Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc07g008890.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GRI5_THECC)

Sequence

ATGGTACCAGAAATTCTTGGTTCACTATTGCATCATTGTTCTAAGACCAAGGCATTCCAT
TATGGACTCTCTCTTCATGCAGCTGCAATCAAGTCAGGCTTACAGGGTGATGTTCTCATA
TCCAATCACATCCTCAACATGTATGCCAAGTGTGGAAATATTAACTTTGCCAGTCAGATT
TTTAATGAGATGTCCAAAAGAAATCTCGTTACCTGGTCGGCCATGATCGCTGGTTATGAT
CAAGATGGGAAACACCTTATGGCTGTCAGCCTCTACTCCCAAATGCCACTAGAGCCCAAT
GAATTTGTCCTTTCCCAGTCTATCAAATTAGGGTGTTCGTCCATTTCGTTTGTGTCCAAC
TCTCTGATTTCAATGTACATGAAAAATGGTCAGTGTAGTGATGCTCTATCAGTTTTTGCA
TTGACACCTAGTCTTACTGATGTCTCTTACAACACAATCATAATGGGTTTGGTAGAAAGT
AATCAAAGAGAGAAAGCATTTGAAGTCTACAGAAGTATGTGCCAACAAGGGTTGGTTCCG
GACCGCTTTACCTTTGTCGGCTTATTGGGAACCTGCAATACTGCACATGATTTGGGGAAA
GGAATGCAATTGCATAGCCAAACAATCAAGCTCAAACTTGATGGGACTGCCTTTATAGGC
AATATAATAATGACAATGTACTCAAATTTGAACTTGCTAAATGAAGCTGACAAAATTTTC
AGATCAATCAAAGAGAAAGATGTCATTTCATGGAATACTCTTATTGCTGCTTGTTCTCGT
TGTGATGATCATTCTAAGGCCTTGGTTGTTTTTAGAGAGATGGTGCAATATTTTGATGGA
GGGCCTGATGAGTTTACCTATGCTAGTCTGCTTTCTGCATGTGCTGGCATGGGTTCGCTG
CAATTTGGGCGGCAAATACATGCTCATCTTATTAGAAAAAGCTCAAGTGTGGATATTGGT
GTTGTCAATGCCCTTGTCAACATGTATGCTAAATGTGGGTGTATCCAGTATGCATATACA
ACTTTTAGGCTAATGACTTTTCGTAATCTTGTCTCATGGAATAGTGTCATTGCTGCATTT
GCTAACCATGGCCATGGGAAAAAAGTTATGAAATTATTCAAGGAGATGATGAGTGATGGT
TTAAAGCCTGATTCTGTCACATTTCTCGGACTTTTAATCGCTTGCAATCATGCAGGGCTT
GTAGATGAGGGCCTATATTACTTCAATACTATGAATGAGATTTATGGGGTTACTCCCGAC
ATTGAACATTTCTCTTGCCTCATTGATTTACTAGGACGAGCTGGGAGACTGAAAGATGCT
GAAGAACACATGCAAAGGTACCCCTTTGGGAATGATTCAGTTGTTTTAGGTTGCTTACTT
TCAGCTTGTCGGCTGCATGGTGATGTTGTAATTGGGGAAAGAATGGCTAAGAAGCTCCTA
CAGCTTCAACCAGTTTCTACTTCGCCTTATGTTTTGTTATCAAACTTATATGCTTCAGAC
GAGAAGTGGGATAGTGTAGCAGAGGCAAGGAAAATGCTGAAGAGTTGTGGTTTAAAGAAG
GAGGCTGGTCATAGTCTTATTGAAGTGAAGGGATCTGTTGAGAAGTTCACAATTGGCAAT
TTTGCGAACTCGAGGATCGAGGAAATCGTTAATGTGCTTGGAACTTTAGGCTGTGGATGG
GATGAAGAAATTATTCTCCTTGATTCAGCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc07g008890.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GRI5_THECC)

Sequence

MVPEILGSLLHHCSKTKAFHYGLSLHAAAIKSGLQGDVLISNHILNMYAKCGNINFASQI
FNEMSKRNLVTWSAMIAGYDQDGKHLMAVSLYSQMPLEPNEFVLSQSIKLGCSSISFVSN
SLISMYMKNGQCSDALSVFALTPSLTDVSYNTIIMGLVESNQREKAFEVYRSMCQQGLVP
DRFTFVGLLGTCNTAHDLGKGMQLHSQTIKLKLDGTAFIGNIIMTMYSNLNLLNEADKIF
RSIKEKDVISWNTLIAACSRCDDHSKALVVFREMVQYFDGGPDEFTYASLLSACAGMGSL
QFGRQIHAHLIRKSSSVDIGVVNALVNMYAKCGCIQYAYTTFRLMTFRNLVSWNSVIAAF
ANHGHGKKVMKLFKEMMSDGLKPDSVTFLGLLIACNHAGLVDEGLYYFNTMNEIYGVTPD
IEHFSCLIDLLGRAGRLKDAEEHMQRYPFGNDSVVLGCLLSACRLHGDVVIGERMAKKLL
QLQPVSTSPYVLLSNLYASDEKWDSVAEARKMLKSCGLKKEAGHSLIEVKGSVEKFTIGN
FANSRIEEIVNVLGTLGCGWDEEIILLDSA*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc07g008890.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat superfamily protein (AHRD V3.3 *** A0A061GRI5_THECC)

Sequence

ATGGTACCAGAAATTCTTGGTTCACTATTGCATCATTGTTCTAAGACCAAGGCATTCCAT
TATGGACTCTCTCTTCATGCAGCTGCAATCAAGTCAGGCTTACAGGGTGATGTTCTCATA
TCCAATCACATCCTCAACATGTATGCCAAGTGTGGAAATATTAACTTTGCCAGTCAGATT
TTTAATGAGATGTCCAAAAGAAATCTCGTTACCTGGTCGGCCATGATCGCTGGTTATGAT
CAAGATGGGAAACACCTTATGGCTGTCAGCCTCTACTCCCAAATGCCACTAGAGCCCAAT
GAATTTGTCCTTTCCCAGTCTATCAAATTAGGGTGTTCGTCCATTTCGTTTGTGTCCAAC
TCTCTGATTTCAATGTACATGAAAAATGGTCAGTGTAGTGATGCTCTATCAGTTTTTGCA
TTGACACCTAGTCTTACTGATGTCTCTTACAACACAATCATAATGGGTTTGGTAGAAAGT
AATCAAAGAGAGAAAGCATTTGAAGTCTACAGAAGTATGTGCCAACAAGGGTTGGTTCCG
GACCGCTTTACCTTTGTCGGCTTATTGGGAACCTGCAATACTGCACATGATTTGGGGAAA
GGAATGCAATTGCATAGCCAAACAATCAAGCTCAAACTTGATGGGACTGCCTTTATAGGC
AATATAATAATGACAATGTACTCAAATTTGAACTTGCTAAATGAAGCTGACAAAATTTTC
AGATCAATCAAAGAGAAAGATGTCATTTCATGGAATACTCTTATTGCTGCTTGTTCTCGT
TGTGATGATCATTCTAAGGCCTTGGTTGTTTTTAGAGAGATGGTGCAATATTTTGATGGA
GGGCCTGATGAGTTTACCTATGCTAGTCTGCTTTCTGCATGTGCTGGCATGGGTTCGCTG
CAATTTGGGCGGCAAATACATGCTCATCTTATTAGAAAAAGCTCAAGTGTGGATATTGGT
GTTGTCAATGCCCTTGTCAACATGTATGCTAAATGTGGGTGTATCCAGTATGCATATACA
ACTTTTAGGCTAATGACTTTTCGTAATCTTGTCTCATGGAATAGTGTCATTGCTGCATTT
GCTAACCATGGCCATGGGAAAAAAGTTATGAAATTATTCAAGGAGATGATGAGTGATGGT
TTAAAGCCTGATTCTGTCACATTTCTCGGACTTTTAATCGCTTGCAATCATGCAGGGCTT
GTAGATGAGGGCCTATATTACTTCAATACTATGAATGAGATTTATGGGGTTACTCCCGAC
ATTGAACATTTCTCTTGCCTCATTGATTTACTAGGACGAGCTGGGAGACTGAAAGATGCT
GAAGAACACATGCAAAGGTACCCCTTTGGGAATGATTCAGTTGTTTTAGGTTGCTTACTT
TCAGCTTGTCGGCTGCATGGTGATGTTGTAATTGGGGAAAGAATGGCTAAGAAGCTCCTA
CAGCTTCAACCAGTTTCTACTTCGCCTTATGTTTTGTTATCAAACTTATATGCTTCAGAC
GAGAAGTGGGATAGTGTAGCAGAGGCAAGGAAAATGCTGAAGAGTTGTGGTTTAAAGAAG
GAGGCTGGTCATAGTCTTATTGAAGTGAAGGGATCTGTTGAGAAGTTCACAATTGGCAAT
TTTGCGAACTCGAGGATCGAGGAAATCGTTAATGTGCTTGGAACTTTAGGCTGTGGATGG
GATGAAGAAATTATTCTCCTTGATTCAGCATAGGAAAGGCAGATCTGATCCTCCTAGCTT
CAGCACTCTTGCGGACATTAAGCTCGGCACGTACGAAGGGTTTCTGAACTGACAGATTAC
TGAACTAACAAAGATACATATATCACCACTCATGGAAGTACATCATCCTAAGCATCAGCA
GATCACTAAATACGAACATATTGTGTTGTTCAAAGAGTGTCTGCAGCAACAAGCTGCGAA
AAGTCGATCCCCATACACTATACTTGGAAGTTACAAAGTGAAGTTGCAGTGGTGCCTCAC
AGCCTCTCTAGCCATGGGTGTTTGGCTAAGAAAATCTTCAGTGATTATAAGAGTTACATC
AAAGCTGTAAATTTTTGGTGACATATTCTTTAGCTACCGGTCTGCTTTGATGGGCAATGA
GACAATACGTTTCCAAGGCTAATATGGATCCCCTGTTGTTTTTACTCTTTTTCATGTTGC
ACAAATGTGAAATAAGAAAATTTTGTGGTTTCTCTTACTATGCTCAGTCTCTAGTTCCTT
TATCTCAAAAGTTACTGAAGGTTATAGACTTAATTGTGTTTCCTTTCACTTTATTTAGCT
CTCCTAA