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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g042930.3.1

CDS Infomation

Rhomboid family protein (AHRD V3.3 *** B9HXC8_POPTR)

Sequence

ATGGAGAGAGGAAGAGGACAGTGGGGATCAGTATTTCGTGGTATGATTCCTCTGCTAGGG
CTGCATACGCTGAGTGAGTATTCCAGATTAGACAGAAAACCCCCTATTACTGCTGCACTT
CTTGCCGCTAATACCATTATTTACTTGAGGCCCAAATTTATTCATCCTTTCCTTCCCACA
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GGTGTCTCATTCCTTGGCCACCTTGGGGGAATACTAGCTGGCCTTCTGTATTTGCAATTA
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CTGAGCTGGCCTTTAAGATTAGTGAAGAGCTTATTTCGACATCGACCTAGAATTACTGGG
AGAGGAACTGCTGGTGCGAGGATTGCACGAGATACACTTCATACGTGGAGATGTGATGCA
TGTACATTTGATAATTCAGGTAGGCTGAACGTTTGTGAAATGTGTGGCACAGGTCGTACC
GGTGATGCACCATCATCCCCTGGTTCAACAAGTGAGATACATGATCTATCTTTGGAAGAA
TTAAGACGTAGGAGGATTCAACGATTTGGTAGATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g042930.3.1

PEP Infomation

Rhomboid family protein (AHRD V3.3 *** B9HXC8_POPTR)

Sequence

MERGRGQWGSVFRGMIPLLGLHTLSEYSRLDRKPPITAALLAANTIIYLRPKFIHPFLPT
IDQVWFNPHLILKYTDLKRFFLSPFFHVNESHLVYNMLSLLWKGIQLETSMGSAEFASMV
ATLVAMSQGVTLLLAKSLLLFFDYERPYYNEYSVGFSGVLFAMKVIVNSQSDEYTSVHGL
MVPTRYAAWAELVLVQMFVPGVSFLGHLGGILAGLLYLQLKASYSGLNPVRQFMRGFSHA
LSWPLRLVKSLFRHRPRITGRGTAGARIARDTLHTWRCDACTFDNSGRLNVCEMCGTGRT
GDAPSSPGSTSEIHDLSLEELRRRRIQRFGR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g042930.3.1

Transcript Infomation

Rhomboid family protein (AHRD V3.3 *** B9HXC8_POPTR)

Sequence

ATAATTTATCCAAATGAAAACAATATATCTTTTCAAGATCCAAAAAATATATTTTTTTAA
AATCTAATATTTTCTTTTTTTCCAAAAAAAACAAACTAAAATTGACTAATATTTTTTTTA
AAAAAATTAATTATCTCAATTTTTTTTTTGGAAAAAAAAGAGAAAATACTAGAAATTAAA
ATATATTTTTTGAACTTGATAAGATATATTATTTTCGTTTAGATAAATTATGGGACAAAA
TTAATAGAGGTGAATTTTTATTTCATTTAATAAGAAAATGACACATAATGAATACTTTTT
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AGAGAGGAAGAGGACAGTGGGGATCAGTATTTCGTGGTATGATTCCTCTGCTAGGGCTGC
ATACGCTGAGTGAGTATTCCAGATTAGACAGAAAACCCCCTATTACTGCTGCACTTCTTG
CCGCTAATACCATTATTTACTTGAGGCCCAAATTTATTCATCCTTTCCTTCCCACAATCG
ATCAAGTTTGGTTTAATCCTCACCTTATTCTCAAGTACACAGACCTCAAGCGATTCTTCC
TGTCGCCGTTCTTCCACGTAAATGAATCTCACCTGGTGTACAATATGCTTTCACTTTTGT
GGAAGGGTATTCAACTGGAGACATCGATGGGTAGTGCAGAGTTTGCATCAATGGTTGCAA
CCTTAGTTGCTATGTCCCAAGGTGTTACACTGTTGCTTGCAAAATCACTTCTGCTGTTCT
TTGATTACGAGAGACCCTACTATAATGAATACTCTGTGGGTTTTTCTGGTGTCCTCTTCG
CCATGAAAGTTATCGTCAATTCACAATCAGATGAGTATACCTCTGTACATGGACTTATGG
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TCTCATTCCTTGGCCACCTTGGGGGAATACTAGCTGGCCTTCTGTATTTGCAATTAAAAG
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GCTGGCCTTTAAGATTAGTGAAGAGCTTATTTCGACATCGACCTAGAATTACTGGGAGAG
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ATGCACCATCATCCCCTGGTTCAACAAGTGAGATACATGATCTATCTTTGGAAGAATTAA
GACGTAGGAGGATTCAACGATTTGGTAGATAATAAGGCAAATTGTTATCAAGTTTAGATG
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GAACCAAGTGAGTTCATCATAATTCATGAACTACTTTCTCTGTTCACTATTATATCTCCA
ATATGAAGTTTGCACCCGCTTAAAAGAAAAATATAGATATATAATTATTCTTTTATTTGC
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CATCAAATTACATGAGATTGGGAATTGGGGTCTAGTCTTAGATTTGGTGAATAATTTGAA
AATATAGGCTAGAAGCTGGAGAAATTTATATATTTTTCGTCTTAAAATGCCTTTTTTGTT
AAAGAGAATTGGCAGCGCTTCTACAACGAATCAAGCAGGTTCAGTAGCAACGGATAACGG
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CAGCAACTATGCTAGCTCACGATCGAGTAGTAAAGACATAAAGAGAATTGGCAGCGCTTC
TACAACGAATCAAGCAGGTTCAGTAACGACGGATAACGATACTCACCTGATCGGACTTTG
CTTTTTCAGGCTCCAAGCTAATGAAGGGCTATTCCATATCAACAACTATGCTAGCTCGCT
ATCGAGTAGTAAAGACAAAGGGAAAGGTTGGACAACATTGTGTGTTCCAGACCTGATTGA
GAAAGAGCGCATGTATGTTATACGTGGAACCGAGTTCGCACTCCCATGTTTTTAGCTTAA
CAGTAAGTAAAAGTGAAATAAGTAGTTAACATAGAAGTGTTCAAGCTAAAAAGGGTACTT
ATTTTGAACTGAAATGGAGGGAGTAGTTGCAAAGACAAGAGACATTGAACTCTTTGCCTA
CCATTACTCGATTAAAGACTTTAAAAGCATGAAGTTCTTTTTATTTGTTAAGTGTATTTA
CCTTGAATGTGTACTTCACCTAGAATCCTAGACCTAAAACCTGGTAAAATCTTCTAATCT
TGTAACATTAGTTCTTTAACTATTGCATTGTGCATTTCTTAACAGGCAGAACTGCTACTG
CTGTCTCAAATGCGCAAATAAAAACATGAATCACATTGATAAAGTATTAAAGATGAGCAG
ATTAAGTACCATAAGTGAAATTCAAGAACTGCGAAAGAAAGCCAGTAGAGGTAATTAAAA
ACAACAGAAGAAACTCAGTATATTGAGTTTGGAAGAGACGTTCCTTTGGAAACAGGAAAA
AGAACCACGGGAATGGAACTTAGAGCATTTATAAATGTTAGTGATTTCATAATGTGCTGT
CTGAATAATCTACCACAATCTTCCCGGAACTTTGTCATGCCTGTCAATTGTTGCAGAATT
CGACTCAAAGCTAGCAGCTTTTCCTCAACG