Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc07g008890.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GRI5_THECC)
Sequence	ATGGTACCAGAAATTCTTGGTTCACTATTGCATCATTGTTCTAAGACCAAGGCATTCCAT TATGGACTCTCTCTTCATGCAGCTGCAATCAAGTCAGGCTTACAGGGTGATGTTCTCATA TCCAATCACATCCTCAACATGTATGCCAAGTGTGGAAATATTAACTTTGCCAGTCAGATT TTTAATGAGATGTCCAAAAGAAATCTCGTTACCTGGTCGGCCATGATCGCTGGTTATGAT CAAGATGGGAAACACCTTATGGCTGTCAGCCTCTACTCCCAAATGCCACTAGAGCCCAAT GAATTTGTCCTTTCCCAGTCTATCAAATTAGGGTGTTCGTCCATTTCGTTTGTGTCCAAC TCTCTGATTTCAATGTACATGAAAAATGGTCAGTGTAGTGATGCTCTATCAGTTTTTGCA TTGACACCTAGTCTTACTGATGTCTCTTACAACACAATCATAATGGGTTTGGTAGAAAGT AATCAAAGAGAGAAAGCATTTGAAGTCTACAGAAGTATGTGCCAACAAGGGTTGGTTCCG GACCGCTTTACCTTTGTCGGCTTATTGGGAACCTGCAATACTGCACATGATTTGGGGAAA GGAATGCAATTGCATAGCCAAACAATCAAGCTCAAACTTGATGGGACTGCCTTTATAGGC AATATAATAATGACAATGTACTCAAATTTGAACTTGCTAAATGAAGCTGACAAAATTTTC AGATCAATCAAAGAGAAAGATGTCATTTCATGGAATACTCTTATTGCTGCTTGTTCTCGT TGTGATGATCATTCTAAGGCCTTGGTTGTTTTTAGAGAGATGGTGCAATATTTTGATGGA GGGCCTGATGAGTTTACCTATGCTAGTCTGCTTTCTGCATGTGCTGGCATGGGTTCGCTG CAATTTGGGCGGCAAATACATGCTCATCTTATTAGAAAAAGCTCAAGTGTGGATATTGGT GTTGTCAATGCCCTTGTCAACATGTATGCTAAATGTGGGTGTATCCAGTATGCATATACA ACTTTTAGGCTAATGACTTTTCGTAATCTTGTCTCATGGAATAGTGTCATTGCTGCATTT GCTAACCATGGCCATGGGAAAAAAGTTATGAAATTATTCAAGGAGATGATGAGTGATGGT TTAAAGCCTGATTCTGTCACATTTCTCGGACTTTTAATCGCTTGCAATCATGCAGGGCTT GTAGATGAGGGCCTATATTACTTCAATACTATGAATGAGATTTATGGGGTTACTCCCGAC ATTGAACATTTCTCTTGCCTCATTGATTTACTAGGACGAGCTGGGAGACTGAAAGATGCT GAAGAACACATGCAAAGGTACCCCTTTGGGAATGATTCAGTTGTTTTAGGTTGCTTACTT TCAGCTTGTCGGCTGCATGGTGATGTTGTAATTGGGGAAAGAATGGCTAAGAAGCTCCTA CAGCTTCAACCAGTTTCTACTTCGCCTTATGTTTTGTTATCAAACTTATATGCTTCAGAC GAGAAGTGGGATAGTGTAGCAGAGGCAAGGAAAATGCTGAAGAGTTGTGGTTTAAAGAAG GAGGCTGGTCATAGTCTTATTGAAGTGAAGGGATCTGTTGAGAAGTTCACAATTGGCAAT TTTGCGAACTCGAGGATCGAGGAAATCGTTAATGTGCTTGGAACTTTAGGCTGTGGATGG GATGAAGAAATTATTCTCCTTGATTCAGCATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc07g008890.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GRI5_THECC)
Sequence	MVPEILGSLLHHCSKTKAFHYGLSLHAAAIKSGLQGDVLISNHILNMYAKCGNINFASQI FNEMSKRNLVTWSAMIAGYDQDGKHLMAVSLYSQMPLEPNEFVLSQSIKLGCSSISFVSN SLISMYMKNGQCSDALSVFALTPSLTDVSYNTIIMGLVESNQREKAFEVYRSMCQQGLVP DRFTFVGLLGTCNTAHDLGKGMQLHSQTIKLKLDGTAFIGNIIMTMYSNLNLLNEADKIF RSIKEKDVISWNTLIAACSRCDDHSKALVVFREMVQYFDGGPDEFTYASLLSACAGMGSL QFGRQIHAHLIRKSSSVDIGVVNALVNMYAKCGCIQYAYTTFRLMTFRNLVSWNSVIAAF ANHGHGKKVMKLFKEMMSDGLKPDSVTFLGLLIACNHAGLVDEGLYYFNTMNEIYGVTPD IEHFSCLIDLLGRAGRLKDAEEHMQRYPFGNDSVVLGCLLSACRLHGDVVIGERMAKKLL QLQPVSTSPYVLLSNLYASDEKWDSVAEARKMLKSCGLKKEAGHSLIEVKGSVEKFTIGN FANSRIEEIVNVLGTLGCGWDEEIILLDSA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc07g008890.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GRI5_THECC)
Sequence	ATGGTACCAGAAATTCTTGGTTCACTATTGCATCATTGTTCTAAGACCAAGGCATTCCAT TATGGACTCTCTCTTCATGCAGCTGCAATCAAGTCAGGCTTACAGGGTGATGTTCTCATA TCCAATCACATCCTCAACATGTATGCCAAGTGTGGAAATATTAACTTTGCCAGTCAGATT TTTAATGAGATGTCCAAAAGAAATCTCGTTACCTGGTCGGCCATGATCGCTGGTTATGAT CAAGATGGGAAACACCTTATGGCTGTCAGCCTCTACTCCCAAATGCCACTAGAGCCCAAT GAATTTGTCCTTTCCCAGTCTATCAAATTAGGGTGTTCGTCCATTTCGTTTGTGTCCAAC TCTCTGATTTCAATGTACATGAAAAATGGTCAGTGTAGTGATGCTCTATCAGTTTTTGCA TTGACACCTAGTCTTACTGATGTCTCTTACAACACAATCATAATGGGTTTGGTAGAAAGT AATCAAAGAGAGAAAGCATTTGAAGTCTACAGAAGTATGTGCCAACAAGGGTTGGTTCCG GACCGCTTTACCTTTGTCGGCTTATTGGGAACCTGCAATACTGCACATGATTTGGGGAAA GGAATGCAATTGCATAGCCAAACAATCAAGCTCAAACTTGATGGGACTGCCTTTATAGGC AATATAATAATGACAATGTACTCAAATTTGAACTTGCTAAATGAAGCTGACAAAATTTTC AGATCAATCAAAGAGAAAGATGTCATTTCATGGAATACTCTTATTGCTGCTTGTTCTCGT TGTGATGATCATTCTAAGGCCTTGGTTGTTTTTAGAGAGATGGTGCAATATTTTGATGGA GGGCCTGATGAGTTTACCTATGCTAGTCTGCTTTCTGCATGTGCTGGCATGGGTTCGCTG CAATTTGGGCGGCAAATACATGCTCATCTTATTAGAAAAAGCTCAAGTGTGGATATTGGT GTTGTCAATGCCCTTGTCAACATGTATGCTAAATGTGGGTGTATCCAGTATGCATATACA ACTTTTAGGCTAATGACTTTTCGTAATCTTGTCTCATGGAATAGTGTCATTGCTGCATTT GCTAACCATGGCCATGGGAAAAAAGTTATGAAATTATTCAAGGAGATGATGAGTGATGGT TTAAAGCCTGATTCTGTCACATTTCTCGGACTTTTAATCGCTTGCAATCATGCAGGGCTT GTAGATGAGGGCCTATATTACTTCAATACTATGAATGAGATTTATGGGGTTACTCCCGAC ATTGAACATTTCTCTTGCCTCATTGATTTACTAGGACGAGCTGGGAGACTGAAAGATGCT GAAGAACACATGCAAAGGTACCCCTTTGGGAATGATTCAGTTGTTTTAGGTTGCTTACTT TCAGCTTGTCGGCTGCATGGTGATGTTGTAATTGGGGAAAGAATGGCTAAGAAGCTCCTA CAGCTTCAACCAGTTTCTACTTCGCCTTATGTTTTGTTATCAAACTTATATGCTTCAGAC GAGAAGTGGGATAGTGTAGCAGAGGCAAGGAAAATGCTGAAGAGTTGTGGTTTAAAGAAG GAGGCTGGTCATAGTCTTATTGAAGTGAAGGGATCTGTTGAGAAGTTCACAATTGGCAAT TTTGCGAACTCGAGGATCGAGGAAATCGTTAATGTGCTTGGAACTTTAGGCTGTGGATGG GATGAAGAAATTATTCTCCTTGATTCAGCATAGGAAAGGCAGATCTGATCCTCCTAGCTT CAGCACTCTTGCGGACATTAAGCTCGGCACGTACGAAGGGTTTCTGAACTGACAGATTAC TGAACTAACAAAGATACATATATCACCACTCATGGAAGTACATCATCCTAAGCATCAGCA GATCACTAAATACGAACATATTGTGTTGTTCAAAGAGTGTCTGCAGCAACAAGCTGCGAA AAGTCGATCCCCATACACTATACTTGGAAGTTACAAAGTGAAGTTGCAGTGGTGCCTCAC AGCCTCTCTAGCCATGGGTGTTTGGCTAAGAAAATCTTCAGTGATTATAAGAGTTACATC AAAGCTGTAAATTTTTGGTGACATATTCTTTAGCTACCGGTCTGCTTTGATGGGCAATGA GACAATACGTTTCCAAGGCTAATATGGATCCCCTGTTGTTTTTACTCTTTTTCATGTTGC ACAAATGTGAAATAAGAAAATTTTGTGGTTTCTCTTACTATGCTCAGTCTCTAGTTCCTT TATCTCAAAAGTTACTGAAGGTTATAGACTTAATTGTGTTTCCTTTCACTTTATTTAGCT CTCCTAA