Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g015800.1.1
CDS Infomation	F-box family protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061F027_THECC)
Sequence	ATGTCGGTAACATTCTTACAGGAACTTCCCGGTGACCAGCCAGCAGATTCTCCGGCATAT TTACAGGGAGTTTCCGGCAACCAGCCAGCAGTTTTACCCTCACAGGGAGTCGCCGGTGAC GAGCCAGCAGTTTTTCCGGCATCCTTACAGGGAGTCGCCGGCAACGCAGATCTTTTATCG GAGATTCTCCTATGGCTACCTCCAAAATCCCTTCTCCGATTCCAAGCCGTTTGTAAAGAC TGGTTTTCGATCATCTCAAGCCGTACATTCCGGCAACTTCACTGCCGTAGAAAACTCACT TCCGGCAAAGTTGACGGACTATTCTTCTGTTGGTGGGTCTATGGTAATAACTATGTCGAC TTTATCCCTCTCAATGGGATACCCAAAAATCAAAAGGGTATGATTCCTTCAACACTCAAA AATATTGCTAAATCTACATCTTCAAAAATTGAACAATTACATTCCTGTAATGGATTGTTC TGTATAAGTTTCAATTTGGGTATTGAAAATTTTGATTATTATGTTTATAACCCTAGTACT AATCAGCATAGATTGATTCCACTCCCATATTTAGGTATAAAAGCTTATGAGATTGTTGTA ATGAATTTGGCTTTTGATCCAATGGTATCTGATTGTTATAAACTCTTATGTGTGATGAAA TTAAATGGGGTTTATGAAATTTCTGTATATTCATCTGAAACTGAAGTTTGGAAAAATTGT ATGGATACGGAGATGAAGATATTGGATGCAAATCAACATTTTTTAGGTCAGGGTGTGTTC TTGAATGGTTGTATGCATTGGGTTAGTGAAATGTCGTCTTTCTTAAGGTTCGATTTGGAT TCGATGTGTTTTAGAGATATGCCTAGTACTGATCTTCCTATTGGAGTGTTGAAAAGGAGT ATAAGGTATTTTGGGGAGTCCGTTGGACATTTGCATCTAATTGAGATACATGAATTTAGG TCGATGAGTTTTGAAGTTCTTGAGATGGAGATTGATTATTCTAAGTGGTTTGTGAAGTAT CGTGTTGATCTTAGTTACATGCATACTACTCATCCATTAATGTTGAGTGAAGAAGTTGAT TTACTAGATGTGAATGGTGGTACTTGCAATGTTGTATGTGTGGTTGTTAATGAGAAGGAA GATACAACGAGGCTTTTGGTAACCACACCAGACGTTATCGTTGAATATGATGCTCATCGT ATGACTATCAAGGAGGTTGCGGATATAGAGATAGCAAAGATCCCTGTTATATGGGAAGAT GTTTCGGTGTTTGAATGGTATGATACACATCAATATGTTGAGACAATGGCTTCTGTTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g015800.1.1
PEP Infomation	F-box family protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061F027_THECC)
Sequence	MSVTFLQELPGDQPADSPAYLQGVSGNQPAVLPSQGVAGDEPAVFPASLQGVAGNADLLS EILLWLPPKSLLRFQAVCKDWFSIISSRTFRQLHCRRKLTSGKVDGLFFCWWVYGNNYVD FIPLNGIPKNQKGMIPSTLKNIAKSTSSKIEQLHSCNGLFCISFNLGIENFDYYVYNPST NQHRLIPLPYLGIKAYEIVVMNLAFDPMVSDCYKLLCVMKLNGVYEISVYSSETEVWKNC MDTEMKILDANQHFLGQGVFLNGCMHWVSEMSSFLRFDLDSMCFRDMPSTDLPIGVLKRS IRYFGESVGHLHLIEIHEFRSMSFEVLEMEIDYSKWFVKYRVDLSYMHTTHPLMLSEEVD LLDVNGGTCNVVCVVVNEKEDTTRLLVTTPDVIVEYDAHRMTIKEVADIEIAKIPVIWED VSVFEWYDTHQYVETMASV*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g015800.1.1
Transcript Infomation	F-box family protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061F027_THECC)
Sequence	ATGTCGGTAACATTCTTACAGGAACTTCCCGGTGACCAGCCAGCAGATTCTCCGGCATAT TTACAGGGAGTTTCCGGCAACCAGCCAGCAGTTTTACCCTCACAGGGAGTCGCCGGTGAC GAGCCAGCAGTTTTTCCGGCATCCTTACAGGGAGTCGCCGGCAACGCAGATCTTTTATCG GAGATTCTCCTATGGCTACCTCCAAAATCCCTTCTCCGATTCCAAGCCGTTTGTAAAGAC TGGTTTTCGATCATCTCAAGCCGTACATTCCGGCAACTTCACTGCCGTAGAAAACTCACT TCCGGCAAAGTTGACGGACTATTCTTCTGTTGGTGGGTCTATGGTAATAACTATGTCGAC TTTATCCCTCTCAATGGGATACCCAAAAATCAAAAGGGTATGATTCCTTCAACACTCAAA AATATTGCTAAATCTACATCTTCAAAAATTGAACAATTACATTCCTGTAATGGATTGTTC TGTATAAGTTTCAATTTGGGTATTGAAAATTTTGATTATTATGTTTATAACCCTAGTACT AATCAGCATAGATTGATTCCACTCCCATATTTAGGTATAAAAGCTTATGAGATTGTTGTA ATGAATTTGGCTTTTGATCCAATGGTATCTGATTGTTATAAACTCTTATGTGTGATGAAA TTAAATGGGGTTTATGAAATTTCTGTATATTCATCTGAAACTGAAGTTTGGAAAAATTGT ATGGATACGGAGATGAAGATATTGGATGCAAATCAACATTTTTTAGGTCAGGGTGTGTTC TTGAATGGTTGTATGCATTGGGTTAGTGAAATGTCGTCTTTCTTAAGGTTCGATTTGGAT TCGATGTGTTTTAGAGATATGCCTAGTACTGATCTTCCTATTGGAGTGTTGAAAAGGAGT ATAAGGTATTTTGGGGAGTCCGTTGGACATTTGCATCTAATTGAGATACATGAATTTAGG TCGATGAGTTTTGAAGTTCTTGAGATGGAGATTGATTATTCTAAGTGGTTTGTGAAGTAT CGTGTTGATCTTAGTTACATGCATACTACTCATCCATTAATGTTGAGTGAAGAAGTTGAT TTACTAGATGTGAATGGTGGTACTTGCAATGTTGTATGTGTGGTTGTTAATGAGAAGGAA GATACAACGAGGCTTTTGGTAACCACACCAGACGTTATCGTTGAATATGATGCTCATCGT ATGACTATCAAGGAGGTTGCGGATATAGAGATAGCAAAGATCCCTGTTATATGGGAAGAT GTTTCGGTGTTTGAATGGTATGATACACATCAATATGTTGAGACAATGGCTTCTGTTTGA