Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g017760.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K0H2_CYNCS)
Sequence	ATGGAAGGTTCTCTCTTCCCTAATAGACCAATCTTGCCAATCCAATCAACAAAACCAACA CCTTTACCACCAACCCAGCGCCTCAAATTGAATCCCACCACCACCACTTCCCCTCTCCCA CCTCTCAAACAACAGCAGCAACAAACCCCTTCTTCTTCTACTTCTACTTCTTTCCCTCTT GATTCTCTTCTCCAACATCTTCTTCATGTTTCATCTTCAAATCCTCCAAGAACTGTTAAA TCTTCAAGAATTAGCAATACCCATTTGTCTACTCTTCCTGTTTCTTTGGAAAATGATGAC ACCCTTTTTGGGAATACGAGGGTTACTGTTCCCAAAATGGAATCTTTTGATGATGGGTCA CTTGAATTTCTCCCTCTTAACTGTAAGTTAATGATTGATTCAATTCTTGAACGCCCTCTT TCTCATATGACTGAATTCTTTGATTCTGTGAAACTTGAGTTGCTTGAAGTTGATTTGATG AGTCTTTTGAAAGGCTTAGATGTTTTAGGCAAATGGGATAGAGCTATTTTGTTGTTTGAA TGGGCTGTTTTGAACATTCATGTTGAAAATGAAAAGCTAGATAGTCAAGTTATTGAATTT ATGGTGAAGGTTTTGGGTAGGGAATCACAGCATTTGGTGACGTCGAAACTGTTTGATGTT ATTCCATTCGAAGATTACTCTCTTGATGTCCGAGCGTGGACAACTGTTCTACATGCTTAT TCTAGGATTGGCAAGTATGACAAGGCAATTGCATTGTTTGAATATGTGAAAGAGAAGGGT TTATCTGTCACTTTGGTAACTTATAATGTTATGTTAGATGTTTATGGTAAAAAGGGTAGG TCTTGGAACAATATTTTACTGCTTTTAGATGAAATGACAAGTAACGGGCTTGAATTTGAC GAGTTCACTTGTAGCACGGTTATTGCTGCTTGTGGAAGGGAAGGGTTGTTGGAGGAAGCG AAAGAGTTTTTTGATGTATTGAAGAGAAAGGGTTATGTTCCGGGAACAGTTACTTACAAT TCTTTACTCCAAGTCTTTGGTAAGGCTGGAATTTACTCGGAGGCATTGCGCGTTCTGAAA GAAATGGAGGAGAATAACTGCCCACCTGATTCGGTGACCTATAATGAGCTTGTGGCAGCT TATGTGAGGGCAGGCTTCCTTGAAGAAGGAGCTGCACTTATAGGCACAATGACACAAAAA GGTGTAATGCCGAATGCTATCACTTATACAACAGTGATAGATGCCTATGGTAAGGCAGGG AAGGAGGACAAAGCCTTGAGCTTTTTCAAGCAAATGAAACAAGCAGGGTGTGTTCCTAAT GTCTGTACATATAACGCAATCATTGGGATGCTGGGAAAGAAATCTCGAGTAGAAGAGATG ATGGACATGATCTCTGATATGAAATTAAATGGATGTGCCCCAAACCGTATTACTTGGAAT ACAATGCTTGCAATGTGTGGTAATAGGGGAATGCAAAAATATGTAAATCACGTTTTCCAT GAGATGAAAAGCTGTGGTTTTGAGCCTGATAGAGACACATTTAATACTTTGATTCGTGCT TATGGAAGGTGTGATTCTGATTTTAATGCTGCAAAGATGTACGATGAGATGATCCAATCA GGATTCACTCCGTGTGTCACAACATACAATGCGCTTCTTAATGCCCTTGCTCGTCGAGGT GATTGGAGAGCAGCTGAATCTGTTTTCTCAGACATGAAAAGTAAGGGCTTTAAGCCCAGT GAAACTACTTACTCTTTGATGCTCCACTGCTATTCCAAGGGAGGGAACGTGAGAGGTGTG GAGAGAATCGCAAAGGAAATTTATGATGGTCATATTTTTCCTAGTTGGATGCTTTTGAGA ACCCTCATTCTTGCAAATTTCAAGTGTAGATCTCTCATGGGTATGGAGAGAGCATTTCAG GAACTACAGAAAAATGGATACAGGCCAGATTTGGTCATATTTAACTCCATGCTTTCCATA TTTGCAAGGAACAAGCTATATGACCGTGCTCATGAGGTGCTGCATTTAATTAGGGAGAAT GGTCTGCAGCCAGATCTTGTTACATATAATAGTTTAATGGATATGTATGCTAGAGCCGGT GAATGTTGGAAAGCTGAGGAAATCCTTAATCGACTGCAGAAGAATGGAGGAAAGCCAGAC CTTGTATCATATAACACTGTCATCAAAGCGTTCTGCAGACAAGGTCGTATGGAGGAGGCC ATACGAGTTTTCTCCCAGATGACAGAAAAAGGAATCCGACCTTGCATTGTTACATATAAT ACATTTATGGCTGGATTTGCAGCTCGAGGAATGTTCTCTGAGGTAAATGAATTGATCAGT TATATGATCCAGCACAAGTGCAGACCAAATGAGCTAACATACAAGACTATTGTTGATGGT TATTGTAAAGCAAAAAGATACCAAGATGCAATGGATTTTGTGTTGAATATTAAAGAAAAA GATAACACCTTTGATGAGGAATCTTTGCAACGATTTGCTTCTCGAGTTAGGGAAAATATG GAATCATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g017760.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K0H2_CYNCS)
Sequence	MEGSLFPNRPILPIQSTKPTPLPPTQRLKLNPTTTTSPLPPLKQQQQQTPSSSTSTSFPL DSLLQHLLHVSSSNPPRTVKSSRISNTHLSTLPVSLENDDTLFGNTRVTVPKMESFDDGS LEFLPLNCKLMIDSILERPLSHMTEFFDSVKLELLEVDLMSLLKGLDVLGKWDRAILLFE WAVLNIHVENEKLDSQVIEFMVKVLGRESQHLVTSKLFDVIPFEDYSLDVRAWTTVLHAY SRIGKYDKAIALFEYVKEKGLSVTLVTYNVMLDVYGKKGRSWNNILLLLDEMTSNGLEFD EFTCSTVIAACGREGLLEEAKEFFDVLKRKGYVPGTVTYNSLLQVFGKAGIYSEALRVLK EMEENNCPPDSVTYNELVAAYVRAGFLEEGAALIGTMTQKGVMPNAITYTTVIDAYGKAG KEDKALSFFKQMKQAGCVPNVCTYNAIIGMLGKKSRVEEMMDMISDMKLNGCAPNRITWN TMLAMCGNRGMQKYVNHVFHEMKSCGFEPDRDTFNTLIRAYGRCDSDFNAAKMYDEMIQS GFTPCVTTYNALLNALARRGDWRAAESVFSDMKSKGFKPSETTYSLMLHCYSKGGNVRGV ERIAKEIYDGHIFPSWMLLRTLILANFKCRSLMGMERAFQELQKNGYRPDLVIFNSMLSI FARNKLYDRAHEVLHLIRENGLQPDLVTYNSLMDMYARAGECWKAEEILNRLQKNGGKPD LVSYNTVIKAFCRQGRMEEAIRVFSQMTEKGIRPCIVTYNTFMAGFAARGMFSEVNELIS YMIQHKCRPNELTYKTIVDGYCKAKRYQDAMDFVLNIKEKDNTFDEESLQRFASRVRENM ES*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g017760.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A118K0H2_CYNCS)
Sequence	ATGGAAGGTTCTCTCTTCCCTAATAGACCAATCTTGCCAATCCAATCAACAAAACCAACA CCTTTACCACCAACCCAGCGCCTCAAATTGAATCCCACCACCACCACTTCCCCTCTCCCA CCTCTCAAACAACAGCAGCAACAAACCCCTTCTTCTTCTACTTCTACTTCTTTCCCTCTT GATTCTCTTCTCCAACATCTTCTTCATGTTTCATCTTCAAATCCTCCAAGAACTGTTAAA TCTTCAAGAATTAGCAATACCCATTTGTCTACTCTTCCTGTTTCTTTGGAAAATGATGAC ACCCTTTTTGGGAATACGAGGGTTACTGTTCCCAAAATGGAATCTTTTGATGATGGGTCA CTTGAATTTCTCCCTCTTAACTGTAAGTTAATGATTGATTCAATTCTTGAACGCCCTCTT TCTCATATGACTGAATTCTTTGATTCTGTGAAACTTGAGTTGCTTGAAGTTGATTTGATG AGTCTTTTGAAAGGCTTAGATGTTTTAGGCAAATGGGATAGAGCTATTTTGTTGTTTGAA TGGGCTGTTTTGAACATTCATGTTGAAAATGAAAAGCTAGATAGTCAAGTTATTGAATTT ATGGTGAAGGTTTTGGGTAGGGAATCACAGCATTTGGTGACGTCGAAACTGTTTGATGTT ATTCCATTCGAAGATTACTCTCTTGATGTCCGAGCGTGGACAACTGTTCTACATGCTTAT TCTAGGATTGGCAAGTATGACAAGGCAATTGCATTGTTTGAATATGTGAAAGAGAAGGGT TTATCTGTCACTTTGGTAACTTATAATGTTATGTTAGATGTTTATGGTAAAAAGGGTAGG TCTTGGAACAATATTTTACTGCTTTTAGATGAAATGACAAGTAACGGGCTTGAATTTGAC GAGTTCACTTGTAGCACGGTTATTGCTGCTTGTGGAAGGGAAGGGTTGTTGGAGGAAGCG AAAGAGTTTTTTGATGTATTGAAGAGAAAGGGTTATGTTCCGGGAACAGTTACTTACAAT TCTTTACTCCAAGTCTTTGGTAAGGCTGGAATTTACTCGGAGGCATTGCGCGTTCTGAAA GAAATGGAGGAGAATAACTGCCCACCTGATTCGGTGACCTATAATGAGCTTGTGGCAGCT TATGTGAGGGCAGGCTTCCTTGAAGAAGGAGCTGCACTTATAGGCACAATGACACAAAAA GGTGTAATGCCGAATGCTATCACTTATACAACAGTGATAGATGCCTATGGTAAGGCAGGG AAGGAGGACAAAGCCTTGAGCTTTTTCAAGCAAATGAAACAAGCAGGGTGTGTTCCTAAT GTCTGTACATATAACGCAATCATTGGGATGCTGGGAAAGAAATCTCGAGTAGAAGAGATG ATGGACATGATCTCTGATATGAAATTAAATGGATGTGCCCCAAACCGTATTACTTGGAAT ACAATGCTTGCAATGTGTGGTAATAGGGGAATGCAAAAATATGTAAATCACGTTTTCCAT GAGATGAAAAGCTGTGGTTTTGAGCCTGATAGAGACACATTTAATACTTTGATTCGTGCT TATGGAAGGTGTGATTCTGATTTTAATGCTGCAAAGATGTACGATGAGATGATCCAATCA GGATTCACTCCGTGTGTCACAACATACAATGCGCTTCTTAATGCCCTTGCTCGTCGAGGT GATTGGAGAGCAGCTGAATCTGTTTTCTCAGACATGAAAAGTAAGGGCTTTAAGCCCAGT GAAACTACTTACTCTTTGATGCTCCACTGCTATTCCAAGGGAGGGAACGTGAGAGGTGTG GAGAGAATCGCAAAGGAAATTTATGATGGTCATATTTTTCCTAGTTGGATGCTTTTGAGA ACCCTCATTCTTGCAAATTTCAAGTGTAGATCTCTCATGGGTATGGAGAGAGCATTTCAG GAACTACAGAAAAATGGATACAGGCCAGATTTGGTCATATTTAACTCCATGCTTTCCATA TTTGCAAGGAACAAGCTATATGACCGTGCTCATGAGGTGCTGCATTTAATTAGGGAGAAT GGTCTGCAGCCAGATCTTGTTACATATAATAGTTTAATGGATATGTATGCTAGAGCCGGT GAATGTTGGAAAGCTGAGGAAATCCTTAATCGACTGCAGAAGAATGGAGGAAAGCCAGAC CTTGTATCATATAACACTGTCATCAAAGCGTTCTGCAGACAAGGTCGTATGGAGGAGGCC ATACGAGTTTTCTCCCAGATGACAGAAAAAGGAATCCGACCTTGCATTGTTACATATAAT ACATTTATGGCTGGATTTGCAGCTCGAGGAATGTTCTCTGAGGTAAATGAATTGATCAGT TATATGATCCAGCACAAGTGCAGACCAAATGAGCTAACATACAAGACTATTGTTGATGGT TATTGTAAAGCAAAAAGATACCAAGATGCAATGGATTTTGTGTTGAATATTAAAGAAAAA GATAACACCTTTGATGAGGAATCTTTGCAACGATTTGCTTCTCGAGTTAGGGAAAATATG GAATCATGA