Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g041970.3.1
CDS Infomation	Subtilisin-like protease (AHRD V3.3 *** W9R6D5_9ROSA)
Sequence	GATCCTCTCTCTCAGTCGCATTTACCGGCGACTGTCTCCTCTTCTGTTCTTGCTTTTCCG ATGGGTTCTCTTTTCTGTTTCTCTCTCATTGCTTTTCTCCTTGTTCTTCACCCATGTTTC GCAAAGAAAACTTACATTGTTCATGTGAAACATCAACAAAAGCCGCCTTCTTATTCTACT CATCATGATTGGTACGATGCTCAGTTGAAATCTCTTTCTTCTTCTTCCAACTCTGAATCT CTTCTTTACTCTTACGATACTGCTTATCCTGGATTTGCTGCTTCTCTTGACCCCCATGAG GCTGAATTGCTCCGACAGTCTGAGGATGTAGTTGGGGTGTATGAGGATACTGTTTATACA CTTCATACTACTCGGACCCCTGAGTTTCTTGGGTTGGATAATGAGTTGGGGGTTTGGGCT GGGCATACTCAACAAGAGCTTAATAGTGCTGCTCAGGATGTTATTATTGGAGTGCTTGAT ACCGGTGTTTGGCCTGAATCTAAGAGTTTTAGTGATGTGGGTATGCCTGATGTGCCGTCC AGATGGCGTGGGGAATGTGAATCTGGACCTGATTTCGATCCAAAGGTACATTGCAACAAG AAACTGGTTGGTGCGAGATTTTTCGCTAAAGGTTACCGTATGTCGTCTTCTAGTTCATTT GCGAATCAACCCAGACAGCCGGAATCGCCTCGGGATCAGGACGGTCATGGCACCCATACA GCCAGTACCGCCGCTGGTGCACCAGTGGGTAACGCTAGCCTTTTTGGTTATGCTAGTGGA ATCGCTCGTGGTATGGCTCCTCGTGCCCGTGTAGCTACTTACAAGGTGTGTTGGCCTACT GGTTGTTTTGGGTCTGATATTCTTGCAGGTATGGACCGTGCTATTTTGGATGGGGTTGAT GTGTTATCTTTATCTTTGGGTGGTGGATCAGGTCCTTATTATCGTGATACCATTGCTATT GGTGGTTTCTCTGCAATGGAGAAAGGAATTGTTGTGTCGTGTTCTGCAGGTAACAGCGGT CCTGCTAAAGCTTCACTTGCAAATACAGCTCCATGGATTATGACTGTTGGTGCTGGTACC ATAGACCGTGATTTCCCTGCTTATGCTGTTTTAGGTAATGGCAAAAAGATTACTGGTGTG TCTTTATACAGTGGTAAAGGTATGGGTAAAAAGCTAGTTAGCTTAGTTTACAACACAGAT AGTAGCTCTAGCCTTTGCTTGCCTGGTTCCCTAAACCCTAAAGATGTTCGTGGGAAGATA GTGGTATGTGACAGAGGGACTAATGCTAGAGTTGAGAAGGGTCTAGTTGTGAAAGAAGCT GGTGGGGTTGGGATGATATTGGCCAACACCGTCGAGAGTGGTGAGGAGCTGGTGGCAGAC AGTCATTTGTTACCTGCGGTGGCTGTTGGTAGGAAATTAGGAAATGCGATTAGGCAGTAT GTGAAGAGTGAGAGGAATCCGACTGCATTGCTCAGCTTTGGAGGTACGGTGGTAAACGTT AAGCCATCGCCGGTAGTGGCAGCGTTTAGCTCAAGAGGGCCTAATACAGTGACTCCACAG ATATTGAAGCCTGATTTAATTGGACCTGGAGTTAACATATTGGCAGCTTGGTCTGAGGCT ATTGGCCCTACTGGCCTTGAGAAAGATACCAGGAGGACCAAGTTCAACATCATGTCTGGT ACATCCATGTCCTGTCCTCATATCAGTGGACTGGCTGCACTGCTGAAAGCAGCACATCCT GAATGGAGTCCAAGTGCAATCAAATCTGCACTTATGACAACTGCCTATAATCGCGACACC ACTAACTCCCCTCTTCGTGATGCCGAAGGTGATCAACTTTCCACTCCATGGGCTCATGGA GCAGGTCATGTTGATCCTCACAAGGCACTCTCCCCGGGTCTTGTCTATGATATTAGGCCT AAGGAGTACATCAAGTTCTTATGCTCGTTGGACTATGAGATGGAACACATACAAGCCATT GTCAAGCGCCCAAATGTCACTTGTGCTAAGAAATTTTCAGATCCTGGGCAGATCAACTAC CCATCGTTTGCAGTTTTGTTTGGCAAATCAAGGGTTGTTCGTTACACCCGTACCTTGACC AATGTGGGAGCTGCAGGCTCTACCTATGAGGTAGTCATTGATGCTCCCCCGTCTGTTACT GTGACTGTGAAGCCATCAAAGCTTGTATTCAAAAAGGTAGGAGAGAGGCTGCGATACACA GTTACATTCGTGTCAAAGAAGGGTGTTAGCACGATGAGCAAGACTACATTTGGTTCGATA TCTTGGAATAATGCTCAAAACCAAGTTAGAAGTCCAGTTTCATATTCGTGGTCACAATTA TTTAACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g041970.3.1
PEP Infomation	Subtilisin-like protease (AHRD V3.3 *** W9R6D5_9ROSA)
Sequence	DPLSQSHLPATVSSSVLAFPMGSLFCFSLIAFLLVLHPCFAKKTYIVHVKHQQKPPSYST HHDWYDAQLKSLSSSSNSESLLYSYDTAYPGFAASLDPHEAELLRQSEDVVGVYEDTVYT LHTTRTPEFLGLDNELGVWAGHTQQELNSAAQDVIIGVLDTGVWPESKSFSDVGMPDVPS RWRGECESGPDFDPKVHCNKKLVGARFFAKGYRMSSSSSFANQPRQPESPRDQDGHGTHT ASTAAGAPVGNASLFGYASGIARGMAPRARVATYKVCWPTGCFGSDILAGMDRAILDGVD VLSLSLGGGSGPYYRDTIAIGGFSAMEKGIVVSCSAGNSGPAKASLANTAPWIMTVGAGT IDRDFPAYAVLGNGKKITGVSLYSGKGMGKKLVSLVYNTDSSSSLCLPGSLNPKDVRGKI VVCDRGTNARVEKGLVVKEAGGVGMILANTVESGEELVADSHLLPAVAVGRKLGNAIRQY VKSERNPTALLSFGGTVVNVKPSPVVAAFSSRGPNTVTPQILKPDLIGPGVNILAAWSEA IGPTGLEKDTRRTKFNIMSGTSMSCPHISGLAALLKAAHPEWSPSAIKSALMTTAYNRDT TNSPLRDAEGDQLSTPWAHGAGHVDPHKALSPGLVYDIRPKEYIKFLCSLDYEMEHIQAI VKRPNVTCAKKFSDPGQINYPSFAVLFGKSRVVRYTRTLTNVGAAGSTYEVVIDAPPSVT VTVKPSKLVFKKVGERLRYTVTFVSKKGVSTMSKTTFGSISWNNAQNQVRSPVSYSWSQL FN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g041970.3.1
Transcript Infomation	Subtilisin-like protease (AHRD V3.3 *** W9R6D5_9ROSA)
Sequence	GATCCTCTCTCTCAGTCGCATTTACCGGCGACTGTCTCCTCTTCTGTTCTTGCTTTTCCG ATGGGTTCTCTTTTCTGTTTCTCTCTCATTGCTTTTCTCCTTGTTCTTCACCCATGTTTC GCAAAGAAAACTTACATTGTTCATGTGAAACATCAACAAAAGCCGCCTTCTTATTCTACT CATCATGATTGGTACGATGCTCAGTTGAAATCTCTTTCTTCTTCTTCCAACTCTGAATCT CTTCTTTACTCTTACGATACTGCTTATCCTGGATTTGCTGCTTCTCTTGACCCCCATGAG GCTGAATTGCTCCGACAGTCTGAGGATGTAGTTGGGGTGTATGAGGATACTGTTTATACA CTTCATACTACTCGGACCCCTGAGTTTCTTGGGTTGGATAATGAGTTGGGGGTTTGGGCT GGGCATACTCAACAAGAGCTTAATAGTGCTGCTCAGGATGTTATTATTGGAGTGCTTGAT ACCGGTGTTTGGCCTGAATCTAAGAGTTTTAGTGATGTGGGTATGCCTGATGTGCCGTCC AGATGGCGTGGGGAATGTGAATCTGGACCTGATTTCGATCCAAAGGTACATTGCAACAAG AAACTGGTTGGTGCGAGATTTTTCGCTAAAGGTTACCGTATGTCGTCTTCTAGTTCATTT GCGAATCAACCCAGACAGCCGGAATCGCCTCGGGATCAGGACGGTCATGGCACCCATACA GCCAGTACCGCCGCTGGTGCACCAGTGGGTAACGCTAGCCTTTTTGGTTATGCTAGTGGA ATCGCTCGTGGTATGGCTCCTCGTGCCCGTGTAGCTACTTACAAGGTGTGTTGGCCTACT GGTTGTTTTGGGTCTGATATTCTTGCAGGTATGGACCGTGCTATTTTGGATGGGGTTGAT GTGTTATCTTTATCTTTGGGTGGTGGATCAGGTCCTTATTATCGTGATACCATTGCTATT GGTGGTTTCTCTGCAATGGAGAAAGGAATTGTTGTGTCGTGTTCTGCAGGTAACAGCGGT CCTGCTAAAGCTTCACTTGCAAATACAGCTCCATGGATTATGACTGTTGGTGCTGGTACC ATAGACCGTGATTTCCCTGCTTATGCTGTTTTAGGTAATGGCAAAAAGATTACTGGTGTG TCTTTATACAGTGGTAAAGGTATGGGTAAAAAGCTAGTTAGCTTAGTTTACAACACAGAT AGTAGCTCTAGCCTTTGCTTGCCTGGTTCCCTAAACCCTAAAGATGTTCGTGGGAAGATA GTGGTATGTGACAGAGGGACTAATGCTAGAGTTGAGAAGGGTCTAGTTGTGAAAGAAGCT GGTGGGGTTGGGATGATATTGGCCAACACCGTCGAGAGTGGTGAGGAGCTGGTGGCAGAC AGTCATTTGTTACCTGCGGTGGCTGTTGGTAGGAAATTAGGAAATGCGATTAGGCAGTAT GTGAAGAGTGAGAGGAATCCGACTGCATTGCTCAGCTTTGGAGGTACGGTGGTAAACGTT AAGCCATCGCCGGTAGTGGCAGCGTTTAGCTCAAGAGGGCCTAATACAGTGACTCCACAG ATATTGAAGCCTGATTTAATTGGACCTGGAGTTAACATATTGGCAGCTTGGTCTGAGGCT ATTGGCCCTACTGGCCTTGAGAAAGATACCAGGAGGACCAAGTTCAACATCATGTCTGGT ACATCCATGTCCTGTCCTCATATCAGTGGACTGGCTGCACTGCTGAAAGCAGCACATCCT GAATGGAGTCCAAGTGCAATCAAATCTGCACTTATGACAACTGCCTATAATCGCGACACC ACTAACTCCCCTCTTCGTGATGCCGAAGGTGATCAACTTTCCACTCCATGGGCTCATGGA GCAGGTCATGTTGATCCTCACAAGGCACTCTCCCCGGGTCTTGTCTATGATATTAGGCCT AAGGAGTACATCAAGTTCTTATGCTCGTTGGACTATGAGATGGAACACATACAAGCCATT GTCAAGCGCCCAAATGTCACTTGTGCTAAGAAATTTTCAGATCCTGGGCAGATCAACTAC CCATCGTTTGCAGTTTTGTTTGGCAAATCAAGGGTTGTTCGTTACACCCGTACCTTGACC AATGTGGGAGCTGCAGGCTCTACCTATGAGGTAGTCATTGATGCTCCCCCGTCTGTTACT GTGACTGTGAAGCCATCAAAGCTTGTATTCAAAAAGGTAGGAGAGAGGCTGCGATACACA GTTACATTCGTGTCAAAGAAGGGTGTTAGCACGATGAGCAAGACTACATTTGGTTCGATA TCTTGGAATAATGCTCAAAACCAAGTTAGAAGTCCAGTTTCATATTCGTGGTCACAATTA TTTAACTAAAAGGTTGTTCCTTTAATGTAATGTATGGTTTTCCCTTTTTGAATTACCAGC AAAAATTGTGGTAATCAGATGCTGCAAATGGAAGTGTTTTTCTTTTAGCAATCTGAGTGA TAGGGTTCCTCCAAAAAATTTTAGTTTTATGCAATGCAATTATAGCCCTTGCTTGTATGA TATCATGTGAGGTAATGTATTTGTTACTTGTCAAGAAAATTCTTATGTGTTGGGTAAAA