Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g042160.3.1

CDS Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G42950.1)

Sequence

ATGGTTGAGACTCTAACACCATCGTCTTCATCCCGGTGGTCTCAATTTCACCACCCACGT
CCATGGATCACGTCACTGTTCTCTAACCCCAAAACCCTTTTGACTATTCTATGGATCGCC
GTTATATTTTCTGTTCTATTCTGGCAAAAGGATGCTACCACCGGAATCTTGTTTTTCCGG
CGGGATTTTCCGGTGAGGGAGATGCCGAAGCTGAGGACGGTGGCGTTTAATTTGACGGAG
TTTGGAGGGGTTGGTGACGGAGTTACATTGAATACGGCGGCATTTGAGAGGGCAGTGTTG
GCTATTTCTAAGCTTGGTAAGAAAGGTGGTGGACAGCTCAATGTGCCACCTGGATATTGG
TTAACGGCACCCTTTAATCTTACTAGTCATATGACTCTCTTCCTTGCTGAGGGAGCTGTG
ATATTGGGTGTTGACGATCAGAAGTACTGGCCTCTCATGCCTCCCTTGCCTTCATATGGG
TATGGGAGAGAACATATTGGACCACGATATGGAAGTTTAATCCATGGCCAGAATCTCAGA
GATGTTGTAATCACAGGGCATAATGGTACCATTAATGGGCAGGGTCAAGCATGGTGGAAG
AAGTACAAGCAGAGGCTTCTTAACAATACCAGAGGGCCGCTTGTCCAGATAATGTGGTCT
AGTGACATAGTGATCTCTAATATAACATTGCGTGATTCTCCGTTTTGGACACTTCATCCA
TATGACTGCAAAAATGTAACAATCAAGAATGTCACAATTCTGGCACCCATCTTCAATGCT
CCGAATACTGATGGCATAGATCCAGATTCATGTGAAGATATGTTGATCGAGAACTGTTAC
ATCAGTGTTGGAGATGATGGAATTGCAATAAAGAGTGGTTGGGATCAGTATGGGATTTCT
TATGGACGGCCTTCAAAAAATATAATTATCCGAAATCTTGTAGTTCGTTCAATGGTCAGT
GCAGGCATATCGATAGGAAGTGAGATGTCTGGTGGAGTGTCAAATGTCATTGTGGAAAAC
GTACATGTCTGGAACTCAAGGCGTGCTGTTCGCATCAAAACAGCAGCTGGCAGAGGAGGA
TATGTACGACACATAGCATACAGGAACTTGACATTTGTAAACGTTAGGGTGGGGATCGTC
ATCAAGACAGATTACAATGAACATCCTGCAGGGGAGTTTAATCCCAAAGCTCTACCAGTA
CTAGAGGACATAAGCTACACATCAATACACGGTGAGGGAGTTCGTGTACCCGTTCGTATC
CATGGAAATTCTGAAATTCCAGTGAAAAATTTAACTATCAGAGATATGTCAATTGGGATA
ACATACAAGAAGAAACACATATTTCAGTGCTCTCACGTTCAAGGTCGTGTTATAGGTACC
GTCTTCCCCGCCCCCTGTGAGAACCTTGACCTATATGACGAGCAAGGACATCTGGTCCGA
CGTTCTGGCTCTCAGAATGCATCAGACATAGATTACGACTTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g042160.3.1

PEP Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G42950.1)

Sequence

MVETLTPSSSSRWSQFHHPRPWITSLFSNPKTLLTILWIAVIFSVLFWQKDATTGILFFR
RDFPVREMPKLRTVAFNLTEFGGVGDGVTLNTAAFERAVLAISKLGKKGGGQLNVPPGYW
LTAPFNLTSHMTLFLAEGAVILGVDDQKYWPLMPPLPSYGYGREHIGPRYGSLIHGQNLR
DVVITGHNGTINGQGQAWWKKYKQRLLNNTRGPLVQIMWSSDIVISNITLRDSPFWTLHP
YDCKNVTIKNVTILAPIFNAPNTDGIDPDSCEDMLIENCYISVGDDGIAIKSGWDQYGIS
YGRPSKNIIIRNLVVRSMVSAGISIGSEMSGGVSNVIVENVHVWNSRRAVRIKTAAGRGG
YVRHIAYRNLTFVNVRVGIVIKTDYNEHPAGEFNPKALPVLEDISYTSIHGEGVRVPVRI
HGNSEIPVKNLTIRDMSIGITYKKKHIFQCSHVQGRVIGTVFPAPCENLDLYDEQGHLVR
RSGSQNASDIDYDF*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g042160.3.1

Transcript Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G42950.1)

Sequence

TCTAACTCTAATATAACATATCACAAAATATCTATGCCACCTAAATATCAGGCTACATGA
ATTCTTGACCTTGTATGATGAAAAAATGTTAAAAAGATATACCTCTTTATAAATTTGGTA
ATAACATGAGTGAATCTGTTAGCCTTTTAATATAATTAGCGAAAAATATAATCAATAAAT
AAAAATAGAATGATATTTTTGACTCTTTTTCATAATTAAGTTGACAGAGAAGTATTTTTT
AAAAAATTAAAACTATATTACATTAACAAATATTATAATTATAATGGAACATGTCTTTTA
ATTAGGGCAAATTGTCAGCAAGTAGAACAAAAAAGAACATAACACCAACTGTTTTCAAAT
TAAGGCAATACTTGCTTAGAATGCAATTCATCAACATTTACCTAACCCCTCACTGATCCA
GACTGCTACACTTCACCTTCCAAATTCATAATTCACTTCATATTATTGTTTTTTGCTAAT
ATACTTTCATGCACACAATCACATTTCTCCTATCCACACTTTGAAAAAATTCGAATTTTC
TACATTATGGTTGAGACTCTAACACCATCGTCTTCATCCCGGTGGTCTCAATTTCACCAC
CCACGTCCATGGATCACGTCACTGTTCTCTAACCCCAAAACCCTTTTGACTATTCTATGG
ATCGCCGTTATATTTTCTGTTCTATTCTGGCAAAAGGATGCTACCACCGGAATCTTGTTT
TTCCGGCGGGATTTTCCGGTGAGGGAGATGCCGAAGCTGAGGACGGTGGCGTTTAATTTG
ACGGAGTTTGGAGGGGTTGGTGACGGAGTTACATTGAATACGGCGGCATTTGAGAGGGCA
GTGTTGGCTATTTCTAAGCTTGGTAAGAAAGGTGGTGGACAGCTCAATGTGCCACCTGGA
TATTGGTTAACGGCACCCTTTAATCTTACTAGTCATATGACTCTCTTCCTTGCTGAGGGA
GCTGTGATATTGGGTGTTGACGATCAGAAGTACTGGCCTCTCATGCCTCCCTTGCCTTCA
TATGGGTATGGGAGAGAACATATTGGACCACGATATGGAAGTTTAATCCATGGCCAGAAT
CTCAGAGATGTTGTAATCACAGGGCATAATGGTACCATTAATGGGCAGGGTCAAGCATGG
TGGAAGAAGTACAAGCAGAGGCTTCTTAACAATACCAGAGGGCCGCTTGTCCAGATAATG
TGGTCTAGTGACATAGTGATCTCTAATATAACATTGCGTGATTCTCCGTTTTGGACACTT
CATCCATATGACTGCAAAAATGTAACAATCAAGAATGTCACAATTCTGGCACCCATCTTC
AATGCTCCGAATACTGATGGCATAGATCCAGATTCATGTGAAGATATGTTGATCGAGAAC
TGTTACATCAGTGTTGGAGATGATGGAATTGCAATAAAGAGTGGTTGGGATCAGTATGGG
ATTTCTTATGGACGGCCTTCAAAAAATATAATTATCCGAAATCTTGTAGTTCGTTCAATG
GTCAGTGCAGGCATATCGATAGGAAGTGAGATGTCTGGTGGAGTGTCAAATGTCATTGTG
GAAAACGTACATGTCTGGAACTCAAGGCGTGCTGTTCGCATCAAAACAGCAGCTGGCAGA
GGAGGATATGTACGACACATAGCATACAGGAACTTGACATTTGTAAACGTTAGGGTGGGG
ATCGTCATCAAGACAGATTACAATGAACATCCTGCAGGGGAGTTTAATCCCAAAGCTCTA
CCAGTACTAGAGGACATAAGCTACACATCAATACACGGTGAGGGAGTTCGTGTACCCGTT
CGTATCCATGGAAATTCTGAAATTCCAGTGAAAAATTTAACTATCAGAGATATGTCAATT
GGGATAACATACAAGAAGAAACACATATTTCAGTGCTCTCACGTTCAAGGTCGTGTTATA
GGTACCGTCTTCCCCGCCCCCTGTGAGAACCTTGACCTATATGACGAGCAAGGACATCTG
GTCCGACGTTCTGGCTCTCAGAATGCATCAGACATAGATTACGACTTTTGAAATGGTTTC
AAATTTCCACATTTTCTAGGGCCAATTTTCCCAGTAGCCAGCCTCTGATTTTTATGTCTA
TATTTTTTAATGTTCAGTCCAACTACTCATTGCCCAGTCAGTCATTTTCTAGTTTTTCTT
TTTCTAGACTTGTAATATTCCTTTTCCACTGTACATAGAACAATGAAATCCAGCTTTATG
TATTCAAAAATTCCAACAGCTAATTAAACTAAGTTTGTATGAAATGTGAAAGCAGCACGA
AGTTTCCACTCAA