Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g040750.2.1
CDS Infomation

RNA helicase DEAD21
Sequence

ATGGCGGGTGCAGCTCCTGATGGATCCCAATTTGATGCTCGTCAATTTGATTCAAAAATG
ACAGAGTTGCTAAATGCTGAAGGGCAAGAGTTTTTTACCTCATATGACGAGGCTTATGAT
ACTTTTGATGCTATGGAATTGAAGGAGGATCTCCTGAAAGGCATTTATGCATACGGTTTT
GAGAAACCCTCAGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTACCTTTTTGCAAAGGTCTTGATGTG
ATTCAGCAGTCTCAGTCTGGAACGGGAAAGACTGCTACTTTTTGTTCTGGAGTTCTGCAA
CAACTGGACTATGAACTGTTAGGTTGTCAAGCATTGGTCTTGGCACCTACTCGTGAGCTT
GCACAACAAATTGAGAAGGTCATGGAAGCACTTGGACAGTGTCTTAAAGTCAAGGTTCAT
GCGTGTGTGGGAGGTACCAGTGTCCGTGAGGATCAAAGGATCCTTTCAATTGGGGTTCAT
GTTGTTGTGGGAACACCTGGACGTGTGTTTGACATGTTGAGAAGACAGTCTCTCCGCGCT
GATCACATTAAAATGTTTGTATTGGATGAAGCTGATGAAATGCTCTCCAGAGGGTTCAAG
GATCAGATCTATGATATTTTCCAGCTATTGCCTCCTAAGATTCAGGTTGGTGTTTTCTCT
GCCACAATGCCTCCTGAGGCCCTTGAGATCACAAGGAAGTTCATGAACAAACCTGTGAGG
ATTCTTGTGAAACGTGATGAACTGACCTTAGAAGGTATCAAACAGTTTTATGTGAATGTG
GAAAAGGAAGAATGGAAGTTTGACACCCTTTGCGATCTATATGAAACCTTAGCCATCACA
CAGAGTGTTATTTTTGTGAATACTCGTCGCAAAGTTGACTTGTTAACAGAGCAGATGCAA
AGCAAAGACCATACAGTCTCAGCTACCCACGGTGACATGGACCACAAAACTAGGGATGTT
ATAATGCATGAATTCCGAAGTGGTTCCTCTCGTGTTCTCATCACCACTGATCTTTTAGCC
AGAGGAATTGATGTCCAACAAGTCTCCCTCGTCATAAACTATGATCTCCCCACTCAACCT
GAAAATTACCTTCATCGTATTGGACGTAGTGGACGGTTTGGTAGGAAGGGTGTTGCAATC
AATTTTGTAACCATGGATGATGAGAGAATGCTTTCTGACATTCAAAGTTTTTACAACATG
GTGATTGAGGAGCTTCCAGCAAATGTCGCTGATCTCCTATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g040750.2.1
PEP Infomation

RNA helicase DEAD21
Sequence

MAGAAPDGSQFDARQFDSKMTELLNAEGQEFFTSYDEAYDTFDAMELKEDLLKGIYAYGF
EKPSAIQQRGIVPFCKGLDVIQQSQSGTGKTATFCSGVLQQLDYELLGCQALVLAPTREL
AQQIEKVMEALGQCLKVKVHACVGGTSVREDQRILSIGVHVVVGTPGRVFDMLRRQSLRA
DHIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYDIFQLLPPKIQVGVFSATMPPEALEITRKFMNKPVR
ILVKRDELTLEGIKQFYVNVEKEEWKFDTLCDLYETLAITQSVIFVNTRRKVDLLTEQMQ
SKDHTVSATHGDMDHKTRDVIMHEFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTQP
ENYLHRIGRSGRFGRKGVAINFVTMDDERMLSDIQSFYNMVIEELPANVADLL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g040750.2.1
Transcript Infomation

RNA helicase DEAD21
Sequence

CAAGAAGTATATTTAAAATGAAAGCATATTATGAGAGTATTCAATTTAATTAACTTTTGA
ATTTTATATGAATCTATTTATTTTTATATTTCACGTAAAAGATATATTAAAATATAGTAA
AAGAGTTGATAATTTAAAAAAAACATATTCTCATTCGAGGTTGGACATATTGAAACTTAA
TAGCGTAACATTTTGGATAACATTCTGAAAATAAATTTTGACAAATGATAACAATTATCT
TTGATATAAATGCAACTAAATAATCTAAAATACCAGTAAATGTGATTCGTACAAAAATCA
TACAAATTTAAATTGTATATTTGAAAAAGGAACAAAAACGATTGAAAAACTAAATATTCA
AAGGAATTTTATCATATCAATATGAAAAAGAATAATAAGACGTGTAGATATATTTCATTA
GTATTTTTCAGTTACGTTATAATATAATTCTTATATACTAAAGAAAAAAAGTACATCCGA
GTATATGTTGTAATATAAAGATTTAAACTCTTTGATATTCCAATAAAATGTAGAAAGTGA
CATATTAAATACCTGTCCAAACAGAAAAATTACTAAGAAAATATAAATTGACATTTGACA
TATTGATTAATAATGTACTATTCCTCATTTAATAGATTATAGATGTTAAATTTGTTAAGT
TTCATTTCAATCATCATCTCAAAACGATTTTCATAATTAATATATAAGTAAAAATAATAA
AGTGATAAATTACGTTTGGAAATAAAGAGAACTATATAATTAATTGGAAAAAAATAATCC
TTTAATATTTATTTTAAAGACCGCGTGAAGCACGGTCAAATTCCCTAGTATATTAATATA
AATGGTCTTAAGTATAAATATCGTCATGGCATGAAATTTTTTTTTATTCGTGGTTTGATT
TCTTTTTAATTAAATTTAAATCAATAAAATCAATTGTACTTGTTTTTTGCTAATATCAAA
TTAAATGGTTTTCGAATTTGCTAATTTGTACGATTTATTTAAAAGGCAAATATGTTAGTT
ATAATCTCATAAATTCTTGAATTTACTTCAACTTTTCTCGAATTTCCCTTTAGATAGAAA
AATCACAAGCAATATTCCTATTTATGATATTAAAAAGTAAATTAAACTAGGTCTAGAAAA
CTAAGACAAACAAATCCTAACTAGACAATATTTAATTAAAGTATAAAAAAGGGTTAAATT
TAAATAAATTAGGATTCCTACTGTAGTTTTAAATTATTATTCCAACATTTATGAATTTTG
TTGAATGCCTCTTATCGTAACTAGAGGTTTTATGGCAATTTTGGCCTATTTTTGGTGTGA
AATTTTATTTTTACGTAAAACGTTTTTGTTTTTGATTAGGAGAACATGCTTTGAGCACAA
GGAACATAGAGGAAAAAATTGTTATAAATAGTTGTTGAAAAACCCTAACGCACATTATTG
AATTGTATTTTGTCTCTTTCGAACTTTGATCCGAGAAGCTTGGAAAACCCCAACTTCTCT
TTACTTATACTCAACAACAACAACAACTATTTCTCATCTCTTCTTCAGCAGTCTTTCTAG
TCATGGCGGGTGCAGCTCCTGATGGATCCCAATTTGATGCTCGTCAATTTGATTCAAAAA
TGACAGAGTTGCTAAATGCTGAAGGGCAAGAGTTTTTTACCTCATATGACGAGGCTTATG
ATACTTTTGATGCTATGGAATTGAAGGAGGATCTCCTGAAAGGCATTTATGCATACGGTT
TTGAGAAACCCTCAGCAATCCAGCAAAGGGGAATTGTACCTTTTTGCAAAGGTCTTGATG
TGATTCAGCAGTCTCAGTCTGGAACGGGAAAGACTGCTACTTTTTGTTCTGGAGTTCTGC
AACAACTGGACTATGAACTGTTAGGTTGTCAAGCATTGGTCTTGGCACCTACTCGTGAGC
TTGCACAACAAATTGAGAAGGTCATGGAAGCACTTGGACAGTGTCTTAAAGTCAAGGTTC
ATGCGTGTGTGGGAGGTACCAGTGTCCGTGAGGATCAAAGGATCCTTTCAATTGGGGTTC
ATGTTGTTGTGGGAACACCTGGACGTGTGTTTGACATGTTGAGAAGACAGTCTCTCCGCG
CTGATCACATTAAAATGTTTGTATTGGATGAAGCTGATGAAATGCTCTCCAGAGGGTTCA
AGGATCAGATCTATGATATTTTCCAGCTATTGCCTCCTAAGATTCAGGTTGGTGTTTTCT
CTGCCACAATGCCTCCTGAGGCCCTTGAGATCACAAGGAAGTTCATGAACAAACCTGTGA
GGATTCTTGTGAAACGTGATGAACTGACCTTAGAAGGTATCAAACAGTTTTATGTGAATG
TGGAAAAGGAAGAATGGAAGTTTGACACCCTTTGCGATCTATATGAAACCTTAGCCATCA
CACAGAGTGTTATTTTTGTGAATACTCGTCGCAAAGTTGACTTGTTAACAGAGCAGATGC
AAAGCAAAGACCATACAGTCTCAGCTACCCACGGTGACATGGACCACAAAACTAGGGATG
TTATAATGCATGAATTCCGAAGTGGTTCCTCTCGTGTTCTCATCACCACTGATCTTTTAG
CCAGAGGAATTGATGTCCAACAAGTCTCCCTCGTCATAAACTATGATCTCCCCACTCAAC
CTGAAAATTACCTTCATCGTATTGGACGTAGTGGACGGTTTGGTAGGAAGGGTGTTGCAA
TCAATTTTGTAACCATGGATGATGAGAGAATGCTTTCTGACATTCAAAGTTTTTACAACA
TGGTGATTGAGGAGCTTCCAGCAAATGTCGCTGATCTCCTATAAGCTTCCTGCTACAAGA
ATCACTTGTTTGATTTCTCCACATTTTTAAACTCTTTTTTATTAGTCTTGATTTTTATAT
TTAGCTGTTTATTTAGTTTAATAGTCGTAGTGTAATACTGAACTTAGTAATACACATTCA
ATTGTCTAATTCACCATATATATACAAAAATAGGCTCTC