGGCTTTGCCACTATCCCTCCATTATTTCTGTTTATGG CATATCCTGGGAAAGGTGTCTGATACACTGAATCATGTCATCAAACAGAATGAAAAGTTT ATGCCTAAGTTCGAGAAATGTCTTAACAGGTCATGGACAGATGAGGAGTTTGAAAAGAGG TGGAGAAAACTAGTTGATAAATTTGATCTCAGAGAAGTTGAATTGGTTCATTCACTGTAT GAAGATCGGGTGAAATGGGCCCCTACATTTATAAGGGATGTGGTTTTAGCGGGAATGTCA ACGGTTCAACGATCAGAGAGTGTAAACTCTTTCTTTGACAAATATGTACATAAGAAAACT ACCATCCAGGAGTTTGTAAAGCAATATGAATCAATATTACAAGATAGGTATGAGGAGGAG GCAAAGGCAGATTCTGATACATGGAACAAACAACCTGCTTTGAGATCCCCATCCCCATTT GAGAAGCACTTGGCGGGGCTTTATACACATGCTGTATTTAAGAAATTCCAGTCTGAGGTT GTGGGTGCAACTGCTTGTGGTCCTAAAAGAGAGAAGCAAGATGAGATAGTCTTAACATAT AGAGTTCAAGATTTTGAGAAGACTCAAGAGTTCATTGTTACATTGGATGAAATGAAGTCA GAAATATCTTGTATTTGTCATTTGTTTGAATATAAAGGCTACCTTTGTAGACATGCATTG ATAGTTCTCCAAATATGTGCTGTTTCCTCTATCCCACCACAATATATTTTGAAGCGATGG ACAAAAGATGCGAAGAGCAAGTACTCTATGACGGATGGATCTGAAGATGTGCAGTCAAGG TTCCAGAGATATAATGAGCTATGTCATCGGGCTATGAAATTGAGTGAAGAAGGGTCGTTA TCTCAAGAGAGCTATAGTTTTGCTCTTCGTGCACTTGATGACGCGTTTGGGAGTTGTGTA ACTTTTAATAACTCAAACAAGAACATGTTAGAAGCTGGCACATCATCAGCATCTGGTCTT CTCTGTATTGAAGATGATAACCAAAGTAGGAGTATGAGCAAGACAAACAAGAAGAAAAAT AACTTCACTAAGAAACGCAAGGTGAACTCGGAGCCAGATGTTATGGCTGTTGGGGCAGCA GACAGCTTGCAACAAATGGACAAATTGAACTCCAGGCCTGTGACTCTTGATGGTTATTTT GGCCCGCAACAAAGTGTTCAAGGAATGGTACAGTTAAACTTGATGGCACCAACTCGTGAT AACTACTATGCAAACCAACAGACTATTCAGGGCCTTGGACAGTTGAACTCTATAGCTCCT ACACATGATGGCTATTATGGTGCTCAGCCAACAATGCATGGGCTGGGCCAAATGGACTTT TTCCGCTCTCCAAGTTTCTCATATGGCATTCGGGATGAACCCACTGTAAGATCTTCTCAA TTGCACGACGATGCATCTAGACATCCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g043270.3.1
PEP Infomation	FAR1 (AHRD V3.3 *** A0A178UYQ0_ARATH)
Sequence	MDIDLRLPSQDHDKEEEEEEQNGIINMLDNEEKIHGDDGMHGMLVIEEKMHAEDRGDMNT PVGTMIDFKEDVNLEPLAGMEFESHGEAYAFYQEYARSMGFNTAIQNSRRSKTSREFIDA KFACSRYGTKREYEKSANRPRSRQGNKQDPENATGRRACAKTDCKASMHVKRRPDGKWII HRFEKEHNHELLPAQAVSEQTRRMYAAMARQFAEYKNVVGLKSDTKVLFDKGRNSAIEGG DISVLLEFFIQMQNLNSNFFYAVDVGEDQRVKNLFWVDAKARHDYVNFSDVVSFDTTYVR NKYKMPLALFVGVNQHFQFMLLGCALVSEESASTFSWVMRTWLKAMGGQAPKTVITDHDL VLKSVISEALPLSLHYFCLWHILGKVSDTLNHVIKQNEKFMPKFEKCLNRSWTDEEFEKR WRKLVDKFDLREVELVHSLYEDRVKWAPTFIRDVVLAGMSTVQRSESVNSFFDKYVHKKT TIQEFVKQYESILQDRYEEEAKADSDTWNKQPALRSPSPFEKHLAGLYTHAVFKKFQSEV VGATACGPKREKQDEIVLTYRVQDFEKTQEFIVTLDEMKSEISCICHLFEYKGYLCRHAL IVLQICAVSSIPPQYILKRWTKDAKSKYSMTDGSEDVQSRFQRYNELCHRAMKLSEEGSL SQESYSFALRALDDAFGSCVTFNNSNKNMLEAGTSSASGLLCIEDDNQSRSMSKTNKKKN NFTKKRKVNSEPDVMAVGAADSLQQMDKLNSRPVTLDGYFGPQQSVQGMVQLNLMAPTRD NYYANQQTIQGLGQLNSIAPTHDGYYGAQPTMHGLGQMDFFRSPSFSYGIRDEPTVRSSQ LHDDASRHP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g043270.3.1
Transcript Infomation	FAR1 (AHRD V3.3 *** A0A178UYQ0_ARATH)
Sequence	ACTAAAAAACAAAAATTAAAAGAGAGTCTAACAATTTATTTAGACAGTCTTTATTATGTG TTGGGTGGTTAAAAATGTAGGAAAAGAAAATAAAAATCACGCGCTGCAGTGGCGTTGGTA AGAAGAAGAGGAAACCCTAAATCAGGAGAAAGAAAAAGACTCCACTCGCCATTAGACATC GCGTGAATTCTCAGTTGCAGAATCGCAGATCGAGTGTGTGAATGTGCGTGCGTGAAACTA AGATACATACAGGTTGAATGTGGTTAGATTTCAAGTAAGCACTTCTGATATATAGACTGG AAGCTGCAATTTCAGTCGCTCTCACCTGCAGCTGGAGTATTCCATTATATACCCTCTAAA CTTGGAGGGAGGCATTTTACATTCAACTGATTCAAATCCCTGATGGATCGGAGGTGGTCA GGGTTCTTCATCTTCAGGTATCAGTAAAAGAGAAATCTATAGGCTTTCAATTGTTCAGCA GCATGGATATAGATCTTCGTCTGCCTTCTCAAGACCATGATAAGGAAGAAGAAGAAGAGG AACAAAATGGAATTATAAATATGCTTGACAATGAAGAAAAAATACATGGTGATGACGGAA TGCATGGGATGTTGGTTATTGAAGAGAAGATGCATGCAGAAGATAGAGGGGATATGAACA CTCCCGTAGGAACTATGATAGACTTTAAGGAGGATGTGAACCTTGAACCGCTGGCTGGCA TGGAATTTGAGTCACATGGTGAGGCTTATGCCTTTTATCAAGAGTATGCTCGGTCGATGG GATTCAATACAGCCATACAAAACAGCCGTCGCTCAAAGACGTCAAGGGAATTCATTGATG CAAAATTCGCATGTTCTAGATATGGAACTAAACGGGAATATGAGAAGTCTGCAAATCGGC CACGTAGTAGGCAAGGAAACAAACAGGATCCAGAAAATGCTACTGGTCGGCGAGCATGTG CAAAGACAGATTGCAAAGCAAGTATGCATGTGAAAAGAAGGCCCGATGGGAAATGGATAA TTCATAGATTCGAGAAAGAACATAATCATGAACTTCTACCTGCCCAAGCTGTCAGTGAAC AAACAAGAAGAATGTATGCTGCAATGGCAAGACAATTTGCTGAATACAAAAATGTTGTTG GTCTGAAAAGTGACACAAAAGTTCTATTTGACAAAGGTCGAAATTCAGCAATTGAAGGGG GAGACATAAGTGTTCTATTAGAGTTCTTTATTCAGATGCAAAATCTTAATTCCAACTTCT TTTATGCTGTTGATGTGGGTGAAGATCAACGTGTAAAGAACTTGTTCTGGGTTGATGCCA AAGCTAGGCATGATTATGTGAATTTCAGCGATGTTGTCTCTTTTGATACTACCTATGTCA GAAACAAATATAAGATGCCCCTGGCTCTTTTTGTTGGGGTCAATCAGCATTTTCAGTTCA TGCTACTTGGATGTGCTTTGGTCTCTGAAGAGAGTGCGTCAACATTTTCTTGGGTAATGC GGACATGGTTGAAGGCAATGGGCGGTCAAGCTCCGAAGACAGTGATCACCGATCATGACC TGGTATTGAAGTCAGTCATTTCAGAGGCTTTGCCACTATCCCTCCATTATTTCTGTTTAT GGCATATCCTGGGAAAGGTGTCTGATACACTGAATCATGTCATCAAACAGAATGAAAAGT TTATGCCTAAGTTCGAGAAATGTCTTAACAGGTCATGGACAGATGAGGAGTTTGAAAAGA GGTGGAGAAAACTAGTTGATAAATTTGATCTCAGAGAAGTTGAATTGGTTCATTCACTGT ATGAAGATCGGGTGAAATGGGCCCCTACATTTATAAGGGATGTGGTTTTAGCGGGAATGT CAACGGTTCAACGATCAGAGAGTGTAAACTCTTTCTTTGACAAATATGTACATAAGAAAA CTACCATCCAGGAGTTTGTAAAGCAATATGAATCAATATTACAAGATAGGTATGAGGAGG AGGCAAAGGCAGATTCTGATACATGGAACAAACAACCTGCTTTGAGATCCCCATCCCCAT TTGAGAAGCACTTGGCGGGGCTTTATACACATGCTGTATTTAAGAAATTCCAGTCTGAGG TTGTGGGTGCAACTGCTTGTGGTCCTAAAAGAGAGAAGCAAGATGAGATAGTCTTAACAT ATAGAGTTCAAGATTTTGAGAAGACTCAAGAGTTCATTGTTACATTGGATGAAATGAAGT CAGAAATATCTTGTATTTGTCATTTGTTTGAATATAAAGGCTACCTTTGTAGACATGCAT TGATAGTTCTCCAAATATGTGCTGTTTCCTCTATCCCACCACAATATATTTTGAAGCGAT GGACAAAAGATGCGAAGAGCAAGTACTCTATGACGGATGGATCTGAAGATGTGCAGTCAA GGTTCCAGAGATATAATGAGCTATGTCATCGGGCTATGAAATTGAGTGAAGAAGGGTCGT TATCTCAAGAGAGCTATAGTTTTGCTCTTCGTGCACTTGATGACGCGTTTGGGAGTTGTG TAACTTTTAATAACTCAAACAAGAACATGTTAGAAGCTGGCACATCATCAGCATCTGGTC TTCTCTGTATTGAAGATGATAACCAAAGTAGGAGTATGAGCAAGACAAACAAGAAGAAAA ATAACTTCACTAAGAAACGCAAGGTGAACTCGGAGCCAGATGTTATGGCTGTTGGGGCAG CAGACAGCTTGCAACAAATGGACAAATTGAACTCCAGGCCTGTGACTCTTGATGGTTATT TTGGCCCGCAACAAAGTGTTCAAGGAATGGTACAGTTAAACTTGATGGCACCAACTCGTG ATAACTACTATGCAAACCAACAGACTATTCAGGGCCTTGGACAGTTGAACTCTATAGCTC CTACACATGATGGCTATTATGGTGCTCAGCCAACAATGCATGGGCTGGGCCAAATGGACT TTTTCCGCTCTCCAAGTTTCTCATATGGCATTCGGGATGAACCCACTGTAAGATCTTCTC AATTGCACGACGATGCATCTAGACATCCTTGAGGATCACCTTTGTCATTAAATAGGAAAG AGGGGCTGCACATTTCAACTTTCATTACAGGCTGTTTATGGAAGTACAACCAACAGGAAG AATGTTGTAGTATTTGTTTGTAAAATAAAAGGGGATCTTCAATGTAGGCAGTGCTTTTAT TTTTTGTACCTTTGTTCTTTGATAAACAAACTCTTTAGGTTAATCTCACCCTGTTAAGGC TGTTGTGAGATGTATTGGTTACAGCAAGTAAAGATTATTGGTGTGAAGATATATGTACAC TTTTCTTCAAGTGAAAGCGAATGAGTTGTAAATGTAGGCATAAAAAATGGACAGAAGCTG GATGAAGTAAAATTATTACTGCTCTGAAGCATGTTTTAT